A machine learning based drug discovery pipeline: finding new therapies for Cystic Fibrosis

Tese de mestrado, Bioinformática e Biologia Computacional, Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2019O avanço tecnológico e a crescente disponibilidade de dados públicos levaram ao desenvolvimento de metodologias robustas de predição de atividade de compostos com base em aprendizagem automática. Estas metodologias apresentam maior rapidez, eficiência e menores custos que os métodos tradicionais de descoberta de fármacos. Fibrose Quística (FQ) é uma doença autossómica progressiva para a qual existe urgente necessidade de surgimento de novas terapias. Mutações no gene CFTR nos pacientes de FQ levam à produção deficiente do canal de membrana de transporte de aniões CFTR, gerando desequilíbrios iónicos e transporte anormal de fluidos. FQ afeta vários órgãos, os pulmões com mais gravidade, sendo normalmente devido a problemas nestes a causa de morte prematura. A mutação mais prevalente e relevante em FQ é a deleção da fenilalanina 508 (F508del-CFTR). Por esta razão, os principais esforços de descoberta de novos fármacos são direcionados a corrigir ou amenizar os feitos desta mutação. Foi criada uma metodologia com recurso a modelos de aprendizagem automática de classificação e regressão baseada em máquinas de vetores de suporte e Random Forests para descoberta de compostos com potencial terapêutico em FQ a partir de bases de dados de compostos de acesso público. Os compostos mais promissores foram selecionados e testados em laboratório através de ensaios de imunofluorescência com microscopia automatizada de triagem e análise de alto rendimento sobre o efeito na F508del-CFTR, com base na eficiência de tráfego da F508del-CFTR para a membrana plasmática. Os 10 compostos com melhores resultados neste ensaio foram validados com Western Blot e comparados com dois conhecidos compostos corretores da F508del-CFTR. 4 compostos foram identificados como promissores compostos terapêuticos para FQ

Logística interna: modelo de reposição semi-automático de materiais e suprimentos - um estudo de caso no SESC

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Produção.Essa dissertação tem como objetivo demonstrar a importância da logística interna nas organizações prestadoras de serviço. A logística é vista como um processo capaz de aumentar a eficiência organizacional através da redução dos custos operacionais bem como agiliza os processos de movimentação das mercadorias em toda cadeia de abastecimento. A logística é um termo militar que foi incorporado pelas organizações comerciais e industriais a partir da evolução tecnológica. Muito pouco tem sido estudado e escrito sobre a logística interna e, bem menos ainda, sobre a logística em empresas prestadoras de serviço. Vamos apresentar de que forma o modelo de ressuprimento matemático de mercadorias muito utilizado no comércio pode ajudar e contribuir para que as empresas prestadoras de serviço consigam criar vantagens competitivas. Apresenta toda a evolução histórica do termo logística no mundo e no Brasil e a sua tendência e benefícios para as organizações. A empresa em estudo será caracterizada e apresentada pela demonstração de suas estruturas físicas, seus objetivos e serviços prestados à sociedade. Para a comprovação do problema e para o atendimento do objetivo proposto, é apresentado o modelo informatizado de ressuprimento semi-automático atualmente em uso na instituição SESC. Dentre os modelos de gestão do estoque existentes; Just-in-time, lote econômico e do ponto de pedido (matemático), foi escolhido o modelo do ponto de pedido como sendo o mais viável para as empresas prestadoras de serviço onde incluímos no processo o envolvimento do elemento humano no processo de decisão. Esse estudo não se esgota e nem tão pouco reduz o campo de pesquisa nessa área da administração, pelo contrário, ele serve de estímulo para a integração entre as empresas através dos sistemas, e-commerce (comércio eletrônico), business to business (negócio entre empresas)

O impacto da adoção do SNC no capital próprio das empresas portuguesas

Comunicação apresentada em XIV Congresso Internacional de Contabilidade e Auditoria, LisboaA entrada em vigor em 2010 do Sistema de Normalização Contabilística (SNC) completou o processo de harmonização contabilístico, iniciado em 2005, em Portugal. Neste trabalho pretende-se analisar o impacto que a adoção do SNC teve nos capitais próprios das empresas. Utilizando as últimas demonstrações financeiras apresentadas de acordo com o Plano Oficial de Contabilidade e as primeiras apresentadas de acordo com o SNC, comparamos os capitais próprios e através da análise de um conjunto de empresas verificamos os impactos daí resultantes. Do estudo conclui-se que, a adoção do novo normativo teve impacto muito diverso nos capitais próprios das empresas. Para a maioria das empresas (60%) a variação dos capitais próprios foi nulo ou inferior a 5%, tendo as restantes variações superiores

