Extracting Conflict-free Information from Multi-labeled Trees

A multi-labeled tree, or MUL-tree, is a phylogenetic tree where two or more leaves share a label, e.g., a species name. A MUL-tree can imply multiple conflicting phylogenetic relationships for the same set of taxa, but can also contain conflict-free information that is of interest and yet is not obvious. We define the information content of a MUL-tree T as the set of all conflict-free quartet topologies implied by T, and define the maximal reduced form of T as the smallest tree that can be obtained from T by pruning leaves and contracting edges while retaining the same information content. We show that any two MUL-trees with the same information content exhibit the same reduced form. This introduces an equivalence relation in MUL-trees with potential applications to comparing MUL-trees. We present an efficient algorithm to reduce a MUL-tree to its maximally reduced form and evaluate its performance on empirical datasets in terms of both quality of the reduced tree and the degree of data reduction achieved.Comment: Submitted in Workshop on Algorithms in Bioinformatics 2012 (http://algo12.fri.uni-lj.si/?file=wabi

Slope and Roughness Statistics of the Northern Gulf of Mexico Seafloor With Some Oceanographic Implications

We analyzed 11 cross-slope and six along-slope bathymetric profiles over the continental slope of the northern Gulf of Mexico using statistical and time series techniques. Linear regressions account for over 93% of the water depth variability in nine north-south profiles; the remaining profiles follow quadratic polynomials accounting for over 92% of the variability. Seafloor gradients from the linear fits are generally ≤1°, but local gradients can reach ≅16° near the Sigsbee Escarpment (SE), which is smaller than previously documented. Seafloor roughness elements reach 13-300 m, with most \u3c100m. Such rough bottoms could affect waves with wavelengths of tens of kilometers but not waves of hundreds of kilometers. Water depth power spectra are red (having the most energy at scales ≤10 km) and exhibit a k-2 dependence. Power spectra of short-scale gradients are near constant at scales \u3e0.02 cpkm, implying a white noise process, and overall, these spectra exhibit an exponential dependence. Oceanographically, the slopes are large enough for topographic β-effects to dominate over the planetary β-effect, which allows approximating the topographic Rossby waves (TRWs) dispersion in terms of the Brunt-Vaisala frequency and bottom gradients. The steep SE can sustain minimum periods of ~18 d, which agrees with observed periods. Bottom trapping caused by stratification should be effective only for short waves, but observations suggest that bottom trapping is independent of wavelength. This discrepancy can be explained by the fact that the Gulf of Mexico can be approximated as a two-layer ocean, and TRWs are bottom trapped regardless of wavelength. The critical frequency and slope show that only diurnal and inertial frequencies (at this latitude) could be inducing strong vertical mixing on the study area. The initial conjecture that cyclonic eddies with diameters of 40-150 km are generated by flow-topography interaction was not upheld because the resonance conditions are not met. Finally, the analysis reveals that fluids inside basins cannot escape

Representación política y responsiveness en Brasil contemporáneo

La representación política, a lo largo del tiempo, ha sido ejercida por representantes elegidos que componen los partidos políticos. De este modo, la vinculación con los electores constituye un desafío cada vez más importante. Bajo esta perspectiva, este artículo tiene como objetivo realizar una comparación entre los intereses de los representantes y las demandas de los representados a principios del siglo XXI en Brasil. Trataremos de contestar a la siguiente pregunta de investigación: ¿son convergentes las demandas de la ciudadanía y los intereses de los representantes en el Congreso Nacional en Brasil? Para contestar a esta pregunta analizaremos los datos de las encuestas del Proyecto de Elites Parlamentarias de la Universidad de Salamanca y de la Cooperación Latinobarómetro, para dos puntos temporales, 2005 y 2010. Buscaremos comparar las actuaciones de los representantes democráticamente elegidos con las opiniones de los electores. Por lo tanto, los principales objetivos del análisis son percibir si existe responsiveness en la actuación de los representantes, es decir, sincronización entre los intereses de estos representantes y las demandas de los representados, además de observar en cuáles aspectos dicha sincronización se presenta de forma más contundente

Coenzyme Q10 deficiencies: pathways in yeast and humans.

Coenzyme Q (ubiquinone or CoQ) is an essential lipid that plays a role in mitochondrial respiratory electron transport and serves as an important antioxidant. In human and yeast cells, CoQ synthesis derives from aromatic ring precursors and the isoprene biosynthetic pathway. Saccharomyces cerevisiae coq mutants provide a powerful model for our understanding of CoQ biosynthesis. This review focusses on the biosynthesis of CoQ in yeast and the relevance of this model to CoQ biosynthesis in human cells. The COQ1-COQ11 yeast genes are required for efficient biosynthesis of yeast CoQ. Expression of human homologs of yeast COQ1-COQ10 genes restore CoQ biosynthesis in the corresponding yeast coq mutants, indicating profound functional conservation. Thus, yeast provides a simple yet effective model to investigate and define the function and possible pathology of human COQ (yeast or human gene involved in CoQ biosynthesis) gene polymorphisms and mutations. Biosynthesis of CoQ in yeast and human cells depends on high molecular mass multisubunit complexes consisting of several of the COQ gene products, as well as CoQ itself and CoQ intermediates. The CoQ synthome in yeast or Complex Q in human cells, is essential for de novo biosynthesis of CoQ. Although some human CoQ deficiencies respond to dietary supplementation with CoQ, in general the uptake and assimilation of this very hydrophobic lipid is inefficient. Simple natural products may serve as alternate ring precursors in CoQ biosynthesis in both yeast and human cells, and these compounds may act to enhance biosynthesis of CoQ or may bypass certain deficient steps in the CoQ biosynthetic pathway

