Untangling buybacks vs. dividends in Europe and in the U.S.

The literature shows an increase in activity in share repurchases in the latest years in Europe and in the U.S., alongside a reappearance of dividends. This research reveals a surge in repurchases of 107% in Europe and of 55% in the U.S. for the 2001-18 period, whereas the fraction of dividends slightly increased 7 p.p. in Europe, to 91%, and 6 p.p. in the U.S., to 79%, in 2018. Although these are two forms of disbursing cash to shareholders, dividends tend to be more resilient and carry signaling power, whilst repurchases are more sporadic and their policy can vary without compromise. The focus is on ascertaining the significant drivers for repurchases and dividend payments. Hence, the main characteristics analysed are the Size, Cash Holdings, Investment Opportunities, Leverage Ratio, Profitability and Region. The majority proved to be significant across the models measuring the propensity to pay dividends and repurchase shares, and the natural logarithm of the amount of dividends and repurchases, mostly confirming the expected relationships.A literatura demostra um aumento na atividade de recompra de ações nos últimos anos na Europa e Estados Unidos, ao mesmo tempo que um reaparecimento de dividendos. Esta pesquisa revela um aumento da recompra de ações de 107% na Europa e 55% nos Estados Unidos entre 2001 e 2018, enquanto que os dividendos subiram ligeiramente, cerca de 7 p.p na Europa, atingindo 91%, e 6 p.p nos Estados Unidos, alcançando 79%, em 2018. Apesar estas serem duas formas de distribuir resultados aos acionistas, os dividendos tendem a ser mais resilientes e têm um maior poder de sinalização, enquanto que as recompras são mais esporádicas e a sua política pode variar sem compromisso. O objetivo é determinar indicadores que expliquem o comportamento da recompra de ações e pagamento de dividendos. Assim, as principais características analisadas são a Dimensão, Tesouraria, Oportunidades de Investimento, Rácio de dívida, Rentabilidade e Região. A maioria é significante em vários modelos medindo a propensão para pagar dividendos e recomprar ações, e o logaritmo do valor desses dividendos e recompras, a maioria confirmando a ligação esperada

