Long-range chromatin interactions at the mouse Igf2/H19 locus reveal a novel paternally expressed long non-coding RNA

Parental genomic imprinting at the Igf2/H19 locus is controlled by a methylation-sensitive CTCF insulator that prevents the access of downstream enhancers to the Igf2 gene on the maternal chromosome. However, on the paternal chromosome, it remains unclear whether long-range interactions with the enhancers are restricted to the Igf2 promoters or whether they encompass the entire gene body. Here, using the quantitative chromosome conformation capture assay, we show that, in the mouse liver, the endodermal enhancers have low contact frequencies with the Igf2 promoters but display, on the paternal chromosome, strong interactions with the intragenic differentially methylated regions 1 and 2. Interestingly, we found that enhancers also interact with a so-far poorly characterized intergenic region of the locus that produces a novel imprinted long non-coding transcript that we named the paternally expressed Igf2/H19 intergenic transcript (PIHit) RNA. PIHit is expressed exclusively from the paternal chromosome, contains a novel discrete differentially methylated region in a highly conserved sequence and, surprisingly, does not require an intact ICR/H19 gene region for its imprinting. Altogether, our data reveal a novel imprinted domain in the Igf2/H19 locus and lead us to propose a model for chromatin folding of this locus on the paternal chromosome

Architecture génomique et expression du gène murin "Igf2", un modèle d'étude du formatage du génome chez les mammifères

MONTPELLIER-BU Sciences (341722106) / SudocSudocFranceF

De la prévention primaire des radicalisations violentes à l’éducation à la sante pour la responsabilité

Aujourd’hui, l’engagement de personnes dans un radicalisme violent, politique ou religieux, menace la sécurité publique. Pour contribuer à solutionner ces problèmes transcontinentaux, plusieurs pays ont mis en œuvre des programmes de prévention primaire des radicalisations violentes (RV), où le système judiciaire a un rôle prépondérant. Or, les évaluations, pas toujours rigoureuses, ont tout de même tendance à montrer l’inefficacité et même la vraisemblable contre-productivité de ces actions. La problématique de cet article théorique concerne donc la manière de mettre en œuvre une prévention efficace des RV et d’évaluer scientifiquement son efficacité (quels indicateurs considérer ?). Dans une première partie nous argumentons, sur la base de la littérature psychologique, en partie dédiée au terrorisme islamiste, que le dogmatisme et le besoin de clôture constituent une caractéristique des esprits radicalisés. Ensuite, sur cette base et celle d’une conceptualisation antérieure, nous présentons un modèle théorique pionnier où la RV apparaît comme fermant l’esprit, tandis qu’une prévention efficace conduirait, au contraire, à ouvrir l’esprit. Après cela, nous argumentons sur les liens entre ouverture d’esprit, santé, responsabilité (éthique) et méditation. Nous en déduisons l’importance d’inclure l’éducation à la santé comme un moyen efficace de prévention primaire des RV, avec comme fin la responsabilité. Notre modèle ouvre de nouvelles perspectives, tant pour l’éducation que pour la recherche. Il contient en effet des indicateurs psychologiques mesurables et opérationnels qui pourront servir à étudier empiriquement l’impact de dispositifs éducatifs sur la prévention, impliquant par exemple un outil éducatif que nous avons particulièrement étudié : la méditation

Comparison Between ESC and Duke Criteria for the Diagnosis of Prosthetic Valve Infective Endocarditis

International audienceObjectives: The primary objective was to assess the value of the European Society of Cardiology (ESC) criteria, including 18F-fluorodeoxyglucose positron emission tomography/computed tomography (18F-FDG-PET/CT) in prosthetic valve infective endocarditis (PVE). Secondary objectives were: 1) to assess the reproducibility of 18F-FDG-PET/CT; 2) to compare its diagnostic value with that of echocardiography; and 3) to assess the diagnostic value of the presence of a diffuse splenic uptake BACKGROUND: 18F-FDG PET/CT has been added as a major criterion in the ESC 2015 infective endocarditis (IE) guidelines, but the benefit of the ESC criteria has not been prospectively compared with the conventional Duke criteria.Methods: Between 2014 and 2017, 175 patients with suspected PVE were prospectively included in 3 French centers. After exclusion of patients with uninterpretable 18F-FDG PET/CT, 115 patients were evaluated, including 91 definite and 24 rejected IE, as defined by an expert consensus.Results: Cardiac uptake by 18F-FDG PET/CT was observed in 67 of 91 patients with definite PVE and 6 with rejected IE (sensitivity 73.6% [95% confidence interval (CI): 63.3% to 82.3%], specificity 75% [95% CI: 53.3% to 90.2%]). The ESC 2015 classification increased the sensitivity of Duke criteria from 57.1% (95% CI: 46.3% to 67.5%) to 83.5% (95% CI: 74.3% to 90.5%) (p < 0.001), but decreased its specificity from 95.8% (95% CI: 78.9% to 99.9%) to 70.8% (95% CI: 48.9% to 87.4%). Intraobserver reproducibility of 18F-FDG PET/CT was good (kappa = 0.84) but interobserver reproducibility was less satisfactory (kappa = 0.63). A diffuse splenic uptake was observed in 24 (20.3%) patients, including 23 (25.3%) of definite PVE, and only 1 (4.2%) rejected PVE (p = 0.024).Conclusions: 18F-FDG PET/CT is a useful diagnostic tool in suspected PVE, and explains the greater sensitivity of ESC criteria than Duke criteria. However, 18F-FDG PET/CT also presents with important limitations concerning its feasibility, specificity, and reproducibility. Our study describes for the first time a new endocarditis criterion, that is, the presence of a diffuse splenic uptake on 18F-FDG PET/CT

