MEPSA: Minimum energy pathway analysis for energy landscapes

From conformational studies to atomistic descriptions of enzymatic reactions, potential and free energy landscapes can be used to describe biomolecular systems in detail. However, extracting the relevant data of complex 3D energy surfaces can sometimes be laborious. In this article, we present MEPSA (Minimum Energy Path Surface Analysis), a cross-platform user friendly tool for the analysis of energy landscapes from a transition state theory perspective. Some of its most relevant features are: identification of all the barriers and minima of the landscape at once, description of maxima edge profiles, detection of the lowest energy path connecting two minima and generation of transition state theory diagrams along these paths. In addition to a built-in plotting system, MEPSA can save most of the generated data into easily parseable text files, allowing more versatile uses of MEPSA's output such as the generation of molecular dynamics restraints from a calculated path.Grant IPT2011-0964-900000 (Government of Spain).Peer Reviewe

PM2.5: FACTOR DE RIESGO EN SALUD DE NIÑOS MENORES A 5 AÑOS. ESTUDIO DE CASO: FONTIBÓN

En este artículo se presentan las razones por las cuales es posible que exista morbilidad por ERA en los niños menores a cinco años en la localidad de Fontibón, lo cual suele atribuirse a microorganismos (virus y bacterias). No obs-tante, desde el conocimiento técnico ambiental adquirido hasta el momento, se consideró que es posible identificar las condiciones de contaminación ambiental como un factor de riesgo que puede generar algún tipo de afección respiratoria aguda en el organismo. Es por lo anterior, que nació la necesidad de identificar una posible causa ambiental que genere Enfermedades Respiratorias Agudas en niños. Para ello, inicialmente, se hizo uso de información obtenida a partir de los informes elaborados por la Secretaría de Salud y la Subred Suroccidente de Salud de Bogotá en donde se reportan casos de ERA tanto en las Salas ERA, como en consulta externa. Posteriormente, teniendo en cuenta esa información se formuló una matriz Vester en la cual, se identificó que las causas son de carácter fisiológico, biológico y ambiental; luego, se elaboró un análisis de resultados, a partir del trabajo de campo, para finalmente, sugerir al PM2.5 como una causa potencial ambiental que podría ocasionar ERA en niños

ESTUDIO DESCRIPTIVO Y EXPLICATIVO, CAUSAS DE ERA EN NIÑOS MENORES DE CINCO AÑOS EN BOGOTÁ

La mortalidad y morbilidad en los niños menores de cinco años ocasionados por Enfermedad Respiratoria Aguda (ERA) es un fenómeno que ha preocupado a las autoridades de salud pública, debido a que esta se considera como la causa principal por la cual fallecen los niños en la primera infancia. Este se considera un tema de estudio importante que ha generado varias hipótesis sobre sus causas, por esa razón nace la necesidad de elaborar un estudio explicativo de la problemática y un estudio descriptivo de las causas mediante el uso tanto de fuentes primarias como de fuentes secundarias, en donde se logre identificar aspectos sociales, ambientales, biológicos y fisiológicos que derivan en la presencia o ausencia de ERA en niños, otorgando prioridad a los aspectos biológicos (virus), sin atribuir la debida importancia a las causas ambientales y antrópicas las cuales según varios estudios revisados, también se consideran causas importantes de ERA

Evaluación del impacto generado por las campañas de sensibilización acerca de la ingesta de ácido fólico para la prevención de enfermedades del tubo neural, en una población universitaria

Debido a la importancia del ácido fólico en el desarrollo del sistema nervioso del feto, se hace necesario adoptar estrategias que impulsen el consumo de la vitamina en aras de mitigar la frecuencia de defectos del tubo neural (DTN). En el presente estudio, se evalúa el impacto generado por las campañas de promoción de consumo de ácido fólico en una población universitaria. Los resultados al ser comparados con los de la encuesta realizada en el año 2006, evidencian que el conocimiento acerca del ácido fólico presenta una diferencia proporción del 6% pero este dato no es significativo, no obstante, la diferencia de las proporción de mujeres que conoce los beneficios de la vitamina B9 es del 13% y este dato demostró ser significativo. Los datos previamente mencionados demuestran que las campañas si funcionan, pero es de gran importancia que estas intervenciones sean incluidas en procesos pedagógicos, con el fin de recordar de forma constante la información vinculada con el ácido fólico y así generar conciencia de la importancia.Due of the importance of folic acid in the development of the fetal nervous system, it is necessary to adopt strategies that encourage the consumption of the vitamin in order to mitigate the frequency of neural tube defects (NTDs). In the present study, was evaluated the impact generated by campaigns promoting folic acid consumption in a college population. The results when compared with those of the survey conducted in 2006, show that knowledge about folic acid has a different ratio of 6% but this figure is not significant, however, the difference in the proportion of women who know benefits of vitamin B9 is 13% and this figure proved to be significant. The aforementioned data demonstrate that campaigns do work, but it is very important that these interventions are included in pedagogical processes, in order to constantly remember information associated with folic acid and generate awareness of the importance.Bacteriólogo (a)Pregrad