Co-disseny d’un espai d’aprenentatge a l’escola Lluís Millet

Postgrau Disseny d’Espais d’Aprenentatge, Facultat d’Educació. Curs: 2021-2022, Tutor: Guillermo Bautista[cat] A continuació s’exposa el Treball Final de Postgrau, un document en què es mostra el prototip de la renovació d’un espai educatiu com a cloenda d’un procés de reflexió, ideació, treball en equip i anàlisi del propi espai, de les seves possibilitats i necessitats. Tot això s’ha pogut realitzar gràcies a la investigació, les lectures i les dinàmiques i activitats establertes en relació amb el Postgrau de Disseny d’Espais d’Aprenentatge. ‘’Vivim en una societat en constant canvi, en un món que ja no és el mateix que fa unes poques dècades; sembla obvi que no podem continuar demanant a l'escola que faci el mateix que feia. Hem de donar una resposta actualitzada a la pregunta com eduquem? Ens hem de plantejar quin és l'objectiu de l'educació; què li demanem a l'escola; quin sistema educatiu necessita el segle XXI’’ (Generalitat de Catalunya Departament d’Educació, 2022). El canvi que s’ha vist en l’educació durant els últims anys és notori. Estem deixant enrere un sistema que ja no dona resposta a les necessitats de l’alumnat. En l’actualitat som més conscients de la repercussió que té la concepció de l’espai en el procés d’ensenyament-aprenentatge. I és que no és un factor que hem de deixar a la sort, sinó que tot l’equip docent ha de reflexionar sobre quin és el millor ambient per al nostre alumnat, pel seu benestar i per la seva implicació i participació en les propostes d’aprenentatge. Des d’aquest punt de vista, és imprescindible que l’espai educatiu sigui familiar i agradable per a l’infant, fent referència al terme d’hogarització, així com que busqui una estètica acurada. Aquest fet, però, no és quelcom nou, sinó que ja fa molts anys, pedagogs com Montessori, Rousseau o Pestalozzi van impulsar un canvi de paradigma amb l’anomenada Escola Nova, que va néixer a finals del segle XIX. El procés que es porta a terme per a l’elaboració del prototip és un procés de co-disseny entre totes les persones que habiten aquest espai

Un trastorno mental tanto en su inicio como camino a su rehabilitación depende de factores personales y ambientales

Treball Final de Màster Universitari en Rehabilitació Psicosocial en Salut Mental Comunitària. Codi: SAX013. Curs acadèmic: 2021-2022El objetivo principal del trabajo es desarrollar un Plan Individualizado de Rehabilitación (PIR) por y para la persona usuaria y mostrar cómo tanto los factores personales como los ambientales son una pieza clave en el inicio de la rehabilitación psicosocial como en su recuperación

A gestão de políticas públicas sociais na periferia urbana. Uma tentativa para estabelecer um modelo explicativo

This analysis investigates the performance of social partners in fulfilling the economic and social rights of individuals living in urban peripheries in large Brazilian cities in the early twenty-first century. To analyze the changes in the scenario of these rights between 2000 and 2010 in urban peripheral neighborhoods, three case studies were carried out in suburbs of Salvador and Recife. The research was conducted by observing the performance of the three key social stakeholders -societal organizations, the State and the market- in policies and projects for the enjoyment of economic and social rights by locals. Thus, based on the tri-sector partnership model, this study proposes a new variation in the performance of these three actors to favour increased enjoyment of economic and social rights in urban neighborhoods through public policies: the Community tri-sector partnership.El presente análisis investiga la actuación de los agentes sociales en el disfrute de los derechos económicos y sociales en las periferias urbanas de grandes ciudades brasileñas a principios del siglo XXI. Para hacer el análisis de los cambios en el escenario del disfrute de estos derechos entre los años 2000 y 2010 en las periferias urbanas se han llevado a cabo tres estudios de caso en barrios periféricos de las ciudades de Salvador y Recife. La investigación ha sido realizada por medio de la observación de la actuación de los tres actores sociales fundamentales, es decir, las organizaciones de la sociedad, el Estado y el mercado, en políticas y proyectos en favor del disfrute de los derechos económicos y sociales por la población local. Por lo tanto, a partir del modelo de la alianza trisectorial, este estudio propone una nueva variación de la actuación de estos tres actores que favorece el incremento del disfrute de los derechos económicos y sociales en periferias urbanas por medio de las políticas públicas locales: la alianza trisectorial comunitaria.Essa análise trata do desempenho dos parceiros sociais em uma situação de gozo dos direitos econômicos e sociais em periferias urbanas das grandes cidades brasileiras no início do século XXI. Para analisar as mudanças no cenário de gozo desses direitos entre 2000 e 2010 em bairros urbanos foram realizados três estudos de caso nos subúrbios das cidades de Salvador e Recife. A pesquisa foi feita através da observação do desempenho de três atores sociais fundamentais, organizações da sociedade, o Estado e o mercado, em políticas e projetos em favor do gozo dos direitos econômicos e sociais por moradores destas áreas. Assim, a partir da proposta do modelo de parceria tri-setorial, este estudo propõe uma nova variação do desempenho desses três atores que favoreça o aumento do gozo dos direitos econômicos e sociais em bairros urbanos periféricos através de políticas públicas: a parceria comunitária tri-sector

