Modélisation de l'écophysiologie de l'huître

Un modèle écophysiologique déterministe de la croissance, de la reproduction et des interactions entre le bivalve et son environnement estuarien a été élaboré pour l'huître japonaise Crassostrea gigas. Pour fonctionner, le modèle a besoin de la température de l'eau, des concentrations en matière en suspension, matière organique particulaire, matière minérale particulaire, chlorophylle-a, phéopigments, protéines, lipides et glucides particulaires. Les fonctions de filtration, consommation, ingestion, absorption et respiration ainsi que les efficacités de rétention, sélection et absorption sont modélisées à l'aide de variables endogènes (poids sec de l'animal, allocation d'énergie entre la croissance et la reproduction) et exogènes (température, quantité et qualité de la nourriture). Le modèle simule l'évolution temporelle de deux compartiments : somatique et réserves-gonades. L'énergie provenant de la nourriture absorbée est allouée au compartiment somatique jusqu'à un maximum de croissance somatique. Ce maximum décroît avec l'âge du bivalve et ne dépasse jamais 0,02 g.j−1.individu−1. L'énergie en excès est alors attribuée au compartiment réserves-gonades. Cette représentation permet d'identifier les périodes de stockage de réserves et de gamétogénèse ainsi qu'une bonne simulation de l'intensité des pontes. Le modèle tient compte d'une efficacité de sélection plus importante pour les microphytes que pour les particules détritiques. L'efficacité d'absorption a été représentée en fonction du pourcentage de matière organique dans la fraction ingérée afin de tenir compte de la dilution de la nourriture par les particules minérales. L'efficacité d'absorption des microalgues varie de 20 à 60 %, tandis que pour les particules organiques détritiques, le modèle simule des valeurs négatives pour tenir compte des pertes fécales métaboliques. Ces formulations permettent de suivre l'évolution temporelle des quantités de microphytes et de matières détritiques rejetées sous la forme de pseudofèces et de fèces

Temporal changes in community structure of tide pools following the “

The impact of the “Erika” oil spill on the tidal rock pool community, and particularly on two species of sea urchin (Paracentrotus lividus and Psammechinus miliaris), was investigated over a 3-year period, at Piriac-sur-Mer (Department of Loire-Atlantique, France, 47°21.6' N; 2°31.7' W). A dramatic increase in the abundance of two macroalgae Ulva sp. and Grateloupia doryphora occurred following a 100% mortality of sea urchins observed three weeks after the oil spill. The density of sea urchins and of other main herbivores, the periwinkle Littorina littorea and the trochid mollusks Gibbula umbilicalis and Gibbula pennantii, were monitored between January 2000 and March 2003. There was significant inverse relationship between the overall density of herbivores (sea urchins, periwinkles and trochid mollusks) and the percent cover of algae in the tidal pools. The first urchins in the tidal pools were observed two years after the oil spill and it took three years to reach sea urchin densities comparable to the reference value of 63 ind.m−2 obtained before the oil spill

Modélisation de l'affinage de l'huître

L'affinage traditionnel des huîtres creuses, pratiqué dans les claires ostréicoles de la façade Atlantique française, est soumis aux fluctuations des facteurs environnementaux. Un procédé d'affinage contrôlé en terme de matières organique et inorganique particulaires (MOP et MIP) et de température a été développé afin de réduire la variabilité de croissance de la chair des huîtres. Cet élevage intensif repose sur la production de la diatomée Skeletonema costatum, distribuée aux huîtres avec une concentration moyenne de 4–5 mg de MOP·L–1. Un modèle écophysiologique de l'huître Crassostrea gigas, simulant les croissances du soma et des réserves–gonades, a été appliqué aux conditions d'affinage contrôlé dans le but d'analyser les réponses du bivalve. Son élaboration a nécessité un retour à l'expérimentation. Deux fonctions d'alimentation ont été étudiées au laboratoire : la filtration et la production de pseudofèces, intervenant dans la régulation de l'ingestion. Les résultats, pour une température de 14 °C, et pour une gamme de MOP et de MIP variant respectivement de 4 à 18 mg·L–1 et de 15 à 55 mg·L–1, montrent que l'ingestion est régulée par la production de pseudofèces, la filtration ne présentant pas de variation significative (moyenne de 2,09 ± 0,11 L·h–1·g–1, avec un taux d'activité de 59%). Cette production de pseudofèces, qui engendre une augmentation de la fraction organique ingérée par le mécanisme de sélection pré-ingestive, permet de compenser la variabilité des concentrations en MIP. Des simulations ont permis d’analyser les effets négatifs de ce facteur environnemental sur la croissance du bivalve. Il apparaît alors que la ration utilisée en affinage contrôlé (4–5 mg de MOP.L–1) permet une croissance en chair sèche malgré des concentrations simulées atteignant 50 mg·L–1 de MIP. Lors de l'élaboration du modèle pour les conditions spécifiques à l'affinage contrôlé, la gamétogenèse est apparue comme un processus déterminant pour la répartition de l'énergie chez le bivalve

Comparison of loss on ignition and thermal analysis stepwise methods for determination of sedimentary organic matter.

1. Loss on ignition (LOI) is a widely used method to estimate organic matter (OM) in the sediment of marine and freshwater ecosystems. Thermogravimetric-differential thermal analysis (TG-DTA) of organic species provides information on thermal reactions, the amount and properties of clay structural water, organic species and carbonates. 2. The accuracy of LOI compared to TG-DTA was evaluated in 33 sediment samples from the Lagoon of Venice (Italy). 3. In all tests conducted with TG-DTA we measured the mass loss of OM and the loss of clay structural water (LCSW) on oxidized samples. The mass loss of OM at 350°C (TG-DTA 350 OM) and the total extraction of organic matter at 567°C (TEOM) calculated from the difference between natural state samples and oxidized samples highlight the presence of both thermally labile and thermally stable substances. 4. The grain size data of sediment samples from the Lagoon shows a variable distribution between slightly muddy sand and mud. Loss of clay structural water at 350°C (LCSW 350) and total extraction of clay structural water at 567°C (TECSW) both estimated by TG-DTA on oxidized samples, were found to correspond approximately to 6% and 10% respectively of the clay fraction (<4 µm). This percentage may be used to correct LOI measurements of OM in sediments with high clay content. 5. LOI 350 (loss on ignition at 350°C) and LOI 550 (loss on ignition at 550°C) proved to be ~80 % and ~200 % respectively of total extraction of mass loss at 350°C (TG-DTA 350 tot) and at 567°C (TEML) estimated by TG-DTA on natural samples, meaning that the LOI 550 value represents a significant overestimate. The difference between the LOI 550 and TEML values indicates that the mass loss excess (MLE) may be accounted for by losses due to breakdown of carbonates