Museomics of a rare taxon: placing Whalleyanidae in the Lepidoptera Tree of Life

https://doi.org/10.1111/syen.12503Museomics is a valuable approach that utilizes the diverse biobanks that are natural history museums. The ability to sequence genomes from old specimens has expanded not only the variety of interesting taxa available to study but also the scope of questions that can be investigated in order to further knowledge about biodiversity. Here, we present whole genome sequencing results from the enigmatic genus Whalleyana (comprising two species - occurring in drier biomes of Madagascar - previously placed in a monotypic superfamily, Whalleyanoidea), as well as from certain species of the families Callidulidae and Hyblaeidae (Calliduloidea and Hyblaeoidea, respectively). Library preparation was carried out on four museum specimens and one existing DNA extract and sequenced with Illumina short reads. De novo assembly resulted in highly fragmented genomes with the N50 ranging from 317 to 2078 bp. Mining of a manually curated gene set of 331 genes from these draft genomes had an overall gene recovery rate of 64-90%. Phylogenetic analysis places Whalleyana as sister to Callidulidae and Hyblaea as sister to Pyraloidea. Since the former sister-group relationship turns out to be also supported by ten morphological synapomorphies, we propose to formally assign the Whalleyanidae to the superfamily Calliduloidea. These results highlight the usefulness of not only museum specimens but also existing DNA extracts, for whole genome sequencing and gene mining for phylogenomic studies.Peer reviewe

Le radeau des cimes au Parc national de Masoala (Madagascar). Première partie : éléments pour un inventaire des Lépidoptères

Grâce à l'expédition Radeau des Cimes 2001, de nombreuses espèces de Lépidoptères peuvent être rajoutées aux inventaires faunistiques de la presqu'île de Masoala, encore très incomplets. Des papillons et quelques chenilles ont été collectés pendant cinq semaines (principalement en novembre) dans la région de Tampolo, mais aussi dans celle d'Andranobe, au sud d'Ambanizana. Un certain nombre de chenilles ont été élevées avec succès, notamment celle d'une noctuelle, apparemment non décrite (Herminiinae) et la chenille jusque-là inconnue du Sphingidae Rhagastis lambertoni (Clark). A partir de nids d'un Hypsoides sp. (Notodontidae Thaumetopoeinae; espèce peut-être nouvelle), divers insectes ont été obtenus, dont un Cosmopterigidae et un Phycitinae (Pyralidae) vraisemblablement des espèces nouvelles pour la science. Au moins 23 espèces de Bombycoïdes (dont le Sphingidae Hipparion melichari Haxaire) ont pu être capturées - en octobre-novembre 2001 - dans la région de Tampolo. En comparant l'efficacité de trois pièges lumineux similaires, mais installés, l'un sur le Radeau des Cimes, les deux autres sous celui-ci, dans le sous-bois, on peut avancer l'hypothèse selon laquelle la plupart des Sphinx nocturnes tendraient à voler au-dessus de la canopée. Une première liste des Sphingidae de Masoala est proposée. Parmi les Rhopalocères, 65 espèces de Rhopalocères ont été distinctement aperçues (p. ex. Smerina manoro (Ward) - Nymphalidae) ou capturées. Trois Hesperiidac sont signalés pour la première fois de Masoala: Perrotia howa (Mabille), P. silvestralis (Viette) et Borbo ratek (Boisduval). (Résumé d'auteur

Photography-based taxonomy is inadequate, unnecessary, and potentially harmful for biological sciences

The question whether taxonomic descriptions naming new animal species without type specimen(s) deposited in collections should be accepted for publication by scientific journals and allowed by the Code has already been discussed in Zootaxa (Dubois & Nemésio 2007; Donegan 2008, 2009; Nemésio 2009a–b; Dubois 2009; Gentile & Snell 2009; Minelli 2009; Cianferoni & Bartolozzi 2016; Amorim et al. 2016). This question was again raised in a letter supported by 35 signatories published in the journal Nature (Pape et al. 2016) on 15 September 2016. On 25 September 2016, the following rebuttal (strictly limited to 300 words as per the editorial rules of Nature) was submitted to Nature, which on 18 October 2016 refused to publish it. As we think this problem is a very important one for zoological taxonomy, this text is published here exactly as submitted to Nature, followed by the list of the 493 taxonomists and collection-based researchers who signed it in the short time span from 20 September to 6 October 2016

