Differential gene expression in cells from Fabry and Gaucher diseases: cell reprogramming and culture aging

Gene expression varies deeply, even in the same individual’s cells, depending on stress factors, cell aging, gene variants or gene and cell manipulation In this work, gene expression can be seen to shift in many genes, using fibroblasts from donors with Fabry and Gaucher type 3 genetic diseases Tests were also made to compare the impact of aging cultures Real time qRT PCR protocols for genes of interest were used for expression comparison after cell induction and reprogramming.FCT project PTDC/BIM-MEC/4762/2014 (CeMoLy)info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Forças armadas em regime democrático

O autor propõe-se abordar o tema da Lei de Defesa Nacional começando pela descrição pormenorizada do chamado período de “autogoverno das Forças Armadas”, que decorre de 1974 a 1982, devido, parcialmente, a uma permanente subordinação entre os militares e o poder político que se tinha verificado no regime anterior. Logo após o golpe do 25 de Abril existe um evidente predomínio militar sobre a componente civil e é entre 1980 e 1982 que se agudizou o esforço pela subordinação das Forças Armadas ao poder civil, para o que era necessário uma revisão constitucional e a elaboração de uma Lei de Defesa Nacional e das Forças Armadas

Uma Presidência Portuguesa da Assembleia Geral da ONU

Este artigo descreve os passos que conduziram à escolha do candidato português como representante do grupo ocidental na eleição para a presidência da Assembleia Geral das N.U. em 1995. O cargo configurava um desafio especialmente relevante por coincidir com o 50º aniversário da Organização. Em seguida dá a conhecer as problemáticas mais significativas que teve de gerir ou acompanhar, num estilo da mais rigorosa imparcialidade, mesmo quando estavam em jogo interesses de Portugal ou dos seus aliados. Destaca os conflitos de interesses entre países ricos e pobres, critica a arrogância dos EUA e dos seus representantes, e enuncia as dificuldades que o Direito Internacional encontra para se afirmar. Por fim, refere-se às circunstâncias em que a ambicionada reforma das N.U. foi interrompida na Primavera de 1996. No essencial, tratou-se duma desinteligência de fundo entre os EUA que queriam uma espécie de reforma, o Terceiro Mundo que queria outra, e a UE que, por não se ter nunca interessado verdadeiramente pelo assunto, não chegou a apresentar qualquer proposta