Quelle éducation avec la Covid-19

APPEL A CONTRIBUTION : QUE NOUS APPREND LA PANDEMIE? Numéro HS Recherches et Educations (Juillet 2020) (HCERES 70ème section) Qu'est ce que la pandémie nous apprend de nos sociétés, de nos politiques de santé publique, des souverainetés épistémologiques de la recherche et des praxis individuelles et collectives? Solidarités ou/ et d'exclusions? Stratégies d'adaptation au confinement ou de rejet? Comment agit-on dans ce monde incertain, soumis à l'autorité des politiques de gestion d'un virus? Soumission volontaire à l'autorité ou organisation des résistances? Quels sont les savoirs exercés sur quels pouvoirs ? Quelles sont les légitimités et les responsabilités plurielles : individuelles, collectives, politiques et sociales ? Quels sont les usages sociaux et politiques des résultats de la recherche des experts ? Qu’apprenons nous des expériences de prévention individuelles, européennes et internationales ? Comment s’exercent les pouvoirs à partir des savoirs des épistémologies et des évidence-base medecine ? Comment l’histoire des épidémies pourrait répondre à notre présent ? Quel futur pour notre société après la pandémie ? Quelles seront nos inégalités sociales ? Vers quelles écologies ? Quelles résistances ? Quel mode de vie ? Quelles expériences corporelles de l’absence de toucher et de la distanciation ? Quelle croissance ? Quelle décroissance ? Quelles solidarités face à la techno-économique ? La revue Recherches & Educations lance un appel à contribution, multi disciplinaire, sur le « dispositif covid 19 » pendant le confinement imposé aux populations. Elle propose de réunir les textes critiques et réflexifs sur ce que nous apprend l’épidémie et la pandémie de nous même, de notre relation au vivant, à la mondialisation néolibérale, aux souverainetés de santé, au gouvernement des corps, de la psyché et de la vie, aux politiques de prévention, aux représentations de l’épidémie, aux pratiques corporelles visuelles et tactiles, aux modes de résistances et aux praxis du quotidien du présent et de demain. Texte à adresser (avant le 30 mai 2020) en 30.000 signes à [email protected] [email protected] [email protected]

Early Hepatocellular Carcinoma Detection Using Magnetic Resonance Imaging Is Cost-Effective in High-Risk Patients with Cirrhosis

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The PRSS3P2 and TRY7 deletion copy number variant modifies risk for chronic pancreatitis

Background PRSS1 and PRSS2 constitute the only functional copies of a tandemly-arranged five-trypsinogen-gene cluster (i.e., PRSS1, PRSS3P1, PRSS3P2, TRY7 and PRSS2) on chromosome 7q35. Variants in PRSS1 and PRSS2, including missense and copy number variants (CNVs), have been reported to predispose to or protect against chronic pancreatitis (CP). We wondered whether a common trypsinogen pseudogene deletion CNV (that removes two of the three trypsinogen pseudogenes, PRSS3P2 and TRY7) might be associated with CP causation/predisposition. Methods We analyzed the common PRSS3P2 and TRY7 deletion CNV in a total of 1536 CP patients and 3506 controls from France, Germany, India and Japan by means of quantitative fluorescent multiplex polymerase chain reaction. Results We demonstrated that the deletion CNV variant was associated with a protective effect against CP in the French, German and Japanese cohorts whilst a trend toward the same association was noted in the Indian cohort. Meta-analysis under a dominant model yielded a pooled odds ratio (OR) of 0.68 (95% confidence interval (CI) 0.52–0.89; p = 0.005) whereas an allele-based meta-analysis yielded a pooled OR of 0.84 (95% CI 0.77–0.92; p = 0.0001). This protective effect is explicable by reference to the recent finding that the still functional PRSS3P2/TRY7 pseudogene enhancers upregulate pancreatic PRSS2 expression. Conclusions The common PRSS3P2 and TRY7 deletion CNV was associated with a reduced risk for CP. This finding provides additional support for the emerging view that dysregulated PRSS2 expression represents a discrete mechanism underlying CP predisposition or protection

The PRSS3P2 and TRY7 deletion copy number variant modifies risk for chronic pancreatitis

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