Hidrolizado de proteínas de chícharo (Pisum sativum) y arroz (Oryza sativa) y su efecto antiadipogénico in silico

Tanto a nivel internacional como nacional, se estima que al menos el 50% de la población presenta un exceso de masa grasa, la cual está estrechamente relacionado con el desarrollo de enfermedades crónico-degenerativas. Recientemente, se ha considerado a las proteínas como compuestos bioactivos. En el caso de los aislados proteicos de chícharo (Pisum sativum) y arroz (Oryza sativa), se han reportado diversos efectos benéficos; sin embargo, existe escasez de información respecto a su efecto en tejido adiposo. El objetivo de este trabajo fue identificar péptidos, con una longitud de 2 a 5 residuos de aminoácidos, liberados por enzimas proteolíticas digestivas (pepsina, tripsina y quimotripsina) de las fracciones proteicas del arroz: prolamina y glutelina, y chícharo: legumina, convicilina y vicilina, que presenten potencial actividad antiadipogénica por medio la unión a sitios activos de PPARγ. Proteínas de chícharo y arroz (NCBI) se sometieron a un proceso de hidrólisis in silico usando el programa informático BIOPEP-UWM. Péptidos liberados con longitud de 2 a 5 residuos fueron primeramente evaluados su energía de unión a PAPRγ (PDB) por medio del software HPEPDOCK y los péptidos con valores inferiores a -160 kcal/mol fueron modelados utilizando el programa Avogrado, para finalmente analizar las energías y sitios de unión a sitios activos del receptor PPARγ con una región de interacción ligando-receptor centrada a 7.745 x 50.606 x 57.552 y con dimensiones de X= 70, Y=40 y Z=40 con un espaciamiento de 0.375 Angstrom. Los péptidos que presentaron valores inferiores a -160 kcal/mol fueron 11 (5 del arroz y 6 del chícharo) de los cuales los oligopéptidos PIVF, IVPQH, IIQGR, QPY (glutelina) y QSPVF (prolamina) del arroz y AQTF y AAVSH del chícharo fueron los que mayor afinidad tuvieron en sitios activos del receptor PPARγ (Phe264, His266,Ile281, Cys285, Arg288, Ser289, Met348 e His449) con energías de unión comprendidas entre -1.87 a -6.38 kcal/mol. Los péptidos de la glutelina (PIVF, IVPQH, IIQGR, QPY) y prolamina (QSPVF) por parte de arroz y, los péptidos de legumina (AQTF, AAVSH), convicilina (VIPVN, PQH) y vicilina (PVAIN, PGSSH) del chícharo pudieran presentar actividad antiadipogénica con base a las energías de enlaces intermoleculares formadas en sitios de unión claves del proceso de adipogénesis vía PPARγ. Abstract Both internationally and nationally, it is estimated that at least 50% of the population has an excess of fat mass, which is closely related to the development of chronic degenerative diseases. Recently, proteins have been considered as bioactive compounds, such as pea (Pisum sativum) and rice (Oryza sativa), which have reported various beneficial effects. However, there is a lack of information regarding its effect on adipose tissue. The objective of this work was to identify peptides, with a length of 2 to 5 amino acid residues, released by digestive proteolytic enzymes (pepsin, trypsin and chymotrypsin) from the protein fractions of rice: prolamine and glutelin, & pea: legumin, convicilin and vicilin, that show potential antiadipogenic activity by binding to active sites of PPARγ. Pea and rice proteins (NCBI) were subjected to an in silico hydrolysis process using the BIOPEP-UWM computer program. Peptides released with a length of 2 to 5 amino acid residues were first evaluated for their binding energy to PAPRγ (PDB) by means of the HPEPDOCK software and the peptides with values lower than -160 kcal / mol were modeled using Avogrado to finally analyze the energies and sites of binding to active sites of the PPARγ receptor with a region of ligand-receptor interaction centered at 7,745 x 50,606 x 57,552 and with dimensions of X = 70, Y = 40 and Z = 40 with a spacing of 0.375 angstroms. The peptides that presented values below -160 kcal / mol were 11 (5 from rice and 6 from peas) of which the oligopeptides PIVF, IVPQH, IIQGR, QPY (glutelin) and QSPVF (prolamine) from rice and AQTF and AAVSH from rice Peas were the ones with the highest affinity for active sites of the PAPRγ receptor (Phe264, His266, Ile281, Cys285, Arg288, Ser289, Met348 and His449) with binding energies between -1.87 and -6.38 kcal / mol. Glutelin peptides (PIVF, IVPQH, IIQGR, QPY) and prolamine (QSPVF) from rice and legumin peptides (AQTF, AAVSH), convicilin (VIPVN, PQH) and vicillin (PVAIN, PGSSH) from pea could show antiadipogenic activity based on the intermolecular bond energies formed at key binding sites of the adipogenesis process via PPARγ

