Semantic Segmentation with Labeling Uncertainty and Class Imbalance

Recently, methods based on Convolutional Neural Networks (CNN) achieved impressive success in semantic segmentation tasks. However, challenges such as the class imbalance and the uncertainty in the pixel-labeling process are not completely addressed. As such, we present a new approach that calculates a weight for each pixel considering its class and uncertainty during the labeling process. The pixel-wise weights are used during training to increase or decrease the importance of the pixels. Experimental results show that the proposed approach leads to significant improvements in three challenging segmentation tasks in comparison to baseline methods. It was also proved to be more invariant to noise. The approach presented here may be used within a wide range of semantic segmentation methods to improve their robustness.Comment: 15 pages, 9 figures, 3 table

Efeito de meios diluidores na congelabilidade do semen canino/ Effect of diluting media on canine semen freezability

Este estudo teve como objetivo avaliar a eficácia de dois meios diluentes de congelação, para sêmen canino. Para tanto, foram utilizados 3 machos, adultos, de diferentes raças, com idades entre 2 a 5 anos e fertilidade comprovada. Realizaram-se 4 colheitas de sêmen de cada animal, pelo método de manipulação digital do bulbo peniano, priorizando a segunda fração do ejaculado. As amostras colhidas foram divididas em 2 grupos, com concentração de 80 x 106 espermatozoides por mL. As amostras foram centrifugadas a 600g por 10 minutos e em seguida, o pellet foi ressuspendido em meio de congelação. No grupo 1, foram diluídas em meio de TRIS-gema e no grupo 2, diluídas em meio de congelação comercial Botudog® (Botupharma Biotecnologia Animal). As amostras foram envasadas em palhetas de 0,25 mL na concentração de 40x106 espermatozoides viáveis. Em seguida, as amostras permaneceram por 1 hora em estabilização a 5ºC. Logo após, transferidas para o vapor de nitrogênio durante 20 minutos, e por fim, mergulhadas em nitrogênio e armazenadas em botijão criogênico. As palhetas foram descongeladas a 46ºC por 15 segundos e avaliados os parâmetros de cinética espermática, integridade de membrana plasmática e acrossomal (IMPA, %). Os parâmetros de motilidade total (%), motilidade progressiva (%), velocidade linear progressiva (VSL; µm/s), velocidade média da trajetória (VAP; µm/s), linearidade (%), percentagem de espermatozoides rápidos (%), integridade de membrana plasmática e acrossomal avaliados por citometria de fluxo foram superiores no grupo 2 (TRIS-gema). Desta forma, concluímos que o protocolo de congelação de sêmen canino, utilizando o diluente Botudog® apresenta melhores parâmetros de cinética e viabilidade espermática pós descongelação, quando comparados ao meio TRIS-gema

Perfil epidemiológico das intoxicações exógenas no município de Moreno-PE no período de 2012 a 2015

Objetivou-se descrever as características do perfil epidemiológico das intoxicações exógenas, no Município de Moreno, Estado de Pernambuco, no período de 2012 a 2015. Foi realizado um estudo epidemiológico do tipo descritivo, onde foram analisadas a faixa etária, sexo, tipo de agente tóxico, utilização de agrotóxicos e motivo de exposição dos indivíduos acometidos pelas intoxicações exógenas registradas no Sistema de Informação de Agravos de Notificação (SINAN). Foram notificados 109 casos de intoxicação exógena no período de 2012 a 2015, sendo as maiores frequências, encontradas em adultos (51,1%), e os principais agentes tóxicos corresponderam aos medicamentos (41,3%) e agrotóxicos agrícolas (12%). Em 94,5% dos casos, o agrotóxico utilizado não foi informado. Dos 109 casos de intoxicação exógena, 37 (33,9%) ocorreram pela tentativa de suicídio. Os dados analisados permitem concluir que o quantitativo de dados em branco, nas fichas de notificação dificulta o desenvolvimento de estratégias de prevenção das intoxicações pela Vigilância em Saúde, bem como a instituição de tratamentos específicos para os pacientes intoxicados pela Atenção Primária a Saúde

Incidência e Estudo Morfológico de Pontes Miocárdicas no Estado do Ceará: Um Estudo Cadavérico

Resumo Fundamento As pontes miocárdicas (PM) são anomalias anatômicas com possíveis repercussões clínicas, e, portanto, seu entendimento merece atenção. Objetivo Para determinar a prevalência e caracterizar a PM em corações humanos do estado do Ceará. Métodos: Foram usados cinquenta corações de cadáveres humanos adultos da Faculdade de Medicina da Universidade Federal do Ceará, Brasil. Os corações foram dissecados para identificar PMs que passam sobre parte da artéria coronária. O segmento da artéria (proximal, médio e distal) com a ponte foi identificado. O diâmetro externo da artéria nos pontos proximal e distal da PM foi medido. O comprimento e a espessura da PM também foram medidos com um calibre eletrônico. O índice de massa muscular (IMM) da PM foi calculado como o produto do comprimento pela espessura expresso em milímetros. O nível de significância adotado para a análise estatística foi 5%. Resultados A PM foi confirmada em 40% da amostra. Aproximadamente um terço da amostra tinha apenas 1 PM. A PM foi encontrada mais frequentemente sobre o ramo interventricular anterior da artéria coronária esquerda (59,25%, p = 0,02), e sua prevalência em outros ramos foi muito mais baixa (22,23%). Os segmentos das artérias mais afetados foram o superior (44,44%) e o médio (40,74%). O diâmetro médio das artérias proximais em relação à PM foi de 2,38 ± 0,97 mm (intervalo = 0,78 - 5,15 mm), e o diâmetro distal da PM foi de 1,71 ± 0,75 mm (intervalo = 0,42 - 3,58 mm). O comprimento foi medido como média = 8,55 ± 5,27 mm, e a espessura média foi de 0,89 ± 0,33 mm. Conclusão A alta prevalência de PM tem mais probabilidade de afetar o sistema da artéria coronária esquerda com IMM maior do que outros ramos afetados

