32 research outputs found

    Clonal chromosomal mosaicism and loss of chromosome Y in elderly men increase vulnerability for SARS-CoV-2

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    The pandemic caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2, COVID-19) had an estimated overall case fatality ratio of 1.38% (pre-vaccination), being 53% higher in males and increasing exponentially with age. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, we found 133 cases (1.42%) with detectable clonal mosaicism for chromosome alterations (mCA) and 226 males (5.08%) with acquired loss of chromosome Y (LOY). Individuals with clonal mosaic events (mCA and/or LOY) showed a 54% increase in the risk of COVID-19 lethality. LOY is associated with transcriptomic biomarkers of immune dysfunction, pro-coagulation activity and cardiovascular risk. Interferon-induced genes involved in the initial immune response to SARS-CoV-2 are also down-regulated in LOY. Thus, mCA and LOY underlie at least part of the sex-biased severity and mortality of COVID-19 in aging patients. Given its potential therapeutic and prognostic relevance, evaluation of clonal mosaicism should be implemented as biomarker of COVID-19 severity in elderly people. Among 9578 individuals diagnosed with COVID-19 in the SCOURGE study, individuals with clonal mosaic events (clonal mosaicism for chromosome alterations and/or loss of chromosome Y) showed an increased risk of COVID-19 lethality

    Plasma lipid profiles discriminate bacterial from viral infection in febrile children

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    Fever is the most common reason that children present to Emergency Departments. Clinical signs and symptoms suggestive of bacterial infection are often non-specific, and there is no definitive test for the accurate diagnosis of infection. The 'omics' approaches to identifying biomarkers from the host-response to bacterial infection are promising. In this study, lipidomic analysis was carried out with plasma samples obtained from febrile children with confirmed bacterial infection (n = 20) and confirmed viral infection (n = 20). We show for the first time that bacterial and viral infection produces distinct profile in the host lipidome. Some species of glycerophosphoinositol, sphingomyelin, lysophosphatidylcholine and cholesterol sulfate were higher in the confirmed virus infected group, while some species of fatty acids, glycerophosphocholine, glycerophosphoserine, lactosylceramide and bilirubin were lower in the confirmed virus infected group when compared with confirmed bacterial infected group. A combination of three lipids achieved an area under the receiver operating characteristic (ROC) curve of 0.911 (95% CI 0.81 to 0.98). This pilot study demonstrates the potential of metabolic biomarkers to assist clinicians in distinguishing bacterial from viral infection in febrile children, to facilitate effective clinical management and to the limit inappropriate use of antibiotics

    Identification of regulatory variants associated with genetic susceptibility to meningococcal disease.

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    Non-coding genetic variants play an important role in driving susceptibility to complex diseases but their characterization remains challenging. Here, we employed a novel approach to interrogate the genetic risk of such polymorphisms in a more systematic way by targeting specific regulatory regions relevant for the phenotype studied. We applied this method to meningococcal disease susceptibility, using the DNA binding pattern of RELA - a NF-kB subunit, master regulator of the response to infection - under bacterial stimuli in nasopharyngeal epithelial cells. We designed a custom panel to cover these RELA binding sites and used it for targeted sequencing in cases and controls. Variant calling and association analysis were performed followed by validation of candidate polymorphisms by genotyping in three independent cohorts. We identified two new polymorphisms, rs4823231 and rs11913168, showing signs of association with meningococcal disease susceptibility. In addition, using our genomic data as well as publicly available resources, we found evidences for these SNPs to have potential regulatory effects on ATXN10 and LIF genes respectively. The variants and related candidate genes are relevant for infectious diseases and may have important contribution for meningococcal disease pathology. Finally, we described a novel genetic association approach that could be applied to other phenotypes

    Plasma lipid profiles discriminate bacterial from viral infection in febrile children

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    Fever is the most common reason that children present to Emergency Departments. Clinical signs and symptoms suggestive of bacterial infection ar

    Abstracts from the Food Allergy and Anaphylaxis Meeting 2016

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    Pollen signal of modern vegetation registered in surface soil samples along an elevation gradient from Iztaccíhuatl volcano, central Mexico

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    AbstractCharacterising the vegetation-pollen signal is a crucial task for enhancing the interpretation of fossil pollen records. This study analyses 28 surface soil samples collected in the surroundings of Iztaccíhuatl volcano, between 2,650 and 4,024 m asl. Pollen zones and ordination analysis were assessed to establish a qualitative connection between the pollen signal and the distribution of plant communities along the elevation gradient. The results show: (i) the predominant pollen type in the pollen assemblage is Pinus; (ii) pollen grains of Quercus and Alnus are present along the elevation gradient, even at high elevations where the parental plants are not typically found; (iii) samples taken between 2,650 and 3,338 m asl., where fir forests dominate, exhibit higher values of Abies pollen compared to samples above 3,405 m asl.; (iv) the locally-dispersed pollen of the hemiparasite Arceuthobium results key in identifying the presence of pine forests; and (v) pollen taxa such as Apiaceae, Eryngium, Valerianaceae, and Caryophyllaceae are linked to higher elevations, specifically where the plant communities of Pinus hartwegii and alpine grassland occur. The study suggests that the pollen signal along the elevation gradient is useful to characterise the main plant communities of the study site (fir forest, pine forest and alpine grassland). Additionally, the percentage variations of Abies in the pollen signal below 3,600 m asl. show the reduction of fir forest communities resulting from recent human activities in the area.</jats:p

