Termoestabilización de proteínas de interés biotecnológico

Tesis doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 12-12-2012Thermostability is a desired property for many biotechnological applications of enzymes because it allows an increase in their half-life at the working temperatures and produces a concomitant increase in the stability against organic solvents and detergents. Thermostable enzymes from thermophilic microorganisms are well adapted to such conditions, but not are always available or fulfill the role that the industry or specific applications require, leading to the development of methods to select thermostable variants from enzymes of mesophilic origin. Some of these methods rely on the deep knowledge of the structure-function relationships of the enzyme to design modifications that increase the thermostability. In other cases the methods of “directed evolution” mimics nature by selecting for a specific property (thermostability) among a high variety of random or semi-random mutants generated by in vitro or in vivo procedures. In directed evolution, the success of the selection depends on the capability to select over a huge amount of variants, and require either robotic system for the analysis of individual variants, or intermediate enrichment selection procedures to decrease the burden of selection. In this Thesis, we have applied the method of folding interference at high temperature in a thermophilic host (Thermus thermophilus) to select thermostable variants of two very different enzymes, a DNA polymerase form bacteriophage φ29, and the esterase I from Pseudomonas fluorescens (PFEI). The method is based on the expression in the thermophilic host of fusions between the target protein (N-terminal) and a thermostable kanamycin nucleotidyl transferase (C-terminal) as selectable reporter. In the first part of the experimental work, we isolated T. thermophilus deletion mutants defective in a major LonA-like protease, and checked their suitability as selection host, leading us to conclude that this protease is highly relevant to avoid toxicity of the fusions. In the second and third experimental sections, we isolated “folding-reinforced” mutants of the exonuclease and polymerase domains of the DNA polymerase of F29 and explained on structural ground their effects on stability. In the final experimental section, we went through the isolation of thermostable variants of the PFEI, and also were able to explain most of the observed effects on structural models. Some of the mutations obtained with both proteins are likely susceptible of patent protection. General conclusions about what can be expected for the general application of this method to isolate thermostable variants of any protein are discussed

Varietal description of two genotypes of manzano chili pepper (Capsicum pubescens Ruiz & Pav.)

Objective: the objective of this research work was to obtain the varietal description of two varieties of chile manzano in Las Montañas in the center of Veracruz, México. Design/methodology/approach: the varietal characterization module was established under greenhouse conditions at the Centro de Bachillerato Tecnológico Agropecuario No. 99 in the municipality of Coscomatepec de Bravo. The recorded descriptors were in accordance with the International of Plant Genetic Resources Institute for Capsicum and the Graphic Handbook for Variety Description of manzano hot pepper. The plants were characterized from the seedling to the adult plant. The agronomic management of the crop was carried out in accordance with the manual for the production of manzano hot pepper in Las Montañas of the state of Veracruz. Results: all qualitative descriptors were constant for the two varieties MEXUVNE1-15-C2 and MEXUVCU1-16-C2 from seedling to fruiting; in contrast, there were dissimilarities in plant height, stem, leaf, flower, fruit and seed dimensions. Limitations of the study/implications: the pandemic caused by COVID-19 was the main limitation so that some descriptors were not recorded in a timely manner as indicated in the Graphic Handbook. Findings/conclusions: both varieties are very similar; however, the greatest distinction was in the quantitative type descriptors such as: plant height, fruit length, fruit diameter and number of seeds.Objective: The objective of this research study was to obtain the varietal description of two varieties of manzano chili pepper in Las Montañas region, in central Veracruz, Mexico. Design/methodology/approach: The varietal characterization module was established under greenhouse conditions. The markers recorded were in accordance with the International Plant Genetic Resources Institute for Capsicum and the Graphic Handbook for Variety Description of manzano chili pepper. The plants were characterized from seedling in greenhouse to adult plant. The agronomic management of the crop was carried out in accordance with the manual for the production of manzano chili pepper in Las Montañas, state of Veracruz. Results: All qualitative markers were constant for the two varieties, MEXUVNE1-15-C2 and MEXUVCU1-16-C2, from seedling to fruit setting. In contrast, there were dissimilarities in plant height, and stem, leaf, flower, fruit and seed dimensions. Study limitations/implications: The pandemic caused by COVID-19 was the main limitation, resulting in some markers not being recorded in a timely manner as indicated in the Graphic Handbook. Findings/conclusions: Both varieties are very similar; however, the greatest distinction was in the quantitative markers, such as: plant height, fruit length, fruit diameter and number of seeds

"Synthesis of Co1-xGdxFe2O4+d (0 ≥ x ≤ 0.1) and study of their magnetic, electric, and magneto-optical properties"

