Energy Efficient Parallel K-Means Clustering for an Intel Hybrid Multi-Chip Package

International audienceFPGA devices have been proving to be good candidates to accelerate applications from different research topics. For instance, machine learning applications such as K-Means clustering usually relies on large amount of data to be processed, and, despite the performance offered by other architectures, FPGAs can offer better energy efficiency. With that in mind, Intel ® has launched a platform that integrates a multicore and an FPGA in the same package, enabling low latency and coherent fine-grained data offload. In this paper, we present a parallel implementation of the K-Means clustering algorithm, for this novel platform, using OpenCL language, and compared it against other platforms. We found that the CPU+FPGA platform was more energy efficient than the CPU-only approach from 70.71% to 85.92%, with Standard and Tiny input sizes respectively, and up to 68.21% of performance improvement was obtained with Tiny input size. Furthermore, it was up to 7.2× more energy efficient than an Intel® Xeon Phi ™, 21.5× than a cluster of Raspberry Pi boards, and 3.8× than the low-power MPPA-256 architecture, when the Standard input size was used

RICHARD RORTY E O PROBLEMA COM A TEORIA DO CONHECIMENTO

O presente estudo é uma reflexão sobre apontamentos realizados pelo filósofo neopragmatista Richard Rorty em sua crítica à metafísica e epistemologia então dominantes, sobretudo às tentativas de abordar o conhecimento como uma espécie de imagem especular da realidade. Problematiza-se a concepção do filósofo estadunidense sobre a função da epistemologia tanto na filosofia como nas demais áreas da cultura. De modo geral, objetiva-se mostrar como a crítica de Rorty incide sobre a epistemologia em sua pretensão de erigir divisões e legislar sobre as áreas da cultura humana, separando as que podem ser conhecidas com um rigor metodológico daquelas que não possuem rigor epistemológico, criando, com isso, uma cissura entre as áreas do conhecimento e, finalmente, dando especial atenção às ciências naturais que, por possuírem um método inquestionável, estariam em condições de servirem de modelos às demais. De modo mais específico, objetiva-se mostrar como tal perspectiva crítica relaciona-se ao que Rorty vem chamar de behaviorismo epistemológico e como, a partir dele, podemos desenvolver nossas práticas de uma comunidade de pesquisadores, mais baseados na solidariedade do que na objetividade. Justifica-se tal estudo pela centralidade dos temas tratados para uma compreensão das ideias do autor e do cenário mais amplo do neopragmatismo contemporâneo, salientando os debates sobre como o conhecimento humano pode ser adquirido, antes, mediante uma comunidade voltada para a solidariedade, do que uma comunidade voltada para a objetividade e das implicações de tais concepções em distinções metafísicas tradicionais, como as erigidas entre esquema e conteúdo, ou fato e valor. Espera-se, mediante a leitura de textos fundamentais do filósofo neopragmatista e da literatura crítica a seu respeito, consolidar uma compreensão suficientemente robusta da crítica à epistemologia a fim de, num segundo momento, analisar como Rorty argumenta em prol de uma posição filosófica em que a redescrição seja uma maneira de construir novos vocabulários para a sociedade, para o ser humano e para as diversas ciências

Positividade da anemia infecciosa equina no Distrito Federal

Anemia Infecciosa Equina (AIE) é uma doença de notificação obrigatória causada por um lentivírus que infecta membros da família Equidae, ela é caracterizada por sua baixa letalidade e alta morbidade. A sintomatologia caracteriza-se por episódios febris, perda de peso, debilidade progressiva e anemia, e a transmissão da doença ocorre por repasto sanguíneo de um animal infectado para outro suscetível, o que advém principalmente da alimentação por insetos hematofágos, que quando alimentados de um animal infectado carreiam o vírus em seu aparelho bucal podendo infectar outros animais. Esse projeto teve como objetivo identificar a positividade da AIE em equídeos do Distrito Federal e estimar fatores de risco associados a doença. Para análise da distribuição espacial de AIE foram elaborados mapas utilizando a distribuição de casos. O banco utilizado foi a partir de dados secundários, e o número e distribuição dos casos notificados na SEAGRI no período de 2013 a 2018. O nível de agregação destas unidades espaciais foi o município de residência. Os mapas temáticos foram elaborados utilizando o software ARCGis e a distribuição da ocupação espacial dos municípios foi obtida a partir dos recenseamentos do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE). Foram encontrados 192 animais sororeagentes entre os anos de 2013 a 2018, sendo desses 145 equinos e 47 muares. Apenas 3,12% dos animais atestados no estudo tinham como finalidade a reprodução, enquanto 41,66% tinha como finalidade o lazer e 55,2% o trabalho. A região administrativa com maior número de animais positivos foi a Asa Norte, com 20,8% dos casos, seguido por Planaltina com 15,6% e Brazlândia com 14%. Foi realizada a eutanásia de 91,14% dos animais sororeagentes, 5,2% dos animais apresentaram resultado negativo no reteste, 0,52% foram a óbito antes da eutanásia, 1,04% foram encaminhados para outro Estado e 0,52% dos animais foram dados como desaparecidos. Os achados no estudo são de extrema importância, uma vez que permitem auxiliar a planificação de uma política sanitária adequada para o controle e futura erradicação da doenç

