Density currents in rectangular settling tanks.

In this thesis, the density currents in a rectangular sedimentation tank are investigated. Experimental studies were made of the flow under different conditions of geometry, momentum and buoyancy. A mathematical model was developed to simulate the characteristics associated with the denser wall jet condition. The experimental program involved temperature tests, flow visualization dye tests and fluorescent dye tests. The variables in the experiments were flowrate, gate opening, weir height, ambient fluid temperature and influent temperatures in the initial tank. Both denser wall jet and buoyant surface jet conditions were considered. The characteristics depths, velocity and temperature of the jet and moving internal hydraulic jump were determined. The mathematical model developed was divided into two parts: a jet submodel and a moving internal hydraulic jump submodel. An equation was developed to relate the submerged depth to the initial depth and sequent depth of the submerged internal hydraulic jump. The mathematical model results are compared with the experimental data for the jet, moving internal hydraulic jump and the submerged hydraulic jump.Dept. of Civil and Environmental Engineering. Paper copy at Leddy Library: Theses & Major Papers - Basement, West Bldg. / Call Number: Thesis1990 .G646. Source: Masters Abstracts International, Volume: 30-03, page: 0819. Adviser: J. A. McCorquodale. Thesis (M.A.Sc.)--University of Windsor (Canada), 1990

Acumulació d'anomalies cromosómiques en espermatozoides

Una investigació amb participació de la UAB ha estudiat com els portadors de translocacions recíproques cromosòmiques, una anomalia en la qual s'intercanvia material genètic entre dos cromosomes no homòlegs, acumulen també altres tipus d'anomalies en els cromosomes dels seus espermatozoides. Conèixer millor l'acumulació d'aquestes anomalies ajuda a millorar l'assessorament a les persones que són portadores d'aquestes translocacions quan desitgen tenir fills.Una investigación con participación de la UAB ha estudiado cómo los portadores de translocaciones recíprocas cromosómicas, una anomalía en la que se intercambia material genético entre dos cromosomas no homólogos, acumulan también otros tipos de anomalías en los cromosomas de sus espermatozoides. Conocer mejor la acumulación de estas anomalías ayuda a mejorar el asesoramiento a las personas que son portadoras de estas translocaciones cuando desean tener hijos

Protocol per l’elaboració de recomanacions de cobertura per part de panels de persones expertes en els informes d’avaluació de tecnologies sanitàries realitzats per l’AQuAS

Protocol; Panel d'experts; RecomanacionsProtocolo; Panel de expertos; RecomendacionesProtocol; Expert panel; RecommendationsEl present document defineix la participació dels i les professionals en l’Avaluació de Tecnologies Sanitàries (ATS) pel que fa als procediments interns a seguir en l’organització i gestió funcional d’un panel d’experts que doni suport a la formulació de recomanacions de cobertura de la tecnologia sanitària objecte de l’avaluació per part de l’AQuAS

Anàlisi del contingut cromosòmic en espermatozoides d'individus portadors de translocacions : relació entre efecte intercromosòmic i segregació /