In this investigation, pure and gadolinium-doped cobalt ferrites (Co1−xGdxFe2O4+δ, x= 0, 0.02, 0.04, 0.06, 0.08 y 0.1), were synthesized through a modified route of the coprecipitation method. X-ray diffraction technique shows a cubic phase of the spinel-type structure typically associated with these compounds. According to Scherrer's equation, the crystallite size can be tuned through the Gd3+ content (26 nm to x= 0 and 9 nm to x= 0.1) or through the temperature of the thermal treatment (21 nm to 400 °C and 28 nm to 700 °C). The obtained powders show a ferrimagnetic behavior, at room temperature, with magnetization (reached at the maximum applied field) and coercivity values showing a dependence on the substitution grade of cobalt (II) by gadolinium (III) ions. At x= 0.02 the magnetization shows an increase of 7% (even when the particle size decreases a 40%) and the coercivity shows a decrease of 45%. DC conductivity of sintered ferrites is enhanced up to 3 orders of magnitude in the x= 0.1 substituted materials; while, keeping a constant transverse magneto-optical Kerr effect around 0.35%.This investigation was supported by Centro de Investigación en Química Aplicada through the internal projects 6238 and 6311. Noé Vázquez thanks to CIQA and Gobierno del Estado de Coahuila for the scholarship received.Peer Reviewe

Red pigment production by Penicillium purpurogenum GH2 is influenced by pH and temperature*

The combined effects of pH and temperature on red pigment production and fungal morphology were evaluated in a submerged culture of Penicillium purpurogenum GH2, using Czapek-Dox media with D-xylose as a carbon source. An experimental design with a factorial fix was used: three pH values (5, 7, and 9) and two temperature levels (24 and 34 °C) were evaluated. The highest production of red pigment (2.46 g/L) was reached with a pH value of 5 and a temperature of 24 °C. Biomass and red pigment production were not directly associated. This study demonstrates that P. purpurogenum GH2 produces a pigment of potential interest to the food industry. It also shows the feasibility of producing and obtaining natural water-soluble pigments for potential use in food industries. A strong combined effect (p<0.05) of pH and temperature was associated with maximal red pigment production (2.46 g/L)

Antología del pensamiento crítico hondureño contemporáneo

Esta antología recopila estudios en perspectiva crítica, para aportar a una interpretación racional y objetiva de la realidad de Honduras los últimos cincuenta años. Los trabajos aquí reunidos han sido formulados desde muy diversos enfoques, con un denominador común: diferenciarse de aquella interpretación convencional de los fenómenos y procesos que cumple funciones de justificación del statu quo y suele circunscribirse al discurso oficial. Se han antologado veintidós trabajos, agrupados como una pluralidad de discursos cuestionadores y propositivos. Los trabajos no están presentados en un orden cronológico, sino en uno sistemático. Se han agrupado en tres secciones: Dinámica del poder, Sociedad, economía y desarrollo, y Pensar la nación. Los textos de la primera sección hacen referencia tanto a la crisis centroamericana y el inicio de la transición democrática, como al momento presente. La segunda sección incluye trabajos de los años sesenta y setenta del siglo anterior, junto con aportes actuales. En la sección tercera, cuyo objeto de estudio es la nación, los textos tienen una temporalidad más amplia, yendo del siglo XX al XXI

