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FunGenAgent: An Agent-Based Approach for Workflow Composition in Homology Functional Genomics
Environmental characterization of the stagno longu of posada, sardinia: assessing the benthic community and ecological quality status
Os invertebrados macrobentónicos foram investigados em seis locais na Stagno Longu, uma
lagoa costeira do nordeste da Sardenha (Itália), a fim de realizar a primeira caracterização
ambiental de sua fauna bentónica. Apesar da lagoa pertencer à Rede Natura 2000, à lista da
Convenção de Ramsar das zonas húmidas de importância internacional e de ter sido
recentemente adicionada ao Programa Homem e Biosfera (MAB) da UNESCO, ainda falta
um plano de gestão especifico, bem como programas de avaliação e monitorização ambiental.
Em 2000, a Diretiva-Quadro da Água da União Europeia (DQA) estabeleceu uma estrutura
jurídica para a proteção e melhoria de todas as massas de água europeias, através de uma
abordagem holística baseada no ecossistema. A DQA exigiu que todos os Estados-Membros
(EM) protegessem e melhorassem a qualidade em todas as suas massas de água e definiu
como objetivo final alcançar pelo menos um “bom estado” até 2015 ou, o mais tardar, até
2027. A diretiva requer, de todos os EM, a avaliação do Estado da Qualidade Ecológica (EQS)
para todas as massas de água.
A composição e a abundância de macroinvertebrados bentónicos, além do seu papel central
no funcionamento do ecossistema aquático, é um Elemento de Qualidade Biológica (BQE)
amplamente utilizado na avaliação do estado da qualidade ecológica em águas costeiras e de
transição. Muitos estudos descreveram como as biocenoses macrobentónicas respondem de
forma relativamente rápida a perturbações de origem antropogénica. Deste modo, está bem
documentado que atividades humanas que resultem na emissão de esgotos urbanos ou
industriais, as atividades agrícolas e a destruição de habitats aumentam as concentrações de
compostos orgânicos e de nutrientes, provocam alterações em todo o ecossistema e em
particular nas comunidades de macroinvertebrados bentónicos.
Para cumprir a implementação da DQA e determinar a integridade biológica, houve
necessidade de aplicar metodologias que incorporassem respostas bióticas através da
avaliação de todos os processos, desde os indivíduos aos ecossistemas. Em particular,
numerosos índices baseados nos macroinvertebrados foram desenvolvidos para avaliar o EQS
em lagoas costeiras europeias. Através do recente exercício europeu de intercalibração, diferenças significativas na
classificação do EQS entre os EM foram harmonizadas, comparando e ajustando os limites
de “Bom estado ecológico” em grandes unidades geográficas com tipos semelhantes de
massas de água.
Para as águas de transição italianas no Mediterrâneo, os índices adotados foram derivados de
AMBI multivariado (M-AMBI) (Muxika et al., 2007) e usados em conjunto com o Índice
Biótico Marinho (AMBI). Estes índices dependem das características das comunidades de
macroinvertebrados bentónicos, como riqueza de espécies, diversidade de espécies,
abundância e sensibilidade das espécies a perturbações antropogénicas.
A estrutura taxonómica da comunidade bentónica de Stagno Longu foi caracterizada como
típica de lagoas de água salobra com fauna de meios mesohalinos, comparável à de outras
lagoas do Mediterrâneo. Apesar do pequeno tamanho e baixa profundidade média da lagoa, a
sua comunidade bentónica era numericamente dominada por crustáceos, poliquetas e
bivalves. Os taxa predominantes incluíram o poliqueta depositívoro Neanthes nubila, e
organismos que se alimentam de detritos e restos de matéria orgânica à superfície do
sedimento, de pequeno tamanho, como o poliqueta Streblospio sp. e os anfípodes Corophium
ascherosicum, Gammarus sensibilis e Corophium sextonae. Os filtradores foram quase
exclusivamente representados pelo bivalve Scrobicularia plana.
O poliqueta depositívoro Neanthes nubila foi a espécie mais abundante na bacia norte
(estações 1 e 2) durante as amostragens de inverno e verão. A comunidade desta bacia
apresentou a menor abundancia e riqueza de espécies. A bacia oeste mostrou uma estrutura
diferente da comunidade: durante o inverno, a parte interna (estacão 3) foi dominada por
Scrobicularia plana, enquanto a parte externa (estacão 4) por Streblospio sp.. Durante o
verão, Scrobicularia plana continuou a dominar toda a bacia, juntamente com Corophium. A
bacia leste, a mais próxima do canal do mar, apresentou a maior abundancia e riqueza de
espécies (estações 5 e 6) e caracterizou-se pela dominância do poliqueta Streblospio sp. e dos
crustáceos Corophium ascherosicum, C. sextonae, Gammarus insensibilis e Cyathura
carinata. Essas espécies são geralmente inteiramente marítimas, encontradas em estuários e
águas costeiras (Levin, 2001), mas provavelmente colonizam também áreas lagunares que
estão em contato imediato com o mar. Entre as variáveis espaciais e temporais medidas, a localização da bacia e a composição dos
sedimentos foram os fatores que mais contribuíram para a estrutura e distribuição das
comunidades de macroinvertebrados bentónicos.