Els individus portadors de translocacions cromosòmiques equilibrades presenten un risc incrementat de produir gàmetes amb anomalies cromosòmiques, ja sigui per una segregació desequilibrada dels cromosomes reorganitzats o per la formació d'anomalies numèriques derivades de l'efecte intercromosòmic. Es desconeix si existeix una relació entre les anomalies derivades d'ambdós esdeveniments, que podria residir en l'aparició de fenòmens d'heterosinapsi entre els multivalents i altres cromosomes durant la profase I. D'altra banda, l'heterosinapsi s'ha relacionat amb canvis en l'arquitectura nuclear dels cromosomes en espermatozoides, que en última instància també podrien afectar la fertilitat dels individus portadors. Els objectius d'aquesta tesi han estat: i) Desenvolupar un mètode d'anàlisi seqüencial basat en tècniques d'hibridació in situ fluorescent (FISH) que permeti identificar anomalies cromosòmiques numèriques i determinar el mode de segregació dels cromosomes reorganitzats sobre els mateixos espermatozoides; ii) Caracteritzar els patrons de segregació de diferents reorganitzacions cromosòmiques en espermatozoides no seleccionats i en espermatozoides portadors d'anomalies numèriques; iii) Determinar si existeix una relació entre els diferents modes de segregació dels cromosomes reorganitzats i la producció d'espermatozoides amb anomalies numèriques; iv) Desenvolupar una tècnica d'anàlisi que permeti valorar la disposició tridimensional dels territoris cromosòmics en nuclis d'espermatozoides. S'han recollit mostres de semen de vuit individus portadors de translocacions recíproques, onze portadors de translocacions Robertsonianes i un portador d'una triple translocació. En la primera ronda de FISH seqüencial s'han detectat espermatozoides amb anomalies numèriques per cinc cromosomes no relacionats amb la reorganització. En la segona ronda s'han analitzat els productes de segregació dels cromosomes reorganitzats en els espermatozoides amb anomalies numèriques detectats prèviament, així com en espermatozoides no seleccionats. L'optimització del sistema d'anàlisi de la disposició dels territoris cromosòmics en el nucli espermàtic ha inclòs la selecció de nuclis segons el seu genotip, la captura d'imatges tridimensionals, la relocalització dels nuclis d'interès, el tractament digital de les imatges, la normalització de les dades i l'obtenció dels valors de posicionament dels centròmers en l'eix longitudinal i radial de l'espermatozoide. Els resultats de l'anàlisi de segregació en espermatozoides no seleccionats mostren una elevada homogeneïtat dels patrons de segregació entre portadors del mateix tipus de translocació, caracteritzats per una elevada freqüència dels modes de segregacions que impliquen la disjunció a pols cel·lulars oposats dels cromosomes amb centròmers homòlegs. Els resultats de segregació en espermatozoides aneuploides i diploides/múltiples disòmics mostren un patró de segregació alterat respecte els espermatozoides no seleccionats, on s'afavoreixen els modes de segregació desequilibrats, en detriment dels productes de segregació equilibrats. Els espermatozoides amb diferents tipus d'aneuploïdies i amb diferents cromosomes implicats, influeixen per igual al patró de segregació alterat. Els resultats sobre el posicionament tridimensional dels cromosomes han permès validar la metodologia desenvolupada, ja que s'ha obtingut informació sobre la localització preferent dels cromosomes estudiats en nuclis amb diferents genotips. Els resultats obtinguts demostren una associació entre la presència d'anomalies numèriques i un contingut desequilibrat dels cromosomes reorganitzats. L'acumulació d'anomalies cromosòmiques en els mateixos gàmetes pot ser atribuïble a un efecte bidireccional de l'heterosinapsi, que comportaria un canvi en la localització nuclear dels cromosomes afectats i una alteració en la formació dels quiasmes. Els problemes d'orientació dels cromosomes a la placa metafàsica poden provocar una aturada meiòtica prolongada, que en cas de no corregir-se, es podria resoldre a través de l'evasió del punt de control. Aquest fet afavoriria la producció de gàmetes que podrien acumular anomalies procedents de segregacions desequilibrades, a més d'aneuploïdies d'altres cromosomes. La tècnica desenvolupada per estudiar l'arquitectura nuclear dels espermatozoides permetrà determinar si les anomalies cromosòmiques presents en els gàmetes dels individus portadors de reorganitzacions cromosòmiques afecten l'organització nuclear global dels cromosomes i condicionen la seva fertilitat.Carriers of chromosomal translocations present a high risk of producing chromosomally abnormal gametes, as a consequence of an unbalanced segregation of the rearranged chromosomes, or the presence of numerical chromosomal anomalies derived from an interchromosomal effect. It is not known whether there exists a relationship between anomalies produced by these two events, but it might be based on the occurrence of heterosynapsis at the meiotic prophase I between multivalents and other chromosomes. Moreover, heterosynapsis has been associated related to changes in the nuclear chromosome architecture in sperm, which may also affect the fertility of reorganization carriers. The objectives of this thesis have been: i) To develop a sequential fluorescence in situ hybridization (FISH) protocol in order to detect numerical chromosomal abnormalities and to establish the segregation mode of rearranged chromosomes in the same spermatozoa; ii) To establish the segregation pattern of different chromosomal rearrangements in random sperm and in sperm with numerical abnormalities; iii) To determine whether there exists a relationship between certain segregation modes and the occurrence of numerical chromosome abnormalities; iv) To develop a methodology to evaluate the tridimensional distribution of chromosome territories in sperm nuclei. Semen samples of eight carriers of reciprocal translocations, eleven carriers of Robertsonian translocations and one carrier of a three-way translocation have been included in the study. In the first sequential FISH round, numerical anomalies for five chromosomes unrelated to the rearrangements have been analysed. In the second round, a segregation analysis has been performed both in the numerically abnormal sperm detected in the first round as well as in randomly assessed sperm. The optimization of the analysis of chromosome territories in sperm nuclei has included: nuclei classification according to their genotype, 3D image recording, relocalization of selected nuclei, digital images editing, data normalization, and prediction of the preferred position of each hybridization signal along the longitudinal and radial axis of spermatozoa. The segregation patterns obtained in randomly assessed sperm show high homogeneity among carriers of the same translocation. These patterns involve high frequencies of segregation modes that entail disjunction to opposite cellular poles of chromosomes with homologous centromeres. Data obtained from segregation analysis in aneuploid and diploid/multiple disomic sperm show altered segregation patterns when compared to randomly assessed sperm, in which unbalanced segregation modes are favoured while balanced segregation products decrease. Aneuploid sperm with different types of chromosomal abnormalities or different chromosomes involved in the aneuploidy have the same effect over the altered segregation pattern. The results obtained in the analysis of chromosome territories allow for the validation of the developed methodology. It has allowed the prediction of the preferred positioning of analysed chromosomes in sperm nuclei with different genotypes. In conclusion, data obtained point out that indeed there exists a relationship between the presence of numerical chromosome abnormalities and an unbalanced segregation content in sperm. This accumulation of chromosome anomalies in the same gametes would be driven by a bidirectional effect of heterosynapsis, which could entail changes in the nuclear positioning of the affected chromosomes, as well as alterations in chiasmata formation. The chromosome misalignment at metaphase plate would cause a meiotic arrest. If unresolved, cells could eventually evade this checkpoint favouring the accumulation of both unbalanced segregation products and aneuploidies for other chromosomes in the same gametes. The developed methodology to study the sperm nuclear architecture can be potentially used in carriers of chromosomal rearrangements, in order to assess whether chromosomal abnormalities in sperm affect the global nuclear chromosome organization and disturb their fertility

