Pulmonary mycobiome of patients with suspicion of respiratory fungal infection – an exploratory study

Objective: This pilot study aimed to characterize the pulmonary mycobiome of patients with suspicion of fungal infection of the respiratory tract as well as to identify potentially pathogenic fungi colonizing/infecting their lungs. Methods: A cohort of 10 patients was analyzed, including HIV+ patients and patients with active infection caused by Mycobacterium species. Their respiratory samples (bronchoalveolar lavage fluid/ bronchial secretions) were pre-treated with lyticase and proteinase K; DNA was extracted using the High Pure PCR Template Preparation kit following the manufacturer’s instructions. The internal transcribed spacer region 1 (ITS1) and calmodulin gene were amplified by PCR and the resulting amplicons were sequenced using the Illumina MiSeq platform with pair-end reads of 150 bp. The obtained results were analyzed using the PIPITS pipeline as described by Gweon et al. [1]. Operational taxonomic units (OTU) to which less than 0.1% of the total reads attributed were disregarded. Results: Thirty-seven different OTU were identified from which two belonged to the Plantae kingdom, 11 had less than the 0.1% threshold of the total reads and were therefore disregarded. The remaining 24 different OTU (grouped in 17 phylotypes), were considered as part of the pulmonary mycobiome of patients. Two phyla were identified: Basidiomycota (33.3%) and Ascomycota (54.2%). Regarding the Basidiomycota phylum, reads were classified in three classes (Agaricomycetes, Tremellomycetes and Walleomycetes), while for the Ascomycota phylum four different taxonomical classes were identified: Pneumocystidomycetes, Dothideomycetes, Eurotiomycetes and Saccharomycetes, with the latter being the most frequent class. Twelve fungal genera were identified, being Candida the most frequently detected. The median number of fungal genera detected in patients’ pulmonary mycobiome was six (ranging from two up to nine). The genus Papilotrema and the potentially pathogenic genera Cryptococcus and Pneumocystis were exclusively found in the pulmonary mycobiome of HIV+ + patients. Other potentially pathogenic fungi such as Aspergillus spp., Trichosporon spp., Saccharomyces spp. and Schizophyllum spp. were also detected. Conclusion: This pilot study illustrates how the pulmonary mycobiome is rich and highly variable in patients with fungal infections. The obtained results suggest that the described metagenomic analysis may possess a great ability to quickly and effectively detect potentially pathogenic fungi in the mycobiome of patients, making it a promising future diagnostic tool. Thus, further optimization, standardization and clinical validation of these NGS methodologies should be warranted in the future.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Para a caracterização da disciplina de Língua Portuguesa no Ensino Básico

Pretende-se, neste estudo, identificar o estatuto que a disciplina de Língua Portuguesa tem no currículo do Ensino Básico, estabelecendo como ponto de referência a Reforma do Sistema Educativo iniciada em 1986. Porém, e uma vez que nos encontramos num período em que estão em curso algumas medidas de reorganização curricular, não poderemos deixar de fazer referência às concepções que as atravessam. Por fim, conscientes de que as justificações do seu estatuto não podem apenas ser encontradas na nossa sincronia, procuraremos na história, de forma necessariamente sucinta, elementos que nos ajudem a perceber a importância hoje atribuída à disciplina

Estatuto e funções do manual escolar de língua Portuguesa

Na tentativa de identificação do estatuto de que se revestem os manuais escolares no processo de ensino-aprendizagem, estabelecemos, como linha de orientação neste capítulo, a caracterização das suas funções com base em i) concepções teóricas, ii) discursos oficiais e iii) nas práticas lectivas. Consideramos, numa análise inicial, o estatuto e funções do manual escolar em geral, para, posteriormente, nos referirmos ao manual de Língua Portuguesa

Gramática no ensino básico - renascer do caos ou o extermínio do mito?

