Identificação e avaliação de estratégias de desenvolvimento territorial em áreas de cafeicultura familiar do sul de Minas Gerais.

Este texto se refere a uma pesquisa (?Identificação e avaliação de estratégias de desenvolvimento rural sustentável para a cafeicultura do Sul de Minas?, subprojeto componente do projeto ?Estratégias, modelos e geotecnologias para a caracterização e monitoramento de agroecossistemas cafeeiros de Minas Gerais?, coordenado pela Embrapa Café) em andamento que analisa as relações sócio-ambientais do espaço rural, mais especificamente as que tratam do processo de desenvolvimento rural sustentável das famílias produtoras de café dos de Machado, Campestre e Poço Fundo, Sul de Minas Gerais. A pesquisa optou por uma combinação de métodos científicos que foca o uso eficaz dos recursos naturais e valoriza o conhecimento e cultura locais. De maneira abrangente, três preocupações estruturam o subprojeto: 1) a caracterização de territórios, sob os aspectos físico-ambiental, técnico, comercial, cultural e socioeconômico; 2) a análise da qualidade do café e 3) apoio às dinâmicas sociais e territoriais valorizando ativos específicos da região da cultura cafeeira

Identificação e avaliação de estratégias de desenvolvimento territorial em áreas de cafeicultura familiar do sul de Minas Gerais.

Este texto se refere a uma pesquisa (?Identificação e avaliação de estratégias de desenvolvimento rural sustentável para a cafeicultura do Sul de Minas?, subprojeto componente do projeto ?Estratégias, modelos e geotecnologias para a caracterização e monitoramento de agroecossistemas cafeeiros de Minas Gerais?, coordenado pela Embrapa Café) em andamento que analisa as relações sócio-ambientais do espaço rural, mais especificamente as que tratam do processo de desenvolvimento rural sustentável das famílias produtoras de café dos de Machado, Campestre e Poço Fundo, Sul de Minas Gerais. A pesquisa optou por uma combinação de métodos científicos que foca o uso eficaz dos recursos naturais e valoriza o conhecimento e cultura locais. De maneira abrangente, três preocupações estruturam o subprojeto: 1) a caracterização de territórios, sob os aspectos físico-ambiental, técnico, comercial, cultural e socioeconômico; 2) a análise da qualidade do café e 3) apoio às dinâmicas sociais e territoriais valorizando ativos específicos da região da cultura cafeeira

Tipologia dos sistemas de producao praticados pelos pequenos produtores do Estado do Ceara.

Esta pesquisa buscou tipificar e caracterizar os sistemas de producao praticados pelos pequenos produtores do Estado do Ceara. Foram selecionadas 23 Unidades Geoambientais representativas da regiao semi-arida do Estado, e para cada unidade, escolhido um municipio representativo. Em cada municipio, foi selecionada uma amostra de produtores e aplicado um questionario contendo 860 variaveis. As informacoes foram analisadas atraves de tecnicas estatisticas multivariadas. Os resultados mostraram a existencia de doze tipos distintos de pequenos produtores e que foram caracterizados de acordo com o tamanho da familia, dos rebanhos, producoes vegetais e animais, areas total e cultivadas (culturas comerciais, subsistencia e pastagens), indice de tecnologia e rendas diversas (agropecuarias, aposentadoria e outras atividades), e que estes tipos possuem demandas diferenciadas no que diz respeito a politica de difusao de tecnologias, priorizacao de acoes de pesquisa e de investimentos

BioRuby: bioinformatics software for the Ruby programming language

Summary: The BioRuby software toolkit contains a comprehensive set of free development tools and libraries for bioinformatics and molecular biology, written in the Ruby programming language. BioRuby has components for sequence analysis, pathway analysis, protein modelling and phylogenetic analysis; it supports many widely used data formats and provides easy access to databases, external programs and public web services, including BLAST, KEGG, GenBank, MEDLINE and GO. BioRuby comes with a tutorial, documentation and an interactive environment, which can be used in the shell, and in the web browser

Biogem: an effective tool-based approach for scaling up open source software development in bioinformatics

Summary: Biogem provides a software development environment for the Ruby programming language, which encourages community-based software development for bioinformatics while lowering the barrier to entry and encouraging best practices

Complete genome sequence of a serotype 11A, ST62 Streptococcus pneumoniae invasive isolate

