Caractérisation de variables de structure forestière à partir du nuage de points du lidar aéroporté

Les pratiques d'aménagement forestier doivent être adaptées aux particularités des écosystèmes. L'inventaire de la structure forestière permet de fournir les informations de base pour décrire la diversité des écosystèmes. La télédétection est une solution économique pour mesurer de manière détaillée et extensive la structure forestière. Le lidar (Light Detection and Ranging) aéroporté est une technologie qui permet d'observer la structure tridimensionnelle de la végétation sur de grandes superficies. Cette thèse s'intéresse à trois éléments de la structure forestière : l'âge, la composition et la densité de couvert. Dans le premier chapitre, nous utilisons la distribution verticale des retours lidar ainsi que d'autres indicateurs de structure forestière (hauteur, taux de pénétration des premiers retours, paramètres de distribution Weibull) et de station (altitude, pente, orientation, radiation solaire, indice d'humidité, aire du bassin versant et longueur de pente arrière) pour prédire l'âge moyen des placettes avec une erreur de prédiction de 8.8 ans (R² 0.83, racine de l'erreur quadratique moyenne (RMSE) 19%). Dans le deuxième chapitre, nous avons associé la distribution verticale des retours lidar à l'espèce, l'âge et la densité de couvert en utilisant un GLM fonctionnel et un nouveau test de signifiance non paramétrique graphique permettant d'identifier les variations associées à chacune des variables. Nos résultats indiquent que les trois variables peuvent expliquer jusqu'à 47% de la variation de la distribution verticale des retours lidar. Chaque espèce présentait des caractéristiques discriminantes, mais trois groupes se démarquaient : les peuplements de peuplier faux-tremble affichaient la distribution verticale la plus uniforme ; les peuplements de sapin baumier et de bouleau à papier présentaient une distribution centrée autour de 50% de la hauteur. Les peuplements dominés par les épinettes blanche et noire présentaient une distribution plutôt concentrée à 30% de la hauteur du peuplement. Une augmentation de la fermeture du couvert était associée à une concentration de la distribution autour de 50% de la hauteur du peuplement. L'augmentation de l'âge déplaçait la distribution dans la partie supérieure du peuplement jusqu'à 50-70 ans, puis se stabilisait et redescendait à 90-120 ans. Finalement, nous avons étudié l'influence du seuil de hauteur et de la résolution spatiale de la grille sur la répétabilité des mesures de densité de couvert par lidar aéroporté en utilisant trois survols, dont deux conduits la même année (respectivement 2016 et 2018). En utilisant une mesure d'asymétrie (skewness) et la variance des différences décalées de la densité de couvert, nous avons identifié des mesures qui étaient plus répétables entre les survols. Les résultats montrent que les paramètres suivants étaient optimaux : seuil de hauteur à 3 m, résolution de grille de 25 m (RMSE de 7% et 5% ; biais de 4% et 0% pour les relevés à basse densité de 2016 et 2018). Ces résultats montrent que le lidar est un outil important pour l'enrichissement des données d'inventaire par des données de structure et pourrait contribuer à cibler les pratiques d'aménagement adaptées aux particularités des écosystèmes

Selection of roosting habitat by male Myotis bats in a boreal forest

Male little brown bats (Myotis lucifugus (Le Conte, 1831)) and northern long-eared bats (Myotis septentrionalis (Trouessart, 1897)) often roost under exfoliating bark, within trunks, and within cavities of trees during summer. Current lack of knowledge about the roosting ecology of these species in boreal forest limits our understanding of how they may be affected by logging. The main objective was to identify tree and forest stand features that were selected by bats for roosting within a balsam fir (Abies balsamea (L.) Mill.) – paper birch (Betula papyrifera Marshall) forest of Quebec, Canada. Over 3 years, we captured and fitted radio transmitters to 22 individual bats to locate their roost trees for 7–14 days following release. We measured tree and forest stand features in the field and using light detection and ranging (LiDAR) technology. Roost trees were compared with random trees using generalized linear mixed models. Male Myotis bats selected larger and taller snags, within stands containing a higher proportion of canopy gaps and a larger number of snags compared with random trees. Vegetation clumps of 0.1 ha containing a minimum of 10 snags with a diameter at breast height (DBH) = 10 cm should be maintained to preserve roosting habitat that is used by male Myotis bats in balsam fir – paper birch forests.Les petites chauves-souris brune (Myotis lucifugus (Le Conte, 1831)) et les chauves-souris nordique (Myotis septentrionalis (Trouessart, 1897)) se perchent souvent sous l’écorce exfoliante, a` l’intérieur des troncs et des cavités d’arbres durant l’été. Le manque actuel de connaissances sur l’écologie de perchage de ces espèces dans la forêt boréale limite notre compréhension sur la façon dont elles peuvent être affectées par l’exploitation forestière. L’objectif principal était d’identifier les caractéristiques des arbres et des peuplements forestiers qui étaient sélectionnés par les chauves-souris pour se percher au sein de la sapinière (Abies balsamea (L.) Mill.) a` boulot blanc (Betula papyrifera Marshall) du Québec (Canada). Durant 3 ans, nous avons capturé et équipé 22 chauves-souris de radio-émetteurs pour localiser leurs arbres-gîtes durant 7 a` 14 jours après relâche. Nous avons mesuré les caractéristiques des arbres et du peuplement sur le terrain et en utilisant la technologie LiDAR (light detection and ranging). Les arbres-gites ont été comparés a` des arbres aléatoires en utilisant des modèles mixtes linéaires généralisés. Les chauves-souris mâles du genre Myotis ont choisi des chicots plus larges et plus hauts au sein de peuplements contenant une plus grande proportion de trouées et un plus grand nombre de chicots, comparativement aux arbres aléatoires. Des parcelles de végétation de 0,1 ha comprenant un minimum de 10 chicots avec un diamètre a` hauteur de poitrine (DHP) = 10 cmdevraient être maintenues afin de préserver les sites de perchages des chauves-souris mâles du genre Myotis au sein des sapinières a` bouleau blanc