No momento em que se assiste à tentativa de afirmação pedagógica da Terminologia Linguística para os Ensinos Básico e Secundário (TLEBS), muitas vozes fazem eco dos seus pareceres. Uns baseiam-se em critérios científicos para justificar os seus argumentos pró ou contra; outros, em critérios de natureza mais didáctica. Afinal, trata-se de romper com princípios e práticas enraizados numa lógica gramatical justificada pela tradição; a nomenclatura gramatical presente nos Programas é ainda a definida por Portaria do MEN, publicada no Diário do Governo, 1ª série, de 28 de Abril de 1967. Esta tentativa de colocar um estado de ordem no ensino-aprendizagem da gramática, leia-se uniformizar conceitos, surge já no texto que se apresenta como orientador das práticas lectivas, no que à disciplina de Língua Portuguesa diz respeito: A Língua Materna na Educação Básica (LMEB). Neste documento, que numa fórmula “pronto-a-usar” se condensou num livro conhecido no âmbito pedagógico como o livro das Competências, é referida a utilização da então nova Proposta de Nomenclatura Gramatical apresentada por DUARTE et al. (1991). (Cf. SIM-SIM et al.,1997,p. 84). Em consequência, alguns manuais tentaram actualizar as propostas de análise gramatical tendo por base esta nova terminologia, fazendo desde logo adivinhar a multiplicidade de noções e conceitos que passaram a emergir dos manuais (Cf. Pinto, 2000)

Effects of methadone on intraocular pressure in dogs and cats

Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina VeterináriaObjective: The purpose of this study was to determine the effects of methadone as a solo-agent of anaesthetic premedication, on intraocular pressure (IOP) in dogs and cats undergoing both elective surgeries or diagnostic procedures. Methods: The study group was composed of 32 and 5 cats. The baseline IOP (T0) of the subjects were registered before IV methadone at the 0.2 mg kg-1 dosage. IOP variations were registered ten (T10) and twenty (T20) minutes after the drug administration. IOP values were measured with rebound tonometry (Icare ®, Helsinki, Finland), each animal being positioned in sternal recumbency, without e-collars and with the head maintained relaxed at the level of the thorax. All variables were compared at each specific time point using a repeated-measures analysis of variance (ANOVA) with R® 3.3.3 software and the R-Commander extension. The differences were considered significant when p < 0.05. Results: The study group was composed of 32 dogs with a mean age of 8,6 ± 3,3 years and 5 cats with a mean age of 6,02 ± 5,3 years. Ophthalmic exam was normal. The mean ± SD baseline (T0) and post-treatment (T10, T20) IOP values were respectively: 17,1 ± 3,32 mm Hg, 16,9 ± 3,37 mm Hg and 16,3 ± 3,33 mm Hg. In the majority of the individuals, IOP levels decreased less significantly at T10 comparing to the mean values at T20. There were no statistically significant differences between baseline values and post-treatment values (p=0.296). Conclusions: There were no statistically significant variations in IOP values in dogs and cats after the administration of methadone as a solo-agent of anaesthetic premedication. Methadone may be a good alternative as anaesthetic premedication in intraocular surgery or in sedation of glaucoma patients since it apparently does not interfere with IOP.RESUMO - Objetivo: Este estudo teve como objetivo determinar os efeitos do uso de metadona como fármaco único de pré-medicação cirúrgica, na pressão intraocular, tanto em cães, como em gatos, submetidos a procedimentos cirúrgicos eletivos e/ou exames de diagnóstico complementares que necessitassem de sedação prévia. Métodos: O grupo em estudo incluiu cães e gatos submetidos a sedação. Os valores de pressão intraocular foram medidos antes da administração intravenosa de metadona, na dose de 0,2 mg kg-1, e após 10 minutos (T10) e 20 minutos (T20) da mesma. As medições foram efetuadas por tonometria de ressalto (Icare ®, Helsínquia, Finlândia) com o animal posicionado em decúbito ventral, sem uso de colar isabelino e com a cabeça mantida numa posição relaxada ao nível do tórax. Os valores da variável pressão intraocular, obtidos nos três tempos, foram comparados utilizando o teste de análise de variância (ANOVA) para medidas repetidas, com o auxílio do software R® 3.3.3 software e na sua extensão R-Commander. As diferenças foram consideradas significativas quando p< 0.05. Resultados: O grupo em estudo foi composto por 32 cães e 5 gatos com uma média de idades de 8,6 ± 3,3 e 6,02 ± 5,3 anos de idade, respetivamente. Os valores da média ± desvio padrão da pressão intraocular basais (T0) e após a administração de metadona (T10 e T20) foram, respetivamente: 17,1 ± 3,32 mm Hg, 16,9 ± 3,37 mm Hg e 16,3 ± 3,33 mm Hg. Na maioria dos indivíduos, os níveis de pressão intraocular diminuíram de forma menos marcada em T10 comparativamente com T20. Não se observou diferença estatisticamente significativa entre os três tempos em estudo (p=0,296). Conclusões: Não se observaram variações estatisticamente significativas na pressão intraocular em cães e gatos após a administração de metadona como fármaco único de pré-medicação. Este fármaco pode ser uma boa opção na cirurgia intraocular ou na sedação de animais com diagnóstico prévio de glaucoma, uma vez que aparentemente não interfere com a pressão intraocular.N/