Estas comunidades foram submetidas à variabilidade espacial das variáveis físicas da lagoa,
sobretudo no nível de confinamento relacionado com a distância à entrada do mar. Os
resultados da análise multivariada n-MDS, com base nas semelhanças da fauna betónica,
confirmaram que a lagoa Stagno Longu é caracterizada por três comunidades distintas,
altamente correlacionadas com sua localização na bacia. A composição dos sedimentos (das
camadas superficiais e sub-superficiais) da entrada em direção à ligação marítima de cada
bacia influenciou a composição e a estrutura da comunidade de macrofauna betónica ao longo
da lagoa. A bacia norte, mais confinada, apresenta sedimentos com elevado conteúdo de finos
(areia fina, silte e argila) e matéria orgânica, sendo a comunidade bentónica dominada por
um elevado número de depositívoros de superfície (Neanthes nubila) e de espécies
oportunistas como Streblospio sp. e Polydora hoplura. Indo em direção ao centro, a bacia
oeste – composta por carbonato de cálcio (principalmente conchas de bivalves), cascalho e
argila – mostrou-se dominada por filtradores; e a bacia leste, por sua vez, apresentou maior
diversidade de depositivores de superfície e de sub-superfície e de filtradores, sendo composta
principalmente por areia.
Um facto interessante é a alteração sazonal da dominância dos poliquetas sobre os crustáceos,
durante o inverno, para a relação inversa durante o verão. Além disso, as espécies de
crustáceos (Corophium ascherosicum, Corophium sextonae e Melita palmata), mesmo que
em pequeno número, estão entre as que mais contribuíram para distinções entre bacias, nas
duas estações do ano. Quanto ao padrão espacial, foram obtidos valores mais altos do Índice
de Diversidade de Shannon-Winner em estações próximas ao canal do mar (bacia leste e
oeste) e valores mais baixos nas estações mais internas (bacia norte).
Com base nos resultados de AMBI, todos as estações, tanto no inverno quanto no verão, foram
classificadas como levemente perturbadas (BI-2), enquanto através da aplicação do M-AMBI
se concluiu que o estado ecológico da maioria dos estações – tanto no inverno como no verão
– era moderado exceto no estação 5, que apresentou um bom estado no inverno, mas
moderado no verão; e na estação 6, que foi sempre classificada como tendo um bom estado
ecológico. De particular interesse é o facto das estações na parte interna da lagoa apresentarem valores
mais altos do valor do AMBI em comparação às externas, o que aponta para ambientes
ligeiramente perturbados. Há que realçar que faltam os valores das condições de referência
da lagoa, o que faz com que os resultados do M-AMBI devam ser avaliados com precaução,
sendo necessário mais estudos para confirmar o estado ecológico da lagoa.
Este estudo representa uma primeira caracterização ambiental e análise quantitativa de
comunidades macrobentónicas e as relações com a composição de sedimentos no Stagno
Longu da Posada. Foi demonstrado que as comunidades de macroinvertebrados bentónicos
foram influenciadas por variações temporais e espaciais.
Este trabalho fornece conhecimentos fundamentais sobre as características básicas da área
acima mencionada, sobre a sua fauna betónica e o estado ecológico. Essas informações
representam referências básicas para futuros programas de monitorização, que serão
essenciais para garantir a gestão dos recursos hídricos e a implementação de outras ações
politicas. No caso da lagoa costeira de Stagno Longu, este estudo oferece as informações
necessárias para realizar com êxito pesquisas futuras, sobretudo com foco em programas de
monitorização das condições ambientais, da hidrologia da área assim como das suas
comunidades, o que permitirá uma gestão baseada nos ecossistemas, no uso sustentável de
recursos e, por fim, promover a conservação e a proteção de modo eficaz, necessárias para
melhorar a coerência entre os objetivos económicos, sociais e ambientais.Macrobenthic invertebrate assemblages were investigated at six sites in Stagno Longu, northeastern
Sardinian costal lagoon (Italy), in order to perform the first environmental
characterization of the benthic fauna and to assess the ecological quality status. Despite the
fact that this coastal lagoon belongs to Nature2000 sites, Ramsar list of wetlands of
international importance and recently was added to the Man and Biosphere program (MAB),
it still lacks specific management plan as well as environmental assessment and monitoring
programs. Benthic assemblages comprised 32 taxa, of which Streblospio sp., Neanthes nubila,
Corophium ascherusicum and Scrobicularia plana contributed the most to the abundance.
