by M Sprenger Rapid communications HIV and AIDS in the European Union, 2009 4

D Tubin-Delic, on behalf of the outbreak control team Surveillance and outbreak reports Control of a multi-hospital outbreak of KPC-producing Klebsiella pneumonia

Dissemination of Clonally Related Escherichia coli Strains Expressing Extended-Spectrum β-Lactamase CTX-M-15

E. coli ST131 and ST405 and multidrug-resistant IncFII plasmids may determine spread of this lactamase

A Call for Action: The Application of the International Health Regulations to the Global Threat of Antimicrobial Resistance

Stephen Harbarth and colleagues argue that the International Health Regulations (IHR) should be applied to the global health threat of antimicrobial resistance

A Review of SHV Extended-Spectrum β-Lactamases: Neglected Yet Ubiquitous

Microbial Biotechnolog

Klebsielle Pneumoniae nosocomial pathogen resistance and virulence

In the first part of our work, following two outbreaks that involved K. pneumoniae producing carbapenemases, we defined a clear strategy that allowed us to control and stop the spread of those strains. Similar measures have been applied successfully in other hospitals in France, Israel and the United States. These two outbreaks, linked to the spread of epidemic clones, led us to study the prevalence of virulence factors among an international collection of multidrug-resistant K. pneumoniae strains. We could establish a link between resistance and virulence with, especially a high prevalence (42%) of a pathogenicity island bearing the yersiniabactin, Ybts, which plays an essential role in the expression of hyper-virulent phenotype of Yersinia sp. In the second part of our work, we showed that strains of K. pneumoniae producing CTX-M-15 type ESBL, are associated with plasmids belonging to incompatibility group IncF whereas plasmids carrying blaSHV genes and carbapenemases, are less well characterized by the PCR method. These results lead to the sequencing of plasmids. We report the complete nucleotide sequence of the first IncX plasmid carrying a blaKPC-2 gene from Klebsiella. It consists of the backbone of the IncX plasmid and carries a region encoding both KPC-2 and SHV-12. The transposon Tn4401 is inserted in a part encoding the blaSHV-12Dans la première partie du travail, suite à deux épidémies à K. pneumoniae productrices de carbapénémases, nous avons défini une stratégie précise qui nous a permis de maîtriser et de stopper la première épidémie et de très rapidement contrôler la seconde. Des mesures similaires ont été appliquées avec succès dans d'autres hôpitaux en France, en Israël et aux USA. Ces deux épidémies étant liées à la diffusion de clone épidémique, nous avons étudié la prévalence des facteurs de virulence parmi une collection internationale de souches de K. pneumoniae multirésistantes aux antibiotiques. Nous avons pu établir un lien entre résistance et virulence avec, en particulier une forte prévalence (42%) d'un îlot de pathogénicité portant la yersiniabactine, Ybts, qui joue essentiel dans l'expression du phénotype hyper-virulent de Yersinia sp. Dans la deuxième partie, nous montrons que les souches de K. pneumoniae productrices de BLSE de type CTX-M-15, sont associées à des plasmides appartenant au groupe d'incompatibilité IncF alors que les plasmides portant les gènes blaSHV et ceux portant les carbapénémases, sont moins bien caractérisés et souvent non typables par la méthode de PCR. Ces résultats incitent au séquençage des plasmides. Nous avons procédé au séquençage et à l'annotation du premier plasmide portant à la fois KPC-2 et SHV-12 isolé d'une souche de K. pneumoniae. Cette analyse nous a permis de mettre en évidence un nouveau groupe d'incompatibilité (IncX) impliqué pour la première fois dans la multirésistance chez K. pneumoniae. Nous avons pu montrer l'insertion du transposon Tn4401 (KPC) au sein du transposon portant la BLSE de type SHV-1