Access to essential medicines in Timor-leste: availability, prices and affordability

O acesso a medicamentos essenciais a preços acessíveis de forma sustentável é um dos indicadores do cumprimento dos Objectivos de Desenvolvimento do Milénio e pode ser considerado como parte do direito universal à saúde. Tal como acontece com outros bens essenciais, o acesso aos medicamentos depende de múltiplos factores, como a sua disponibilidade, preços e capacidade de aquisição por parte da população. Na última década, foram efectuados mais de 50 estudos para avaliar esses factores, em países de baixos e médios rendimentos, utilizando uma metodologia desenvolvida pela Organização Mundial de Saúde e a organização Health Action International, numa tentativa de compreender as possíveis causas para o baixo acesso aos medicamentos. Os resultados destes estudos revelam uma baixa disponibilidade de medicamentos essenciais de um modo geral, sobretudo no sector público, e preços elevados, sobretudo no sector privado. O objectivo deste estudo foi descrever a disponibilidade, os preços e a capacidade de aquisição de medicamentos essenciais em Timor-Leste, com recurso à metodologia da OMS/HAI. Foram recolhidos dados sobre a disponibilidade e os preços de uma lista de medicamentos em hospitais, centros de saúde e farmácias comunitárias. Embora os resultados pareçam apontar para uma disponibilidade global razoável de medicamentos genéricos no sector público (59,2%), algumas substâncias activas e classes terapêuticas encontravam-se sistematicamente esgotadas em vários pontos do país. Nas unidades situadas em locais mais remotos, a disponibilidade de medicamentos chegava a descer para valores na ordem dos 47,5%. Verificou-se que a disponibilidade de medicamentos nas farmácias privadas era ainda mais baixa do que nos serviços públicos (38,0%). Os medicamentos são dispensados gratuitamente nos hospitais e centros de saúde, mas nas farmácias privadas chegam a ultrapassar 40 vezes os seus preços de referência internacionais, mesmo como genéricos. Consequentemente, estima-se por exemplo, que um funcionário público que utilize diclofenac para o tratamento crónico da artrose, tenha de trabalhar durante mais de 2 dias para pagar o seu tratamento mensal com o medicamento genérico, ou 12,5 dias, se for prescrito o medicamento de marca. Durante o estudo, foram detectados vários outros problemas que podem comprometer a qualidade e segurança dos medicamentos. Apesar das limitações inerentes a uma investigação deste tipo, foi possível concluir através do presente estudo que, ao contrário da tendência geral observada em países similares, o sector público de cuidados de saúde em Timor-Leste parece ter um melhor desempenho do que o privado. No entanto, as condições limitadas da maioria das unidades de saúde públicas pode forçar alguns doentes a recorrer ao sector privado, onde os preços pagos pelos tratamentos são inaceitavelmente elevados. A ausência de regulamentação do sector farmacêutico (e fiscalização insuficiente da existente) parece estar a contribuir para a estagnação do sector privado e a encorajar indirectamente a falta de transparência nas práticas farmacêuticas. Dada a escassez de estudos sobre este assunto em Timor-Leste, espera-se que o presente trabalho forneça evidências importantes que possam ser utilizadas em estudos subsequentes e como base a uma intervenção por parte das autoridades com o objectivo de melhorar a disponibilidade de medicamentos no sistema público e de encorajar o desenvolvimento do sector privado como alternativa viável, segura e de custo aceitável.Access to affordable essential medicines on a sustainable basis is one of the indicators of compliance with the Millennium Development Goals, and can be regarded as part of the human universal right to health. As with other basic commodities, access to medicines depends on multiple factors, like their availability, prices and affordability. Over the last decade, more than 50 surveys using a methodology developed by the World Health Organization and Health Action International have been carried out in low- and middle-income countries, to assess these parameters in an attempt to understand the causes underlying poor access to medicines. Findings typically reveal low availability of essential medicines, particularly in the public health system, and high prices, especially in the private forprofit sector. The objective of the present study was to describe the availability, prices and affordability of essential medicines in Timor-Leste using the WHO/HAI methodology. Data on the availability and prices of a drug tracer list was collected from a sample of hospitals, community health centres and private retail pharmacies. Although results seem to show a reasonable overall availability of generic medicines in the public sector (59.2%), some active substances and therapeutic classes were found to be consistently out of stock across the country. In facilities located in more remote areas, availability could be as low as 47.5%. Drug availability in private pharmacies was found to be even lower (38.0%). Medicines are dispensed free of charge in public health facilities, but in private pharmacies they were found to cost up to 40 times their international reference price, even as generics. As a result, it is estimated that a common government worker using diclofenac to treat chronic arthritis, for instance, would have to work 2.3 days to pay for his monthly treatment with the generic drug, or 12.5 days if the originator brand was prescribed. Other problems affecting medicines quality and safety were also detected throughout the study. Despite its limitations, the present study concluded that, contrarily to the general trend observed in similar countries, the public healthcare system in Timor-Leste seems to perform better than private. Nevertheless, the far from ideal conditions of most public health facilities can still push some patients to the private sector where costs of treatment are unacceptably high. The lack of regulation of the pharmaceutical sector (and inefficient monitoring/inspection of the existing one) seems to be contributing to the private sector’s stagnation and indirectly encouraging lack of transparency in pharmacy practice. Given the paucity of studies on the subject in Timor-Leste, it is hoped that the present work will provide an important evidence base for subsequent studies, and government intervention to better regulate the pharmaceutical sector, with the ultimate objective to improve the public drug supply, and encourage the growth of the private sector as a viable, affordable and safe alternative

