Journey to the center of the ceramic matrix: a study of the uses of archaeological vessels from the Late Loma l'Ántigo site, valle del Cajón, Catamarca, Argentina, through the chemical analysis of culinary residues

En el presente trabajo se dan a conocer los resultados de estudios químicos de residuos lipídicos recuperados en las matrices cerámicas de contenedores del sitio arqueológico Loma l´Ántigo, un poblado Tardío del valle del Cajón (Catamarca, Argentina). Se analizaron los residuos de 12 muestras arqueológicas por medio de cromatografía gaseosa con detector de ionización de llama (GC-FID) y una olla etnográfica mediante GC-FID y cromatografía gaseosa acoplada a espectrometría de masa (GC-MS), con fines comparativos. La identificación de distintos ésteres metílicos de ácidos grasos (FAMEs) en nueve de las muestras arqueológicas y en la olla etnográfica resulta evidencia del empleo de los contenedores en distintas actividades culinarias, que implicaron la circulación de sustancias de origen vegetal y animal. En la mayoría de estos casos, se identificaron biomarcadores de grasas de rumiantes compatibles con camélidos. La articulación de los estudios químicos con otras fuentes de indagación permitió constatar el empleo de distintos tipos de contenedores en el almacenamiento, elaboración y servicio de comidas y/o bebidas.In this paper, the results of chemical studies of lipid residues recovered from the ceramic matrices of containers from the archaeological site of Loma l'Antigo, a late settlement in the Valle del Cajón, Catamarca, Argentina, are presented. Residues extracted from 12 archaeological samples were analyzed by gas chromatography with flame ionization detection (GC-FID), and an ethnographic pot was studied by GC-FID and gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS) for comparative purposes. The identification of different fatty acid methyl esters (FAMEs) in nine of the archaeological samples and in the ethnographic pot is evidence of the use of the containers in different culinary activities that involved the circulation of substances of plant and animal origin. Various samples showed the presence of ruminant fat biomarkers compatible with camelids. The articulation of chemical studies with other sources of inquiry allowed us to verify the use of different types of containers for storage, preparation and service of foods and/or drinks.Fil: Fernández Sancha, Sofía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Saavedra 15. Instituto de las Culturas. Universidad de Buenos Aires. Instituto de las Culturas; ArgentinaFil: Lantos, Irene Johanna. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Saavedra 15. Instituto de las Culturas. Universidad de Buenos Aires. Instituto de las Culturas; ArgentinaFil: Bugliani, María Fabiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Saavedra 15. Instituto de las Culturas. Universidad de Buenos Aires. Instituto de las Culturas; ArgentinaFil: Maier, Marta Silvia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica; Argentin

Rayen Hue

Rayen Hue, proyecto audiovisual que contextualiza problemáticas identitarias, territoriales y medioambientales de la región patagónica. Compuesta por Marian Valle, la canción es el primer corte del álbum conceptual “Lenguas de Babel”. La obra, dirigida por Adriel Refle, fue producida entre principios de febrero y mediados de marzo del 2020 por un grupo de realizadores audiovisuales oriundos de Bariloche. Rayen Hue, que en mapudungun significa “Lugar de la flor”, es una canción que fusiona elementos del folclore andino, ritmos del noroeste africano, el rock canción y canto territorial mapuche. Es el relato de “Rayen”, una joven que emprende una travesía por distintos paisajes en búsqueda de una flor mágica, que tiene el poder de recordarnos la lengua de la tierra. En su aventura, nuestra protagonista deberá sortear distintos desafíos en los cuales tendrá que acudir a las diversas dimensiones del lenguaje, aprendiendo a comunicarse con el espíritu de la naturaleza y sus cuatro elementos. El concepto del Videoclip es la búsqueda de la identidad a partir del lenguaje, en torno a nuestro presente mestizo y globalizado. Así como el cuidado de nuestros espacios naturales, teniendo en cuenta los conflictos medioambientales a la par de las problemáticas de los pueblos originarios.Facultad de Arte

A whole-genome sequence and transcriptome perspective on HER2-positive breast cancers.

HER2-positive breast cancer has long proven to be a clinically distinct class of breast cancers for which several targeted therapies are now available. However, resistance to the treatment associated with specific gene expressions or mutations has been observed, revealing the underlying diversity of these cancers. Therefore, understanding the full extent of the HER2-positive disease heterogeneity still remains challenging. Here we carry out an in-depth genomic characterization of 64 HER2-positive breast tumour genomes that exhibit four subgroups, based on the expression data, with distinctive genomic features in terms of somatic mutations, copy-number changes or structural variations. The results suggest that, despite being clinically defined by a specific gene amplification, HER2-positive tumours melt into the whole luminal-basal breast cancer spectrum rather than standing apart. The results also lead to a refined ERBB2 amplicon of 106 kb and show that several cases of amplifications are compatible with a breakage-fusion-bridge mechanism

Partially methylated domains are hypervariable in breast cancer and fuel widespread CpG island hypermethylation.