Spatial occupancy patterns of carnivores in a cork oak landscape

Tese de mestrado em Biologia da Conservação, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2016A forma como as espécies coexistem e interagem, bem como os mecanismos subjacentes, têm sido alvo de diversos estudos. No entanto, são mais raros os estudos onde é realizada uma abordagem multiespecífica, nomeadamente envolvendo uma comunidade de mesocarnívoros. Das várias interações interespecíficas possíveis, a competição é um dos principais fatores a moldar a organização das comunidades, incluindo as de carnívoros. As adaptações comportamentais traduzem-se na segregação e diferenciação de nichos. Esta diferenciação, resultado da utilização de recursos e das interações interespecíficas dentro de uma comunidade, pode ser dividida em três níveis: temporal, trófico e espacial. Assim, em espécies que coexistam, é expectável que, convergindo numa dimensão, divirjam em pelo menos uma das restantes. A organização a nível espacial é o resultado de uma seleção de habitat baseada num trade-off entre os desempenhos dos diferentes habitats de um ecossistema, fruto das características dos mesmos. Entre os vários fatores a ter em conta, podem-se enumerar a capacidade de o habitat providenciar refúgio e alimento bem como a morfologia e fisiologia das espécies que fazem a dita seleção. Esta diferenciação espacial, tal como a temporal e a trófica, pode variar sazonalmente e mesmo entre populações. Os carnívoros (Ordem Carnivora) exibem uma variedade de tamanhos, estratégias de reprodução, preferências de habitat e outras características que lhes permitem a exploração de diversos nichos ecológicos. Adicionalmente, esta diversidade também lhes confere uma enorme importância no ecossistema, pelas funções que nele podem desempenhar. Uma dessas funções é o controlo de populações de herbívoros e de mesopredadores, esta ultima desempenhada pelos grandes carnívoros, ou predadores de topo. Uma das principais forças motrizes das alterações dos ecossistemas é a agricultura, uma atividade humana que afeta temporal e espacialmente a estrutura do ecossistema, podendo impactar o seu funcionamento. Dependendo das culturas, as paisagens agrícolas podem representar ecossistemas ricos em termos de alimento, beneficiando diversas comunidades animais, sendo o montado um bom exemplo de um sistema agrícola que providencia diversos e abundantes recursos tróficos. O montado, bastante heterogéneo, resultou de uma interação entre o Homem e o ecossistema durante centenas de anos, com uma rotação de usos do solo entre pasto, agricultura e pousio, que alterou localmente a fauna portuguesa, favorecendo as espécies mais generalistas. Com o êxodo rural e a industrialização da agricultura, este ecossistema está a degradar-se, impactando igualmente as comunidades que nele residem, nomeadamente a comunidade de mesocarnívoros. Pela sua função enquanto predadores de topo neste ecossistema, é importante determinar de que forma os mesocarnívoros estão a ser afetados pelo abandono do montado, que resultou na perda de alguma heterogeneidade espacial, o que pode originar uma menor disponibilidade ou acessibilidade dos recursos alimentares bem como de abrigos. Visto que os mesocarnívoros poderão ser forçados a competir mais intensamente pelos recursos do ecossistema, e que terão que arranjar novas formas de se organizarem espacial e temporalmente, este estudo pretende determinar os padrões de ocupação e uso do espaço pela comunidade de mesocarnívoros da Serra de Grândola, uma área em processo de renaturalização, bem como avaliar o efeito de diversas variáveis ambientais e ecológicas (ex. composição da paisagem, competição interespecífica) sobre esses padrões. Adicionalmente, através da comparação dos resultados com os obtidos num estudo realizado na Companhia das Lezírias (Centro-Oeste de Portugal), pretende-se discutir o efeito das diferentes opções de gestão do montado nos padrões de ocupação e estruturação da comunidade de mesocarnívoros. É esperado habitats que possam funcionar como fontes de alimento exerçam um efeito positivo nos padrões de ocupação e que os diferentes estados de desenvolvimento do subcoberto tenham efeitos variados consoante as espécies, i.e. espécies como a raposa, mais ágeis, beneficiem duma cobertura mais densa enquanto o texugo, pela sua morfologia, se adapte melhor a subcoberto mais esparsos. Já relativamente às respostas às diferentes ações de gestão, estas deverão ser espécie e contexto-dependentes, nomeadamente com o gado a exercer um efeito geralmente negativo e zonas como hortas e pomares, provedoras de alimento, a assumirem uma maior importância na Serra de Grândola, onde o ecossistema é mais homogéneo e onde poderá haver uma menor diversidade e abundância de recursos. Para tal, foi monitorizada a comunidade de mesocarnívoros da Serra de Grândola, com recurso à foto-armadilhagem. Nesta região a presença e impactos humanos são moderados, com a gestão do montado a ocorrer ainda a pequena escala, fruto do abandono rural cujos efeitos só recentemente começaram a ser mitigados. Esta monitorização baseou-se no estabelecimento de uma grelha de 30 câmaras fotográficas, ativas durante cerca de 4 meses (Dezembro de 2015 a início de Abril de 2016). Adicionalmente, foram recolhidas várias variáveis ambientais nos locais onde as câmaras estavam instaladas, variáveis essas que, pelo conhecimento ecológico que existe das espécies alvo, se pensa que poderão afetar a seleção de habitat por parte dos carnívoros. Estas variáveis foram recolhidas num buffer de 325 m2 em torno de cada câmara, tendo sido agrupadas em três categorias: Habitat, Fonte de Alimento e Perturbação. Foi considerada ainda uma quarta categoria, Competição Interespecífica, de forma a avaliar se a presença de potenciais competidores influência os padrões de ocupação de cada espécie. Os resultados foram posteriormente analisados recorrendo a modelos de ocupação (single season, single species). O período de foto-armadilhagem permitiu registar 922 capturas individuais das cinco espécies alvo, sendo a raposa a mais registada, com 489 capturas. Em sentido inverso, a fuinha foi a espécie menos vezes detetada, com 81. Apesar do reduzido número de capturas, a fuinha não foi a espécie com menor taxa de ocupação naïve (ou seja, proporção de câmaras em que a espécie foi detetada), uma vez que apresenta uma taxa de cerca de 77% contra os 63% do texugo. Por constrangimentos do método estatístico selecionado, não foi possível avaliar os padrões de ocupação da raposa e da geneta, uma vez que estas espécies demonstraram taxas de ocupação naïve bastante elevadas (acima de 80%) e, como tal, o modelo não é capaz de estimar os padrões de ocupação. Para cada uma das três espécies modeladas (texugo, fuinha e sacarrabos), as combinações de