Contribution à l'étude des Microlépidoptères de Madagascar [Sesiidae, Alucitidae]

Minet Joël. Contribution à l'étude des Microlépidoptères de Madagascar [Sesiidae, Alucitidae]. In: Bulletin de la Société entomologique de France, volume 81 (1-2), Janvier-février 1976. pp. 40-43

Description préliminaire d'Ectoedemia scoblei n. sp., taxon représentant une famille nouvelle pour la faune malgache [Lep. Nepticulidae]

Minet Joël. Description préliminaire d'Ectoedemia scoblei n. sp., taxon représentant une famille nouvelle pour la faune malgache [Lep. Nepticulidae]. In: Bulletin de la Société entomologique de France, volume 94 (7-8), janvier 1989. p. 220

Contribution à l'étude des Microlépidoptères de Madagascar [Sesiidae, Alucitidae]

Minet Joël. Contribution à l'étude des Microlépidoptères de Madagascar [Sesiidae, Alucitidae]. In: Bulletin de la Société entomologique de France, volume 81 (1-2), Janvier-février 1976. pp. 40-43

Loïc Matile. — Recherches sur la systématique et l'évolution des Keroplatidae (Díptera, Mycetophiloidea). Mémoire du Muséum national d'Histoire naturelle, (série A), Paris, 1990

Minet Joël. Loïc Matile. — Recherches sur la systématique et l'évolution des Keroplatidae (Díptera, Mycetophiloidea). Mémoire du Muséum national d'Histoire naturelle, (série A), Paris, 1990. In: Bulletin de la Société entomologique de France, volume 98 (5), décembre 1993. pp. 438-440

Lathrotelidae Clarke, 1971: a rehabilitated name deserving subfamily rank (Lepidoptera, Crambidae)

The (previously undescribed) abdominal morphology of the male of Lathroteles obscura Clarke, 1971, permits to assign this Polynesian taxon to a new subfamily, which seems to be a close relative of the Acentropinae (Pyraloidea : Crambidae). Core Lathrotelinae include the genera Sufetula, Diplopseustoides, Diplopseustis and Lathroteles. A few autapomorphies can characterize the subfamilies Acentropinae (larva primarily aquatic ; pupa with two or three pairs of enlarged spiracles), Lathrotelinae (imaginal head without chaetosemata ; gnathos lost), and Midilinae (cephalad shifting of the lineae which delimit the tympana anteriorly).Lathrotelidae Clarke, 1971 : un nom qui doit être réhabilité et mérite le rang de sous-famille (Lepidoptera, Crambidae). La morphologie abdominale du mâle de Lathroteles obscura Clarke, 1971 (jusqu’ici non décrite), permet d’attribuer ce taxon polynésien à une sous-famille paeticulière, probablement étroitement apparentée aux Acentropinae (Pyraloidea, Crambidae). Le noyau central des Lathrotelinae comprend les genres Sufetula, Diplopseustoides, Diplopseustis et Lathroteles. Quelques autapomorphies sont susceptibles de caractériser les Acentropinae (chenille fondamentalement aquatique ; chrysalide avec deux ou trois paires de stigmates hypertrophiés), les Lathrotelinae (tête sans chaetosemata ; perte du gnathos) et les Midilinae (déplacement vers l’avant des lineae qui bordent les tympans antérieurement).Minet Joël. Lathrotelidae Clarke, 1971: a rehabilitated name deserving subfamily rank (Lepidoptera, Crambidae). In: Bulletin de la Société entomologique de France, volume 120 (1),2015. pp. 109-112

Chambón (J.-P.), 1986. — Les Tordeuses nuisibles en arboriculture fruitière. INRA, Paris

Minet Joël. Chambón (J.-P.), 1986. — Les Tordeuses nuisibles en arboriculture fruitière. INRA, Paris. In: Bulletin de la Société entomologique de France, volume 94 (1-2), juillet 1989. p. 68