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Mortalidade infantil devido à microcefalia antes do surto de zika no Brasil
Introducción: Presentamos la variación temporal y espacial de las muertes por microcefalia en niños menores de 1 año de edad que se analizan a nivel regional, estatal y municipal en el período pre-Zika en Brasil. Materiales y métodos: Los datos sobre nacimientos y muertes de niños con microcefalia se obtuvieron de DATASUS de 1996 a 2013. La tasa de mortalidad infantil por microcefalia (TMI-M) se estimó a nivel de Región, Unidad de Federativa (UF) y Municipio. La tendencia secular (TS) y la variación del riesgo de muerte se estimaron utilizando un modelo de regresión de Poisson. El análisis estadístico espacial fue realizado por un modelo de Poisson utilizando el software Satscan. Resultados: La TMI-M muestra un TS negativo no significativo en las regiones sudeste, sur y centro-oeste de Brasil. Una mayor variación de riesgo de muerte se encuentra en las regiones Norte y Noreste. La mayoría de las UF en las regiones Sureste, Sur y Centro-Oeste mostraron un TS negativa, en contraste con lo que ocurre en las UF de las Regiones Norte y Noreste mostraron una TS positiva. Se encontraron seis agrupamientos significativos de alto riesgo: 3 en el Norte-Noreste y 3 en el Sur-SurOeste-Centro-Oeste. Conclusiones: Las regiones Norte y Noreste mostraron una TS positiva para la TMI-M y un mayor riesgo de muerte, que no se observó en las otras regiones. La distribución de los agrupamientos de mayor TMI-M y riesgo se asemeja a la distribución de los casos de microcefalia y Zika en el período del brote.Introduction: We present temporal and spatial variation of deaths from microcephaly in children under 1 year of age is analyzed at regional, state, and municipal level in the preZika period in Brazil. Materials and Methods: Data on births and deaths of infants with microcephaly was obtained from DATASUS from 1996 to 2013. Infant mortality rate from microcephaly (IMR-M) was estimated at Region, Federative Unit (UF), and Municipality level. Secular trend (ST) and risk of death variation were estimated using a Poisson regression model. Satscan software was used to obtain a statistic spatial scan for the Poisson model. Results: IMR-M shows a non-significant negative ST in the Southeast, South and Central West Regions of Brazil. A greater IMR-M risk of death variation is found in the North and Northeast Regions. Most UFs in the Southeast, South and Central West Regions showed a negative ST, in contrast to what occurs in the UFs of the North and Northeast Regions showed a positive ST. Six high risk significant clusters were found: 3 in the NorthNortheast and 3 in the South-SouthWest-Center-West. Conclusions: The North and Northeast Regions showed positive ST for IRM-M and higher death risk, which was not observed in the other regions. Cluster distribution for higher IMR-M and risk resembles the distribution of the microcephaly and Zika cases in the outbreak period.Introdução: Apresentamos a variação temporal e espacial das mortes por microcefalia em crianças menores de um ano de idade analisadas nos níveis regional, estadual e municipal no período pré-zika no Brasil. Materiais e métodos: Os dados sobre o nascimento e morte de crianças com microcefalia é obtido DATASUS 1996 a 2013. A taxa de mortalidade infantil por microcefalia (IMR-M) foi estimada região nível, UF (UF) e município. A tendência secular (ST) e a variação do risco de morte foram estimadas usando um modelo de regressão de Poisson. A análise estatística espacial foi realizada por um modelo de Poisson utilizando o software Satscan. Resultados: O IMR-M mostra um ST negativo não significativo nas regiões sudeste, sul e centro-oeste do Brasil. Uma maior variação no risco de morte da IMR-M é encontrada nas regiões Norte e Nordeste. A maioria das UF nas regiões Sudeste, Sul e CentroOeste apresentou um ST negativo, ao contrário do que ocorre na UF das Regiões Norte e Nordeste, que apresentou um ST positivo. Seis grupos significativos de alto risco foram encontrados: 3 no Norte-Nordeste e 3 no Sul-Sul-Oeste-Centro-Oeste. Conclusões: As regiões Norte e Nordeste apresentaram um ST positivo para RM e um aumento do risco de morte, o que não foi observado nas demais regiões. A distribuição dos grupos de maior IMR-M e risco assemelha-se à distribuição dos casos de microcefalia e zika no período do surtoFil: Dipierri, Jose Edgardo. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Biología de la Altura; ArgentinaFil: Schüler-Faccini, Lavinia. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; BrasilFil: Chapur, Valeria Fernanda. Universidad Nacional de Jujuy. Instituto de Ecorregiones Andinas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Ecorregiones Andinas; ArgentinaFil: Bronberg, Ruben Adrian. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Agudos "Ramos Mejía"; Argentin