NPARSEC : NTT Parallaxes of Southern Extremely Cool objects. Goals, targets, procedures and first results

The discovery and subsequent detailed study of T dwarfs have provided many surprises and pushed the physics and modelling of cool atmospheres in unpredicted directions. Distance is a critical parameter for studies of these objects to determine intrinsic luminosities, test binarity and measure their motion in the Galaxy. We describe a new observational programme to determine distances across the full range of T-dwarf subtypes using the New Technology Telescope (NTT)/SOFI telescope/instrument combination. We present preliminary results for ten objects, five of which represent new distances.Peer reviewe

Characterization of monocarboxylate transporters (MCTs) expression in soft tissue sarcomas: distinct prognostic impact of MCT1 sub-cellular localization

Background: Soft tissue sarcomas (STSs) are a group of neoplasms, which, despite current therapeutic advances, still confer a poor outcome to half of the patients. As other solid tumors, STSs exhibit high glucose consumption rates, associated with worse prognosis and therapeutic response. As highly glycolytic tumors, we hypothesized that sarcomas should present an increased expression of lactate transporters (MCTs). Methods: Immunohistochemical expression of MCT1, MCT2, MCT4 and CD147 was assessed in a series of 86 STSs and the expression profiles were associated with patients’ clinical-pathological parameters. Results: MCT1, MCT4 and CD147 were mainly observed in the plasma membrane of cancer cells (around 60% for MCTs and 40% for CD147), while MCT2 was conspicuously found in the cytoplasm (94.2%). Importantly, we observed MCT1 nuclear expression (32.6%). MCT1 and MCT4, alone or co-expressed with CD147 in the plasma membrane, were associated with poor prognostic variables including high tumor grade, disease progression and shorter overall survival. Conversely, we found MCT1 nuclear expression to be associated with low grade tumors and longer overall survival. Conclusions: The present work represents the first report of MCTs characterization in STSs. We showed the original finding of MCT1 expression in the nucleus. Importantly, opposite biological roles should be behind the dual sub-cellular localization of MCT1, as plasma membrane expression of MCT1 is associated with worse patients’ prognosis, while nuclear expression is associated with better prognosis.The authors thank Dr. Pierre Aman, from the Lundberg Laboratory for Cancer Research, Department of Pathology, Sahlgrenska Academy at Goteborg University, Goteborg, Sweden, for providing the myxoid liposarcoma cell line MLS-1765. CP received a post-doctoral fellowship from FCT (Portuguese Foundation for Science and Technology, SFRH/BPD/69479/2010). FMS received a doctoral fellowship from FCT (SFRH/BD/87139/2012)

MUDANÇA CLIMÁTICA, RISCOS E VULNERABILIDADE: UM ESTUDO DOS EVENTOS OCORRIDOS EM 1967 E 1996 NA PLANÍCIE LITORÂNEA DE CARAGUATATUBA – SP

