Structures of T7 bacteriophage portal and tail suggest a viral DNA retention and ejection mechanism

Double-stranded DNA bacteriophages package their genome at high pressure inside a procapsid through the portal, an oligomeric ring protein located at a unique capsid vertex. Once the DNA has been packaged, the tail components assemble on the portal to render the mature infective virion. The tail tightly seals the ejection conduit until infection, when its interaction with the host membrane triggers the opening of the channel and the viral genome is delivered to the host cell. Using high-resolution cryo-electron microscopy and X-ray crystallography, here we describe various structures of the T7 bacteriophage portal and fiber-less tail complex, which suggest a possible mechanism for DNA retention and ejection: a portal closed conformation temporarily retains the genome before the tail is assembled, whereas an open portal is found in the tail. Moreover, a fold including a seven-bladed β-propeller domain is described for the nozzle tail protein.This work was supported by the Ministry of Science, Innovation and Universities of Spain, grants BFU 2014-54181 (to J.L.C.), BFU 2014-53550-P and BFU2017-83720-P (to M.C.), and contracts SEV-2013-0347 (to A.C.) and RYC-2011-09071 (to C.M.). We acknowledge institutional funding through the Spanish Government Centres and Units of Excellence Severo Ochoa and Maria de Maeztu awards to IRB Barcelona (SEV-2015-0500) and IBMB Structural Biology Unit (MDM-2014-0435), respectively, and from the CERCA Programme of the Catalan Government to the IRB Barcelona. This work has also been supported by the European Commission, Horizon 2020 program through iNEXT project (grant number 653706)

Innovación y estrategias de intervención en acoso escolar

Los problemas de convivencia escolar, violencia escolar, bullying y cyberbullying, en los centros españoles son una realidad y, por tanto, es necesario que los futuros docentes cuenten con estrategias específicas para el abordaje de estas situaciones cuando se enfrenten a la realidad de las aulas. En este manual, profesionales del área de la convivencia escolar presentan las actuaciones, programas y herramientas disponibles que en estos momentos se están poniendo en práctica en los centros escolares con resultados positivos. Así, se pretende ampliar el conocimiento teórico-práctico en el ámbito de la convivencia, gestión de conflictos y violencia escolar.EducaciónPsicologí

Docencia orientada a la profesión. Experiencias del equipo docente de la Universidad Politécnica de Cartagena (UPCT)

[SPA]La adquisición por el estudiante de competencias profesionales, entendidas como conjuntos de conocimiento, actitudes, habilidades y destrezas que capacitan a una persona para el desempeño eficiente de una actividad profesional, requiere la incorporación de actividades formativas que permitan desarrollar y evaluar dichas competencias y que conecten al estudiante con lo que será su futura profesión, favoreciendo, además, su motivación. Las empresas y las asociaciones profesionales pueden jugar un papel relevante en el desarrollo de estas actividades y participar, de forma activa, en la orientación de la enseñanza hacia el desarrollo de competencias conectadas con los perfiles profesionales propios de cada título. Esta comunicación muestra los objetivos a corto, medio y largo plazo del Equipo Docente: Docencia Orientada a la Profesión y el trabajo desarrollado por el mismo durante el presente curso académico. Se describe la página web desarrollada por el Equipo y destinada a mostrar, entre otros documentos, actividades docentes orientadas a la profesión en la UPCT. Se analizan los primeros resultados de la puesta en marcha de esta iniciativa y se ofrecen recomendaciones para las asignaturas de materias básicas, cuya orientación profesional puede parecer especialmente compleja. [ENG]The acquisition of professional skills by students, understood as sets of knowledge, attitudes, skills and abilities that enable a person to the efficient performance of a professional activity, requires the inclusion of training activities in order to develop and evaluate those skills and to connect students with what will be their future profession, also trying to encourage motivation. Companies and professional associations can play an important role in the development of these activities and they can participate actively in the orientation of education towards the development of skills connected with the profiles of each career. This communication shows the short, medium and long term objectives of the Teaching Team: Team Career-Oriented Training in the Technical University of Cartagena (UPCT), and it also shows the work done by the team during the current academic year. A web page has been developed by the team and it has been designed to show, among other documents, teaching activities oriented to the profession in the UPCT. We analyze the first results of this initiative, and recommendations are offered for the basic field subjects, whose career-oriented training can look particularly complex.Campus Mare Nostrum, Universidad Politécnica de Cartagena, Universidad de Murcia, Región de Murci

Dibujo para grabado: Pre-producción, lenguajes gráficos y técnicas experimentales de construcción de la imagen para el grabado, las técnicas de estampación e impresión y el libro-arte