Multivariate analysis showed the role of seasonal variations (higher species richness during
summer season and more abundance during winter), basin’s location and its relative location
into the lagoon in influencing benthic assemblages composition. This study also explored the
relationship between macrobenthos community and sediment composition which was found
to influence abundance, diversity and richness of benthic assemblages. Sediments from the
North basin of the lagoon was mostly muddy (rich in OC (organic matter content), H2O
content and fine sands) presenting high numbers of sub-surface deposit feeders (Neanthes
nubila); the West basin comprised calcium carbonate (CC) (mostly death hard-shell of
Bivalvia), gravel and clay and, dominated by filter feeders, while the East basin was mainly
composed by sand and showed higher diversity of surface, sub-surface deposit feeders and
filter feeders. Recently, several indices have been proposed to be used as ecological indicators
in estuarine and coastal waters. The ecological quality of the Stagno Longu was assessed
using biotic indices AMBI and M-AMBI which revealed the lagoon to be in a moderate and
moderate to good status, respectively. In conclusion, our results provide fundamental
knowledge on the basic characteristics of the above-mentioned area, its benthic fauna and the
current EQS. Altogether, those information represents basic references for further monitoring
programs, which will be essential to ensure management of water resources and
implementation of further policy action in order to improve the coherence between economic,
societal and environmental goals
Erectile dysfunction etiology and hormonal changes. Minireview
Erectile dysfunction etiology and hormonal changes. Minirevie
Modelos avanzados de elección de localización residencial
Jornada TRANSPACE, transferencia de resultados de proyect
MASSP3: A System for Predicting Protein Secondary Structure
A system that resorts to multiple experts for dealing with the problem of predicting secondary structures is described, whose performances are comparable to those obtained by other state-of-the-art predictors. The system performs an overall processing based on two main steps: first, a "sequence-to-structure" prediction is performed, by resorting to a population of hybrid genetic-neural experts, and then a "structure-to-structure" prediction is performed, by resorting to a feedforward artificial neural networks. To investigate the performance of the proposed approach, the system has been tested on the RS126 set of proteins. Experimental results (about 76% of accuracy) point to the validity of the approach
Risk factors for honey bee (Apis mellifera L.) mortality in Estonian apiaries during 2012–2013
Received: January 4th, 2022 ; Accepted: May 11th, 2022; Published: May 19th, 2022 ; Correspondence: [email protected]; https://orcid.org/0000-0002-6478-7047In light of the global increase in honey bee colony losses, risk factors regarding
beekeeping management practices and honey bee diseases have been studied intensively during
the last decade. Some risk factors have been outlined, but the correlation of evidence between
relevant factors coinciding with honey bee mortality still needs to be clarified. The current study
used the two-year data collected in frames of the European Commission EPILOBEE project.
Previously, the data from Estonian apiaries were analysed together with the data from all 17
participating European countries in the consortium. In the current study, data from Estonian
apiaries were targeted separately. In total, 196 apiaries containing 2,439 colonies all over Estonia
were included in this dataset. The study aimed to clarify the risk factors that would predict colony
losses in Estonia. The main factors increasing colony mortality after winter were the size of the
apiary, Varroa destructor mite count, infestation with Paenibacillus larvae, and lack of farmlands
around the apiary. No significant risk factors in relation to honey bee summer mortality were
detected
Systemic inflammatory response to shoulder ulcers and lack of preventive effect of postpartum pain medication with ketoprofen in sows
Shoulder lesions are common in lactating sows and can affect their welfare. We assessed the systemic inflammatory response to shoulder ulcers and monitored the preventive effect of postpartum administration with non-steroidal anti-inflammatory medication (ketoprofen) on their prevalence. In a double-blind placebo-controlled field trial, 144 YxL hybrid sows farrowing in crates with a cast-iron floor received either ketoprofen (3 mg/kg) or placebo as an intramuscular injection on days 0-1 after parturition. During the lactation period (weeks 1–4) all sows were assessed weekly for the presence of shoulder ulcers (0 = no ulcer, 1 = unilateral ulcer, 2 = bilateral ulcers; in all cases at least epithelial damage). From a subset of 37 sows, haptoglobin (Hp), albumin (ALB) and cortisol (COR) were measured from blood samples taken 10 to 12 days after farrowing. Results