Spermatozoa from infertile patients exhibit differences of DNA methylation associated with spermatogenesis-related processes: an array-based analysis

The influence of aberrant sperm DNA methylation on the reproductive capacity of couples has been postulated as a cause of infertility. This study compared the DNA methylation of spermatozoa of 19 fertile donors and 42 infertile patients using the Illumina 450K array. Clustering analysis of methylation data arranged fertile and infertile patients into two groups. Bivariate clustering analysis identified a differential distribution of samples according to the characteristics of seminogram and age, suggesting a possible link between these parameters and specific methylation profiles. The study identified 696 differentially methylated cytosine-guanine dinucleotides (CpG) associated with 501 genes between fertile donors and infertile patients. Ontological enrichment analysis revealed 13 processes related to spermatogenesis. Data filtering identified a set of 17 differentially methylated genes, some of which had functions relating to spermatogenesis. A significant association was identified between RPS6KA2 hypermethylation and advanced age (P = 0.016); APCS hypermethylation and oligozoospermia (P = 0.041); JAM3/NCAPD3 hypermethylation and numerical chromosome sperm anomalies (P = 0.048); and ANK2 hypermethylation and lower pregnancy rate (P = 0.040). This description of a set of differentially methylated genes provides a framework for further investigation into the influence of such variation in male fertility in larger patient cohorts.This work was supported by Projects PS09/00330 (Gobierno de España, Spain) and SGR2014-524 2 (Generalitat de Catalunya).Peer reviewe

Seguridad, eficacia y evaluación económica de la implantación de un programa de cribado de aneurisma de aorta abdominal

