The avifauna of the Brazilian state of Roraima: Bird distribution and biogeography in the Rio Branco basin

The Brazilian state of Roraima represents a meaningful biogeographical unit, enclosing the entire basin of the Rio Branco, a major river in the Amazon basin. Roraima is also an area of high habitat diversity where terra fi rme forest, seasonally fl ooded forest, white-sand forest, savanna, gallery and dry forest, and the vegetation associated with the tepuis, all occur within a relatively small area (225,000km2) by Amazonian standards. We provide the fi rst comprehensive compilation of the avifauna of the state in forty years. We integrated the results of our own fi eld work, where we recorded 512 bird species, with data gathered from museum specimens and from published sources. We present a list of 741 bird species for the state of Roraima, 38 of which are mentioned for the fi rst time for the state. We also provide a list of 15 species previously cited for Roraima that we consider hypothetical, and predict the presence of another 69 species that we consider likely to be recorded in the state with further fi eld work. We also present details on some of our most interesting records, which include the fi rst Brazilian specimen of Atalotriccus pilaris, and the second locality for Brazil of Myrmeciza disjuncta. We conclude that habitat heterogeneity (beta-diversity) is responsible for 60% of the avian diversity of Roraima, whereas regional endemism (gamma-diversity) accounts for about one third of the bird species occurring exclusively in terra fi rme forests. We analyze the biogeographical patterns of avian distributions within the state, in relation to the different habitats present in Roraima, and discuss some of the main conservation problems in the state of Roraima, driven by the expansion of monocultures such as soybean, acacia, and rice plantations which are putting at risk large expanses of savannas, wetlands, dry and gallery forests

Photography-based taxonomy is inadequate, unnecessary, and potentially harmful for biological sciences

The question whether taxonomic descriptions naming new animal species without type specimen(s) deposited in collections should be accepted for publication by scientific journals and allowed by the Code has already been discussed in Zootaxa (Dubois & Nemésio 2007; Donegan 2008, 2009; Nemésio 2009a–b; Dubois 2009; Gentile & Snell 2009; Minelli 2009; Cianferoni & Bartolozzi 2016; Amorim et al. 2016). This question was again raised in a letter supported by 35 signatories published in the journal Nature (Pape et al. 2016) on 15 September 2016. On 25 September 2016, the following rebuttal (strictly limited to 300 words as per the editorial rules of Nature) was submitted to Nature, which on 18 October 2016 refused to publish it. As we think this problem is a very important one for zoological taxonomy, this text is published here exactly as submitted to Nature, followed by the list of the 493 taxonomists and collection-based researchers who signed it in the short time span from 20 September to 6 October 2016

Análise biogeográfica da avifauna de uma área de transição cerrado-caatinga no Centro-Sul do Piauí, Brasil

WWF - World Wildlife FundCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorEsta dissertação foi dividida em dois capítulos: o primeiro capítulo deste trabalho avalia as predições da hipótese de homogeneização da seguinte forma: (a) a área de transição seria ocupada por espécies amplamente distribuídas que não reconhecem as bordas destes biomas; (b) a fauna da Caatinga será apenas um subconjunto da fauna do Cerrado, ambas em uma escala continental; e (c) elementos com centro de distribuição no Cerrado ou na Caatinga serão encontrados sintopicamente na área de transição entre os dois biomas. A distribuição das espécies de aves foi avaliada com base em estudos de campo, complementados por registros da literatura e de espécimens em museus. O segundo capítulo apresenta uma avaliação da " teoria geral das distribuições" de James Brown. Especificamente, pretende-se responder as seguintes questões: a) qual a relação entre abundância e área de ocupação das espécies de aves passeriformes e como a escala de estudo influencia esta relação?; (h) Qual o efeito da filogenia e da massa corporal das espécies sobre a relação entre abundância e área de ocupação em diferentes escalas espaciais?; (c) A correlação positiva entre abundância e área de ocupação tende a diminuir com a inclusão de espécies filogeneticarnente mais distantes nas comparações? (d) As espécies generalistas são, em média, mais abundantes e mais distribuídas em qualquer escala espacial do que espécies especialistas? (e) Qual o efeito da filogenia e da massa corporal sobre esta comparação? (f) As espécies próximas aos centros de suas distribuições são, em média, mais abundantes e ocupam mais lugares que espécies que estão próximas às bordas de suas distribuições? (g) Qual o efeito da filogenia e massa corporal sobre esta comparação? A abundância e área de ocupação foram medidas em duas escalas espaciais: regional, compreendendo as 11 unidades de paisagens identificadas na área de estudo; e local compreendendo os 33 locais de amostragens distribuídos nas 11 unidades de paisagens. A abundância das aves foi estimada usando a contagem por pontos com raio fixo. Nós analisamos a influência da filogenia separadamente para os dois maiores dados deste grupo (suboscines e oscines) e a influencia da massa corporal separadas em duas categorias (30g e > 30g)