. 43. Arqueología

En este número les presentamos una serie de contribuciones que ejemplifican los avances de las investigaciones y la variedad de los enfoques sobre problemas de la arqueología mesoamericana a escala regional y de sitio. Inicia el volumen con un texto sobre “La delimitación de zonas arqueológicas: apuntes para reconstruir su historia”, de Francisco Beristain, quien recalca la obligatoriedad de considerar durante la realización de tales delimitaciones, tres aspectos modulares: el académico, el social y el legal. Por su parte, Leticia González realiza un análisis crítico acerca de “La etapa lítica y las categorías utilizadas en México y Estados Unidos para designar las etapas arqueológicas más antiguas”, en donde estudia las diferentes propuestas para entender la Prehistoria en México y Estados Unidos, partiendo en buena medida del análisis de los artefactos líticos tallados, convertidos en documento principal para el estudio del poblamiento de las regiones mencionadas. César Vázquez aborda un tema referente a la comunicación de los grupos prehispánicos y la dificultad de construir nexos entre los datos arqueológicos y la comunicación que ésta pudiese indicar. Para abundar esta problemática emplea un modelo que tiene como base los principios de la semiótica y lo aplica al “Conjunto de petrograbados del Cerro Calizo, sitio arqueológico de La Proveedora, Sonora”. El “Análisis e interpretación iconográfica de las pinturas murales de Totómetla, Teotihuacan, Estado de México” es el tema abordado por Alberto Juárez, quien realiza una identificación e interpretación de los mensajes contenidos en los fragmentos murales —localizados en “palacios” o “conjuntos departamentales”—, en los que se determina una continuidad simbólica habida hasta el periodo Posclásico. Sobre “Las cerámicas tempranas en el área del delta del Balsas” escriben Ma. de Lourdes López C. y Salvador Pulido, quienes nos proporcionan información obtenida de los materiales propios de la zona, y de su relación con otros provenientes de otras zonas culturales, cercanas y lejanas. Las relaciones de unos con otros se observan, sobre todo, en los motivos decorativos afines no sólo con materiales de Colima, Michoacán y Guerrero, sino también con los del centro de México e inclusive de lugares de Sudamérica. Ma. Teresa Salomón participa con “Nuevos datos para entender la transición del Clásico al Posclásico en el Cerro Zapotecas” del valle poblano, en el cual hace una revaloración de las interpretaciones conocidas sobre la ocupación en dicho Cerro, con lo cual además se aportan nuevos elementos para entender la transición del mismo en la región poblano-tlaxcalteca. “Las canchas del Juego de Pelota de Cuauhyehualulco” y los materiales culturales aquí presentes conforman el texto de A. García Cook y Mónica Zamora, quienes realizan una comparación entre algunas canchas y conjuntos arquitectónicos con juegos de pelota de Cantona, y proponen una cronología relativa a Cuauhyehualulco, asentamiento integrado a un ramal de la ruta comercial Golfo-Sur Altiplano Central o “corredor teotihuacano”, la cual ha sido propuesta, por uno de los autores desde 1974. Claudia Itzel Alvarado y Silvia Garza apuntan interesante información relacionada con el tema “El carácter defensivo de Xochicalco (650-1100 d.C.)”, asentamiento cuyas características defensivas se incrementaron junto con otros sitios de importancia regional, en el contexto de la caída de las grandes ciudades que tuvieron su esplendor durante el periodo Clásico. Xochicalco fue una de éstas, en la que sus elementos arquitectónicos tuvieron como función básica la defensa de la ciudad. Del sitio arqueológico Bocana del Río Copalita, ubicado en las bahías de Huatulco, en el estado de Oaxaca, escriben Raúl Noé Matadamas y Sandra Liliana Ramírez. En su escrito ubican al sitio en su contexto natural e histórico. Tratan sobre el asentamiento y sus características generales, abordan las relaciones culturales y los trabajos anteriores a lo largo de la costa oaxaqueña; también hacen una descripción de la industria cerámica que han identificado hasta el momento. Enrique Nalda, a quien recordamos con aprecio, y Sandra Balanzario ofrecen “Nuevas consideraciones sobre la fase Lobil”, a partir de la propuesta de Peter Harrison para el Posclásico en el sur de Quintana Roo. Con base en los resultados de las excavaciones y sus hallazgos en estructuras monumentales de Dzibanché y en las varias casas del Posclásico, se contrastan los resultados y se amplia la documentación sobre dicha fase cultural. “Análisis composicional de seis yacimientos de obsidiana del centro de México y su clasificación con DBSCAN”, es el titulo del texto escrito por Denisse Artote y asociados, quienes llevan acabo la caracterización geoquímica de yacimientos de obsidiana con la finalidad de contar con un banco de datos que permita comparar la composición geoquímica de los artefactos arqueológicos, con la de los yacimientos, y conocer así la fuente de la cual procede la materia prima de los objetos obtenidos. Información que se puede lograr de manera automatizada utilizando el DBSCAN. La composición química de obsidiana, procedente de los yacimientos de Oyameles-Zaragoza y de muestras de los “Talleres estatales” de Cantona, así como de talleres domésticos en asentamientos entorno a dicha ciudad, en la Cuenca de Oriental, es el tema del texto de A. García Cook y colaboradores, quienes por medio de activación neutrónica analizan 79 muestras de obsidiana y otorgan los resultados a que se llegaron. En las secciones Archivo Técnico y Noticias se ofrece información importante; el texto sobre “Los toltecas de Tollan y la Cultura Tolteca”, escrito por Jorge R. Acosta, es presentado y comentado por Héctor Patiño, y “La expresión iconográfica y la modalidad verbal en las altas montañas”, es un texto escrito por Ismael Arturo Montero. Se ofrece asimismo una semblanza de Margarita Gaxiola González, a quien recordamos con aprecio, elaborada por Fernando Torres Cruz. Para concluir esta presentación, se reitera la invitación a colaborar en las páginas de Arqueología, para lo cual los trabajos enviados deberán cumplir con los requisitos incluidos en la página dos de la publicación.</p