Importância dos acidentes com materiais perfurocortantes em trabalhadores de saúde no Brasil: uma análise situacional

O objetivo deste artigo foi discutir a importância dos acidentes com materiais perfurocortantes, abrangendo os trabalhadores de saúde no Brasil, pois os acidentes com materiais perfurocortantes indubitavelmente destacam-se entre os agravos sofridos por profissionais da área de saúde. Os trabalhadores da saúde estão expostos a mais riscos, de tal agravo, devido à constante manipulação de materiais perfurocortantes, sua longa e exaustiva rotina de trabalho e, às vezes, a não adesão às medidas profiláticas recomendadas, como o uso de Equipamentos de Proteção Individual (EPI). Além das lesões diretas ocasionadas, há também o maior risco de transmissão de patógenos que possuem o sangue como via de transmissão, tais como os vírus das hepatites B e C e o Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV). É notada em todas as categorias profissionais, que manuseiam tais produtos, a baixa percepção dos riscos vindos dos acidentes e a baixa utilização de equipamentos de proteção. Nos estudos existentes, prevalece a ocorrência de acidentes após a utilização do material, durante o momento de transporte, descarte e limpeza. A adoção de condutas pós-acidente não supera as garantias de efetividade fornecidas pela conduta pré-exposição. É de suma importância a notificação correta, e imediata, da ocorrência de tais agravos nos sistemas adequados, bem como a realização de ações que promovem Educação em Saúde para os profissionais atuantes, visando à redução de riscos ocupacionais e uma melhor promoção de saúde para os profissionais expostos

The genomes of two key bumblebee species with primitive eusocial organization

Background: The shift from solitary to social behavior is one of the major evolutionary transitions. Primitively eusocial bumblebees are uniquely placed to illuminate the evolution of highly eusocial insect societies. Bumblebees are also invaluable natural and agricultural pollinators, and there is widespread concern over recent population declines in some species. High-quality genomic data will inform key aspects of bumblebee biology, including susceptibility to implicated population viability threats. Results: We report the high quality draft genome sequences of Bombus terrestris and Bombus impatiens, two ecologically dominant bumblebees and widely utilized study species. Comparing these new genomes to those of the highly eusocial honeybee Apis mellifera and other Hymenoptera, we identify deeply conserved similarities, as well as novelties key to the biology of these organisms. Some honeybee genome features thought to underpin advanced eusociality are also present in bumblebees, indicating an earlier evolution in the bee lineage. Xenobiotic detoxification and immune genes are similarly depauperate in bumblebees and honeybees, and multiple categories of genes linked to social organization, including development and behavior, show high conservation. Key differences identified include a bias in bumblebee chemoreception towards gustation from olfaction, and striking differences in microRNAs, potentially responsible for gene regulation underlying social and other traits. Conclusions: These two bumblebee genomes provide a foundation for post-genomic research on these key pollinators and insect societies. Overall, gene repertoires suggest that the route to advanced eusociality in bees was mediated by many small changes in many genes and processes, and not by notable expansion or depauperation

Mitochondrial physiology

As the knowledge base and importance of mitochondrial physiology to evolution, health and disease expands, the necessity for harmonizing the terminology concerning mitochondrial respiratory states and rates has become increasingly apparent. The chemiosmotic theory establishes the mechanism of energy transformation and coupling in oxidative phosphorylation. The unifying concept of the protonmotive force provides the framework for developing a consistent theoretical foundation of mitochondrial physiology and bioenergetics. We follow the latest SI guidelines and those of the International Union of Pure and Applied Chemistry (IUPAC) on terminology in physical chemistry, extended by considerations of open systems and thermodynamics of irreversible processes. The concept-driven constructive terminology incorporates the meaning of each quantity and aligns concepts and symbols with the nomenclature of classical bioenergetics. We endeavour to provide a balanced view of mitochondrial respiratory control and a critical discussion on reporting data of mitochondrial respiration in terms of metabolic flows and fluxes. Uniform standards for evaluation of respiratory states and rates will ultimately contribute to reproducibility between laboratories and thus support the development of data repositories of mitochondrial respiratory function in species, tissues, and cells. Clarity of concept and consistency of nomenclature facilitate effective transdisciplinary communication, education, and ultimately further discovery