Liver regeneration and tissue engineering

Tese de doutoramento em Farmácia (Biotecnologia Farmacêutica), apresentada à Universidade de Lisboa através da Faculdade de Farmácia, 2008Over 21 million people in the world are estimated to live with chronic liver disease, and about 800,000 expire annually, accordingly with WHO. Liver transplantation remains today the definitive treatment for end-stage liver failure. However, the gap between organ donation and the number of patients in the waiting list for a liver keeps widening. The shortage of organs has stimulated the research for alternatives in end-stage liver disease. Cell therapies with some degree of success are today a reality. Nevertheless, the goal of generating a whole liver in vitro remains elusive. The purpose of the work of this dissertation was to develop a new approach to liver tissue engineering that would allow the generation of significant mass tissue readily implantable and/or transplantable. Cell sources for tissue engineering applications are of vital importance. Our research focus on the use of hFL progenitor cells in combination with the liver bioscaffold and on a new promising source of fetal stem cells from amniotic fluid, in liver therapies and tissue engineering. In our work, we were able to create a novel acellular liver derived bioscaffold with preserved vascular network. This bioscaffold could be efficiently re-cellularized and considerable mass tissue, displaying some hepatic functions, was generated. It was also successfully transplanted to living hosts and perfused with blood. Another goal attained in this work was that the combination of hFL progenitor cells with the liver bioscaffold produced cell engraftment, expansion and differentiation of the hFL cells. hAFS cells also showed engraftment and integration in injured livers, representing a new alternative for in vivo cell therapies and liver regeneration. In conclusion, this doctoral dissertation clearly demonstrates the successful generation of 3D liver tissue with a novel acellular liver bioscaffold using different cell sources. This potentially represents a new hope for patients suffering of end-stage liver disease.A gravidade das doenças hepáticas terminais está directamente relacionada com o papel vital que o fígado desempenha na homeostase metabólica sistémica. A transplantação de órgãos permanece ainda hoje como o único tratamento definitivo para a doença hepática terminal. Devido à escassez de orgãos, novas alternativas têm sido investigadas na última década. Com o despontar da medicina regenerativa, a transplantação de células hepáticas adultas tem emergido como um opção terapêutica válida no tratamento de várias patologias hepáticas graves. No entanto, embora com algum sucesso, o efeito terapêutico diminui e desaparece ao fim de alguns meses. Os recentes avanços no conhecimento da biologia das células estaminais, nomeadamente na identificação e caracterização, trouxeram novas oportunidades de terapêuticas celulares com recurso a populações de células estaminais/progenitoras. A possibilidade de finalmente gerar um fígado totalmente in vitro passível de ser facilmente implantado ou transplantado, também aumentou. Neste trabalho, foi investigada a geração de um novo biomaterial derivado do fígado preservando intacta a sua rede vascular. Para tal, foram empregues algumas das técnicas de descelularização de tecidos, usadas na obtenção de matrizes naturais, e efectuada a optimização destes processos na descelularização de tecidos mais espessos e orgãos sólidos. O processo revelou-se eficaz quando soluções de descelularização foram perfundidas pelo sistema vascular do fígado em alternativa à simples agitação do órgão imerso nas soluções de descelularização e cujo princípio se baseia na difusão dos reagentes pelo órgão. O resultado foi a obtenção de uma nova matriz acelular derivada do fígado e que preserva o seu sistema vascular nativo. Esta matriz permite a perfusão de meio de cultura e de células através da rede vascular do órgão descelularizado, permitindo virtualmente atingir qualquer posição da espessa matriz 3D. As limitações de difusão de oxigénio e de nutrientes são assim ultrapassadas pela utilização da rede vascular nativa doorgão descelularizado com a geração de denso tecido 3D in vitro. Foi também efectuada a optimização do processo de re-celularização, através da perfusão das células com meio de cultura pela rede vascular do orgão descelularizado. A utilização de diferentes velocidades de perfusão da suspensão celular permitiu determinar as condições ideais para a re-celularização destas matrizes acelulares com diferentes tipos de células. Isto permitiu também gerar tecido 3D densamente re-celularizado e com expressão de marcadores hepáticos característicos.Para melhorar a geração de tecido hepático, foi investigado o uso de células progenitoras humanas obtidas a partir de fígados fetais em combinação com a matriz acelular. O uso destas células progenitoras constitui sem qualquer dúvida um recurso determinante na engenheria de tecidos do fígado e em terapias celulares. Ensaios preliminares revelaram que estas células progenitoras humanas cultivadas em discos de matriz acelular se estabeleceram, proliferaram e diferenciaram em células de linhagem hepática e biliar. Finalmente, foi investigado o uso de células estaminais humanas obtidas a partir do fluído amniótico em vários modelos de regeneração in vivo. As experiências confirmaram a natureza não tumorigénica destas células e demonstraram a sua integração e diferenciação em modelos de lesão muscular e de angiogénese. Adicionalmente, estas células demonstraram capacidade para se fixar em fígados danificados. A plasticidade exibida in vivo por estas células é notável e confirma o seu potencial em medicina regenerativa. Globalmente, nesta dissertação de doutoramento destaca-se a relevância de um novo método de descelularização de orgãos passível de gerar matrizes acelulares derivadas a partir do fígado com preservação de uma rede vascular funcional. A perfusão de meio de cultura e a geração de tecido 3D permite ultrapassar os problemas de difusão de oxigénio e de nutrientes. Por último, a utilização de células progenitoras humanas, obtidas a partir de fígados fetais em combinação com a matriz acelular, e de células estaminais humanas, derivadas a partir do fluído amniótico, apresentam potencialmente novas oportunidades na engenharia de tecidos do fígado e nas terapias celulares na doença hepática terminal.Fundação para a Ciência e Tecnologia (SFRH/BD/11802/2003

A systematic evaluation of deep learning methods for the prediction of drug synergy in cancer