were analyzed according to a linear regression model for associations between Hp, ALB, COR and shoulder ulcers. A random ordered logistic model was used to assess risk factors (body condition score (BCS), back and shoulder fat, decrease in BCS or fat layer thickness during lactation, parity, number of live born and stillborn piglets, piglets weaned, shoulder ulcer scar) and the effect of ketoprofen treatment. Total prevalence of shoulder ulcers at lactation weeks 1–4 was 26.4%, 33.3%, 38.2% and 38.9%, respectively. Prevalences of unilateral shoulder ulcers at lactation weeks 1–4 were 16.7%, 19.4%, 20.8% and 18.8%, and prevalences of bilateral shoulder ulcers were 9.7%, 13.9%, 17.4%, and 20.1%. There was a decrease in albumin and an increase in Hp levels in sows with bilateral shoulder ulcers compared with sows without shoulder ulcers (P Peer reviewe
Interacción con empresas y casos prácticos reales en la docencia de la asignatura Movilidad Metropolitana y Terminales de Transporte
[Resumen] El póster expone la organización de la asignatura Movilidad Urbana y Terminales de Transporte, obligatoria anual de tercer curso del Grado en Ingeniería de Obras Públicas,
especialidad en Transportes y Servicios Urbanos. El temario es amplio, abarcando contenidos de movilidad sostenible, operación y gestión del
transporte público, planificación del transporte, terminales, intermodalidad y transporte de
mercancías, etc. Estos temas tienen una componente práctica importante.
Para que los estudiantes perciban la aplicación de las competencias adquiridas a la realidad de
su entorno, parte de la evaluación consiste en la solución de problemas reales y el desarrollo
de trabajos tutelados sobre casos. Los estudiantes han tenido que valorar críticamente el Plan
de Movilidad Urbana Sostenible de A Coruña, analizar la implantación de plataformas
reservadas para autobús o metro ligero en diferentes itinerarios, analizar las operaciones y
estudiar nuevas posibilidades para diferentes líneas de autobús urbano, estudiar variantes de
población en localidades gallegas, etc.
Adicionalmente, dentro de las actividades del Aula Compañía de Tranvías, se organiza
anualmente una visita técnica durante la cual el personal de la empresa muestra los talleres y cocheras y el centro de control, con una explicación detallada de las características de los
mismos. En esta visita los estudiantes pueden apreciar cómo los contenidos impartidos se
utilizan en el día a día de una explotación de autobuses urbanos. También en el marco del Aula se organiza anualmente una jornada relacionada con el transporte urbano, a la que pueden asistir gratuitamente los estudiantes de la asignatura, valorándose en la evaluación
Use of a Genetic Algorithm to Optimize Wheel Profile Geometry
[Abstract] Wear is a very important subject for Railway Administrations because it entails very important costs. So, it seems to be logical to develop a new methodology for designing wheel profiles in order to improve its behaviour in relation to this subject.
Until now, existing approach of this kind are based in statistical studies of the wear profile of many wheels, but this do not consider characteristics of different vehicles and railway tracks, and in addition, it is not an option when a vehicle is going to run, for example, over two different types of track over which mixed running never happens until now.
In this paper a new general methodology for improving wheel profiles is presented. This methodology is based in Genetic Algorithms technique. To show the potential of this procedure, it is applied to an application case (a tram-train in Spain), in which great improvements in the behaviour of the wheel profile are achieved. In the light of this application, the importance of definition of indexes which control the evolution of the GA is shown.[Resumen] El desgaste es un aspecto muy importante para las Administraciones Ferroviarias porque da lugar a costes importantes. Por ello, parece lógico desarrollar una nueva metodología para el diseño de perfiles de rueda al objeto de mejorar su comportamiento en relación al desgaste. Hasta ahora, los planteamientos existentes se basan en estudios estadísticos del desgaste del perfil de un gran número de ruedas, pero con ello no se tienen en cuenta las características de diferentes vehículos o vías y asímismo, este planteamiento no es posible cuando un vehículo va a circular, por ejemplo, sobre diferentes tipos de vías sobre las cuales nunca se ha producido la circulación mixta hasta ahora. En este artículo se presenta una nueva metodología para mejorar el perfil de rueda. Esta metodología se basa en la técnica de los Algoritmos Genéticos. Para mostrar el potencial de este procedimiento, se aplica a un caso de tranvitrén en España, en el que se consiguen grandes mejoras en el comportamiento del perfil de rueda. A partir de esta aplicación se muestra la importancia de la definición de los índices de control de la evolución en el Algoritmo Genético
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