Centro de conservación y rehabilitación de flora y fauna en Moyobamba

La presente investigación trata la problemática de la fragmentación del ecosistema natural en la ciudad de Moyobamba, ubicado en el Distrito y Provincia de Moyobamba, Región de San Martin, en donde los espacios naturales característicos de esta ciudad en la selva, están siendo afectados por la constante actividad humana, como la agricultura, actividades extractivas, construcción de nuevas vías vehiculares y ocupaciones ilegales, lo que genera la desaparición de especies de flora y fauna. Por otro lado, se puede reconocer que el crecimiento urbano en esta localidad, posee un ritmo de crecimiento en constante proceso de expansión, la cual se desarrolla de forma horizontal, lo que produce la ocupación de áreas no destinadas a urbanizaciones, como zonas de recuperación y conservación, planteadas por la Municipalidad del Distrito. Además, la falta de cumplimiento de la normativa de planificación por parte de los pobladores, influye de igual manera al crecimiento caótico. Es por ello que se plantea como objetivo de estudio, determinar la relación entre el crecimiento urbano y la fragmentación del ecosistema natural de esta ciudad. El método de investigación empleado es descriptivo correlacional, de enfoque cuantitativo y diseño transeccional. Para el desarrollo de la medición, se ha empleado el instrumento de la encuesta, la cual fue realizada a una muestra de 142 habitantes del sector 10 de la ciudad de Moyobamba, en donde se localiza parte de esta problemática. De este modo, los resultados de la investigación, posibilitaron el conocimiento de que si existe una relación entre el crecimiento urbano y la fragmentación del ecosistema natural en la ciudad de Moyobamba, concluyendo que las diversas formas de crecimiento y las características de esta ciudad, están relacionadas a los factores que originan la fragmentación de este ecosistema, por lo que se puede afirmar que esta problemática está relacionada a la degradación de los espacios naturales, y la disminución de la flora y fauna en esta ciudad

Predicción de las conductas disruptivas a partir del aburrimiento y la satisfacción con la educación física

The aim of the present study was to analyze the psychometric properties of the Questionnaire for Disruptive Behavior in Physical Education (CCD-EF) in the Mexican context. A non-experimental, cross-sectional, correlational-causal study was designed in which 378 girls (M = 13.99; SD = .30) and 375 boys (M = 14.02; SD = .33), all high school students participated. The psychometric properties of the scale were analyzed by means of different exploratory and confirmatory analyzes that demonstrate that this instrument with four correlated factors, and as higher order models, is valid, reliable, and invariant as a function of sex. A regression model with latent variables showed a positive and significant prediction of boredom with Physical Education on disruptive behaviors, finding that this prediction is higher in boys than in girls. The CCDEF has proven to be a reliable and valid instrument to use with Mexican high school students.El objetivo del presente estudio fue analizar las propiedades psicométricas del Cuestionario de Conducta Disruptiva en Educación Física (CCD-EF) en el contexto mexicano. Se diseñó un estudio no experimental, transversal, correlacional- causal, en el que participaron 378 niñas (M = 13.99; DT = .30) y 375 niños (M = 14.02; DT = .33), todos estudiantes de secundaria. Las propiedades psicométricas de la escala fueron analizadas mediante diferentes análisis exploratorios y confirmatorios que demuestran que este instrumento con cuatro factores correlacionados, y como modelos de orden superior, es válido, confiable e invariante en función del sexo. Un modelo de regresión con variables latentes mostró una predicción positiva y significativa del aburrimiento con la Educación Física sobre las conductas disruptivas, encontrando que esta predicción es mayor en niños que en niñas. El CCD-EF ha demostrado ser un instrumento confiable y válido para utilizar con estudiantes mexicanos de secundaria.Secretariat of Public Education of Mexico (identification number: 431/569/E