Sustainability on the craft beer sector: Management improvements towards sustainable business and supply chain transparency: A case study on BARONA Brewing Company

Craft beer has revolutionized the beer industry and market worldwide through diversification, innovation, authenticity, and tradition. As a result, these SMEs challenged the large breweries operating in a highly homogenized and consolidated market. Thus, addressing sustainability challenges in the growing craft beer sector is a strong recommendation. Therefore, this study has two main objectives. The first one is to understand how to improve sustainability in a Portuguese SME craft brewery named BARONA Brewing Company and implement sustainability practices into the business model. The second objective is more geared to operational level and practical improvements, looking to understand how this microbrewery can adapt to a transparent supply chain. A mixed methodology was used to provide value-added suggestions. Information about the current sustainability and supply chain activities and performance will be collected through direct field observation and semi-structured interviews. Results analysis showed that sustainability is not a focus for SMEs craft brewers. Even though it can be challenging to improve processes and measures to accomplish it, it is possible to include it in a business model by reducing resource consumption, minimizing waste, and focusing on efficient production. This will be cost-effective and make the company closer to a fully sustainable approach. However, when it comes to the supply chain transparency topic and the use of blockchain technology this is more challenging once it needs an investment of time and money, something some SME craft brewers may not be able to dispose of.A cerveja artesanal tem revolucionado a indústria e o mercado mundial da cerveja, através da sua diversificação, inovação, autenticidade e tradição. Estas PMEs vieram desafiar as grandes cervejarias que operam num mercado altamente homogeneizado e consolidado. Assim, enfrentar os desafios da sustentabilidade no sector da cerveja artesanal é urgente. Este estudo tem dois objetivos. O primeiro é compreender como é possível melhorar a sustentabilidade numa PME portuguesa fabricante de cerveja artesanal chamada BARONA Brewing Company e implementar práticas de sustentabilidade no modelo de negócio. O segundo objetivo é orientado para o nível operacional, procurando compreender como é possível esta microcervejeira adaptar-se a uma cadeia de abastecimento transparente. Para fornecer sugestões com valor, foi escolhida uma metodologia mista. Serão recolhidas informações sobre as atividades de sustentabilidade e da cadeia de abastecimento, através da observação direta no terreno e de entrevistas semiestruturadas. Os resultados evidenciam que a sustentabilidade não é um foco para as cervejeiras artesanais. É um desafio melhorar os processos e as medidas de sustentabilidade, mas é possível incluí-la no modelo de negócio através da redução do consumo de recursos, minimização do desperdício e foco na produção eficiente. Assim será rentável e a empresa ficará mais próxima de uma abordagem totalmente sustentável. Quando se trata do tema de transparência da cadeia de abastecimento e da utilização de tecnologia de blockchain, isto é ainda mais desafiante uma vez que necessita de investimento de tempo e dinheiro, algo que algumas cervejeiras artesanais podem não ser capazes de disponibilizar