variáveis ambientais que influenciaram os padrões de ocupação foram diferentes, o que suporta a ideia inicial de que existe segregação ao nível do nicho espacial, facilitando a coexistência. No entanto, de todas as variáveis incluídas nos modelos das três espécies, apenas uma apresentou um efeito significativo. Assim, detectou-se que a proximidade a zonas com presença humana, como casas ou aldeias, afeta positivamente a probabilidade de ocupação de uma determinada área pelo texugo. Isto implica que a presença humana parece beneficiar os texugos, possivelmente devido ao facto destas zonas antrópicas poderem representar novas fontes de alimento. Estas fontes de alimento ganham especial importância em épocas como aquela em que o estudo foi realizado (i.e. Inverno 2015-2016), uma vez que durante esse período foi registada uma escassez dos recursos essenciais às espécies de mesocarnívoros. Este estudo providenciou outros resultados inesperados, apesar de não estatisticamente significativos, nomeadamente a relação entre a presença da raposa e a probabilidade de ocupação do texugo e do sacarrabos. Este facto pode ser o resultado de um efeito indireto da presença da raposa e não um impacto efetivamente positivo deste canídeo sobre as duas outras espécies. O caracter generalista da raposa faz com que esta frequente áreas de maior disponibilidade de alimento sendo que a sua presença poderá ser indicativa da capacidade dessas áreas de fornecer alimento pelo que, por isso, são mais utilizadas pelo texugo e sacarrabos. É importante salientar a presença do modelo nulo entre os melhores modelos de ocupação gerados para o sacarrabos, indicando que; 1) algumas variáveis ambientais que poderão ter importantes impactos positivos ou negativos na probabilidade de ocupação das áreas pelo sacarrabos, não foram incluídas como candidatas no processo de modelação; e/ou 2) a distribuição desta espécie é muito generalizada, tendo sido detetada em todas as áreas com características distintas, impossibilitando a identificação dos efeitos das variáveis consideradas. A comparação dos resultados deste estudo com um semelhante, implementado numa área de montado com uma gestão mais ativa, permitiu evidenciar o papel da presença do gado na estruturação das comunidades de mesocarnívoros. Enquanto no presente estudo este fator parece não ter importância, no estudo realizado na Companhia das Lezírias, uma zona de criação de gado bovino, a presença deste tipo de gado tem um efeito essencialmente negativo em várias espécies, nomeadamente na raposa e no texugo. Esta diferença de efeito das actividades antrópicas realça o impacto que uma utilização mais intensiva das áreas de montado pode ter nas comunidades naturais. No entanto, é necessário frisar que as abordagens analíticas usadas em ambos os trabalhos diferem (modelos de ocupação single season single species do presente estudo vs modelos N-Mixture do estudo realizado na Companhia das Lezírias) e, por isso, as ilações que se retiram desta comparação devem ter em conta estas diferenças metodológicas. Este estudo revelou que os padrões de ocupação do espaço de cada espécie são influenciados por diferentes variáveis ambientais. Apesar dos constrangimentos, os resultados apontam para a necessidade de, pelo menos, alguma manutenção do montado, enfatizando a importância das fontes de alimento bem como da camada arbustiva que, exigindo manutenção, deve ser moderada. A realização deste estudo, juntamente com a comparação com dados anteriores, reforçam a ideia de que as ações de conservação do montado devem sempre ter em conta a comunidade, em vez de cada espécie individualmente, bem como a relevância de pensar cada ação caso a caso. Isto é especialmente importante uma vez que apesar do sistema ser essencialmente o mesmo, entre os vários sítios as diferenças locais podem exigir diferentes medidas. Para o futuro sugere-se uma diferente análise estatística bem como um esforço de amostragem maior, aumentando a grelha de armadilhagem, ponderando-se também a inclusão de novas variáveis.Competition is one of the main driving forces in communities’ structuring and organization. This implies that species have to adapt in order to minimize competition and be able to coexist. Species develop either morphologic adaptations of character displacement or behavioral mechanisms to coexist. These mechanisms translate as different niche selection, which can act at temporal, trophic or spatial scales. Spatial patterns are the outcome of habitat selection mechanisms and inter and intra-specific interactions based on a trade-off in performance between the different habitat types and its characteristics. Agriculture is one of the main human-induced drivers of ecosystem change. In Southern Portugal the landscape has been changed for the last few thousands of years, originating an agro-silvo-pastoral system known today as the Montado. The mesocarnivores community inhabiting this system evolved to take advantage of the resources it has provided but also to cope with the human associated disturbance. However, the full effect of the decrease of human maintenance activities within the montado on the mesocarnivore community structure and functioning is still unknown. Thus, this study aims to access the patterns of spatial organization of the mesocarnivore community inhabiting Serra de Grândola, and understand how these may differ from areas where montado management is more intensive. We developed a camera-trap approach that, along with a collection of environmental covariates related to habitat, food and disturbance, allowed the construction of single season, single species occupancy models for three mesocarnivores species. For the stone marten and the Egyptian mongoose no significant covariate effects were detected, but a negative influence of the distance to human presence sites on badger occupancy was found. This is probably due to a higher food availability in these anthropic areas, which can become particularly important when resources are scarcer in the wild. We also showed different mesocarnivore occupancy patterns between areas with different types of livestock management, with cattle exerting a stronger negative impact in carnivores’ occupancy. Thus, human management is still important not only for the montado maintenance but also to preserve the carnivore community. From this study and the comparison between areas, two messages can be taken towards conservation. First, conservation strategies must be directed towards the entire community and not be species-specific. Additionally, each case must be considered individually, since the same ecosystem may found variation across different locations. For the future, we suggest a different statistical approach as well as a more intensive habitat characterization and covariates recollection