Thalidomide Analogs in Brazil: Concern About Teratogenesis
It has been more than 50 years since thalidomide was withdrawn from the world market due to its teratogenic potential. However, its widespread use around the world resumed due to its immunomo-dulatory and anti-angiogenic properties. The drug established itself in new therapies, and interest continued with the emergence of more potent analogs, the most notable being lenalidomide and pomalidomide, which are not approved in Brazil. The question that arises after analog synthesis is: Do these drugs also have the same teratogenic potential? The answer to this question is based only on experimental studies because exposure to humans is not authorized and has not yet been descri-bed. Although thalidomide has been recognized as a powerful human teratogen for many years, its molecular mechanisms of teratogenesis remain to be fully explained. Efforts with animal models and human genetic studies have clarified some important pathways that are most likely involved in the teratogenic action of thalidomide. However, it has not yet been possible to identify the teratogenic domain of the molecule from the therapeutic ones. Moreover, there are species-specific differences that must be taken into consideration when teratogenicity is evaluated.Título PT: Análogos da Talidomida no Brasil: Preocupação com a TeratogêneseFaz mais de 50 anos que a talidomida foi retirada do mercado mundial devido ao seu potencial teratogênico. Entretanto, seu uso disseminado em todo o mundo foi retomado devido às suas propriedades imunomodulatórias e antiangiogênicas. A droga foi utilizada em novas terapias e o interesse continuou com a emergência de análogos mais potentes, os mais notáveis deles sendo a lenalidomida e a pomalidomida, que não estão aprovados no Brasil. A questão que surge após a síntese dos análogos é: Estas drogas também têm o mesmo potencial teratogênico? A resposta a esta pergunta baseia-se apenas em estudos experimentais, pois a exposição a humanos não está autorizada e ainda não foi reporta-da. Embora a talidomida tenha sido durante muitos anos reconhecida como um poderoso teratógeno humano, os mecanismos moleculares da teratogênese ainda não foram com-pletamente explicados. Os esforços com modelos animais e estudos genéticos humanos para entender o efeito tóxico da droga esclareceram alguns importantes caminhos que estão muito provavelmente envolvidos na ação teratogênica. Entretanto, ainda não foi possível isolar o agente teratogênico das outras ações terapêuticas na talidomida e seus análogos. Além disso, há diferenças específicas da espécie que devem ser levadas em consideração quando a teratogenicidade é avaliada
Mapeamento dinâmico da probabilidade de infestação por vetores urbanos de arbovírus nos municípios do Rio Grande do Sul, 2016-2017
Objective: To compare the official mapping with the probabilistic mapping of infestation by Aedes spp. in Rio Grande do Sul municipalities, Brazil. Methods: Ecological study analyzing samples of mosquito breeding sites collected in 2016-2017; official classification was obtained from epidemiological reports, and infestation per municipality and week was estimated by fitting a dynamic site-occupancy model to data from municipal epidemiological surveillance. Results: 187,245 samples collected in 473 municipalities returned 10,648 detections of Aedes aegypti, and 8,414 detections of Aedes albopictus.; official mapping agrees with the probabilistic mapping in municipalities from northwestern and western regions. These mappings disagree in eastern, center, northeastern and southern regions, revealing municipalities not officially infested with high infestation probability and notification of arbovirus. Conclusion: While official classification correctly identifies critically infested municipalities from northwestern and western regions, it did not identify infestation in municipalities with false negative errors and where infestation varies over time.Objetivo: Comparar o mapeamento oficial com um mapeamento probabilístico da infestação por Aedes spp. nos municípios do Rio Grande do Sul, Brasil. Métodos: Estudo ecológico com dados de amostras de criadouros em 2016-2017; obteve-se a classificação oficial em boletins epidemiológicos e estimou-se a probabilidade