One of the main obstacles to the successful treatment of cancer is the phenomenon of drug resistance. A common strategy to overcome resistance is the use of combination therapies. However, the space of possibilities is huge and efficient search strategies are required. Machine Learning (ML) can be a useful tool for the discovery of novel, clinically relevant anti-cancer drug combinations. In particular, deep learning (DL) has become a popular choice for modeling drug combination effects. Here, we set out to examine the impact of different methodological choices on the performance of multimodal DL-based drug synergy prediction methods, including the use of different input data types, preprocessing steps and model architectures. Focusing on the NCI ALMANAC dataset, we found that feature selection based on prior biological knowledge has a positive impact on performance. Drug features appeared to be more predictive of drug response. Molecular fingerprint-based drug representations performed slightly better than learned representations, and gene expression data of cancer or drug response-specific genes also improved performance. In general, fully connected feature-encoding subnetworks outperformed other architectures, with DL outperforming other ML methods. Using a state-of-the-art interpretability method, we showed that DL models can learn to associate drug and cell line features with drug response in a biologically meaningful way. The strategies explored in this study will help to improve the development of computational methods for the rational design of effective drug combinations for cancer therapy.Author summary Cancer therapies often fail because tumor cells become resistant to treatment. One way to overcome resistance is by treating patients with a combination of two or more drugs. Some combinations may be more effective than when considering individual drug effects, a phenomenon called drug synergy. Computational drug synergy prediction methods can help to identify new, clinically relevant drug combinations. In this study, we developed several deep learning models for drug synergy prediction. We examined the effect of using different types of deep learning architectures, and different ways of representing drugs and cancer cell lines. We explored the use of biological prior knowledge to select relevant cell line features, and also tested data-driven feature reduction methods. We tested both precomputed drug features and deep learning methods that can directly learn features from raw representations of molecules. We also evaluated whether including genomic features, in addition to gene expression data, improves the predictive performance of the models. Through these experiments, we were able to identify strategies that will help guide the development of new deep learning models for drug synergy prediction in the future.Competing Interest StatementThe authors have declared no competing interest.This study was supported by the Portuguese Foundation for Science and Technology (FCT) under the scope of the strategic funding of UIDB/04469/2020 unit and through a PhD scholarship (SFRH/BD/130913/2017) awarded to Delora Baptista.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Encapsulamiento de Hemoglobina porcina como fuente de oxigenación en ingeniería de tejidos

En la presente tesis de máster, se ha perseguido obtener un sistema de oxigenación para ingeniería de tejidos, mediante la encapsulacion de hemoglobina porcina. Para ello diferentes métodos de síntesis de encapsulación han sido llevados a cabo caracterizando y analizando los resultados obtenidos. En primer lugar se encapsulo hemoglobina siguiendo la técnica de doble emulsión-evaporación del disolvente siguiendo dos protocolos diferentes, se obtuvieron nano partículas de entre 40 y 200nm aproximadamente con resultados de eeficiencia de encapsulamiento y carga del principio activo razonables. A continuación, se optimizo y se sintetizaron microcapsulas por medio de electrospray con un tamaño aproximado de una micra, pero su compleja recolección y los pobres valores de encapsulamiento y oxigenación hacen que no sea una opción demasiado viable. Finalmente se obtuvieron micropartículas por medio de microreactores, con tamaños desde 3 micras hasta 200 y con valores de oxigenación no demasiado significantes

Estudo morfométrico da retina em doentes com formas precoces de degenerescência macular da idade : Integridade e quantificação das estruturas através da tomografia de coerência ótica de domínio espectral