Plan de Apoyo a Personas Refugiadas de la Universidad de Málaga y de 16 ONG

Esta investigación tiene como finalidad conocer en profundidad el Plan de Apoyo a Personas Refugiadas de la Universidad de Málaga y de 16 ONG. El estudio pretende conocer las debilidades del plan y poder trabajar en la mejora de éstas. Los resultados servirán para seguir avanzando en la inclusión de las personas refugiadas y en la mejora de su calidad de vida.Universidad de Málaga. Campus de Excelencia Internacional Andalucía Tech

Simulación de reacciones en biomoléculas con QM/MM

Tesis doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Física Teórica de la Materia Condensada. Fecha de lectura: 13-07-201

Waveguiding properties of surface states in photonic crystals

We propose and analyze novel surface-state-based waveguides in bandgap photonic crystals. We discuss surface mode band structure, field localization and effect of imperfections on the waveguiding properties of the surface modes. We demonstrate that surface-state-based waveguides can be used to achieve directional emission out of the waveguide. We also discuss the application of the surface-state waveguides as efficient light couplers for conventional photonic crystal waveguides.Comment: 4 pages 5 figure

USO DE HIDRALAZINA 20 mg/mL IV EN PACIENTES EMBARAZADAS CON PREECLAMPSIA GRAVE (15 - 40 AÑOS), INGRESADAS SALA DE ARO, HOSPITAL DE REFERENCIA NACIONAL BERTHA CALDERÓN ROQUE, MANAGUA. MAYO - AGOSTO 2014

La preeclampsia es un síndrome exclusivo del embarazo en pacientes con edad gestacional mayor o igual a 20 semanas, que se caracteriza por la presencia de hipertensión, proteinuria y edema. Es una de las complicaciones más comunes del embarazo, en Nicaragua es considerada como la segunda causa de mortalidad materna siendo también un factor importante de mortalidad perinatal. Se realizó un estudio cuantitativo con un componente de variables cualitativas, además es un estudio descriptivo, retrospectivo y de corte transversal, basado en indicación - prescripción, sobre el uso de Hidralazina 20 mg/mL en pacientes embarazadas de 15 - 40 años con preeclampsia grave en sala de ARO del Hospital de Referencia Nacional Bertha Calderón Roque. Para obtener los datos de la población y muestra se elaboró una ficha de recolección de la información; no se utilizó ninguna fórmula para obtener la muestra de la población, sino que fueron encontradas a conveniencia

DFT molecular dynamics and free energy analysis of a charge density wave surface system

This Accepted Manuscript will be available for reuse under a CC BY-NC-ND licence after 24 months of embargo periodThe K/Si(111):B 3×3 surface, with one K atom per 3×3 unit cell, is considered a prototypical case of a surface Mott phase at room temperature. Our Density Functional Theory (DFT) Molecular Dynamics (MD) and free energy calculations show, however, a 23×3 Charge Density Wave (CDW) ground state. Our analysis shows that at room temperature the K atoms easily diffuse along the lines of a honeycomb network on the surface and that the 3×3 phase appears as the result of the dynamical fluctuations between degenerate CDW states. DFT-MD free energy calculations also show a 23×3↔3×3 transition temperature below 90 K. The competing electron-electron and electron-phonon interactions at low temperature are also analyzed; using DFT calculations, we find that the electron-phonon negative-U * is larger than the electron-electron Hubbard U, indicating that the CDW survives at very low temperatureThis work was supported by grant nos. MAT2014-59966-R and MAT2017-88258-R from the Ministerio de Economía, Industria y Competitividad (Spain