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p><it>Streptococcus pneumoniae </it>is an important human pathogen representing a major cause of morbidity and mortality worldwide. We sequenced the genome of a serotype 11A, ST62 <it>S. pneumoniae </it>invasive isolate (AP200), that was erythromycin-resistant due to the presence of the <it>erm</it>(TR) determinant, and carried out analysis of the genome organization and comparison with other pneumococcal genomes.</p> <p>Results</p> <p>The genome sequence of <it>S. pneumoniae </it>AP200 is 2,130,580 base pair in length. The genome carries 2216 coding sequences (CDS), 56 tRNA, and 12 rRNA genes. Of the CDSs, 72.9% have a predicted biological known function. AP200 contains the pilus islet 2 and, although its phenotype corresponds to serotype 11A, it contains an 11D capsular locus. Chromosomal rearrangements resulting from a large inversion across the replication axis, and horizontal gene transfer events were observed. The chromosomal inversion is likely implicated in the rebalance of the chromosomal architecture affected by the insertions of two large exogenous elements, the <it>erm</it>(TR)-carrying Tn<it>1806 </it>and a functional prophage designated ϕSpn_200. Tn<it>1806 </it>is 52,457 bp in size and comprises 49 ORFs. Comparative analysis of Tn<it>1806 </it>revealed the presence of a similar genetic element or part of it in related species such as <it>Streptococcus pyogenes </it>and also in the anaerobic species <it>Finegoldia magna, Anaerococcus prevotii </it>and <it>Clostridium difficile</it>. The genome of ϕSpn_200 is 35,989 bp in size and is organized in 47 ORFs grouped into five functional modules. Prophages similar to ϕSpn_200 were found in pneumococci and in other streptococcal species, showing a high degree of exchange of functional modules. ϕSpn_200 viral particles have morphologic characteristics typical of the <it>Siphoviridae </it>family and are capable of infecting a pneumococcal recipient strain.</p> <p>Conclusions</p> <p>The sequence of <it>S. pneumoniae </it>AP200 chromosome revealed a dynamic genome, characterized by chromosomal rearrangements and horizontal gene transfers. The overall diversity of AP200 is driven mainly by the presence of the exogenous elements Tn<it>1806 </it>and ϕSpn_200 that show large gene exchanges with other genetic elements of different bacterial species. These genetic elements likely provide AP200 with additional genes, such as those conferring antibiotic-resistance, promoting its adaptation to the environment.</p

RSSsite: a reference database and prediction tool for the identification of cryptic Recombination Signal Sequences in human and murine genomes

Recombination signal sequences (RSSs) flanking V, D and J gene segments are recognized and cut by the VDJ recombinase during development of B and T lymphocytes. All RSSs are composed of seven conserved nucleotides, followed by a spacer (containing either 12 ± 1 or 23 ± 1 poorly conserved nucleotides) and a conserved nonamer. Errors in V(D)J recombination, including cleavage of cryptic RSS outside the immunoglobulin and T cell receptor loci, are associated with oncogenic translocations observed in some lymphoid malignancies. We present in this paper the RSSsite web server, which is available from the address http://www.itb.cnr.it/rss. RSSsite consists of a web-accessible database, RSSdb, for the identification of pre-computed potential RSSs, and of the related search tool, DnaGrab, which allows the scoring of potential RSSs in user-supplied sequences. This latter algorithm makes use of probability models, which can be recasted to Bayesian network, taking into account correlations between groups of positions of a sequence, developed starting from specific reference sets of RSSs. In validation laboratory experiments, we selected 33 predicted cryptic RSSs (cRSSs) from 11 chromosomal regions outside the immunoglobulin and TCR loci for functional testing

Professional Sports Firm Values: Bringing New Determinants to the Foreground? A Study of European Soccer, 2005-2013

Since 2004, Forbes has proposed a list of the most valuable soccer clubs. One year later, Transfermarkt began to estimate European soccer players&rsquo; value. This article estimate the determinants of firm values in European soccer over the period 2005-2013 incorporating player valuations, clubs&rsquo; operating income, and new ownership, three variables not included previously. The results of this study demonstrate that these variables are significant factors in club valuations. More generally, club assets including stadium age, club ownership type, supporter numbers and income, and past sports performances all have a significant impact

Tipologia dos sistemas de produção praticados pelos pequenos produtores rurais do Estado do Rio Grande do Norte.

Esta pesquisa buscou tipificar e caracterizar os sistemas de producao praticados pelos pequenos produtores rurais do Estado do Rio Grande do Norte. Foram selecionadas 14 Unidades Geoambientais representativas da regiao semi-arida do Estado, e para cada unidade, escolhido um municipio representativo. Em cada municipio, foi selecionada uma amostra de produtores e aplicado um questionario contendo 860 variaveis. As informacoes foram analisadas atraves de tecnicas estatisticas multivariadas. Os resultados mostraram a existencia de doze tipos distintos de pequenos produtores, que foram caracterizados de acordo com o tamanho da familia, dos rebanhos, producoes vegetais e animais, areas total e cultivadas (culturas comerciais, subsistencia e pastagens), indice de tecnologia e rendas diversas (agropecuarias, aposentadoria e outra atividades), e que estes tipos possuem demandas diferenciadas no que diz respeito a politicas de difusao de tecnologias, priorizacao de acoes de pesquisa e de investimentos