RESUMO: Introdução A degenerescência macular da idade (DMI) é uma patologia ocular resultante da interação entre a componente genética e os fatores ambientais. O impacto direto que tem ao nível da cegueira, pelo envelhecimento da população mundial, e o impacto desafiante ao nível económico reveste esta patologia de um particular interesse em saúde pública. A contínua evolução da tomografia de coerência ótica (OCT), com a melhoria dos algoritmos utilizados, tem contribuído para uma melhor caracterização e monitorização da DMI. Esta técnica tem permitido, de forma não invasiva, a aquisição de imagens transversais e topográficas de alta resolução dos tecidos. No diagnóstico e monitorização da DMI é importante poder separar-se as primeiras alterações patológicas das alterações próprias do envelhecimento humano. E neste sentido, a constante evolução e melhoria da imagiologia ocular tem dado alguns contributos importantes. Uma aparente diminuição da espessura da retina em algumas localizações topográficas bem como algumas alterações ao nível das camadas externas têm sido tradicionalmente estudadas e associadas à DMI. No entanto, estas alterações não têm justificado por si só a totalidade das alterações que ocorrem e a procura de possíveis diferenças estruturais e morfológicas, possíveis de identificar e quantificar através de SDOCT, surgem como alternativa na melhoria de conhecimento nas formas precoces da DMI. Objetivo Descrever e estudar a espessura média de várias segmentações retinianas e da coroide, obtida de forma manual na região macular através da Tomografia de Coerência Ótica de domínio espectral (SD-OCT), entre participantes com DMI precoce/intermédia e participantes de um grupo de controlo. Métodos Estudo observacional, com metodologia transversal, em que se procedeu à avaliação e quantificação das várias estruturas retinianas e da coroide através do SD-OCT até 3mm do centro da fóvea. Apenas os participantes com diagnóstico médico de DMI confirmado (presença/ausência), seguidos no Instituto de Oftalmologia Dr. Gama Pinto, e com informação clinica essencial para o estudo (retinografia policromática, monocromática e infravermelho por SLO) foram considerados. De acordo com a classificação Age-Related Eye Disease Study (AREDS) e os mais recentes critérios de classificação clinica para a DMI precoce/intermédia foram criados dois grupos de estudo. O grupo de controlo (categoria 1 AREDS) constituído por um subgrupo de participantes sem alterações ligadas à idade (G1 – sem drusens nem alterações pigmentares por DMI) e por um subgrupo de participantes sem DMI mas com algumas alterações ligadas à idade (G2 - apenas alguns drusens <63 μm e sem alterações pigmentares por DMI). O grupo de DMI foi constituído por participantes com drusens intermédios (63-124 μm) ou pela presença de alterações pigmentares por DMI que constituem o grupo de DMI precoce (G3 – categoria 2 AREDS) e os participantes com vários drusens intermédios, pelo menos um drusen de grandes dimensões (≥125 μm de diâmetro), ou pela presença de atrofia geográfica sem envolvimento da fóvea constituem o grupo de DMI intermédia (G4 – categoria 3 AREDS). A análise e quantificação manual das várias camadas de retina e coroide foram baseadas na nomenclatura internacional para o OCT (IN•Consensus) e as diferenças encontradas entre os grupos em estudo descritas. A comparação entre os grupos e/ou subgrupos em estudo foi feita através da aplicação do teste qui-quadrado, ou teste exato de Fisher, para variáveis categóricas e nominais e do teste T-Student para as variáveis continuas. O teste não paramétrico Mann-Whitney foi utlizado para comparação da espessura média das várias estruturas segmentadas entre grupo de controlo e DMI precoce/intermédia. Para a comparação das diferenças encontradas na espessura das várias estruturas segmentadas, nos quatro subgrupos, foi utilizado o teste comparações múltiplas de Kruskal-Wallis. Por fim, e com ajuste para o sexo e idade, procedeu-se ao cálculo de estimativas dos coeficientes, Odds Ratio e valores p obtidos de modelos de regressão logística múltiplos de algumas características de maior interesse na DMI. Resultados: 450 participantes (38% do sexo masculino e 61,8% do sexo feminino) foram estudados. O grupo de controlo (n=204), constituído por 43,6% de participantes do sexo masculino e 56,4% de participantes do sexo feminino, apresentou uma idade média e desvio padrão de 71,5+/-9,5. Em relação ao grupo de DMI precoce/intermédia (n=246), constituído por uma menor percentagem do sexo masculino 33,7% e por uma maior percentagem do sexo feminino 66,3%, verificou-se um aumento da idade média e desvio padrão de 75,7+/-10,3 comparativamente ao grupo de controlo (p<0,001). Cerca de 62,6% dos participantes com DMI precoce/intermédia apresentaram mapas maculares considerados normais, segundo os valores normativos do SD-OCT, e obtiveram um menor numero médio de letras atingidas (p<0,001) comparativamente ao grupo de controlo. Variabilidade intraoperador: pode-se verificar que os maiores valores foram encontrados nas localizações de maior espessura. Variabilidade interoperador: excetuando os 0,826 (0,727;0,898) obtidos na camada plexiforme externa (T2,5) e os 0,634 (0,469;0,771) obtidos na camada plexiforme interna (N2) todos os restantes valores de correlação são superiores a 0,92. Com exceção da camada de fibras nervosas (CFN) todas as segmentações estudadas