O presente trabalho apresenta uma revisão de estudos existentes, sobre os eventos extremos ocorridos na Serra do Mar, na área do município de Caraguatatuba – SP, nas décadas de 1960 e 1990 e suas implicações para a população local. Estudos indicam que características biofísicas e climatológicas, somadas às ações antrópicas, contribuem para uma maior fragilidade ambiental, principalmente nas áreas de encosta, acentuando sua vulnerabilidade à ocorrência de eventos extremos. Pesquisas demonstram que, além destas características, alterações no padrão do clima global, podem contribuir para intensificação de tais eventos. Este trabalho propõe-se a fazer uma compilação de dados e estudos sobre a Fazenda Serramar, também conhecida como Fazenda São Sebastião e Fazenda dos Ingleses, localizada em uma grande área de planície litorânea. Esta foi importante pólo de atividades sócio-econômicas do município de Caraguatatuba até a década de 1970, e, atualmente, recebe as instalações da Unidade de Tratamento de Gás Monteiro Lobato – UTGCA da Petrobras, parte do Plano de Aceleração de Crescimento (PAC) e do Plano de Antecipação da Produção de Gás (Plangas). Estudos recentes, relacionados à vulnerabilidade das populações, propõem um novo enfoque, mais amplo, para além da dinâmica biofísica do evento, e, que considera as relações entre os processos sociais, políticos e econômicos envolvidos no desastre. Sob este prisma, buscamos identificar as novas perspectivas, riscos, vulnerabilidades das populações locais e mudança climática local e regional (Vale do Paraíba) a partir do novo uso e exploração da área da planície litorânea de Caraguatatuba – SP conhecida como Fazenda Serramar. ABSTRACT This paper presents a review of existing studies of extreme events occurred in “Serra do Mar”, in the area of Caraguatatuba city, São Paulo, in the 1960s and 1990s, as well as their implications for the local population. Studies indicate that the biophysical and climate characteristics, added to human activities, contribute to a greater environmental vulnerability, especially in hillside areas, enhancing their vulnerability to occurrence of extreme events. Researches shown that in addition to these characteristics, changes in the pattern of global climate can contribute to increase of such events. This paper proposes to elaborate a compilation of data and studies on the Serramar Farm, also known as São Sebastião Farm and the British’s Farm, located in a large area of coastal plain. This farm was an important center of the socioeconomic activities of the municipality of Caraguatatuba until the 1970s, and currently receives facilities of Gas Treatment Unit Monteiro Lobato (UTGCA) Petrobras, part of the Growth Acceleration Plan (PAC) and Plan of the Gas Production Anticipation (Plangas). Recent studies related to the vulnerability of populations, proposed a new approach, wider, beyond the biophysical dynamics of the event which regards the relationship among the economic, political and social involved in the disaster. Under this view, we seek, so identify new perspectives, risks and vulnerabilities of the local communities and local and regional climate changes (Paraiba Valley) having as a starting point the new use and exploitation of the coastal plain area of Caraguatatuba/SP, as known as Serramar Farm. Key words: Extreme Events. Environment. Climate Change. Population. Risks. Vulnerability. RESUMEN El presente trabajo presenta una revisión de estudios existentes, sobre los eventos extremos ocurridos en la Sierra del Mar, en el área del municipio de Caraguatatuba/SP, en las décadas de 1960 y 1990, y sus implicaciones para la población local. Estudios señalan que características biofísicas y climatológicas, sumadas a las acciones del hombre, contribuyen para una mayor fragilidad ambiental, principalmente en las áreas de ladera, acentuando su vulnerabilidad a la ocurrencia de eventos extremos. Investigaciones demuestran que, además de estas características, alteraciones en el patrón del clima global pueden contribuir para la intensificación de tales eventos. Este trabajo propone hacer una recogida y análisis de datos y estudios sobre la Hacienda Serramar, también conocida como Hacienda São Sebastião y Hacienda de los Ingleses, ubicada en una extensa área de llanura costera. Esta fue un importante polo de actividades socioeconómicas del municipio de Caraguatatuba hasta la década de 1970 y, actualmente, recibe las instalaciones de la Unidad de Tratamiento de Gas Monteiro Lobato (UTGCA) de la Petrobras, parte del Plan de Aceleración de Crecimiento (PAC) y del Plan de Anticipación de la Producción de Gas (Plangas). Estudios recientes, relacionados a la vulnerabilidad de las poblaciones, proponen nueva perspectiva, más amplia, hacia al más allá de la dinámica biofísica del evento, que considera las relaciones entre los procesos sociales, políticos y económicos involucrados en el desastre. Bajo este prisma, buscamos identificar las nuevas perspectivas, riesgos, vulnerabilidades de las poblaciones locales y cambio climático local y regional (Vale do Paraíba), a partir del nuevo uso y explotación del área de la llanura costera de Caraguatatuba/SP, conocida como Hacienda Serramar. Palabras clave: Eventos Extremos. Medio Ambiente. Cambios Climáticos. Población. Riesgos. Vulnerabilidad

Sepse: uma discussão sobre as mudanças de seus critérios diagnósticos / Sepse: a discussion on the changes of its diagnostic criteria

No início de 2016 ocorreu o Terceiro Consenso Internacional para a Definição de Sepse e Choque Séptico (Sepsis-3), no qual algumas mudanças foram adotadas em relação aos antigos critérios diagnósticos, e com elas surgiram dúvidas e discussões a respeito de suas adequações, vantagens e desvantagens. Para melhor esclarecimento destas questões realizamos esta revisão da literatura, cujos resultados indicaram que as atualizações das definições de sepse trazem vantagens em relação ao entendimento de sua definição e fisiopatologia, além de trazer maior importância a qualquer quadro de sepse. Entretanto, o novo escore ainda apresenta problemas como: dificuldade do uso, retardo do diagnóstico, ausência de validação prospectiva do Quick Sequential Organ Failure Assessment (qSOFA), diminuição da importância do lactato e redução da sensibilidade. Desse modo, os critérios de Systemic Inflammatory Response Syndrome (SIRS) ainda não podem ser totalmente abandonados, principalmente nos países em desenvolvimento. Além disso, ainda é necessária a realização de mais estudos prospectivos sobre o assunto e que levem em consideração dados de países em desenvolvimento, como mortalidade, recursos e epidemiologia.