Proyecto de innovación docente pensado para canalizar la elaboración diversa de material docente y recursos didácticos que faciliten la práctica autónoma del estudiante y su aprendizaje del grabado, las técnicas de estampación, la edición y la creación del libro-arte fuera del aula, en un escenario de enseñanza semi-presencial. Se trata de apostar por fomentar la práctica artística independiente del alumnado. Para ello se propone reforzar la fase de pre-producción o fase de planificación aprovechar las posibilidades expresivas que ofrece el dibujo pensado para grabado, explorar diferentes lenguajes gráficos, adquirir vocabulario visual y generar paletas o bibliotecas de recursos gráfico-plásticos. El proyecto se entiende como espacio de diálogo e intercambio de conocimiento

Evaluación de la enseñanza a través de la guía docente en la UPCT

[SPA]Este trabajo presenta una propuesta de metodología para la evaluación de guías docentes basada en un conjunto de tres criterios principales (utilidad, coherencia e idoneidad), once subcriterios y una serie de indicadores cuyos valores se obtienen a través de cuestionarios dirigidos a centros, departamentos, estudiantes y profesorado. Los cuestionarios parten del modelo de Guía Docente adoptado por la UPCT y contemplan todos los apartados de la misma. El método propuesto puede aplicarse también para mejorar los programas de evaluación del profesorado, pues aporta las evidencias que se necesitan para valorar la labor de planificación desarrollada por el mismo, la cual se plasma en la guía docente. [ENG]This paper presents a methodological proposal for the evaluation of teaching guides based on three main criteria, i.e. usefulness, consistency, and suitability, and eleven subcriteria. It is also based on different indicators obtained through questionnaires aimed at Educational Centres, Departments, Students and Professors. These questionnnaires have been prepared from the teaching guide model adopted by the Technical University of Cartagena (UPCT), and considering all the sections included in that guide. The proposed methodology can be also used to improve the teaching staff evaluation program, because of the inclusion of planning task carried out by the professor, an aspect considered in the teaching guide.Campus Mare Nostrum, Universidad Politécnica de Cartagena, Universidad de Murcia, Región de Murcia

Machine Learning-Based Analysis in the Management of Iatrogenic Bile Duct Injury During Cholecystectomy: a Nationwide Multicenter Study

Background Iatrogenic bile duct injury (IBDI) is a challenging surgical complication. IBDI management can be guided by artificial intelligence models. Our study identified the factors associated with successful initial repair of IBDI and predicted the success of definitive repair based on patient risk levels. Methods This is a retrospective multi-institution cohort of patients with IBDI after cholecystectomy conducted between 1990 and 2020. We implemented a decision tree analysis to determine the factors that contribute to successful initial repair and developed a risk-scoring model based on the Comprehensive Complication Index. Results We analyzed 748 patients across 22 hospitals. Our decision tree model was 82.8% accurate in predicting the success of the initial repair. Non-type E (p < 0.01), treatment in specialized centers (p < 0.01), and surgical repair (p < 0.001) were associated with better prognosis. The risk-scoring model was 82.3% (79.0-85.3%, 95% confidence interval [CI]) and 71.7% (63.8-78.7%, 95% CI) accurate in predicting success in the development and validation cohorts, respectively. Surgical repair, successful initial repair, and repair between 2 and 6 weeks were associated with better outcomes. Discussion Machine learning algorithms for IBDI are a novel tool may help to improve the decision-making process and guide management of these patients

Development and validation of a clinical score to estimate progression to severe or critical state in Covid-19 pneumonia hospitalized patients

The prognosis of a patient with Covid-19 pneumonia is uncertain. Our objective was to establish a predictive model of disease progression to facilitate early decision-making. A retrospective study was performed of patients admitted with Covid-19 pneumonia, classified as severe (admission to the intensive care unit, mechanic invasive ventilation, or death) or non-severe. A predictive model based on clinical, analytical, and radiological parameters was built. The probability of progression to severe disease was estimated by logistic regression analysis. Calibration and discrimination (receiver operating characteristics curves and AUC) were assessed to determine model performance. During the study period 1,152 patients presented with Covid-19 infection, of whom 229 (19.9%) were admitted for pneumonia. During hospitalization, 51 (22.3%) progressed to severe disease, of whom 26 required ICU care (11.4); 17 (7.4%) underwent invasive mechanical ventilation, and 32 (14%) died of any cause. Five predictors determined within 24 hours of admission were identified: Diabetes, Age, Lymphocyte count, SaO2, and pH (DALSH score). The prediction model showed a good clinical performance, including discrimination (AUC 0.87 CI 0.81, 0.92) and calibration (Brier score = 0.11). In total, 0%, 12%, and 50% of patients with severity risk scores ≤5%, 6-25%, and >25% exhibited disease progression, respectively. A simple risk score based on five factors predicts disease progression and facilitates early decision-making according to prognosis.Carlos III Health Institute, Spain, Ministry of Economy and Competitiveness (SPAIN) and the European Regional Development Fund (FEDER)Instituto de Salud Carlos II