apresentam diferenças estatisticamente significativas espessuras médias entre grupos com doença comparativamente aos grupos de controlo. Entre Controlo e DMI precoce/intermédia foram encontrados os seguintes valores médios: Complexo das camadas de células ganglionares com camada plexiforme interna (75,2+/-6,7;72,1+/-6,6 p<0,001); camada de células ganglionares (49,3+/-5,6; 47,1+/-5,4 p<0,001); camada plexiforme interna (25,9+/-2,8; 25+/-2,7 p=0,001); camada nuclear interna (44,1+/-4,2; 41,2+/-4,1 p<0,001); camada plexiforme externa (15,1+/-2,1; 14,6+/-1,9 p=0,014); complexo camada plexiforme externa com camada nuclear externa (90,6+/-6,6; 87,9+/-7,7 p<0,001); camada nuclear externa (76,7+/-6,4; 74,5+/-7,7 p=0,002); zona mioide dos fotorrecetores (24,5+/-1,3; 22,9+/-2,2 p<0,001); segmentos externos dos fotorrecetores (22,7+/-1,9; 20,9+/-2,6 p<0,001); complexo epitélio pigmentar da retina com Membrana de Bruch (33,4+/-2,6; 40,5+/-9,7 p<0,001); Coroide (249,8+/-88,4; 200,2+/-76,9 p<0,001). Conclusão: As medições das várias camadas da retina e coroide, nas 13 localizações estudadas de forma manual pelo SD-OCT, apresentaram uma boa repetibilidade e reprodutibilidade. Foi demonstrado que com treino, e seguindo o protocolo desenvolvido, poderão ser atingidos valores de ICC bastante elevados através da quantificação manual. A utilização da espessura central macular para avaliar e monitorizar a patologia retiniana não pareceu ser o parâmetro mais adequado (cerca de 64% de casos de DMI precoce/intermédia são identificados como estando dentro dos valores normais). Com exceção da CFN, todas as segmentações da retina interna mostraram diferenças marcadas entre os subgrupos extremos (DMI intermedia com subgrupo sinais de envelhecimento e com subgrupo sem alterações). No entanto nem todas as segmentações foram sensíveis à presença de diferenças mais ténues na espessura média nos subgrupos. Foi no complexo CCG_CPI, em especial na região temporal, que foram encontradas maiores diferenças nos vários grupos etários. Foi nesta localização que maiores diferenças foram encontradas entre os vários subgrupos permitindo também encontrar diferenças entre os subgrupos onde as variações são mais ténues (como entre DMI precoce com sinais de envelhecimento). A camada nuclear interna (CNI) apresentou uma boa capacidade de discriminar diferenças entre subgrupos com diferenças mais ténues, no entanto as grandes diferenças encontradas entre sexos e nos grupos etários podem atenuar a sua utilidade na presença e ausência de doença. As segmentações ao nível da zona mioide dos fotorrecetores, dos segmentos externos dos fotorrecetores (SEF), do complexo epitélio pigmentar da retina com Membrana de Bruch (EPR_MB), e do complexo SEF com epitélio pigmentar da retina e Membrana de Bruch (SE_EPR_MB) apresentam grandes diferenças nos vários grupos etários sem aparentarem grandes diferenças entre sexos. Estas segmentações permitem encontrar grandes diferenças essencialmente entre subgrupos extremos (G1 com G4). Nestas segmentações não foram encontradas grandes diferenças entre ausência de doença com DMI precoce. Em relação à Coroide foram encontradas grandes diferenças ao longo dos grupos etários sendo mais diminuída no sexo feminino na presença de doença. Apresenta na globalidade boa capacidade de discriminação entre G4 com G1, G4 com G2, e G3 com G2.ABSTRACT: Introduction Age-related macular degeneration (AMD) is an ocular pathology resulting from the interaction between genetic and environmental factors. The direct impact it has in terms of blindness, the aging of the world population, or the impact and challenging economic level takes this pathology of a particular Interest in public health. The characterization and monitoring of AMD has been improved through the use of optical coherence tomography (OCT). This technique has allowed, noninvasively, the acquisition of transversal and topographic high resolution images of tissues. In the diagnosis and monitoring of AMD it is important to separate the first pathological changes of changes in human aging. In this sense, the constant evolution and improvement of imaging has given some important contributions. An apparent decrease in retinal thickness in some topographical locations in the early AMD and changes the level of the outer layers have traditionally been studied and associated with AMD. However, these changes have not justified itself all the changes that occur as the disturbance of VA and the search for possible structural and morphological differences, possible to Identify and quantify through SD-OCT emerge as an alternative to improve knowledge in the early forms of AMD. AIM Study the mean thickness of various retinal and choroidal segmentations, obtained manually in the macular region by Spectral Domain Optical Coherence Tomography, among participants with early/intermediate AMD and participants in a control group. Methods: A cross-sectional study in which the retinal and choroidal structures were evaluated and quantified through SD-OCT up to 3 mm from the center of the fovea. Only participantes with a confirmed AMD medical diagnosis (presence / absence), followed by the Dr. Gama Pinto Institute of Ophthalmology, and with essential clinical information for the study (polychromatic, monochromatic and infrared retinography by SLO) were included. According to the Age-Related Eye Disease Study (AREDS) and more recent clinical