Avifauna do estado de Roraima: biogeografia e conservação

Esta Tese de Doutorado tem dois objetivos gerais: (a) investigar os padrões de diversidade e distribuição da avifauna do Estado de Roraima; e (b) analisar a as lacunas de conhecimento científico no estado. Para a melhor apresentação dos problemas que compõem este projeto, ele foi dividido em 5 sub-projetos:(1) Aves de Roraima – Este capítulo tem como objetivo principal apresentar uma listacomentada e atualizada da avifauna do Estado de Roraima, além de uma caracterização geral de Roraima e a apresentação de um histórico completo da exploração ornitológica do Estado. (2) Variação em composição e diversidade da avifauna de Roraima – Nesse Capítulo procuramos documentar os padrões de distribuição das aves nas grandes regiões ecológicas de Roraima por meio da comparação da diversidade de espécies, análise da composição taxonômica, análise da distribuição ecológica, similaridade faunística, singularidade faunística e comparação com as áreas de endemismo adjacentes. (3) Análise geográfica e ecológica do esforço de investigação ornitológica no estado de Roraima - Neste capítulo, basicamente, apresentaremos uma síntese sobre todo o esforço ornitológico feito até o momento em Roraima, visando responder as seguintes questões: (a) quais os locais bem amostrados para aves? (b) quais são as lacunas geográficas de investigação? (c) em que estágio de descobertas está o inventário das espécies de aves em Roraima? (d) quais são os macro-hábitats prioritários para investigação? (e) quais os tipos de vegetação bem investigados e quais os que podem ser classificados como prioritários para investigação? (4) As aves das savanas de Roraima/Rupununi: composição e biogeografia - O objetivo principal desse Capítulo é avaliar a importância biogeográfica das savanas amazônicas e suas implicações para os processos de manutenção da diversidade biótica da região. Para isso pretendemos responder as seguintes questões: (1) Quais as espécies de aves que ocorrem nas savanas de Roraima ? (2) Qual a composição ecológica da avifauna das savanas de Roraima? (3) Quais os padrões de distribuição das aves exclusivas de savanas? (4) Como a avifauna das savanas de Roraima se originou? (5) Da análise de raridade a seleção de sítios importantes para a conservação: uma abordagem integrada para a conservação da avifauna de Roraima - Nesse capítulo utilizamos uma nova abordagem para definir áreas importantes para a conservação da avifauna de Roraima a partir da integração de duas ferramentas básicas, ou seja, estabelecer sítio importantes para a conservação de aves no estado (IBAs), a partir do diagnóstico de espécies vulneráveis à extinção geradas através da análise de raridade de Rabinowitz et al. (1986). Este capítulo tem como objetivo responder as seguintes questões: (1) Quais as regiões do estado de Roraima com maior número de “IBAs”?, (2) Onde estão concentradas as áreas com maior número de táxons e IBAs ausentes do sistema de unidades de conservação de Roraima? (3) Quais as maiores pressões atuantes sobre as espécies ausentes do sistema de unidades de conservação? (4) Quais as congruências e incongruências entre as IBAs de Roraima e as áreas prioritárias para conservação propostas por Capobianco et al., (2001)

Composição da avifauna nas Áreas de Proteção Ambiental Serra da Tabatinga e Chapada das Mangabeiras, Brasil

Um estudo das comunidade de aves das Áreas de Proteção Ambiental Serra da Tabatinga e Chapada das Mangabeiras, localiza­ das na divisa dos estados do Piauí, Maranhão e Tocantins, para o in­ventário da avifauna dos diversos tipos de habitats existentes nesta área, revelou 254 espécies, distribuídas em 50 famílias. Elanus leucurus, Elanoides forficatus e Colonia colonus são registros novos para o Es­tado do Piauí. Três espécies ameaçadas de extinção foram registradas: Penelope jacucaca; Anodorhynchus hyacinthinus e Procnias averano. Comentam-se também, aspectos relevantes para a conservação da área e suas implicações para a avifauna da região