An aPKC-Exocyst Complex Controls Paxillin Phosphorylation and Migration through Localised JNK1 Activation

The exocyst/aPKC complex controls the spatiotemporal activation of the kinases JNK and ERK at the leading edge of migrating cells and thereby controls the dynamic behaviour of the adhesion protein paxillin during cell migration

Reducing the environmental impact of surgery on a global scale: systematic review and co-prioritization with healthcare workers in 132 countries

Abstract Background Healthcare cannot achieve net-zero carbon without addressing operating theatres. The aim of this study was to prioritize feasible interventions to reduce the environmental impact of operating theatres. Methods This study adopted a four-phase Delphi consensus co-prioritization methodology. In phase 1, a systematic review of published interventions and global consultation of perioperative healthcare professionals were used to longlist interventions. In phase 2, iterative thematic analysis consolidated comparable interventions into a shortlist. In phase 3, the shortlist was co-prioritized based on patient and clinician views on acceptability, feasibility, and safety. In phase 4, ranked lists of interventions were presented by their relevance to high-income countries and low–middle-income countries. Results In phase 1, 43 interventions were identified, which had low uptake in practice according to 3042 professionals globally. In phase 2, a shortlist of 15 intervention domains was generated. In phase 3, interventions were deemed acceptable for more than 90 per cent of patients except for reducing general anaesthesia (84 per cent) and re-sterilization of ‘single-use’ consumables (86 per cent). In phase 4, the top three shortlisted interventions for high-income countries were: introducing recycling; reducing use of anaesthetic gases; and appropriate clinical waste processing. In phase 4, the top three shortlisted interventions for low–middle-income countries were: introducing reusable surgical devices; reducing use of consumables; and reducing the use of general anaesthesia. Conclusion This is a step toward environmentally sustainable operating environments with actionable interventions applicable to both high– and low–middle–income countries

Tree species, crown cover, and age as determinants of the vertical distribution of airborne LiDAR returns

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Repository/R-Forge/DateTimeStamp 2014-03-06 16:07:45 Date/Publication 2014-03-07 16:01:31

implements basic and high-level functions. Processing of very large files is supported

Anisotropy of cell adhesive microenvironment governs cell internal organization and orientation of polarity

Control of the establishment of cell polarity is an essential function in tissue morphogenesis and renewal that depends on spatial cues provided by the extracellular environment. The molecular role of cell–cell or cell–extracellular matrix (ECM) contacts on the establishment of cell polarity has been well characterized. It has been hypothesized that the geometry of the cell adhesive microenvironment was directing cell surface polarization and internal organization. To define how the extracellular environment affects cell polarity, we analyzed the organization of individual cells plated on defined micropatterned substrates imposing cells to spread on various combinations of adhesive and nonadhesive areas. The reproducible normalization effect on overall cell compartmentalization enabled quantification of the spatial organization of the actin network and associated proteins, the spatial distribution of microtubules, and the positioning of nucleus, centrosome, and Golgi apparatus. By using specific micropatterns and statistical analysis of cell compartment positions, we demonstrated that ECM geometry determines the orientation of cell polarity axes. The nucleus–centrosome orientations were reproducibly directed toward cell adhesive edges. The anisotropy of the cell cortex in response to the adhesive conditions did not affect the centrosome positioning at the cell centroid. Based on the quantification of microtubule plus end distribution we propose a working model that accounts for that observation. We conclude that, in addition to molecular composition and mechanical properties, ECM geometry plays a key role in developmental processes

Gem Associates with Ezrin and Acts via the Rho-GAP Protein Gmip to Down-Regulate the Rho Pathway

Gem is a protein of the Ras superfamily that plays a role in regulating voltage-gated Ca(2+) channels and cytoskeletal reorganization. We now report that GTP-bound Gem interacts with the membrane–cytoskeleton linker protein Ezrin in its active state, and that Gem binds to active Ezrin in cells. The coexpression of Gem and Ezrin induces cell elongation accompanied by the disappearance of actin stress fibers and collapse of most focal adhesions. The same morphological effect is elicited when cells expressing Gem alone are stimulated with serum and requires the expression of ERM proteins. We show that endogenous Gem down-regulates the level of active RhoA and actin stress fibers. The effects of Gem downstream of Rho, i.e., ERM phosphorylation as well as disappearance of actin stress fibers and most focal adhesions, require the Rho-GAP partner of Gem, Gmip, a protein that is enriched in membranes under conditions in which Gem induced cell elongation. Our results suggest that Gem binds active Ezrin at the plasma membrane–cytoskeleton interface and acts via the Rho-GAP protein Gmip to down-regulate the processes dependent on the Rho pathway

Tensegrin in context: Dual role of α8 integrin in the migration of different cell types

α8β1 integrin is highly expressed in cells with contractile function, such as mesangial cells of the kidneys and vascular smooth muscle cells (VSMCs). Although it promotes migration of neural crest cells and breast cancer cells, recent studies suggest that α8 integrin has a negative regulatory role in VSMC migration. In this Review, the question of why α8β1 integrin plays a dual role in cell migration is raised and discussed. It seems that cells require optimum contractility and balanced tensile forces for migration. α8β1 integrin promotes migration of cells that are initially in a less than optimal contractile state (e.g., neural cells) and reduces the migration of cells known as contractile cells. α8β1 integrin can be called “Tensegrin” as it fits perfectly into the tensegrity model (tensional integrity) and seems to play a prominent role in the integration of the tensile forces