Análise de dados aplicada à enogastronomia

Orientador : Denise Fukumi TsunodaMonografia (graduação) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Sociais Aplicadas, Curso de Graduação em Gestão da Informação.Inclui referênciasResumo : Estudo de natureza qualitativa que objetiva realizar uma análise de dados a partir de técnicas estatísticas e mineração de dados, a fim de identificar relações e padrões de ocorrência em uma base de dados Enogastronômica. Visa a concepção de uma base de dados que reúna elementos da Gastronomia e Enologia delimitando-se a pizzarias de Curitiba premiadas nos concursos Bom Gourmet 2018 e Comer&Beber 2017/2018, cuja finalidade é comparar os resultados de 2 (dois) algoritmos de mineração de dados, Apriori e Prism, voltados para a descoberta de padrões a partir de regras de associação e classificação; e, aplicar 2 (dois) métodos estatísticos, Qui-quadrado e Análise de Correspondência Múltipla (ACM), com o propósito de realizar uma análise descritiva da base de dados. Apresenta resultados satisfatórios na execução dos algoritmos de mineração de dados, em que a aplicação do Apriori resulta em regras com grau de interesse (lift) superior a 1,45, apresentando uma correlação positiva entre os atributos, além de compor regras com dois ou mais atributos no consequente; enquanto para o Prism considerou os atributos que possuem uma taxa de acerto inicial de 85,00% entre as instâncias, onde o maior índice de acerto foi na aplicação cujo atributo-meta é o ingrediente molho de tomate com 96,89% .Valida as regras geradas nestas aplicações junto aos especialistas com a finalidade de verificar a ocorrência destas no ato de uma harmonização ou a geração de um novo conhecimento. Revela que na inferência estatística, o teste Qui-quadrado apresenta diferenças estatisticamente significativas em um dos atributos e no ACM é possível explicar o método em 2 (duas) dimensões e visualizar 4 (quatro) agrupamentos distintos. Verifica a existência de relação entre um agrupamento da ACM e as regras do algoritmo Prism. Sugere como trabalhos futuros, a ampliação da base de dados para a realização de uma análise qualitativa dos dados; a concepção de outras bases de dados Enogastronômicas voltadas a demais estilos de Gastronomia; e, a criação de um guia de harmonização a partir dos dados coletados, visando auxiliar a escolha do cliente dos estabelecimentos participantes do estudo

Characterization and crystal structure of the type IIG restriction endonuclease RM.BpuSI

A type IIG restriction endonuclease, RM.BpuSI from Bacillus pumilus, has been characterized and its X-ray crystal structure determined at 2.35Å resolution. The enzyme is comprised of an array of 5-folded domains that couple the enzyme's N-terminal endonuclease domain to its C-terminal target recognition and methylation activities. The REase domain contains a PD-x15-ExK motif, is closely superimposable against the FokI endonuclease domain, and coordinates a single metal ion. A helical bundle domain connects the endonuclease and methyltransferase (MTase) domains. The MTase domain is similar to the N6-adenine MTase M.TaqI, while the target recognition domain (TRD or specificity domain) resembles a truncated S subunit of Type I R–M system. A final structural domain, that may form additional DNA contacts, interrupts the TRD. DNA binding and cleavage must involve large movements of the endonuclease and TRD domains, that are probably tightly coordinated and coupled to target site methylation status

Type I restriction enzymes and their relatives

Type I restriction enzymes (REases) are large pentameric proteins with separate restriction (R), methylation (M) and DNA sequence-recognition (S) subunits. They were the first REases to be discovered and purified, but unlike the enormously useful Type II REases, they have yet to find a place in the enzymatic toolbox of molecular biologists. Type I enzymes have been difficult to characterize, but this is changing as genome analysis reveals their genes, and methylome analysis reveals their recognition sequences. Several Type I REases have been studied in detail and what has been learned about them invites greater attention. In this article, we discuss aspects of the biochemistry, biology and regulation of Type I REases, and of the mechanisms that bacteriophages and plasmids have evolved to evade them. Type I REases have a remarkable ability to change sequence specificity by domain shuffling and rearrangements. We summarize the classic experiments and observations that led to this discovery, and we discuss how this ability depends on the modular organizations of the enzymes and of their S subunits. Finally, we describe examples of Type II restriction–modification systems that have features in common with Type I enzymes, with emphasis on the varied Type IIG enzymes