Estudo e otimização de estruturas em PDMS para dispositivos microfluídicos

Dissertação de mestrado em Micro-Nano TecnologiasO uso de elastómeros tem atraído o interesse de investigadores no desenvolvimento de sistemas microeletromecânicos e componentes microfluídicos para aplicações biomédicas. O polidimetilsiloxano, mais vulgarmente conhecido por PDMS, é um exemplo desses materiais. O extenso conhecimento deste material, aliado ao seu baixo custo e a outras características como facilidade de fabrico, flexibilidade, biocompatibilidade, transparência ótica, entre outras, permitiram a sua utilização numa diversificada gama de aplicações. Aplicações essas que vão desde nanogeradores de energia até dispositivos médicos, bem como aplicações microfluídicas funcionando como microválvulas, micromisturadores e microbombas. O interesse do grupo de investigação na área da microfluídica, juntamente com as propriedades apresentadas por este material, estimularam o objetivo desta dissertação de mestrado. O trabalho implicou o desenvolvimento de toda a instalação experimental e a otimização do processo de fabrico do PDMS direccionado para estruturas microfluídicas. Para tal, avaliaram-se as diferentes fases do processamento como a mistura, a desgasificação e a cura. Além disso, verificou-se o efeito da alteração das variáveis do processo de fabrico como a proporção base do pré-polímero/agente de cura, o tempo e a temperatura de cura. O módulo de elasticidade foi quantificado por testes de tração para avaliar a influência de cada um destes fatores. A segunda parte do trabalho centrou-se na ligação de estruturas em PDMS recorrendo-se à ligação por cura parcial, descarga corona e plasma de oxigénio. Para além disso avaliou-se a evolução dos ângulos de contacto de amostras de PDMS quando sujeitas a tratamento com plasma de oxigénio. Por fim, mediu-se a transmitância das amostras de PDMS. As estruturas microfluídicas fabricadas a partir de moldes em SU-8 e acrílico mostraram ser reprodutíveis, tendo-se obtido canais lisos e sem obstruções, o que demonstra o enorme potencial deste método no desenvolvimento futuro de dispositivos para aplicações em áreas como Biomédica, Biotecnologia e Análises (Bio)Químicas.The use of elastomers has attracted the interest of researchers in the development of Microelectromechanical Systems (MEMS) and microfluidic components for biomedical applications. Polydimethylsiloxane, more commonly known as PDMS, is an example of these materials. The extensive knowledge on this material combined with its low cost and other characteristics such as ease of manufacture, flexibility, biocompatibility, optical transparency, among others, allowed it to be implemented in a diverse range of applications. These applications range from energy nanogenerators, medical devices and microfluidic applications functioning as microvalves, micropumps and micromixers. The research group's interest in the field of microfluidics allied with the properties displayed by this material stimulated the purpose of this dissertation. The work involved the assembly of the experimental setup and the optimization of PDMS microfluidic structures fabrication process. To this end, the different stages of processing such as mixing, degassing and curing were evaluated. In addition, the effect of manufacturing variables, such as pre-polymer base/curing agent ratio, time and temperature of curing were analyzed. The Young modulus was determined by tensile tests to evaluate the influence of these factors. The second part of the work focused on the bonding of different PDMS structures using techniques such as partial cure, corona discharge and oxygen plasma. In addition, the evolution of contact angles of PDMS samples when subjected to treatment with oxygen plasma were evaluated. Finally, the transmittance of PDMS samples were measured. The PDMS microfluidic structures fabricated from SU-8 and acrylic molds shown to be reproducible, obtaining smooth and unobstructed channel, which demonstrates the large potential of this method in the development of devices for applications in areas such as Biomedical, Biotechnology and Chemical Analysis

In vitro characterization of endophytic bacteria associated with physic nut (Jatropha curcas L.) and their potential for plant-growth promotion and biocontrol / Caracterização in vitro de bactérias endofíticas associadas ao pinhão-manso (Jatropha curcas L.) e seu potencial de promoção de crescimento vegetal e biocontrole

The physic nut (Jatropha curcas L.) is a shrubby plant of perennial cycle, belonging to the family Euphorbiaceae, from Central America and currently vegetates spontaneously in diverse regions of the planet. The commercial interest in Brazil occurred due to the desirable characteristics of that crop as an agricultural option for renewal of the Brazilian energy base, being a promising raw material for biodiesel production. Oil plants that have a high biotechnological potential may have a genetically diverse microbial population with characteristics of promoting the growth of multifunctional plants. Plant growth-promoting endophytes (PGPE) are of biotechnological interest since they can improve the growth of several important agronomical crops. The present study aimed the biochemistry characterization of thirty-seven endophytic bacteria strains associated with J. curcas plants, with the potential of plant growth promotion. Of this total of evaluated strains, 75% showed positive results for fixation of nitrogen, 62% produced IAA in the presence of the tryptophan precursor, 32% solubilized inorganic phosphate and 35% exhibited antagonistic activities against phytopathogenic fungi (Lasiodiplodia. subglobosa, L. euphorbicola, and L. pseudotheobromae) in physic nut. To our knowledge, this is the first report of this potential of biocontrol against Lasiodiplodia species. Among the thirty-seven bacterial isolates identified by partial sequencing of the 16S gene, the presence of the genera Arthrobacter, Bacillus, Citrobacter, Curtobacterium, Enterococcus, Klebsiella, Leucobacter, Lysinibacillus, Microbacterium, Rhodococcus, and Serratia was observed. Our results indicated that the cultivable endophytic bacteria isolated from J. curcas have the potential to demonstrate multiple characteristics of PGPE in vitro and have the potential for other large-scale assays such as biofertilizer and biopesticides. 