a holistic approach

As finanças sustentáveis estão a ser motivadas por uma panóplia de fatores, entre os quais estão as forças de mercado e os impulsos legislativos. Por um lado, o desenvolvimento é impulsionado por legislação, como o Plano de Ação da União Europeia para as Finanças Sustentáveis e o Regulamento de Divulgação de Finanças Sustentáveis. Estas iniciativas estabelecem objetivos e medidas claras para promover o investimento sustentável e exigem que os participantes do mercado financeiro divulguem informações sobre a sustentabilidade dos seus investimentos. Por outro lado, o desenvolvimento das finanças sustentáveis está também a ser impulsionado pelas forças do mercado, tais como a crescente procura de produtos de investimento sustentáveis e o crescente reconhecimento dos potenciais riscos e oportunidades associados à sustentabilidade. Os investidores estão cada vez mais à procura de formas de alinhar os seus investimentos com os seus valores e de apoiar a transição para uma economia mais sustentável. Globalmente, o desenvolvimento das finanças sustentáveis está a ser impulsionado tanto pela legislação como pelas forças de mercado. Um factor-chave é o reconhecimento crescente dos riscos e oportunidades potenciais associados à sustentabilidade. medida que aumenta a consciência de questões como as alterações climáticas e a degradação ambiental, os investidores estão a tornar-se mais conscientes dos potenciais impactos dos seus investimentos na sustentabilidade. Ao mesmo tempo, há também um reconhecimento crescente dos potenciais riscos e oportunidades associados à sustentabilidade, à medida que governos e empresas começam a implementar políticas e estratégias para apoiar a transição para uma economia de baixo carbono. Em resultado destes fatores, os investidores procuram cada vez mais formas de alinhar os seus investimentos com os seus valores e de apoiar a transição para uma economia mais sustentável. Isto está a levar a uma procura crescente de produtos e serviços de investimento sustentáveis, tais como obrigações verdes e outros instrumentos que apoiam a transição para uma economia com baixo teor de carbono. Outro fator fundamental para o desenvolvimento de finanças sustentáveis é a crescente disponibilidade de informação e dados sobre sustentabilidade. medida que mais dados se tornam disponíveis sobre o desempenho ambiental, social e de governança (ESG) das empresas e outros agentes económicos, os investidores estão mais aptos a avaliar a sustentabilidade dos seus investimentos e a tomar decisões mais informadas. Isto está também a conduzir ao desenvolviimento de novas referências e índices que consideram os fatores dos ESG, proporcionando aos investidores ferramentas adicionais para avaliar a sustentabilidade dos seus investimentos. Globalmente, o desenvolvimento do financiamento sustentável está a ser impulsionado por uma combinação de fatores, incluindo tanto a legislação como as forças de mercado. e à medida que mais dados e ferramentas se tornam disponíveis para apoiar o investimento sustentável, é provável que a procura de financiamento sustentável continue a crescer.Sustainable finance is being motivated by a combination of factors, including both legislative and market forces. On the one hand, the development of sustainable finance is being spurred by legislation, such as the EU Sustainable Finance Action Plan and the Sustainable Finance Disclosure Regulation (SFDR). These initiatives set out clear objectives and measures for promoting sustainable investment and require financial market participants to disclose information about the sustainability of their investments. On the other hand, the development of sustainable finance is also being driven by market forces, such as the growing demand for sustainable investment products and the increasing recognition of the potential risks and opportunities associated with sustainability. Investors are increasingly looking for ways to align their investments with their values and to support the transition to a more sustainable economy. Overall, the development of sustainable finance is being driven by both legislation and market forces. One key factor is the growing recognition of the potential risks and opportunities associated with sustainability. As awareness of issues like climate change and environmental degradation increases, investors are becoming more aware of the potential impacts of their investments on sustainability. At the same time, there is also growing recognition of the potential risks and opportunities associated with sustainability, as governments and businesses begin to implement policies and strategies to support the transition to a low-carbon economy. As a result of these factors, investors are increasingly looking for ways to their investments with their values and to support the transition to a more sustainable economy. This is leading to growing demand for sustainable investment products and services, such as green bonds and other instruments that support the transition to a low-carbon economy. Another key factor driving the development of sustainable finance is the increasing availability of information and data on sustainability. As more data becomes available on the environmental, social, and governance (ESG) performance of companies and other economic actors, investors are better able to assess the sustainability of their investments and make more informed decisions. This is also leading to the development of new benchmarks and indices that consider ESG factors, providing investors with additional tools for assessing the sustainability of their investments. Overall, the development of sustainable finance is being driven by a combination of factors, including both legislation and market forces. As more data and tools become available to support sustainable investment, the demand for sustainable finance is likely to continue to grow