Transcription factor clusters regulate genes in eukaryotic cells

Transcription is regulated through binding factors to gene promoters to activate or repress expression, however, the mechanisms by which factors find targets remain unclear. Using single-molecule fluorescence microscopy, we determined in vivo stoichiometry and spatiotemporal dynamics of a GFP tagged repressor, Mig1, from a paradigm signaling pathway of Saccharomyces cerevisiae. We find the repressor operates in clusters, which upon extracellular signal detection, translocate from the cytoplasm, bind to nuclear targets and turnover. Simulations of Mig1 configuration within a 3D yeast genome model combined with a promoter-specific, fluorescent translation reporter confirmed clusters are the functional unit of gene regulation. In vitro and structural analysis on reconstituted Mig1 suggests that clusters are stabilized by depletion forces between intrinsically disordered sequences. We observed similar clusters of a co-regulatory activator from a different pathway, supporting a generalized cluster model for transcription factors that reduces promoter search times through intersegment transfer while stabilizing gene expression

Tio nyanser av mindre avvikelse

Mindre avvikelse är ett begrepp i fastighetsbildningslagen som ger möjlighet att inom vissa ramar göra avsteg från gällande detaljplan vid fastighetsbildning. Syftet med reglerna är bland annat att tillåta små avsteg utan att behöva göra det omfattande och tidskrävande arbetet att ändra en detaljplan. Bestämmelsen, så som den är formulerad i fastighetsbildningslagens 3 kap 2 §, ställer dock krav på att avvikelsen skall vara “mindre” och att den inte skall motverka detaljplanens syfte. För att undersöka hur dessa rekvisit skall tolkas har arbetet som syfte att utreda vilka huvudfaktorer som påverkar bedömningen av tillåtligheten av en mindre avvikelse samt att så långt som möjligt utreda i vilken utsträckning och på vilket sätt dessa faktorer påverkar. För att ta reda på detta har grundliga studier gjorts av förarbeten till såväl fastighetsbildningslagen som plan- och bygglagen. Av detta har framgått att regler om möjligheten att avvika från detaljplaner vid fastighetsbildning har funnits ända sedan jorddelningslagens tid. Reglernas exakta utformning i lagtext har över tiden ändrats i utformning, men mycket sällan har någon ändring i sak varit avsedd. De största förändringarna skedde vid införandet av 1987 års plan- och bygglag, där man bland annat konstaterade att mindre avvikelse i fastighetsbildningslagen skall bedömas efter samma grunder som i plan och bygglagen. 35 rättsfall som berör mindre avvikelse har analyserats. Av den rättspraxis som framträtt kan man tydligt utläsa att möjligheten att göra en mindre avvikelse är starkt beroende av vilken typ av avvikelse det rör sig om. De huvudfaktorer som vi anser påverkar bedömningen av en mindre avvikelse är: • Huruvida avvikelsen beror på att någon detalj i planen blivit felaktigt utformad eller ej tillräckligt studerad. • Huruvida allmänna och/eller enskilda intressen påverkas av avvikelsen. • Byggnadsnämndens inställning till avvikelsen. • Huruvida avvikelsen sker från en bestämmelse som är ett väsentligt inslag i planen eller ej. • Avvikelsens art och omfattning • Områdets karaktär (känslig eller okänslig omgivning). • Huruvida ett beslut om bygglov redan finns för den åtgärd som man önskar göra en mindre planavvikelse för. Några faktorer har karaktären av direkt avgörande ja/nej-faktorer, medan andra snarare avgör den tillåtna storleken på en avvikelse. Om man vid en genomgång av faktorerna ovan finner att det inte föreligger något hinder för en mindre avvikelse, är vår slutsats att den som regel bör tillåtas. En bedömning i det enskilda fallet kommer dock alltid att vara nödvändig. Slutligen ges ett antal förslag på förbättringar av nuvarande lagstiftning med grund i den övriga analysen.In the Swedish cadastral legislation, “minor exemption” is a concept which can be used when a cadastral measure is carried out within an area covered by a zoning plan. If the measure in question differs from the plan, it can still be allowed given that two conditions are met: the exemption must be minor, and it must not counteract the intentions of the plan. The aim of this work is to answer the question “what main factors affect the assessment of what could be read as a minor exemption not counteracting the intentions of the plan.” In order to answer this question, we study the preparatory works of the laws involved, as well as a number of court cases covering minor exemption. In our conclusions, we observe and describe in detail seven main factors that affect this assessment. Lastly, we present a small number of suggestions for improvement of the current Swedish legislation.Dans la législation cadastrale suédoise, une « petit dérogation » est un concept que l’on peut utiliser quand un arrangement cadastral est effectué dans les limites d’un plan de zonage. Si l’arrangement en question écarte du plan, il peut être permis quand même pourvu que deux conditions soient remplies : la dérogation doit être petite, et il ne doit pas contrarier l’intention du plan. Le but de cette ouvrage est de répondre à la question « Quel sont les éléments principaux influent sur l'évaluation de ce qui pourrait être interprété comme une petite dérogation qui ne contraire pas l’intention du plan. » Pour répondre à cette question, nous étudions les travaux préparatoires des lois impliquées, aussi bien qu’un nombre des affaires juridiques qui a traité des questions d’un « petit dérogation ». Dans nos conclusions, nous observons et décrivons en détail sept éléments principaux influents sur cette évaluation. En fin, nous présentons un petit nombre de suggestions pour améliorer la législation actuel suédoise

