15 research outputs found

    Structural interplay of key factors in the human microRNA pathway

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    Evaluation of alternative surfactants as stabilizers for therapeutical protein formulations

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    Surfactants are potent stabilizers of proteins, preventing protein unfolding and aggregation presumably by competitive adsorption to interfaces. Due to limited data on e.g. performance and safety, only three surfactants are routinely found within marketed formulations of parenteral protein products: polysorbate 20 (PS20), polysorbate 80 (PS80), or poloxamer 188 (Px188). These molecules are well-established and safe for parenteral administration but possess liabilities such as degradation of the surfactant itself and/or chemical inhomogeneity (PS) or show decreased stabilizing effects at silicone oil-water interfaces (Px188). Thus, there is a need to evaluate alternative surfactants to expand the toolbox for product development and to ensure optimal drug product stability and quality. In our studies, potential alternative surfactants were evaluated and compared to PS20 and Px188 (e.g. during real-time and stress stability studies using a model mAb). Data from these efforts will be presented

    Evaluation der Berufseinstiegsbegleitung nach § 421s SGB III: Zwischenbericht 2011

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    Die Anforderungen an Schülerinnen und Schüler zwei Jahre vor ihrem Schulabschluss sind hoch. Schulisch sind sie mit vielen Prüfungen gefordert. Daneben müssen sie Bewerbungen für Ausbildungsplätze schreiben. Wenn es zum Bewerbungsgespräch kommt, stehen sie vor einer unbekannten Situation. Viele sind unsicher darüber, wie es nach der Schule weitergeht. Das Berufsleben - später meist selbstverständlich - ist die große Unbekannte. In dieser Phase hilft die Berufseinstiegsbegleitung nach dem Arbeitsförderungsrecht derzeit in einer modellhaften Erprobung an rund 1.000 Schulen denjenigen, die besondere Schwierigkeiten beim Schulabschluss und beim Übergang in die berufliche Zukunft haben. Bisher wurden dabei rund 37.000 Schülerinnen und Schülern durch die Bundesagentur für Arbeit gefördert. Die begleitende Wirkungsforschung (Evaluation) zeigt nun, dass sich bei den Teilnehmenden leichte Verbesserungen der Noten in Mathematik, Deutsch und Englisch zeigen. Von denjenigen, die die Schule „in Begleitung“ verlassen haben, haben 22,8 % eine betriebliche und 5,1 % eine schulische Berufsausbildung begonnen. Vergleichszahlen zu Übergängen von der Schule in den Beruf von jungen Menschen "ohne entsprechende Begleitung" liegen noch nicht vor. Nach der Schule verteilen sich die Schülerinnen und Schüler auf verschiedene Betriebe, Berufsschulen und andere Einrichtungen. Für die Tätigkeit der Berufseinstiegsbegleiterinnen und -begleiter stellt dies eine räumliche und eine organisatorische Herausforderung dar. Denn die Berufseinstiegsbegleitung endet in der Berufsausbildung normalerweise erst nach sechs Monaten. Damit soll die kritische Anfangsphase, in der die meisten Abbrüche stattfinden, stabilisiert werden. Die bisherigen positiven Erfahrungen mit der Berufseinstiegsbegleitung haben die Bundesregierung dazu veranlasst, im Entwurf eines Gesetzes zur Verbesserung der Eingliederungschancen am Arbeitsmarkt die Entfristung der Berufseinstiegsbegleitung vorzuschlagen. Der Deutsche Bundestag hat dieses Gesetz am 23. September 2011 verabschiedet

    Importin-β facilitates nuclear import of human GW proteins and balances cytoplasmic gene silencing protein levels

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    MicroRNAs (miRNAs) guide Argonaute (Ago) proteins to distinct target mRNAs leading to translational repression and mRNA decay. Ago proteins interact with a member of the GW protein family, referred to as TNRC6A-C in mammals, which coordinate downstream gene-silencing processes. The cytoplasmic functions of TNRC6 and Ago proteins are reasonably well established. Both protein families are found in the nucleus as well. Their detailed nuclear functions, however, remain elusive. Furthermore, it is not clear which import routes Ago and TNRC6 proteins take into the nucleus. Using different nuclear transport assays, we find that Ago as well as TNRC6 proteins shuttle between the cytoplasm and the nucleus. While import receptors might function redundantly to transport Ago2, we demonstrate that TNRC6 proteins are imported by the Importin-β pathway. Finally, we show that nuclear localization of both Ago2 and TNRC6 proteins can depend on each other suggesting actively balanced cytoplasmic Ago – TNRC6 levels

    De novo Assembly of a New Solanum pennellii Accession Using Nanopore Sequencing

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    Updates in nanopore technology have made it possible to obtain gigabases of sequence data. Prior to this, nanopore sequencing technology was mainly used to analyze microbial samples. Here, we describe the generation of a comprehensive nanopore sequencing data set with a median read length of 11,979 bp for a self-compatible accession of the wild tomato species Solanum pennellii. We describe the assembly of its genome to a contig N50 of 2.5 MB. The assembly pipeline comprised initial read correction with Canu and assembly with SMARTdenovo. The resulting raw nanopore-based de novo genome is structurally highly similar to that of the reference S. pennellii LA716 accession but has a high error rate and was rich in homopolymer deletions. After polishing the assembly with Illumina reads, we obtained an error rate of <0.02% when assessed versus the same Illumina data. We obtained a gene completeness of 96.53%, slightly surpassing that of the reference S. pennellii. Taken together, our data indicate that such long read sequencing data can be used to affordably sequence and assemble gigabase-sized plant genomes
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