Global loss of DNA methylation and CpG island (CGI) hypermethylation are key epigenomic aberrations in cancer. Global loss manifests itself in partially methylated domains (PMDs) which extend up to megabases. However, the distribution of PMDs within and between tumor types, and their effects on key functional genomic elements including CGIs are poorly defined. We comprehensively show that loss of methylation in PMDs occurs in a large fraction of the genome and represents the prime source of DNA methylation variation. PMDs are hypervariable in methylation level, size and distribution, and display elevated mutation rates. They impose intermediate DNA methylation levels incognizant of functional genomic elements including CGIs, underpinning a CGI methylator phenotype (CIMP). Repression effects on tumor suppressor genes are negligible as they are generally excluded from PMDs. The genomic distribution of PMDs reports tissue-of-origin and may represent tissue-specific silent regions which tolerate instability at the epigenetic, transcriptomic and genetic level

Identification of unique neoantigen qualities in long-term survivors of pancreatic cancer

Pancreatic ductal adenocarcinoma is a lethal cancer with fewer than 7% of patients surviving past 5 years. T-cell immunity has been linked to the exceptional outcome of the few long-term survivors1,2, yet the relevant antigens remain unknown. Here we use genetic, immunohistochemical and transcriptional immunoprofiling, computational biophysics, and functional assays to identify T-cell antigens in long-term survivors of pancreatic cancer. Using whole-exome sequencing and in silico neoantigen prediction, we found that tumours with both the highest neoantigen number and the most abundant CD8+ T-cell infiltrates, but neither alone, stratified patients with the longest survival. Investigating the specific neoantigen qualities promoting T-cell activation in long-term survivors, we discovered that these individuals were enriched in neoantigen qualities defined by a fitness model, and neoantigens in the tumour antigen MUC16 (also known as CA125). A neoantigen quality fitness model conferring greater immunogenicity to neoantigens with differential presentation and homology to infectious disease-derived peptides identified long-term survivors in two independent datasets, whereas a neoantigen quantity model ascribing greater immunogenicity to increasing neoantigen number alone did not. We detected intratumoural and lasting circulating T-cell reactivity to both high-quality and MUC16 neoantigens in long-term survivors of pancreatic cancer, including clones with specificity to both high-quality neoantigens and predicted cross-reactive microbial epitopes, consistent with neoantigen molecular mimicry. Notably, we observed selective loss of high-quality and MUC16 neoantigenic clones on metastatic progression, suggesting neoantigen immunoediting. Our results identify neoantigens with unique qualities as T-cell targets in pancreatic ductal adenocarcinoma. More broadly, we identify neoantigen quality as a biomarker for immunogenic tumours that may guide the application of immunotherapies

Retrospective evaluation of whole exome and genome mutation calls in 746 cancer samples

Funder: NCI U24CA211006Abstract: The Cancer Genome Atlas (TCGA) and International Cancer Genome Consortium (ICGC) curated consensus somatic mutation calls using whole exome sequencing (WES) and whole genome sequencing (WGS), respectively. Here, as part of the ICGC/TCGA Pan-Cancer Analysis of Whole Genomes (PCAWG) Consortium, which aggregated whole genome sequencing data from 2,658 cancers across 38 tumour types, we compare WES and WGS side-by-side from 746 TCGA samples, finding that ~80% of mutations overlap in covered exonic regions. We estimate that low variant allele fraction (VAF < 15%) and clonal heterogeneity contribute up to 68% of private WGS mutations and 71% of private WES mutations. We observe that ~30% of private WGS mutations trace to mutations identified by a single variant caller in WES consensus efforts. WGS captures both ~50% more variation in exonic regions and un-observed mutations in loci with variable GC-content. Together, our analysis highlights technological divergences between two reproducible somatic variant detection efforts

Análisis químico de residuos culinarios de las vasijas arqueológicas tardías de Loma l´ Ántigo (Valle del Cajón, Catamarca, Argentina)