Seismic Analysis and Strengthening of Mallorca Cathedral

Due to the complexity associated with the seismic action, as well as the dynamic properties of the structures, the design of historical buildings only took into account static actions. Depending on the seismicity of the site, the buildings are characterized by more or less constructive details adopted in order to prevent important damages due to seismic action. Therefore, the seismic analysis of Mallorca Cathedral is carried out in the present work. The typical damages arising from seismic activity in historical buildings are caused by single architectonic parts that are characterized by an autonomous structural behaviour than the rest of the building. These local mechanisms, which are likely to develop during an earthquake, are individualized with respect to Mallorca Cathedral within this thesis. The seismic analysis of Mallorca Cathedral comprises the individual analysis of each one of the considered local mechanisms. The nonlinear structural behaviour is obtained through limit analysis and the performance point is obtained though the capacity spectrum method. The results obtained for each local mechanism are its safety condition and, in the case of the safety being assured, the damage level that may be expected. A specific procedure developed for the analysis of historical structures that is recommended in the Italian code is used. The seismic demand of Mallorca Cathedral considered within this thesis corresponds to several spectrums obtained from the European and Spanish codes and the detailed seismic hazard evaluation of the cathedral carried out in a previous work. This evaluation comprised deterministic and probabilistic estimations of the seismic action that may be expected in the site. In order to reduce the damage level or to assure the safety of the local mechanisms, strengthening solutions are proposed in order to improve the seismic behaviour of Mallorca Cathedral. The mainprinciples and criteria for conservation and restoration of historical structures are respected