de infestação por município e semana, ajustando-se um modelo dinâmico de ocupação de sítios aos dados da vigilância epidemiológica municipal. Resultados: 187.245 amostras coletadas em 473 municípios originaram 10.648 detecções de Aedes aegypti e 8.414 de Aedes albopictus; o mapeamento oficial concorda com o probabilístico em municípios da região noroeste e oeste do RS; os mapeamentos discordam nas regiões leste, centro, nordeste e sul, revelando municípios oficialmente não infestados com alta probabilidade de infestação e notificação de arboviroses. Conclusão: A classificação oficial identificou infestação nos municípios infestados do noroeste e oeste; e não identificou infestação em municípios com possíveis falsos zeros e onde ela varia temporalmente
Predicting Physical Features and Diseases by DNA Analysis: Current Advances and Future Challenges
The 'omics' era and its concomitant technological advances have brought great insight into genetics. One of the most promising fields within human genetics is the prediction of physical traits from analysis of genetic material. Besides the predictive potential of DNA, the traceability of pathogenic agents in the human body through molecular analysis is also a field to be further exploited. In this review, we aim to discuss specific aspects of phenotypic prediction by analysing DNA, with special emphasis on normal variation, and the application of a technology known as ‘Forensic DNA Phenotyping’ (FDP). We also suggest the term ‘Phenotype Informative Markers’ (PIMs) to designate any molecular markers responsible for normal or pathological human phenotypic variation. In addition, we raise some recommendations related to forensic genetics, the molecular diagnosis of human diseases, and the traceability of pathogens in the human body, giving special emphasis to the need for validation of these tests with strict protocols. Some relevant concerns about privacy, ethics, and legality of such predictions have also been discussed. Finally, we look at perspectives on the use of epigenetic tools, and quote some examples of what has been done in this specific field.Fil: Silva de Cerqueira, Caio Cesar. Scientific Police Of Sao Paulo State; BrasilFil: Ramallo, Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; ArgentinaFil: Hünemeier, Tábita. Universidade de Sao Paulo; BrasilFil: de Azevedo, Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; ArgentinaFil: Quinto Sanchez, Mirsha Emmanuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; ArgentinaFil: Paschetta, Carolina Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; ArgentinaFil: Cintas, Celia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; ArgentinaFil: González, Marina Fernanda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; ArgentinaFil: Schüler-faccini, Lavinia. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; Brasil. National Institute of Medical Genetics Population; BrasilFil: Bortolini, María Cátira. Universidade Federal do Rio Grande do Sul; BrasilFil: González José, Rolando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto Patagónico de Ciencias Sociales y Humanas; Argentin
Fully automatic landmarking of 2D photographs identifies novel genetic loci influencing facial features
We report a genome-wide association study for facial features in > 6,000 Latin Americans. We placed 106 landmarks on 2D frontal photographs using the cloud service platform Face++. After Procrustes superposition, genome-wide association testing was performed for 301 inter-landmark distances. We detected nominally significant association (P-value < 5×10− 8) for 42 genome regions. Of these, 9 regions have been previously reported in GWAS of facial features. In follow-up analyses, we replicated 26 of the 33 novel regions (in East Asians or Europeans). The replicated regions include 1q32.3, 3q21.1, 8p11.21, 10p11.1, and 22q12.1, all comprising strong candidate genes involved in craniofacial development. Furthermore, the 1q32.3 region shows evidence of introgression from archaic humans. These results provide novel biological insights into facial variation and establish that automatic landmarking of standard 2D photographs is a simple and informative approach for the genetic analysis of facial variation, suitable for the rapid analysis of large population samples.- Introduction - Results And Discussion -- Study sample and phenotyping -- Trait/covariate correlation and heritability -- Overview of GWAS results and integration with the literature -- Follow-up of genomic regions newly associated with facial features: Replication in two human cohorts -- Follow-up of genomic regions newly associated with facial features: effects in the mouse -- Genome annotations at associated loci - Conclusion - Methods -- Study subjects -- Genotype data -- Phenotyping -- Statistical genetic analysis -- Interaction of EDAR with other genes -- Expression analysis for significant SNPs -- Detection of archaic introgression near ATF3 and association with facial features -- Annotation of SNPs in FUMA -- Shape GWAS in outbred mic