Aneurisma d'aorta abdominal; Dolor crònic; CribratgeAneurisma de aorta abdominal; Dolor crónico; CribadoAbdominal aortic aneurysm; Chronic pain; ScreeningL’objectiu general d’aquest informe és avaluar l’evidència disponible sobre seguretat, eficàcia clínica i cost-efectivitat de la implantació d’un programa de cribratge de l’AAA mitjançant ecografia abdominal per ultrasons en la població de risc, a més de realitzar una avaluació econòmica, i respondre als criteris del Document marc sobre cribratges poblacionals, amb la condició de valorar la seva inclusió dins de la cartera comuna de serveis del Sistema Nacional de Salut espanyol.El objetivo general de este informe es evaluar la evidencia disponible sobre seguridad, eficacia clínica y coste-efectividad de la implantación de un programa de cribado del AAA mediante ecografía abdominal por ultrasonidos en la población de riesgo, además de realizar una evaluación económica, y responder a los criterios del Documento marco sobre cribados poblacionales, con tal de valorar su inclusión dentro de la cartera común de servicios del Sistema Nacional de Salud español.The general objective of this report is to evaluate the available evidence on safety, clinical efficacy and cost-effectiveness of the implementation of an AAA screening programme, using ultrasound abdominal ultrasound in the population at risk. Other objectives are to carry out an economic evaluation, and to respond to the criteria of the Framework document on population screening, in order to assess its inclusion in the common portfolio of services of the Spanish National Health System

Very high energy gamma-ray observations of the galaxy clusters Abell 496 and Abell 85 with HESS

Aims. The nearby galaxy clusters Abell 496 and Abell 85 are studied in the very high-energy (VHE, E > 100 GeV) band to investigate VHE cosmic rays (CRs) in this class of objects which are the largest gravitationally bound systems in the Universe. Methods. HESS, an array of four imaging atmospheric cherenkov telescopes (IACT), was used to observe the targets in the range of VHE gamma rays. Results. No significant gamma-ray signal is found at the respective position of the two clusters with several different source size assumptions for each target. In particular, emission regions corresponding to the high-density core, to the extension of the entire X-ray emission in these clusters, and to the very extended region where the accretion shock is expected are investigated. Upper limits are derived for the gamma-ray flux at energies E > 570 GeV for Abell 496 and E > 460 GeV for Abell 85. Conclusions. From the non-detection in VHE gamma rays, upper limits on the total energy of hadronic CRs in the clusters are calculated. If the cosmic-ray energy density follows the large-scale gas density profile, the limit on the fraction of energy in these non-thermal particles with respect to the total thermal energy of the intra-cluster medium (ICM) is 51% for Abell 496 and only 8% for Abell 85 due to its higher mass and higher gas density. These upper limits are compared with theoretical estimates. They predict about ~10% of the thermal energy of the ICM in non-thermal particles. The observations presented here can constrain these predictions especially for the case of the Abell 85 cluster.F. Aharonian...G. Rowell...A. Zech, et a

Anàlisi del contingut cromosòmic en espermatozoides d’individus portadors de translocacions: relació entre efecte intercromosòmic i segregació