Identificação de objetos para veículos autónomos com base em aprendizagem automática

Autonomous driving is one of the most actively researched fields in artificial intelligence. The autonomous vehicles are expected to significantly reduce the road accidents and casualties one day when they become sufficiently mature transport option. Currently much effort is focused to prove the concept of autonomous vehicles that is based on a suit of sensors to observe their surroundings. In particular, camera and LiDAR are researched as an efficient combination of sensors for on-line object identification on the road. 2D object identification is an already established field in Computer Vision. The successful application of Deep Learning techniques has led to 2D vision with Human-level accuracy. However, for a matter of improved safety more advanced approaches suggest that the vehicle should not rely on a single class of sensors. LiDAR has been proposed as an additional sensor, particularly due to its 3D vision capability. 3D vision relies on LiDAR captured data to recognize objects in 3D. However, in contrast to the 2D object identifi- cation, 3D object detection is a relatively immature field and still has many challenges to overcome. In addition, LiDARs are expensive sensors, which makes the acquisition of data required for training 3D object recognition techniques expensive tasks as well. In this context, this Master's thesis has the major goal to further facilitate the 3D object identification for autonomous vehicles based on Deep Learning (DL). The specific contributions of the present work are the following. First, a comprehensive overview of the state of the art Deep Learning architectures for 3D object identification based on Point Clouds. The purpose of this overview is to understand how to better approach such a problem in the context of autonomous driving. Second, synthetic but realistic Lidar captured data was generated in the GTA V virtual environment. Tools were developed to convert the generated data into the KITTI dataset format, which has become standard in 3D object detection techniques for autonomous driving. Third, some of the overviewed 3D object identification DL architectures were evaluated with the generated data. Though their performance with the generated data was worse than with the original KITTI data, the models were still able to correctly process the synthetic data without being retrained. The future benefit of this work is that the models can be further trained with home-made data and varying testing scenarios. The implemented GTA V mod has proved to be capable of providing rich, well-structured and compatible datasets with the state of the art 3D object identification architectures. The developed tool is publicly available and we hope it will be useful in advancing 3D object identification for autonomous driving, as it removes the dependency from datasets provided by a third party.Condução autónoma é uma das áreas mais ativamente estudadas em inteligência artificial. É esperado que os veículos autónomos reduzam significativamente os acidentes rodoviários e vitimas mortais quando se tornarem suficientemente maturos como opção de transporte. Atualmente, muitos dos esforços estão focados na prova de conceito de veículos autónomos serem baseados num conjunto de sensores que observam o ambiente em redor. Em particular, a camara e o LiDAR são estudados como sendo uma combinação eficiente de sensores para realização de identificação de objectos on-line nas estradas. Identificação de objetos 2D é uma área de estudo já estabelecida no campo de Computação Visual. O sucesso na aplicação de técnicas de Deep Learning levou a que a visão 2D atingisse uma precisão ao nível Humano. No entanto, de forma a melhorar a segurança, abordagens mais avançadas sugerem que o veículo não deve depender de uma única classe de sensores. O LiDAR foi proposto como sendo um sensor adicional, particularmente devido à sua capacidade de visão 3D. Visão 3D depende dos dados capturados pelo LiDAR para reconhecer objetos em 3D. No entanto, em contraste com a identificação de objetos 2D, a identificação de objetos 3D é um campo de estudos relativamente imaturo e ainda possui muitos desafios para ultrapassar. Adicionalmente, LiDARs são sensores dispendiosos, o que também torna a aquisição de dados necessários para o treino de técnicas de reconhecimento de objetos 3D mais cara. Neste contexto, esta tese de Mestrado tem como objetivo principal facilitar a identificação de objetos 3D, baseada em Deep Learning (DL), para veículos autónomos. As contribuições especificas deste trabalho são as seguintes. Primeiro, uma visão global compreensiva do estado de arte relativo _as arquiteturas Deep Learning para identificação de objetos 3D baseadas em point clouds. O propósito desta visão global é para perceber como melhor abordar este tipo de problema no contexto de condução autónoma. Segundo, foi gerado um dataset sintético, mas realista, com dados capturados por um LiDAR no ambiente virtual do GTA V. Foram desenvolvidas ferramentas para converter os dados gerados no formato do dataset do KITTI, que se tornou num standard para avaliação de técnicas de deteção de objetos 3D para condução autónoma. Terceiro, algumas das arquiteturas DL de identificação de objetos 3D revistas foram avaliadas com o dataset gerado. Apesar da sua performance com o dataset gerado ter sido pior que os resultados no dataset original do KITTI, os models chegaram a conseguir processar corretamente os dados sintéticos sem serem retreinados. O benefício futuro deste trabalho consiste nos modelos poderem ser adicionalmente treinados com dados produzidos localmente e testados em cenários variados. O mod do GTA V implementado provou ser capaz de fornecer datasets ricos, bem estruturados e compatíveis com o estado de arte em arquiteturas de identificação de objetos 3D. A ferramenta desenvolvida está disponível publicamente e esperamos que seja útil para o avanço da identificação de objetos 3D para condução autónoma, já que remove a dependência de datasets fornecidos por terceiros.Mestrado em Engenharia de Computadores e Telemátic