classification to define early and intermediate stages of AMD, two groups were Created. The early/intermediate AMD study group was formed by: cases with intermediate drusen (63-124μm in diameter) or mild RPE abnormalities designated by G3 (early AMD — AREDS category 2); and cases with numerous intermediate drusens, at least one large drusen (≥125μm in diameter), and geographic atrophy (area of RPE’s atrophy not involving the center of the fovea) designated by G4 (intermediate AMD — AREDS category 3). The control group (no AMD — AREDS category 1) was formed by: cases with no apparent aging changes designated by G1 (no drusen and no AMD pigmentary abnormalities) and others with normal aging changes designated by G2 (only small drusen ≤63 μm and no AMD pigmentary abnormalities). The manual analysis and quantification of the various layers of the retina and choroid will be based on the international nomenclature for the OCT (IN • Consensus) and the differences between the study groups described. The comparison between groups and / or subgroup in the study was made by applying the chi-square test or Fisher's exact test for categorical and nominal variables and the Student t-test for continuous variables. The nonparametric Mann-Whitney test it was used for comparing the mean thickness of the various segmented structures between the control group and early/intermediate AMD. To compare the differences in the thickness of the various segmented structures in four subgroups, it was used multiple comparisons of Kruskal-Wallis test. Finally, and adjusted for sex and age, estimates of the coefficients, Odds Ratio and p values, obtained from multiple logistic regression models of some characteristics of greater interest in AMD, were calculated. Results: 450 participants (38% of males and 61.8% of females) were studied. The control group, consisting of 43.6% male gender participants and 56.4% were female, had a mean age+/-standard deviation of 71.5 +/- 9.5. Regarding early/intermediate AMD group, consisting of a lower percentage of males 33.7% and a higher percentage of females 66.3%, there was an increase in mean age+/-standard deviation 75.7 +/- 10.3 compared with the control group (p <0.001). About 62.6% of participants with AMD have normal macular maps according to normative values SD-OCT and obtained a decreased number of letters (p <0.001) compared to the control group. Intraoperator variability: it can be verified that the highest values were found in the locations of greater thickness. Interoperator variability: except the 0.826 (0.727; 0.898) obtained in the outer plexiform layer (T2,5) and the 0.634 (0.469; 0.771) obtained in the inner plexiform layer (N2) all other correlation values are higher than 0.92. Except RNFL all structures studied have show thickness statistically significant differences between groups in disease compared to control groups. Between control and AMD group the following mean values were found: Ganglion cell complex (75.2 +/- 6.7, 72.1 +/- 6.6 p<0.001); ganglion cell layer (49.3 +/- 5.6, 47.1 +/- 5.4 p <0.001); inner plexiform layer (25.9+/- 2.8, 25 +/- 2.7 p = 0.001); inner nuclear layer (44.1 +/- 4.2, 41.2 +/- 4.1 p <0.001); outer plexiform layer (15.1 +/- 2.1, 14.6 +/- 1.9 p = 0.014); outer nuclear layer and outer plexiform layer complex (90.6 +/- 6.6, 87.9 +/- 7.7 p <0.001); outer nuclear layer (76.7 +/- 6.4, 74.5 +/-7.7 p = 0.002); myoid zone (24.5 +/- 1.3, 22.9 +/- 2.2 p <0.001); outer segments (22.7 +/- 1.9, 20.9 +/- 2.6 p <0.001); RPE_BM (33.4 +/- 2.6, 40.5 +/- 9.7 p <0.001); Choroid (249.8 +/-88.4; 200.2 +/- 76.9 p <0.001). Conclusion: The measurements of the various layers of the retina and choroid, studied in 13 locations manually by the SD-OCT, exhibit good repeatability and reproducibility. It has been shown that with training and following the protocol can be achieved ICC values quite high by manual quantification. The use of the total thickness of the retina to assess and monitor the retinal disease seems not to be sufficient (approximately 64% of cases of AMD are identified as being within the normal range). With the exception of RNFL, all segmentations of the inner retina clearly show marked differences between the extreme subgroups (G4 with G1). However, not all the segmentations appeared to be sensitive to the presence of smalls differences in mean thickness in the subgroups. It was in GCL_IPL complex, especially in the temporal region, which were found major differences between age groups, this location which is most discriminate differences between the various subgroups also possible to find differences between subgroups where the variations are slight. Inner nuclear layer has a good ability to find differences between subgroups with fainter differences however large differences between genders and slight differences in the age groups can attenuate their usefulness between presence and absence of disease. The myoid zone, outer segments, RPE_BM and OS_RPE_BM segmentations differ widely in age groups but no gender differences. These features allow find great differences between extreme subgroups. These segmentations were no major differences between the absences of disease with early/intermediate AMD. In choroid were found large differences across age groups being more decreased in females in the presence of disease. It has a good ability to discriminate between G4 with G1, G4 with G2, and G3 with G2