Análise de dados aplicada à enogastronomia

Orientador : Denise Fukumi TsunodaMonografia (graduação) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Sociais Aplicadas, Curso de Graduação em Gestão da Informação.Inclui referênciasResumo : Estudo de natureza qualitativa que objetiva realizar uma análise de dados a partir de técnicas estatísticas e mineração de dados, a fim de identificar relações e padrões de ocorrência em uma base de dados Enogastronômica. Visa a concepção de uma base de dados que reúna elementos da Gastronomia e Enologia delimitando-se a pizzarias de Curitiba premiadas nos concursos Bom Gourmet 2018 e Comer&Beber 2017/2018, cuja finalidade é comparar os resultados de 2 (dois) algoritmos de mineração de dados, Apriori e Prism, voltados para a descoberta de padrões a partir de regras de associação e classificação; e, aplicar 2 (dois) métodos estatísticos, Qui-quadrado e Análise de Correspondência Múltipla (ACM), com o propósito de realizar uma análise descritiva da base de dados. Apresenta resultados satisfatórios na execução dos algoritmos de mineração de dados, em que a aplicação do Apriori resulta em regras com grau de interesse (lift) superior a 1,45, apresentando uma correlação positiva entre os atributos, além de compor regras com dois ou mais atributos no consequente; enquanto para o Prism considerou os atributos que possuem uma taxa de acerto inicial de 85,00% entre as instâncias, onde o maior índice de acerto foi na aplicação cujo atributo-meta é o ingrediente molho de tomate com 96,89% .Valida as regras geradas nestas aplicações junto aos especialistas com a finalidade de verificar a ocorrência destas no ato de uma harmonização ou a geração de um novo conhecimento. Revela que na inferência estatística, o teste Qui-quadrado apresenta diferenças estatisticamente significativas em um dos atributos e no ACM é possível explicar o método em 2 (duas) dimensões e visualizar 4 (quatro) agrupamentos distintos. Verifica a existência de relação entre um agrupamento da ACM e as regras do algoritmo Prism. Sugere como trabalhos futuros, a ampliação da base de dados para a realização de uma análise qualitativa dos dados; a concepção de outras bases de dados Enogastronômicas voltadas a demais estilos de Gastronomia; e, a criação de um guia de harmonização a partir dos dados coletados, visando auxiliar a escolha do cliente dos estabelecimentos participantes do estudo

The laser welding features of stainless steels and galvanized steels

This paper is about the most important investigation result process of laser welding thin stainless and galvanized plates. The feature of this issue was the need to preserve the appearance of side reversed side of welding

Structure of mitochondrial poly(A) RNA polymerase reveals the structural basis for dimerization, ATP selectivity and the SPAX4 disease phenotype.

Polyadenylation, performed by poly(A) polymerases (PAPs), is a ubiquitous post-transcriptional modification that plays key roles in multiple aspects of RNA metabolism. Although cytoplasmic and nuclear PAPs have been studied extensively, the mechanism by which mitochondrial PAP (mtPAP) selects adenosine triphosphate over other nucleotides is unknown. Furthermore, mtPAP is unique because it acts as a dimer. However, mtPAPs dimerization requirement remains enigmatic. Here, we show the structural basis for mtPAPs nucleotide selectivity, dimerization and catalysis. Our structures reveal an intricate dimerization interface that features an RNA-recognition module formed through strand complementation. Further, we propose the structural basis for the N478D mutation that drastically reduces the length of poly(A) tails on mitochondrial mRNAs in patients with spastic ataxia 4 (SPAX4), a severe and progressive neurodegenerative disease

Structure of mitochondrial poly A RNA polymerase reveals the structural basis for dimerization, ATP selectivity and the SPAX4 disease phenotype

Polyadenylation, performed by poly(A) polymerases (PAPs), is a ubiquitous post-transcriptional modification that plays key roles in multiple aspects of RNA metabolism. Although cytoplasmic and nuclear PAPs have been studied extensively, the mechanism by which mitochondrial PAP (mtPAP) selects adenosine triphosphate over other nucleotides is unknown. Furthermore, mtPAP is unique because it acts as a dimer. However, mtPAP's dimerization requirement remains enigmatic. Here, we show the structural basis for mtPAP's nucleotide selectivity, dimerization and catalysis. Our structures reveal an intricate dimerization interface that features an RNA-recognition module formed through strand complementation. Further, we propose the structural basis for the N478D mutation that drastically reduces the length of poly(A) tails on mitochondrial mRNAs in patients with spastic ataxia 4 (SPAX4), a severe and progressive neurodegenerative disease

Crystal structure of the V(D)J recombinase RAG1-RAG2

V(D)J recombination in the vertebrate immune system generates a highly diverse population of immunoglobulins and T-cell receptors by combinatorial joining of segments of coding DNA. The RAG1-RAG2 protein complex initiates this site-specific recombination by cutting DNA at specific sites flanking the coding segments. Here we report the crystal structure of the mouse RAG1-RAG2 complex at 3.2A resolution. The 230-kilodalton RAG1-RAG2 heterotetramer is 'Y-shaped', with the amino-terminal domains of the two RAG1 chains forming an intertwined stalk. Each RAG1-RAG2 heterodimer composes one arm of the 'Y', with the active site in the middle and RAG2 at its tip. The RAG1-RAG2 structure rationalizes more than 60 mutations identified in immunodeficient patients, as well as a large body of genetic and biochemical data. The architectural similarity between RAG1 and the hairpin-forming transposases Hermes and Tn5 suggests the evolutionary conservation of these DNA rearrangements.115839sciescopu