Klebsielle Pneumoniae pathogène nosocomial, résistance et virulence

Dans la première partie du travail, suite à deux épidémies à K. pneumoniae productrices de carbapénémases, nous avons défini une stratégie précise qui nous a permis de maîtriser et de stopper la première épidémie et de très rapidement contrôler la seconde. Des mesures similaires ont été appliquées avec succès dans d autres hôpitaux en France, en Israël et aux USA. Ces deux épidémies étant liées à la diffusion de clone épidémique, nous avons étudié la prévalence des facteurs de virulence parmi une collection internationale de souches de K. pneumoniae multirésistantes aux antibiotiques. Nous avons pu établir un lien entre résistance et virulence avec, en particulier une forte prévalence (42%) d un îlot de pathogénicité portant la yersiniabactine, Ybts, qui joue essentiel dans l expression du phénotype hyper-virulent de Yersinia sp. Dans la deuxième partie, nous montrons que les souches de K. pneumoniae productrices de BLSE de type CTX-M-15, sont associées à des plasmides appartenant au groupe d incompatibilité IncF alors que les plasmides portant les gènes blaSHV et ceux portant les carbapénémases, sont moins bien caractérisés et souvent non typables par la méthode de PCR. Ces résultats incitent au séquençage des plasmides. Nous avons procédé au séquençage et à l annotation du premier plasmide portant à la fois KPC-2 et SHV-12 isolé d une souche de K. pneumoniae. Cette analyse nous a permis de mettre en évidence un nouveau groupe d incompatibilité (IncX) impliqué pour la première fois dans la multirésistance chez K. pneumoniae. Nous avons pu montrer l insertion du transposon Tn4401 (KPC) au sein du transposon portant la BLSE de type SHV-12In the first part of our work, following two outbreaks that involved K. pneumoniae producing carbapenemases, we defined a clear strategy that allowed us to control and stop the spread of those strains. Similar measures have been applied successfully in other hospitals in France, Israel and the United States. These two outbreaks, linked to the spread of epidemic clones, led us to study the prevalence of virulence factors among an international collection of multidrug-resistant K. pneumoniae strains. We could establish a link between resistance and virulence with, especially a high prevalence (42%) of a pathogenicity island bearing the yersiniabactin, Ybts, which plays an essential role in the expression of hyper-virulent phenotype of Yersinia sp. In the second part of our work, we showed that strains of K. pneumoniae producing CTX-M-15 type ESBL, are associated with plasmids belonging to incompatibility group IncF whereas plasmids carrying blaSHV genes and carbapenemases, are less well characterized by the PCR method. These results lead to the sequencing of plasmids. We report the complete nucleotide sequence of the first IncX plasmid carrying a blaKPC-2 gene from Klebsiella. It consists of the backbone of the IncX plasmid and carries a region encoding both KPC-2 and SHV-12. The transposon Tn4401 is inserted in a part encoding the blaSHV-12PARIS-BIUSJ-Biologie recherche (751052107) / SudocSudocFranceF

Long-lasting successful dissemination of resistance to oxazolidinones in MDR Staphylococcus epidermidis clinical isolates in a tertiary care hospital in France.

Objectives: Patient- and procedure-related changes in modern medicine have turned CoNS into one of the major nosocomial pathogens. Treatments of CoNS infections are challenging owing to the large proportion of MDR strains and oxazolidinones often remain the last active antimicrobial molecules. Here, we have investigated a long-lasting outbreak (2010-13) due to methicillin- and linezolid-resistant (LR) CoNS (n = 168), involving 72 carriers and 49 infected patients. Methods: Antimicrobial susceptibilities were tested by the disc diffusion method and MICs were determined by broth microdilution or Etest. The clonal relationship of LR Staphylococcus epidermidis (LRSE) was first determined using a semi-automated repetitive element palindromic PCR (rep-PCR) method. Then, WGS was performed on all cfr-positive LRSE (n = 30) and LRSE isolates representative of each rep-PCR-defined clone (n = 17). Self-transferability of cfr-carrying plasmids was analysed by filter-mating experiments. Results: This outbreak was caused by the dissemination of three clones (ST2, ST5 and ST22) of LRSE. In these clones, linezolid resistance was caused by (i) mutations in the chromosome-located genes encoding the 23S RNA and L3 and L4 ribosomal proteins, but also by (ii) the dissemination of two different self-conjugative plasmids carrying the cfr gene encoding a 23S RNA methylase. By monitoring linezolid prescriptions in two neighbouring hospitals, we highlighted that the spread of LR-CoNS was strongly associated with linezolid use. Conclusions: Physicians should be aware that plasmid-encoded linezolid resistance has started to disseminate among CoNS and that rational use of oxazolidinones is critical to preserve these molecules as efficient treatment options for MDR Gram-positive pathogens

Complete Nucleotide Sequence of the First KPC-2- and SHV-12-Encoding IncX Plasmid, pKpS90, from Klebsiella pneumoniae

International audienceWe report the complete nucleotide sequence of the pKpS90 plasmid, carrying the bla KPC-2 and bla SHV-12 genes. This plasmid was isolated from a sequence type 258 (ST258) Klebsiella pneumoniae strain responsible for an outbreak in a French university hospital in 2009. pKpS90 is a 53,286-bp plasmid that belongs to the IncX incompatibility group. pKpS90 consists of a backbone from IncX plasmids, in which the KPC-2-encoding Tn 4401 transposon and a bla SHV-12 -encoding region have been inserted