Els individus portadors de translocacions cromosòmiques equilibrades presenten un risc incrementat de produir gàmetes amb anomalies cromosòmiques, ja sigui per una segregació desequilibrada dels cromosomes reorganitzats o per la formació d’anomalies numèriques derivades de l’efecte intercromosòmic. Es desconeix si existeix una relació entre les anomalies derivades d’ambdós esdeveniments, que podria residir en l’aparició de fenòmens d’heterosinapsi entre els multivalents i altres cromosomes durant la profase I. D’altra banda, l’heterosinapsi s’ha relacionat amb canvis en l’arquitectura nuclear dels cromosomes en espermatozoides, que en última instància també podrien afectar la fertilitat dels individus portadors. Els objectius d’aquesta tesi han estat: i) Desenvolupar un mètode d’anàlisi seqüencial basat en tècniques d’hibridació in situ fluorescent (FISH) que permeti identificar anomalies cromosòmiques numèriques i determinar el mode de segregació dels cromosomes reorganitzats sobre els mateixos espermatozoides; ii) Caracteritzar els patrons de segregació de diferents reorganitzacions cromosòmiques en espermatozoides no seleccionats i en espermatozoides portadors d’anomalies numèriques; iii) Determinar si existeix una relació entre els diferents modes de segregació dels cromosomes reorganitzats i la producció d’espermatozoides amb anomalies numèriques; iv) Desenvolupar una tècnica d’anàlisi que permeti valorar la disposició tridimensional dels territoris cromosòmics en nuclis d’espermatozoides. S’han recollit mostres de semen de vuit individus portadors de translocacions recíproques, onze portadors de translocacions Robertsonianes i un portador d’una triple translocació. En la primera ronda de FISH seqüencial s’han detectat espermatozoides amb anomalies numèriques per cinc cromosomes no relacionats amb la reorganització. En la segona ronda s’han analitzat els productes de segregació dels cromosomes reorganitzats en els espermatozoides amb anomalies numèriques detectats prèviament, així com en espermatozoides no seleccionats. L’optimització del sistema d’anàlisi de la disposició dels territoris cromosòmics en el nucli espermàtic ha inclòs la selecció de nuclis segons el seu genotip, la captura d’imatges tridimensionals, la relocalització dels nuclis d’interès, el tractament digital de les imatges, la normalització de les dades i l’obtenció dels valors de posicionament dels centròmers en l’eix longitudinal i radial de l’espermatozoide. Els resultats de l’anàlisi de segregació en espermatozoides no seleccionats mostren una elevada homogeneïtat dels patrons de segregació entre portadors del mateix tipus de translocació, caracteritzats per una elevada freqüència dels modes de segregacions que impliquen la disjunció a pols cel·lulars oposats dels cromosomes amb centròmers homòlegs. Els resultats de segregació en espermatozoides aneuploides i diploides/múltiples disòmics mostren un patró de segregació alterat respecte els espermatozoides no seleccionats, on s’afavoreixen els modes de segregació desequilibrats, en detriment dels productes de segregació equilibrats. Els espermatozoides amb diferents tipus d’aneuploïdies i amb diferents cromosomes implicats, influeixen per igual al patró de segregació alterat. Els resultats sobre el posicionament tridimensional dels cromosomes han permès validar la metodologia desenvolupada, ja que s’ha obtingut informació sobre la localització preferent dels cromosomes estudiats en nuclis amb diferents genotips. Els resultats obtinguts demostren una associació entre la presència d’anomalies numèriques i un contingut desequilibrat dels cromosomes reorganitzats. L’acumulació d’anomalies cromosòmiques en els mateixos gàmetes pot ser atribuïble a un efecte bidireccional de l’heterosinapsi, que comportaria un canvi en la localització nuclear dels cromosomes afectats i una alteració en la formació dels quiasmes. Els problemes d’orientació dels cromosomes a la placa metafàsica poden provocar una aturada meiòtica prolongada, que en cas de no corregir-se, es podria resoldre a través de l’evasió del punt de control. Aquest fet afavoriria la producció de gàmetes que podrien acumular anomalies procedents de segregacions desequilibrades, a més d’aneuploïdies d’altres cromosomes. La tècnica desenvolupada per estudiar l’arquitectura nuclear dels espermatozoides permetrà determinar si les anomalies cromosòmiques presents en els gàmetes dels individus portadors de reorganitzacions cromosòmiques afecten l’organització nuclear global dels cromosomes i condicionen la seva fertilitat.Carriers of chromosomal translocations present a high risk of producing chromosomally abnormal gametes, as a consequence of an unbalanced segregation of the rearranged chromosomes, or the presence of numerical chromosomal anomalies derived from an interchromosomal effect. It is not known whether there exists a relationship between anomalies produced by these two events, but it might be based on the occurrence of heterosynapsis at the meiotic prophase I between multivalents and other chromosomes. Moreover, heterosynapsis has been associated related to changes in the nuclear chromosome architecture in sperm, which may also affect the fertility of reorganization carriers. The objectives of this thesis have been: i) To develop a sequential fluorescence in situ hybridization (FISH) protocol in order to detect numerical chromosomal abnormalities and to establish the segregation mode of rearranged chromosomes in the same spermatozoa; ii) To establish the segregation pattern of different chromosomal rearrangements in random sperm and in sperm with numerical abnormalities; iii) To determine whether there exists a relationship between certain segregation modes and the occurrence of numerical chromosome abnormalities; iv) To develop a methodology to evaluate the tridimensional distribution of chromosome territories in sperm nuclei. Semen samples of eight carriers of reciprocal translocations, eleven carriers of Robertsonian translocations and one carrier of a three-way translocation have been included in the study. In the first sequential FISH round, numerical anomalies for five chromosomes unrelated to the rearrangements have been analysed. In the second round, a segregation analysis has been performed both in the numerically abnormal sperm detected in the first round as well as in randomly assessed sperm. The optimization of the analysis of chromosome territories in sperm nuclei has included: nuclei classification according to their genotype, 3D image recording, relocalization of selected nuclei, digital images editing, data normalization, and prediction of the preferred position of each hybridization signal along the longitudinal and radial axis of spermatozoa. The segregation patterns obtained in randomly assessed sperm show high homogeneity among carriers of the same translocation. These patterns involve high frequencies of segregation modes that entail disjunction to opposite cellular poles of chromosomes with homologous centromeres. Data obtained from segregation analysis in aneuploid and diploid/multiple disomic sperm show altered segregation patterns when compared to randomly assessed sperm, in which unbalanced segregation modes are favoured while balanced segregation products decrease. Aneuploid sperm with different types of chromosomal abnormalities or different chromosomes involved in the aneuploidy have the same effect over the altered segregation pattern. The results obtained in the analysis of chromosome territories allow for the validation of the developed methodology. It has allowed the prediction of the preferred positioning of analysed chromosomes in sperm nuclei with different genotypes. In conclusion, data obtained point out that indeed there exists a relationship between the presence of numerical chromosome abnormalities and an unbalanced segregation content in sperm. This accumulation of chromosome anomalies in the same gametes would be driven by a bidirectional effect of heterosynapsis, which could entail changes in the nuclear positioning of the affected chromosomes, as well as alterations in chiasmata formation. The chromosome misalignment at metaphase plate would cause a meiotic arrest. If unresolved, cells could eventually evade this checkpoint favouring the accumulation of both unbalanced segregation products and aneuploidies for other chromosomes in the same gametes. The developed methodology to study the sperm nuclear architecture can be potentially used in carriers of chromosomal rearrangements, in order to assess whether chromosomal abnormalities in sperm affect the global nuclear chromosome organization and disturb their fertility