Ultrasound based navigation and control for orthopaedic robot surgery

Thesis approved in public session to obtain the PhD Degree in Mechanical Engineering. Universidade de Lisboa. Instituto Superior TécnicoA Robótica cirúrgica é uma área em expansão, contribuindo para o aumento da precisão e exatidão dos procedimentos cirúrgicos, além de produzir resultados mais confiáveis e reprodutíveis, minimizando a invasividade, reduzindo as complicações e melhorando a segurança dos pacientes, comparativamente com as técnicas convencionais. A navegação dentro da sala de operações é primordial para o sucesso dos sistemas robóticos. Neste contexto é proposto um novo sistema de navegação, usado na malha de controlo, de um sistema robótico co-manipulado, dedesenvolvido para auxiliar os cirurgiões ortopédicos. Embora possa ter outras aplicações, o sistema foi desenvolvido para realizar um furo na cabeça do fémur, necessário ao implante do fio guia na cirurgia de substituição parcial da anca. Durante a cirurgia, a posição e orientação do osso é obtida através de um processo de registo entre as imagens de US adquiridas em tempo real e o modelo CT do fémur, previamente carregado no pré-operatório. Contrariamente aos sistemas cirúrgicos atuais, não usa nenhum tipo de implante no osso para localizar o fémur, mas sim marcadores passivos colocados na sonda e no robô, e um sistema de medição óptico para medir as suas posições 3D. Os testes experimentais de validação foram realizados num phantom de um fémur humano.Abstract: Surgical Robotics is an expanding area, contributing to the increased precision and accuracy of surgical procedures, besides producing more reliable and reproducible results, minimizing the invasiveness, reducing complications and improving patient safety, compared with conventional techniques. Navigation within the operating room is fundamental to the success of robotic systems. In this context a new navigation system, used in the control loop, to co-manipulate a robotic system developed to assist orthopaedic surgeons, is proposed. Although it may have other applications, the system is designed to perform a hole in the femur head, necessary to implant the initial guide wire used in Hip Resurfacing surgery. During the surgery, the bone position and orientation is obtained through a registration process between a set of US images acquired in real time and the CT femur model, preloaded pre-operatively. Contrary to current surgical systems, it does not use any type of implant in the bone, to localize the femur, but passive markers, of an optical measurement system, placed on the probe and the robot to measure their 3D poses. Experimental validation tests were performed on a human’s femur phantom, validating the proposed system

Isothermal DNA amplification coupled to Au-nanoprobes for detection of mutations associated to Rifampicin resistance in Mycobacterium tuberculosis