    InstaGRAF 2.0. Nuevos retos y oportunidades

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    Las metodologías activas permiten al docente desempeñar su labor de manera más efectiva y, a los alumnos, facilitan el estudio, ejerciendo de constructores del conocimiento y gestores de su propio aprendizaje. Desde el Espacio Europeo de Educación Superior (EEES) se promueve el desarrollo de metodologías basadas en el aprendizaje activo, con un modelo educativo basado en el trabajo de los alumnos, que integren, dentro de las clases de teoría, otras técnicas de enseñanza que faciliten el aprendizaje en el aula universitaria, lográndose así una clase más dinámica y participativa. El 11 de marzo de 2020 la Organización Mundial de la Salud declaró que la infección por el coronavirus SARS Cov2 se había convertido en una pandemia global. Desde ese momento se ha vivido una de las situaciones más críticas en la historia de la humanidad. Las condiciones de confinamiento forzoso, distanciamiento social y paralización de actividades en mayor o menor medida en prácticamente la totalidad de las naciones han afectado severamente la vida cotidiana de las personas en todo el planeta. La educación superior, por supuesto, no ha sido una excepción. A nivel global, nacional y local, el impacto ha sido similar al de otras actividades humanas y también asume formas particulares por las características específicas de las actividades docentes, de investigación y de extensión de este nivel educativo. Los actores sociales que la conforman (estudiantes, académicos, trabajadores administrativos, autoridades, etc.), así como otros sectores de la sociedad que interactúan con universidades, colegios e institutos superiores y centros de investigación, han tenido que hacer frente con premura y creatividad al reto de reorganizar sus actividades para dar continuidad al ejercicio de sus funciones educativas y seguir atendiendo los retos y problemas que enfrentaban antes de la pandemia. Tras más de dos año conviviendo con las restricciones de movilidad y de reunión debido a la pandemia por el SARS-Cov2, diferentes instituciones educativas se han visto obligadas a suspender la presencialidad en el aula y a poner en marcha programas docentes adaptados utilizando para ello las tecnologías de la información. En este sentido, las metodologías activas permiten afrontar los cambios creando entornos colaborativos para el desarrollo de las competencias del alumnado a través de las plataformas virtuales. A este respecto, desde hace varios años y gracias a diversos proyectos de innovación y mejora de la calidad docente (PIMCD), los profesores que forman parte de la actual propuesta vienen trabajando en la puesta en marcha de diversas herramientas didácticas con el fin de responder a la necesidad de potenciar la adquisición de competencias genéricas en el alumnado. En este sentido, el equipo docente ha facilitado el trabajo del alumno de manera no presencial con instrumentos creados anteriormente como la Herramienta TAPA, Blog Científicas españolas, Podcasts y píldoras de conocimientos, Laboratorio virtual de ECEN, InstaGRAF (INSTrumento de Apoyo infoGRAFico), etc. Por ello, a partir de esta primera experiencia exitosa se pretende potenciar y mejorar aún más esta herramienta desarrollando una nueva versión del proyecto a la que denominamos proyecto InstaGRAF 2.0. Nuevos retos y oportunidades. Esta nueva versión mejorada continuará con la realización por parte de los alumnos de una infografía basada en las clases teóricas y/o prácticas que estén cursando para compartir en las redes sociales a través de la cuenta @IntaGRAFUCM creada específicamente para ello a través de Twitter e Instagram. Para mejorar la calidad del proyecto este recurso se suman tres bloques de actividades complementarias: De esta forma, el proyecto InstaGRAF 2.0 ha continuado sirviendo como herramienta de motivación, apoyo e incentivo del aprendizaje activo de los alumnos y apoyar a mejorar algunas competencias profesionales y sociales potenciando la capacidad de los estudiantes para manejarse de manera profesional dentro de entornos virtuales. En este sentido, la herramienta InstaGRAF 2.0 integra las características de innovación y mejora de la calidad docente

    Packaged foods collected in an online database as a teaching and learning resource in food and nutrition (ALIVA-BAD). Collaborative project-based learning

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    El proyecto ALIVA-BAD empleó la metodología de aprendizaje basado en proyectos colaborativo para crear una base de datos sobre alimentos procesados envasados. Su objetivo fue mejorar el conocimiento de los estudiantes sobre los alimentos y desarrollar habilidades relevantes para su futuro profesional. Participaron 131 estudiantes de diversas asignaturas relacionadas con la nutrición, analizando 433 marcas de alimentos de 37 categorías diferentes. La encuesta de satisfacción fue completada por 88 estudiantes (67.2% del total). En general, los estudiantes expresaron una opinión positiva sobre su participación, considerando el proyecto como una buena opción para la evaluación continua y valorando su carácter innovador. En conclusión, el proyecto ALIVA-BAD demostró ser un método de enseñanza-aprendizaje original y bien aceptado, que mejoró la comprensión de los estudiantes en temas de alimentos y nutrición, al tiempo que fomentó habilidades de trabajo en equipo.The ALIVA-BAD project employed the methodology of collaborative project-based learning to create a database on processed packaged foods. It aimed to enhance students' knowledge and develop skills relevant to their professional futures. The project involved 131 students across various nutrition-related subjects, analysing 433 food brands of 37 food different categories. The satisfaction survey was completed by 88 students (67.2% of the total). In general, students expressed a positive opinion about their participation, perceiving the project as a good option for continuous assessment and an innovative approach. In conclusion, the ALIVA-BAD project showcased an original and well-received teaching-learning method that improved students' understanding of nutrition and food-related topics, while fostering teamwork skills.Depto. de Nutrición y Ciencia de los AlimentosFac. de FarmaciaFALSEsubmitte
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