A GWAS in Latin Americans identifies novel face shape loci, implicating VPS13B and a Denisovan introgressed region in facial variation
To characterize the genetic basis of facial features in Latin Americans, we performed a genome-wide association study (GWAS) of more than 6000 individuals using 59 landmark-based measurements from two-dimensional profile photographs and ~9,000,000 genotyped or imputed single-nucleotide polymorphisms. We detected significant association of 32 traits with at least 1 (and up to 6) of 32 different genomic regions, more than doubling the number of robustly associated face morphology loci reported until now (from 11 to 23). These GWAS hits are strongly enriched in regulatory sequences active specifically during craniofacial development. The associated region in 1p12 includes a tract of archaic adaptive introgression, with a Denisovan haplotype common in Native Americans affecting particularly lip thickness. Among the nine previously unidentified face morphology loci we identified is the VPS13B gene region, and we show that variants in this region also affect midfacial morphology in mice
Motor development in non-microcephalic infants born to mothers with Zika Virus infection during pregnancy
O objetivo do estudo foi avaliar o desenvolvimento motor de crianças expostas ao ZIKV, nascidas com perímetro cefálico normal (PC). Estudo transversal. Trinta e uma crianças participaram do estudo, distribuídas em dois grupos: 15 crianças cujas mães foram infectadas pelo ZIKV durante a gravidez, nascidas com PC medido entre −1,9 e +2 escores Z ajustados para sexo e idade gestacional (grupo exposto); e 16 controles aleatoriamente selecionados pareados por sexo e idade, sem exposição pré-natal conhecida ao ZIKV (grupo não exposto). Alberta Infant Motor Scale (AIMS) foi usado para avaliar o desenvolvimento motor grosso. Não houve diferenças significativas entre os grupos expostos e não expostos. Embora reconfortante, devemos destacar que o AIMS é um teste de triagem e apenas avalia o desenvolvimento motor grosso, e nossa amostra foi pequena. Portanto, crianças expostas ao ZIKV na gravidez devem ser continuamente avaliadas quanto a diferentes aspectos de seu desenvolvimento.El presente estudio objetivó evaluar el desarrollo motor de niños expuestos al virus del Zika nacidos con la circunferencia de la cabeza (CC) normal. Estudio transversal. Participaron 31 niños en el estudio y se distribuyeron en dos grupos: 15 niños cuyas madres habían sido infectadas por el virus del Zika durante el embarazo nacieron con CC entre −1,9 y +2 puntajes Z ajustados por sexo y edad gestacional (grupo expuesto); y 16 controles seleccionados al azar pareados por sexo y edad, sin exposición prenatal conocida al virus del Zika (grupo no expuesto). La Alberta Infant Motor Scale (AIMS) se utilizó para evaluar el desarrollo motor grueso. No hubo diferencias significativas entre el grupo expuesto y el grupo no expuesto. A pesar de alentador, debemos destacar que la AIMS es una prueba de detección, que solo evalúa el desarrollo motor grueso, y que nuestra muestra fue pequeña. Por lo tanto, los niños expuestos al virus del Zika durante el embarazo se deben evaluar continuamente para que se identifiquen los diferentes aspectos de su desarrollo.This cross-sectional study sought to evaluate motor development in infants exposed to ZIKV born with normal head circumference (HC). Thirty one children, distributed into two groups, participated in the study: 15 whose mothers were infected by ZIKV during pregnancy, born with HC from −1.9 to +2 Z-scores, adjusted for sex and gestational age (exposed group); and 16 randomly selected infants without known prenatal exposure to ZIKV, paired by sex and age (control group). Alberta Infant Motor Scale (AIMS) was used to evaluate gross motor development. We found no significant difference between the exposed and control groups. However, considering that AIMS is a screening test that assesses only the gross motor development and the small size of our sample, infants exposed to ZIKV during pregnancy should be continuously evaluated for different aspects of their development