Healthcare professionals’ attitudes across different hospital departments regarding alcohol-related presentations

INTRODUCTION AND AIMS Attitudes to individuals presenting with alcohol-related issues are important in developing therapeutic relationships and applying alcohol-related interventions. This study explores staff attitudes to these individuals across a range of roles and departments. DESIGN AND METHODS Data were gathered from 204 staff in the Southern Health and Social Care Trust in Northern Ireland. Regression models were used to predict attitudes as measured by the Short Alcohol and Alcohol Problems Perception Questionnaire (SAAPPQ). RESULTS Two hundred and four people participated in the study. The sample comprised doctors, nurses, allied health professionals and other staff who had face-to-face contact with patients. Staff worked in accident and emergency (A&E), medical, surgical, addiction or psychiatry departments. Staff working in addiction and psychiatry departments had significantly higher levels of role adequacy compared with those in A&E. Staff in addictions also demonstrated higher levels of role legitimacy, motivation and role satisfaction than those in A&E. Doctors had higher role adequacy and role legitimacy than nursing staff. DISCUSSION AND CONCLUSIONS There are critical differences in staff attitudes to patients presenting with alcohol-related issues in a range of hospital settings; training and working in a specialist setting have a significant positive influence on staff attitudes. This suggests that further training and support would positively enhance the attitudes of staff in a variety of professional roles and across a range of hospital settings in the management of patients presenting with alcohol-related difficulties

Sumoylation and phosphorylation: hidden and overt links

Post-translational modifications are essential mediators between stimuli from development or the environment and adaptive transcriptional patterns. Recent data allow a first glimpse at how two modifications, phosphorylation and sumoylation, act interdependently to modulate stress responses. In particular, many components of the SUMO conjugation system are phosphoproteins, and some regulators and enzymes of protein phosphorylation can be sumoylated. Equally important, however, a number of proteins can be subject to both modifications. These substrates also have the capacity to connect stimuli transmitted via sumoylation with those transmitted via phosphorylation. As a prime example, we review data suggesting that nitrate reductase is a hub that integrates cues from these two modifications. Powerful proteomics approaches allowed the identification of additional common substrates, paving the way for studies to understand, on a broader basis, the cross-talk of phosphorylation with sumoylation and how it contributes to plant growth