A importância da espiritualidade no tratamento de pacientes oncológicos: uma revisão de literatura

Introdução: diante da descoberta de um câncer, comumente, as pessoas tendem a fazer novas representações a respeito de vários temas que envolvem a sua existência, considerando, sobretudo, a possibilidade de estarem mais próximo a morte. Um dos meios que o ser humano encontra para iniciar e prosseguir o tratamento contra o câncer é através da força que encontra em sua espiritualidade. Objetivo: analisar as discussões científicas existentes sobre como a espiritualidade auxilia na adesão das pessoas com câncer ao tratamento proposto e sobre o fortalecimento emocional diante do quadro de adoecimento. Método: a seleção dos artigos foi realizada nas seguintes bases de dados: Google Scholar/Acadêmico, SciELO, PePsic, BVS Brasil. Foram usados os seguintes descritores: câncer; religião e espiritualidade; espiritualidade e câncer. A bibliográfica utilizada compreende os anos de 2001 a 2017, perfazendo um total de vinte e cinco publicações dentre artigos, dissertações e teses. Resultados: como resultados as referências trazem a espiritualidade um fator que proporciona uma ressignificação dessa experiência para o sujeito, fazendo-o encarar a doença com mais tranquilidade e esperança por meio da força que este fator propicia diante do quadro de um adoecimento repleto de tabus. Além disso, a compreensão do fator espiritualidade permite um melhor acolhimento por parte do profissional para com o paciente, já que esse passa a ter uma postura mais empática, compreendendo os suas questões. Considerações finais: a espiritualidade se torna um ponto de suma importância dentro do cenário oncológico uma vez que a mesma favorece para o desenvolvimento da resiliência em cada sujeito, promovendo qualidade de vida dentro do tratamento

Ruptured arteriovenous fistula pseudoaneurysm treatment by balloon‐assisted direct percutaneous thrombin injection

info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Miosite do músculo reto medial como forma atípica de apresentação de linfoma tipo MALT: relato de caso

Here we describe the rare case of a 55-year-old man with medial rectus muscle myositis as an atypical presentation of non-Hodgkin B-cell mucosa-associated lymphoma (MALT). Pathology and immunohistochemistry of the affected muscle confirmed the diagnosis of a neoplasm. The primary etiology of orbital myositis is Graves' ophthalmopathy, but several other diseases may cause this clinical presentation. Therefore, the neoplastic causes must be eliminated from the differential diagnoses. non-Hodgkin B-cell mucosa-associated lymphoma is the most common histological type of lymphoma in the orbit, with the conjunctiva and lacrimal glands being the most commonly affected sites. However, it may also present in atypical forms involving others sites and tissues.Descrevemos um raro caso de miosite do músculo reto medial como forma atípica de apresentação de linfoma não-Hodgkin de células B tipo MALT. A anatomia patológica e imuno-histoquímica do músculo afetado confirmaram o diagnóstico definitivo do caráter neoplásico da doença. As miosites orbitárias têm como principal etiologia a oftalmopatia de Graves, porém diversas outras causas podem apresentar-se dessa forma. Sendo assim, as causas neoplásicas devem ser descartadas. O linfoma não-Hodgkin de células B tipo MALT é o tipo histológico mais comum de linfoma orbitário, as regiões mais frequentemente acometidas são a conjuntiva e glândula lacrimal. No entanto, pode apresentar-se com formas clínicas atípicas, acometendo outras regiões e tecidos.Universidade Federal de São Paulo (UNIFESP) Department of OphthalmologyUNIFESP, Department of OphthalmologySciEL

N-(1,5-Dimethyl-3-oxo-2-phenyl-2,3-dihydro-1H-pyrazol-4-yl)-4-methyl­benzene­sulfonamide

In the title compound, C18H19N3O3S, the phenyl ring and the pyrazole ring are twisted with respect to each other by an angle of 49.11 (7)°. The C—N—S—C torsion angle is −122.5 (2)°. The methyl group bonded to the N atom of the pyrazole ring has a large deviation from the mean ring plane of 0.603 (3) Å. One inter­molecular N—H⋯O and two non-classical inter­molecular C—H⋯O hydrogen bonds are observed in the crystal structure