Parallaxes of southern extremely cool objects (PARSEC). II : Spectroscopic follow-up and parallaxes of 52 targets

We present near-infrared spectroscopy for 52 ultracool dwarfs, including two newly discovered late-M dwarfs, one new late-M subdwarf candidate, three new L, and four new T dwarfs. We also present parallaxes and proper motions for 21 of them. Four of the targets presented here have previous parallax measurements, while all the others are new values. This allow us to populate further the spectral sequence at early types (L0-L4). Combining the astrometric parameters with the new near-infrared spectroscopy presented here, we are able to investigate further the nature of some of the objects. In particular, we find that the peculiar blue L1 dwarf SDSS J133148.92-011651.4 is a metal-poor object, likely a member of the galactic thick disk. We discover a new M subdwarf candidate, 2MASS J20115649-6201127. We confirm the low-gravity nature of EROS-MP J0032-4405, DENIS-P J035726.9-441730, and 2MASS J22134491-2136079. We present two new metal-poor dwarfs: the L4pec 2MASS J19285196-4356256 and the M7pec SIPS2346-5928. We also determine the effective temperature and bolometric luminosity of the 21 targets with astrometric measurements, and we obtain a new polynomial relation between effective temperature and near-infrared spectral type. The new fit suggests a flattening of the sequence at the transition between M and L spectral types. This could be an effect of dust formation, which causes a more rapid evolution of the spectral features as a function of the effective temperature.Peer reviewe

Cultura de embrião e indução de brotos in vitro para micropropagação do pinhão‑manso

O objetivo deste trabalho foi otimizar o cultivo e desenvolvimento de embriões, bem como avaliar a indução da micropropagação do pinhão‑manso (Jatropha curcas) in vitro. Na primeira etapa, foi avaliada a influência da sacarose (concentrações 0, 15, 30 e 60 g L-1) no desenvolvimento de embriões em meio basal MS. Das plântulas geradas no cultivo de embriões, foram excisadas microestacas e colocadas em meio MS suplementado com os reguladores vegetais 6‑benziladenina (BA), 6‑benzilaminopurina (BAP), cinetina (6‑furfuriladenina) (KIN) e ácido 4‑(3‑indolil) butírico (AIB), nas concentrações 0,5, 1,0, 2,0 e 3,0 mg L-1. Os resultados evidenciaram que a faixa de 15 a 30 g L-1 de suplementação exógena da sacarose promove o melhor alongamento da parte aérea das plantas; a rizogênese, contudo, é mais vigorosa na faixa de 30 a 60 g L-1, em que ocorre aumento significativo do número de raízes. Na fase de micropropagação, o BAP à concentração de 2,0 mg L-1 induz maior número de brotações, enquanto a KIN (1,0 e 2,0 mg L-1) promove maior número de folhas. Ocorre calogênese na base das brotações, mais significativa na suplementação com 2,0 mg L-1 de 6‑BAP. A melhor concentração de sacarose, quanto ao vigor vegetal e rapidez na obtenção de explantes, é de 30 g L-1. Na micropropagação, os melhores resultados da organogênese direta de brotações ocorrem à concentração de 2,0 mg L-1 de BAP.The objective of this work was to optimize the cultivation and embryo development, as well as to evaluate in vitro micropropagation induction of physic nut (Jatropha curcas). In the initial stage, the influence of sucrose (concentrations of 0, 15, 30 and 60 g L-1) on the development of embryos in basal MS medium was evaluated. From the seedlings generated in the embryo culture, microcuttings were excised and inoculated on MS medium supplemented with the plant regulators 6‑benzyladenine (BA), 6‑benzylaminopurine (BAP), kinetin (6‑furfuryladenine) (KIN) and 4‑(3‑indolyl) butyric acid (IBA), in the concentrations of 0.5, 1.0, 2.0 and 3.0 mg L-1. The results showed that the range of 15 to 30 g L-1 of exogenous supplementation with sucrose promotes the best shoot elongation of plants; however, rhizogenesis is more vigorous in the range from 30 to 60 g L-1, in which a significant increase of the number of roots occurs. In the micropropagation phase, BAP at 2.0 mg L-1 concentration induces a higher number of shoots, while KIN (1.0 and 2.0 mg L-1) promotes a higher number of leaves. Callogenesis occurs on the shoot base, being more significant when supplemented with 2.0 mg L-1 of 6‑BAP. The best sucrose concentration, for plant vigor and speed in obtaining explants, is 30 g L-1. In micropropagation, the best results for direct shoot organogenesis occur at 2.0 mg L-1 BAP concentration