Análise de lacunas da investigação ornitológica no estado de Roraima, Brasil

This study analyzes the ornithological data available for the Brazilian state of Roraima, focusing on sampling gaps. All ornithological data collected in Roraima up to the present were collated with the aim of answering the following questions: (a) which sites have been well sampled? (b) Are there are any geographic gaps? (c) What is the current extent of the scientific knowledge of avian diversity in Roraima? (d); Which regions and vegetation types have been well-sampled, and which should be prioritized for future surveys? Ornithological data were obtained from a total of 82 localities, including the Maracá Ecological Station (442 species), Viruá National Park (420 species), Colônia do Apiaú (320 species), Mucajaí (267 species), and Pacaráima (212 species), which were the five sites with the highest species counts. Over the past 20 years, only two localities in Roraima have been added to the list of sites with reliable samples (at least 100 bird species recorded (study skins collected, tape recordings and undocumented field observations) , the Viruá National Park and Fazenda Paraense. Five regions of the state were identified as sampling gaps, and should be prioritized in future ornithological surveys: the northwest, on the border with Venezuela and the Brazilian state of Amazonas, the lower Rio Branco between the town of Caracaraí and the mouth of the river, the terra firme forests of the southeast, the savannas of the northeast, on the border with Guyana, and the northern highlands, including montane forest and tepuis.Neste artigo, o esforço de investigação ornitológica no estado de Roraima será investigado utilizando abordagens de análises de lacunas. Basicamente, apresentaremos uma síntese sobre todo o esforço ornitológico feito até o momento em Roraima, visando responder as seguintes questões: (a) quais os locais bem amostrados para aves? (b) quais são as lacunas geográficas de investigação? (c) em que estágio de descobertas está o inventário das espécies de aves em Roraima? (d) quais são os macro-hábitats prioritários para investigação? (e) quais os tipos de vegetação bem investigados e quais os que podem ser classificados como prioritários para investigação? Como resultados, detectamos Oitenta e duas localidades com algum tipo de informação ornitológica. Dentre essas, a Estação Ecológica de Maracá (442 sp), seguido pelo Parque Nacional do Viruá (420 sp), Colônia do Apiaú (320 sp), Mucajaí (267 sp), e Pacaráima (212 sp), são as cinco localidades com maior grau de conhecimento ornitológico dentro do estado. Nos últimos 20 anos apenas duas localidades ornitológicas em Roraima podem ser acrescidas à lista de sítios bem estudados de acordo com o critério de pelo menos 100 espécies registradas (peles, gravações de voz e observações visuais): Parque Nacional do Viruá e a Fazenda Paraense. Cinco áreas são aqui apontadas como lacunas de amostragem da avifauna de Roraima e devem receber prioridade para novos inventários e estudos sobre a avifauna dessa região, são elas: Noroeste do estado, nas áreas junto à fronteira com a Venezuela e divisa com o Estado do Amazonas; Baixo Rio Branco, desde a cidade de Caracaraí à sua foz; Florestas de terra firme no sudeste do Estado; As savanas do nordeste junto à fronteira com a Guiana e as regiões de floresta montana e os tepuis

Biogeography of the Neotropical genus Malacoptila (Aves: Bucconidae): the influence of the Andean orogeny, Amazonian drainage evolution and palaeoclimate

Aim: To uncover geographical and temporal patterns of diversification in the puffbird genus Malacoptila, focusing on the influence of landscape and palaeoclimate evolution as drivers of diversification. Location: Neotropical, with an emphasis on the Amazon basin. Methods: We sequenced eight mtDNA and nuclear gene regions of 176 individuals belonging to seven of the eight recognized Malacoptila species. Concatenated and time calibrated coalescent multi-locus phylogenies, along with a Bayesian species delimitation analysis, were performed for the genus. Phylogeographical and historical demography patterns were reconstructed for the Amazonian species. Ancestral ranges estimation was performed in BioGeoBEARS. Results: Our analysis recovered 23 reciprocally monophyletic lineages within Malacoptila. All currently recognized species were recovered as monophyletic. With the exception of M. semicincta, all species presented some level of intraspecific phylogeographical structure, varying up to 10 reciprocally monophyletic phylogroups (M. rufa). The distributions of these lineages are generally coincident with known Neotropical areas of endemism (AE). Main Conclusion: Our results corroborate the influence of Andean uplift and the Plio-Pleistocene establishment of the current drainage system in Amazonia as likely drivers of diversification. The spatially structured genetic diversity that exists within Malacoptila is underestimated by current taxonomy and provides another example of widespread cryptic avian endemism in the Neotropics. © 2016 John Wiley & Sons Lt