10 research outputs found

    Whole-Mount In Situ Hybridization to Assess Advancement of Development and Embryo Morphology

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    Chapitre 19International audienceWhole-mount in situ hybridization (WISH) is widely used to visualize the site and dynamics of gene expression during embryonic development. Various methods of probe labeling and hybridization detection are available nowadays. Meanwhile the technique was adapted to be used on many different species and has evolved from a manual to a larger scale and automated procedure. Standardized automated protocols improve the chance to compare different experimental settings reliably. The high resolution of this method is ideally suited for examination of manipulated (e.g., cloned) embryos often displaying subtle changes only. Embedding and sectioning of in situ hybridized specimen further enhance the detailed examination of their gene expression and morphology

    Perception du risque et évaluation économique de l'exposition aux inondations. Étude de deux territoires aux contextes hydrologiques différents

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    [Departement_IRSTEA]Eaux [TR1_IRSTEA]GEUSI [TR2_IRSTEA]SYNERGIEObjectives of this project are at different levels. First, it aims at strengthen and links two research actions conducted in parallel so far. The first action is an interdisciplinary study of risk perception, conducted on Vilaine catchment, second one is an economic valuation of territory exposure to flood, conducted in Orb catchment. The link expected between the two research actions consists in applying each action (perception and valuation) in both catchment. We expect that contrasted hydrological contexts and spatial approach underlying each action is an opportunity to study relations between a territory exposure and the perception inhabitants or actors have of flood risk. The choice of two catchments with contrasted characteristics is perceived as a necessary condition for generalization of results. Second, we expect results for each research actions. For the perception study, we aim at testing and strengthening survey techniques for collecting opinions from different group of social actors. Methodology used will used both opened and closed surveys, with an effort of interdisciplinary (economic, geomatics, sociology and economics). Aims of the surveys are to identify main parameters that contribute to the construction of flood perception. For the economic valuation of territory exposure study, we aim at propose a modelling of territory vulnerability (relation between of submersion hazard and induced consequences). The question of the scale of study will be investigated, depending on stakes studied. A consequent part of the study will concern the study of uncertainty of the modelling proposed, which will be allowed by an interdisciplinary approach (economics, geography, geomatics, hydrology and hydraulics). We expect to find an articulation between both approaches: perception and economic valuation. Consolidation of knowledge on both study areas is also en expected outcome.Les objectifs de cette proposition sont à différents niveaux. Au premier niveau, cette proposition vise à consolider deux actions de recherche menées de façon parallèle et à les mettre en réseau. La première action de recherche consiste en une étude interdisciplinaire sur la perception du risque d'inondation sur le bassin versant de la Vilaine, la seconde en une évaluation économique de l'exposition d'un territoire aux inondations, avec pour cas d'étude le bassin versant de l'Orb. Cette mise en réseau consistera en l'application de chacune des actions (perception ou évaluation) sur chacun des bassins. Elle est justifiée par les faits que (1) les contextes (au moins hydrologiques) des deux bassins versants sont contrastés et (2) l'approche spatialisée favorisée pour les deux actions est un atout pour étudier les relations pressenties entre exposition d'un territoire aux inondations et perception du risque par les habitants ou acteurs de ce territoire. Le choix de deux bassins versants aux caractéristiques contrastées est d'ailleurs une condition nécessaire à une montée en généralité des résultats de la présente proposition. Au second niveau, les objectifs de recherche sont propres à chacune des approches. Concernant la perception, la proposition visera à tester et consolider les techniques de recueil de la perception du risque d'inondation pour différents groupes d'acteurs sociaux (acteurs de la prévention; individus directement soumis au risque; individus non directement soumis au risque). Les méthodes s'appuieront sur des enquêtes ouvertes et fermées, avec un effort particulier d'interdisciplinarité (géographie, géomatique, sociologie et économie). L'objectif de ces enquêtes sera d'identifier les principaux paramètres qui participent à la construction des perceptions des inondations par les acteurs sociaux. Concernant l'évaluation de l'exposition d'un territoire aux inondations, la proposition visera à proposer une modélisation de la vulnérabilité du territoire (relation entre événement de submersion et conséquences induites). En s'appuyant sur les approches existantes, cette modélisation aura une entrée spatiale forte (les enjeux seront localisés, les conséquences subies dépendront de la submersion qu'ils subissent). La proposition visera à discuter le grain de résolution adéquat en fonction du type d'enjeux (ponctuel, surfacique, non territorialisé pour les effets indirects par exemple); l'adéquation entre la modélisation proposée et la disponibilité des données. Un accent particulier sera mis sur l'analyse des incertitudes. Les différents points de cette discussion seront favorisés par une approche interdisciplinaire (économie, géographie, géomatique, hydrologie-hydraulique). Outre les avancées sur chacune des approches, l'un des enjeux de recherche central à notre proposition repose sur l'articulation possible entre les approches elles-mêmes (approche plutôt «objective» de l'évaluation et approche plutôt «subjective» de la perception). Cette articulation est l'un des enjeux de cette proposition, qui vise à dépasser une simple juxtaposition d'approches supposées complémentaires. La consolidation des connaissances sur chacun des terrains d'études est aussi un des résultats attendus

    Checkpoint Kinase 1 Prevents Cell Cycle Exit Linked to Terminal Cell Differentiation â–ż

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    Trophoblast stem (TS) cells proliferate in the presence of fibroblast growth factor 4, but in its absence, they differentiate into polyploid trophoblast giant (TG) cells that remain viable but nonproliferative. Differentiation is coincident with expression of the cyclin-dependent kinase (CDK)-specific inhibitors p21 and p57, of which p57 is essential for switching from mitotic cell cycles to endocycles. Here, we show that, in the absence of induced DNA damage, checkpoint kinase-1 (CHK1), an enzyme essential for preventing mitosis in response to DNA damage, functions as a mitogen-dependent protein kinase that prevents premature differentiation of TS cells into TG cells by suppressing expression of p21 and p57, but not p27, the CDK inhibitor that regulates mitotic cell cycles. CHK1 phosphorylates p21 and p57 proteins at specific sites, thereby targeting them for degradation by the 26S proteasome. TG cells lack CHK1, and restoring CHK1 activity in TG cells suppresses expression of p57 and restores mitosis. Thus, CHK1 is part of a “G2 restriction point” that prevents premature cell cycle exit in cells programmed for terminal differentiation, a role that CHK2 cannot play

    Combined inhibition of BET family proteins and histone deacetylases as a potential epigenetics-based therapy for pancreatic ductal adenocarcinoma

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    Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is one of the most lethal human cancers and shows resistance to any therapeutic strategy used. Here we tested small-molecule inhibitors targeting chromatin regulators as possible therapeutic agents in PDAC. We show that JQ1, an inhibitor of the bromodomain and extraterminal (BET) family of proteins, suppresses PDAC development in mice by inhibiting both MYC activity and inflammatory signals. The histone deacetylase (HDAC) inhibitor SAHA synergizes with JQ1 to augment cell death and more potently suppress advanced PDAC. Finally, using a CRISPR-Cas9–based method for gene editing directly in the mouse adult pancreas, we show that de-repression of p57 (also known as KIP2 or CDKN1C) upon combined BET and HDAC inhibition is required for the induction of combination therapy–induced cell death in PDAC. SAHA is approved for human use, and molecules similar to JQ1 are being tested in clinical trials. Thus, these studies identify a promising epigenetic-based therapeutic strategy that may be rapidly implemented in fatal human tumors

    Cellular senescence in gastrointestinal diseases: from pathogenesis to therapeutics

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