Architecture et mise en place de services web dans un environnement sécurisé garantissant la confidentialité des informations d'un centre de contrôle de qualité externe

Ce travail a pour but de définir une architecture de services Web performante, évolutive et facile à maintenir puis de la mettre en place dans un environnement sécurisé. A cet effet, une analyse de différentes solutions d’architectures est présentée. Elle inclut les principaux précurseurs des architectures distribuées tels CORBA, DCOM et RMI ainsi que des technologies plus récentes, à savoir SOAP et REST. Les choix retenus se basent sur l’analyse des avantages et inconvénients de ces différentes technologies. Ils conduisent par la suite au développement d’une application côté serveur qui permet de gérer le service Web et au développement d’une application côté client qui permet d’interagir avec ce service tant sur des terminaux mobiles que des postes de travail standard. Ces applications sont développées pour le Centre Suisse de Contrôle de Qualité (Chêne-Bourg, Suisse) qui traite des données confidentielles. Une attention particulière est donc portée au développement de services satisfaisant cette contrainte. Dans ce cadre, une recherche parallèle est réalisée tout au long de ce travail analysant différentes solutions de sécurité permettant de garantir la confidentialité des informations accédées par un service Web

Induced pluripotent stem cell line (INSAi001-A) from a Gaucher disease type 3 patient compound heterozygote for mutations in the GBA1 gene

Gaucher Disease (GD) type 3 is a neurological form of a multisystemic autosomal recessive disorder belonging to the group of lysosomal storage diseases. Causal mutations in the glucocerebrosidase 1 (GBA1) commonly lead to abnormal protein and GD, heterozygosity is a genetic risk factor for Parkinson's disease. This work describes the use of a non-integrative approach using Sendai Virus delivery to establish induced Pluripotent Stem Cells (iPSCs) from fibroblasts from a GD type 3 patient. Differentiation of iPSCs can be employed to generate a variety of complex cell types with a high degree of genetic complexity that would otherwise be unattainable.Funding Agency Portuguese Foundation for Science and Technology PTDC/BIM-MEC/4762/2014info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Equity research –Latam Airlines

This reportcontains the description of a valuation performed on LATAM Airlines, the largest airline in South America. This study was conducted by analysing the factors that may affect the company’s value (both macroeconomic, industry, and company-specific factors), whilst also performing a series of scenario analyses, given the uncertain times which characterize the present. An estimated share price (the target value for the 31stof December of 2020) was then computed, which prompts us to recommend investors to sell their positions on LATAM Airlines