We acknowledge Fundacao para a Ciencia e a Tecnologia (FCT-MCTES) for financial support CIGMH (PEst-OE/SAU/UI0009/2011); Projects PTDC/BBB-NAN/1812/2012, PTDC/CTM-NAN/109877/2009; SFRH/BD/78970/2011 for BV. PVB thanks Santander-Totta/UNL for financial support (Scientific Prize Edition 2012).Background: Tuberculosis accounted for 8.7 million new cases in 2011 and continues to be one of the leading human infectious diseases. Burdensome is the increasing rate of multi-drug resistant tuberculosis (MDRTB) and the difficulties created for treatment and public health control programs, especially in developing countries. Resistance to rifampicin (RIF), a first line antibiotic, is commonly associated with point mutations within the rpoB gene of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) whose detection is considered the best early molecular predictor for MDRTB. Gold nanoparticles functionalized with thiol-modified oligonucleotides (Au-nanoprobes) have shown the potential to provide a rapid and sensitive detection method for Mtb and single base alterations associated with antibiotic resistance, namely in rpoB gene associated to RIF resistance.Results: We developed a strategy based on the isothermal amplification of sample DNA (LAMP) coupled to specific Au-nanoprobes capable of identifying members of the Mtb complex (MTBC) and discriminating specific mutations within the rpoB gene. Integration of LAMP and Au-nanoprobe assay allowed to detect MTBC member and identify mutations linked to RIF resistance. A total of 12 biological samples were tested and a 100% specificity and sensitivity was attained.Conclusions: There is an increasing demand for simple, fast and cheap methods for the molecular identification of Mtb and for the detection of molecular tags associated to drug resistance suitable for use at point-of-need. Here we describe such a method, that as the potential to get molecular diagnostic of tuberculosis to remote environments.publishersversionpublishe

Pastor.i: a smartphone application to facilitate grazing management

Grazing in extensive beef farming systems is often manage in an empirical way based on past experience and on the visual appreciation of animal behavior and forage potential. Records of entrances and exits of the animals in the paddocks are rare. However, knowing the occupation period and the animal density, when coupled with biomass defines the grazing pressure. This knowledge is essential for planning and making informed decisions, that influence the profitability of the farm. Moreover, adequate grazing pressure is crucial for the sustainability of many SSPs where system maintenance is dependent on the balance between grazing pressure and regeneration or maintenance of trees and shrubs. Pastor.i is a smartphone application (APP) designed to allow pasture data logging to be very simple. The application is synchronized with the website and allows the producer to have in his pocket all the farm, being possible to identify the paddock, calculate the area, record the movements of the animals and consult the occupation history of the paddock. The application calculates the actual stocking rate, that can be associated with the location of the animals, obtained if the animals are using collars with GPS, which allows to know the areas of the paddock that are most grazed, visualized through heat maps. The information enables localized actions, such as fertilizing or sowing, to improve areas that are not grazed. The application also allows you to save photos of the sward. This temporal photographic record provides information on the condition of trees, the botanical composition and on the tendency of grazing to improve or to worsen coverage. The APP is available for download, is compatible with Android and is being tested with focus groups

Contributos para a implementação da avaliação de sustentabilidade ambiental de edifícios

Nunca foi tão importante olhar e pensar se o que temos hoje é um bem próprio adquirido ou é um bem comum do nosso planeta. Os recursos que exploramos são limitados e as nossas ações poderão comprometer o nosso nível de vida, as gerações futuras e a sustentabilidade do planeta. Cada vez mais as empresas do sector da construção revelam uma atenção crescente sobre os impactes das suas atividades no ambiente e na sociedade, na qual se engloba a empresa parceira deste projeto. O objetivo principal deste trabalho visa colaborar num projeto de construção de um edifício ambientalmente sustentável, recorrendo a metodologias especificas, contribuindo para a obtenção de uma certificação ambiciosa em resultado de um promissor desempenho ambiental. O trabalho desenvolvido tem como base o projeto de construção de um aparthotel de residências para estudantes, e a aplicação da metodologia LiderA – Liderar pelo Ambiente para avaliação do seu desempenho ambiental ambiental. Esta metodologia foi selecionada após a análise de outras ferramentas com finalidades idênticas, tais como BREEAM - Building Research Establishment Environmental Assessment Method, LEED - Leadership in Energy and Environment Design, CASBEE - Compreensive Assessment System for Building Environmental Efficiency, AQUA-HQE - Alta Qualidade Ambiental - High Quality Environmental. A metodologia LiderA (V4.00a) foi aplicada ao projeto do caso de estudo, a qual classifica os edifícios de A+++ a G, conforme o cumprimento dos requisitos em cada critério. Neste estudo foram considerados três cenários, o cenário do projeto inicial do edifício (cenário I) e outros dois cenários, em que foram sugeridas medidas de melhoria de forma a incrementar o desempenho ambiental e consequente classificação. Como principais resultados obteve-se a classificação A no cenário I; no cenário II considerando medidas de melhoria, as quais são de possível implementação sem acréscimo significativo de alterações, permite obter a classificação de A+; e no cenário III, que engloba sugestões de medidas suplementares de melhoria, permite obter a classificação máxima A++