En el presente trabajo se dan a conocer los resultados de estudios químicosde residuos lipídicos recuperados en las matrices cerámicas de 12contenedores del sitio arqueológico Loma l´ Ántigo, un poblado Tardío delvalle del Cajón (Catamarca, Argentina), así como también de una ollaetnográfica local. Se analizaron los ésteres metílicos de ácidos grasos(FAMEs) y esteroles a través de cromatografía gaseosa con detector deionización de llama (GC-FID) y cromatografía gaseosa acoplada aespectrometría de masa (GC-MS). La identificación de lípidos en lasmuestras arqueológicas y etnográfica es evidencia del empleo de loscontenedores en distintas actividades culinarias, que implicaron lacirculación de sustancias de origen vegetal y animal. En la mayoría de estoscasos se identificaron biomarcadores de grasas de rumiantes compatiblescon camélidos. La articulación de los estudios químicos con otras fuentes deindagación permitió constatar el empleo de distintos tipos de contenedoresen el almacenamiento, elaboración y servicio de comidas y/o bebidas.Fil: Fernández Sancha, Sofía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Saavedra 15. Instituto de las Culturas. Universidad de Buenos Aires. Instituto de las Culturas; ArgentinaFil: Lantos, Irene Johanna. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Saavedra 15. Instituto de las Culturas. Universidad de Buenos Aires. Instituto de las Culturas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica; ArgentinaFil: Bugliani, María Fabiana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Saavedra 15. Instituto de las Culturas. Universidad de Buenos Aires. Instituto de las Culturas; ArgentinaFil: Maier, Marta Silvia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Unidad de Microanálisis y Métodos Físicos en Química Orgánica; ArgentinaVIII Congreso Nacional de ArqueometríaPalpaláArgentinaUniversidad Nacional de Tucumán. Instituto de Datación y ArqueometríaUniversidad Nacional de JujuyComisión Nacional de Energía Atómic

Placenta percreta, experiencia en 20 años del Hospital Universitario La Paz, Madrid, España

La placenta percreta es una rara enfermedad placentaria, con una incidencia muy baja y un muy difícil diagnóstico prenatal. Se presentan tres casos clínicos de placenta percreta recogidos en nuestro centro en los últimos 20 años. Se realiza una exposición detallada de cada uno de ellos, atendiendo fundamentalmente a la secuencia de acontecimientos quirúrgicos que tienen lugar tras el diagnóstico de esta grave entidad. La dificultad en el diagnóstico prenatal, así como la imperiosidad de las medidas terapéuticas, convierten a la placenta percreta en una enfermedad con una elevada morbilidad y mortalidad materna. El tratamiento quirúrgico así como la prevención y el tratamiento de la hemorragia posparto son las armas fundamentales para controlar esta gravísima complicación obstétrica.<br>The placenta percreta is a rare placental disease with a very low incidence and prenatal diagnosis difficult. We present three cases of placenta percreta observed in our hospital over the past 20 years. We present a detailed discussion of each of them, fundamentally to the sequence of surgical events that occur after the diagnosis of this serious entity. The difficulty of prenatal diagnosis, as well as the urgent therapeutic measures, make the placenta percreta in a disease with high morbidity and mortality. The surgical treatment and the prevention of postpartum hemorrhage are essential weapons to control this serious obstetric complication

CORIOAMNIONITIS HISTOLÓGICA Y MORBIMORTALIDAD NEONATAL: APROXIMACIÓN AL SÍNDROME DE RESPUESTA INFLAMATORIA FETAL

Antecedentes: El síndrome de respuesta inflamatoria fetal (SRIF) es una entidad relacionada con la presencia de inflamación intrauterina y suele asociarse a infección intraamniótica. Su consecuencia más grave es la lesión cerebral y posterior desarrollo de parálisis cerebral. Objetivo: Evaluar la relación entre el síndrome de respuesta inflamatoria fetal y el desarrollo de complicaciones neonatales. Método: Estudio descriptivo y retrospectivo, realizado en el Hospital Universitario La Paz de Madrid, buscando una aproximación al SRIF desde la corioamnionitis histológica/funiculitis. El grupo de estudio constituido por 35 gestaciones simples pretérmino recogidas durante el primer semestre de 2008 y en las que la anatomía patológica de la placenta y anexos ovulares demostró la presencia de una corioamnionitis histológica y/o funiculitis. Resultados: Siete casos (20%) presentaban clínica sospechosa de infección intraamniótica, si bien en 28 gestantes (80%) existían factores de riesgo asociados al síndrome de respuesta inflamatoria fetal. Mortalidad perinatal en el grupo estudiado fue de 11,4% (4 casos). Sólo en 2 pacientes (5,7%) se pudo relacionar la muerte con el SRIF. En 28 recién nacidos (80%) se encontró algún tipo de patología, siendo la misma inherente a dicho síndrome en 17 casos (48,6%), destacando sepsis neonatal (40%), leucomalacia periventricular (14,3%) y displasia broncopulmonar (5,7%). Conclusión: Se comprueba el alto riesgo neonatal del SRIF. El conocimiento de esta condición, abre una serie de controversias diagnósticas y terapéuticas que obliga a una reevaluación de los protocolos actuales de manejo de la amenaza de parto pretérmino y la rotura prematura de membranas de pretérmino