Referencias para la actividad docente en la UPCT y glosario de términos EEES

Continuando con el trabajo de los equipos docentes se ha realizado este libro en el curso 2011/2012 como resultado de la maduración de los dos años anteriores, en los que este equipo ha realizado el libro “Manual de elaboración de guías docentes adaptadas al EEES” en 2010, la participación en el I Congreso Internacional de Innovación Docente, en julio de 2011 y la realización de un capítulo del libro “Equipos docentes: una nueva apuesta en el EEES” en 2011. El reconocimiento de la calidad de las guías docentes realizadas por el profesorado de nuestra universidad, y enviadas a ANECA dentro del programa piloto MONITOR viene expresamente en el informe global de seguimiento recibido en noviembre de 2011 en el que textualmente comenta “Las guías docentes sólo se pueden calificar de excelentes”

Entre artistas y restauradorӕs. Nuevos formatos de interacción e intercambio de conocimiento

Este proyecto ha tenido como objetivo la consolidación de una red de cooperación horizontal e intercambio interdisciplinar, internivelar, interdepartamental e interfacultativa entre artistas y conservadoræs-restauradoræs, así como la exploración de nuevas formas de interacción para generar conocimiento. Esta red conecta entre sí a los departamentos de la Facultad de Bellas Artes de la UCM (Dibujo y Grabado; Diseño e Imagen; y Pintura y Conservación-Restauración), al tiempo que fomenta interacciones con estudiantes y docentes de departamentos de arte y conservación-restauración de otras universidades públicas y privadas como son la Universidad de la Laguna, la Universidad Politécnica de Madrid, la Universidad Francisco de Vitoria y la Universidad Antonio Nebrija. Así mismo, incorpora a la red un organismo externo al ámbito de la universidad y vinculado al ámbito profesional de la práctica artística, como es la Asociación Cultural Atelier Solar. El proyecto ha abarcado la realización de tres encuentros, un curso, una mesa redonda, la dirección de TFGs, la visita a estudios de artistas y el desarrollo de una investigación en torno a nuevos formatos de interacción entre conservadoræs-restauradoræs y artistas. Esta memoria recoge los objetivos propuestos y evalúa los alcanzados en base a una serie de indicadores, describe la metodología utilizada en el proyecto, analiza las características del equipo de trabajo y expone las actividades desarrolladas durante el curso 2021-2022. Los Anexos incluyen documentación sobre las actividades desarrolladas e imágenes sobre los procesos de investigación

Treatment with tocilizumab or corticosteroids for COVID-19 patients with hyperinflammatory state: a multicentre cohort study (SAM-COVID-19)

Objectives: The objective of this study was to estimate the association between tocilizumab or corticosteroids and the risk of intubation or death in patients with coronavirus disease 19 (COVID-19) with a hyperinflammatory state according to clinical and laboratory parameters. Methods: A cohort study was performed in 60 Spanish hospitals including 778 patients with COVID-19 and clinical and laboratory data indicative of a hyperinflammatory state. Treatment was mainly with tocilizumab, an intermediate-high dose of corticosteroids (IHDC), a pulse dose of corticosteroids (PDC), combination therapy, or no treatment. Primary outcome was intubation or death; follow-up was 21 days. Propensity score-adjusted estimations using Cox regression (logistic regression if needed) were calculated. Propensity scores were used as confounders, matching variables and for the inverse probability of treatment weights (IPTWs). Results: In all, 88, 117, 78 and 151 patients treated with tocilizumab, IHDC, PDC, and combination therapy, respectively, were compared with 344 untreated patients. The primary endpoint occurred in 10 (11.4%), 27 (23.1%), 12 (15.4%), 40 (25.6%) and 69 (21.1%), respectively. The IPTW-based hazard ratios (odds ratio for combination therapy) for the primary endpoint were 0.32 (95%CI 0.22-0.47; p < 0.001) for tocilizumab, 0.82 (0.71-1.30; p 0.82) for IHDC, 0.61 (0.43-0.86; p 0.006) for PDC, and 1.17 (0.86-1.58; p 0.30) for combination therapy. Other applications of the propensity score provided similar results, but were not significant for PDC. Tocilizumab was also associated with lower hazard of death alone in IPTW analysis (0.07; 0.02-0.17; p < 0.001). Conclusions: Tocilizumab might be useful in COVID-19 patients with a hyperinflammatory state and should be prioritized for randomized trials in this situatio