AutoScanJ : A Suite of ImageJ Scripts for Intelligent Microscopy

We developed AutoscanJ, a suite of ImageJ scripts enabling to image targets of interest by automatically driving a motorized microscope at the corresponding locations. For live samples, our software can sequentially detect biological events from their onset and further image them at high resolution, an action that would be impractical by user operation. For fixed samples, the software can dramatically reduce the amount of data acquired and the acquisition duration in situations where statistically few targets of interest are observed per field of view. AutoScanJ is compatible with motorized fluorescence microscopes controlled by Leica LAS AF/X or Micro-Manager. The software is straightforward to set up and new custom image analysis workflows to detect targets of interest can be simply implemented and shared with minimal efforts as independent ImageJ macro functions. We illustrate five different application scenarios with the system ranging from samples fixed on micropatterned surfaces to live cells undergoing several rounds of division. The target detection functions for these applications are provided and can be used as a starting point and a source of inspiration for new applications. Overall, AutoScanJ helps to optimize microscope usage by autonomous operation, and it opens up new experimental avenues by enabling the real-time detection and selective imaging of transient events in live microscopy

Acumulació d'anomalies cromosómiques en espermatozoides

Una investigació amb participació de la UAB ha estudiat com els portadors de translocacions recíproques cromosòmiques, una anomalia en la qual s'intercanvia material genètic entre dos cromosomes no homòlegs, acumulen també altres tipus d'anomalies en els cromosomes dels seus espermatozoides. Conèixer millor l'acumulació d'aquestes anomalies ajuda a millorar l'assessorament a les persones que són portadores d'aquestes translocacions quan desitgen tenir fills.Una investigación con participación de la UAB ha estudiado cómo los portadores de translocaciones recíprocas cromosómicas, una anomalía en la que se intercambia material genético entre dos cromosomas no homólogos, acumulan también otros tipos de anomalías en los cromosomas de sus espermatozoides. Conocer mejor la acumulación de estas anomalías ayuda a mejorar el asesoramiento a las personas que son portadoras de estas translocaciones cuando desean tener hijos