Genome-wide association study identifies variants in the MHC class I, IL10, and IL23R-IL12RB2 regions associated with Behcet's disease

Behcet's disease is a genetically complex disease of unknown etiology characterized by recurrent inflammatory attacks affecting the orogenital mucosa, eyes and skin. We performed a genome-wide association study with 311,459 SNPs in 1,215 individuals with Behcet's disease (cases) and 1,278 healthy controls from Turkey. We confirmed the known association of Behcet's disease with HLA-B*51 and identified a second, independent association within the MHC Class I region. We also identified an association at IL10 (rs1518111, P = 1.88 x 10(-8)). Using a meta-analysis with an additional five cohorts from Turkey, the Middle East, Europe and Asia, comprising a total of 2,430 cases and 2,660 controls, we identified associations at IL10 (rs1518111, P = 3.54 x 10(-18), odds ratio = 1.45, 95% CI 1.34-1.58) and the IL23R-IL12RB2 locus (rs924080, P = 6.69 x 10(-9), OR = 1.28, 95% CI 1.18-1.39). The disease-associated IL10 variant (the rs1518111 A allele) was associated with diminished mRNA expression and low protein production

Epistatic interaction of ERAP1 and HLA-B in Behçet disease: a replication study in the Spanish population

Behçet's disease (BD) is a multifactorial disorder associated with the HLA region. Recently, the ERAP1 gene has been proposed as a susceptibility locus with a recessive model and with epistatic interaction with HLA-B51. ERAP1 trims peptides in the endoplasmic reticulum to optimize their length for MHC-I binding. Polymorphisms in this gene have been related with the susceptibility to other immune-mediated diseases associated to HLA class I. Our aim was, the replication in the Spanish population of the association described in the Turkish population between ERAP1 (rs17482078) and BD. Additionally, in order to improve the understanding of this association we analyzed four additional SNPs (rs27044, rs10050860, rs30187 and rs2287987) associated with other diseases related to HLA class I and the haplotype blocks in this gene region. According to our results, frequencies of the homozygous genotypes for the minor alleles of all the SNPs were increased among patients and the OR values were higher in the subgroup of patients with the HLA-B risk factors, although differences were not statistically significant. Moreover, the presence of the same mutation in both chromosomes increased the OR values from 4.51 to 10.72 in individuals carrying the HLA-B risk factors. Therefore, although they were not statistically significant, our data were consistent with an association between ERAP1 and BD as well as with an epistatic interaction between ERAP1 and HLA-B in the Spanish population

Caractérisation du phytoplancton de deux systèmes limniques vis-à-vis d'un herbicide inhibiteur de la photosynthèse. La méthode PICT (Pollution-Induced Community Tolerance) : application et signification

National audienc

Caractérisation du phytoplancton de deux systèmes limniques vis-à-vis d'un herbicide inhibiteur de la photosynthèse La méthode PICT ( Pollution-Induced Community Tolerance) : application et signification

La méthode PICT (Pollution-Induced Community Tolerance) a été initialement proposée par Blank et al. (1988) afin de caractériser un écosystème aquatique soumis à un polluant suspecté. Le concept du PICT est fondé sur le fait qu'une communauté algale présente différents «composants» ayant une sensibilité variable vis-à-vis du xénobiotique étudié. Ainsi, les organismes les plus sensibles, exposés à une concentration et pendant une durée suffisantes au toxique, ne sont plus concurrentiels et sont remplacés par des organismes plus tolérants. La communauté présente alors une tolérance supérieure vis-à-vis du polluant ou du type de polluant étudié, en comparaison à une communauté similaire n'ayant pas connu de pression de sélection par le toxique. En conciliant deux approches méthodologiques complémentaires (un test global rapide de réponse physiologique et une étude précise des peuplements de la communauté), il est possible de comparer des communautés selon leur tolérance plus ou moins induite par le polluant étudié. Cette méthode a été appliquée à la comparaison de deux systèmes limniques très différents : le lac Léman (Haute-Savoie), mésotrophe, peu pollué par les herbicides inhibiteurs du Photosystème II (P.S. II) et la retenue de Villaumur (Ille-et-Vilaine), très eutrophe et polluée par ce type d'herbicides. Les deux plans d'eau semblent effectivement présenter des communautés phytoplanctoniques différentes, du point de vue structure des peuplements et tolérance à l'Atrazine. Afin de confirmer cette sélection de la communauté phytoplanctonique par les herbicides inhibiteurs du PS. II présents dans la retenue de Villaumur, nous avons étudié expérimentalement l'effet des polluants sur la structure d'une communauté phytoplanctonique provenant du plan d'eau le moins pollué (Léman) : une série de microcosmes était contaminée par de l'eau filtrée du plan d'eau le plus pollué (Villaumur) alors qu'une autre série était contaminée par de l'Atrazine (10 µg/l). Certaines espèces d'algues tolérantes ont été sélectionnées dans les deux types de microcosmes contaminés, après trois semaines de traitement. Enfin, une comparaison expérimentale de l'effet de l'Atrazine sur deux souches d'une même espèce isolées de chaque plan d'eau (calcul et comparaison de CE50), suggère une probable sélection au niveau génotypique par les herbicides inhibiteurs de la photosynthèse. La méthode PICT présente un intérêt indéniable comme indice de pollution spécifique d'un plan d'eau. Notre approche expérimentale a bien mis en évidence l'effet sélection des communautés par les polluants, mais les premiers résultats de mesures in situ montrent que pour valider cette méthode, il est nécessaire de poursuivre l'amélioration du protocole et de l'appliquer sur des systèmes variés, contrôlés et/ou connus

Management of adult patients with Langerhans cell histiocytosis: Recommendations from an expert panel on behalf of Euro-Histio-Net

Langerhans Cell Histiocytosis (LCH) is an orphan disease of clonal dendritic cells which may affect any organ of the body. Most of the knowledge about the diagnosis and therapy is based on pedriatic studies. Adult LCH patients are often evaluated by physicians who focus on only the most obviously affected organ without sufficient evaluation of other systems, resulting in patients being underdiagnosed and/or incompletely staged. Furthermore they may be treated with pediatric-based therapies which are less effective and sometimes more toxic for adults. The published literature on adult LCH cases lacks a comprehensive discussion on the differences between pediatric and adult patients and there are no recommendations for evaluation and comparative therapies. In order to fill this void, a number of experts in this field cooperated to develop the first recommendations for management of adult patients with LCH. Key questions were selected according to the clinical relevance focusing on diagnostic work up, therapy, and follow up. Based on the available literature up to December 2012, recommendations were established, drafts were commented by the entire group, and redrafted by the executive editor. The quality of evidence of the recommendations is predominantly attributed to the level of expert opinion. Final agreement was by consensus. © 2013 Girschikofsky et al.; licensee BioMed Central Ltd

Usual interstitial pneumonia in ANCA-associated vasculitis A poor prognostic factor

International audienc