Treatment with tocilizumab or corticosteroids for COVID-19 patients with hyperinflammatory state: a multicentre cohort study (SAM-COVID-19)

Objectives: The objective of this study was to estimate the association between tocilizumab or corticosteroids and the risk of intubation or death in patients with coronavirus disease 19 (COVID-19) with a hyperinflammatory state according to clinical and laboratory parameters. Methods: A cohort study was performed in 60 Spanish hospitals including 778 patients with COVID-19 and clinical and laboratory data indicative of a hyperinflammatory state. Treatment was mainly with tocilizumab, an intermediate-high dose of corticosteroids (IHDC), a pulse dose of corticosteroids (PDC), combination therapy, or no treatment. Primary outcome was intubation or death; follow-up was 21 days. Propensity score-adjusted estimations using Cox regression (logistic regression if needed) were calculated. Propensity scores were used as confounders, matching variables and for the inverse probability of treatment weights (IPTWs). Results: In all, 88, 117, 78 and 151 patients treated with tocilizumab, IHDC, PDC, and combination therapy, respectively, were compared with 344 untreated patients. The primary endpoint occurred in 10 (11.4%), 27 (23.1%), 12 (15.4%), 40 (25.6%) and 69 (21.1%), respectively. The IPTW-based hazard ratios (odds ratio for combination therapy) for the primary endpoint were 0.32 (95%CI 0.22-0.47; p < 0.001) for tocilizumab, 0.82 (0.71-1.30; p 0.82) for IHDC, 0.61 (0.43-0.86; p 0.006) for PDC, and 1.17 (0.86-1.58; p 0.30) for combination therapy. Other applications of the propensity score provided similar results, but were not significant for PDC. Tocilizumab was also associated with lower hazard of death alone in IPTW analysis (0.07; 0.02-0.17; p < 0.001). Conclusions: Tocilizumab might be useful in COVID-19 patients with a hyperinflammatory state and should be prioritized for randomized trials in this situatio

Genetic and environmental variance components for milk yield across regions, time periods and levels for Holstein cattle in México

Fueron analizados 86.812 registros de producción de leche para estimar componentes de varianza genética aditiva, de ambiente permanente y de ambiente temporal para diferentes regiones, periodos de tiempo y hatos-años de acuerdo a su nivel de desviación estándar en ganado Holstein en México. Las varianzas fueron estimadas utilizando la metodología de máxima verosimilitud restringida con un modelo animal. Las varianzas genética y residual fueron grandes en la región Norte y para el período más reciente 1991-1997, siendo ambas, asociadas con alto nivel de producción en los hatos. Utilizando todas las lactancias, las heredabilidades estimadas para la región oscilaron en el rango entre 0,27 a 0,31 ± 0,02 y para períodos de tiempo 0,20 a 0,27 ± 0,03. En primeras lactancias las heredabilidades para región y período fueron de 0,21 a 0,25 ± 0,02 y de 0,21 a 0,31 ± 0,02, respectivamente. Las heredabilidades estimadas por nivel de desviación estándar fueron de 0,21 a 0,24 ± 0,01. La repetibilidad tuvo un rango de 0,36 a 0,51. Se encontraron diferencias significativas (P<0,05) en las varianzas genética aditiva y ambiental clasificando los hatos-años de acuerdo a su nivel de desviación estándar, para regiones, períodos de tiempo y sus combinaciones. Fueron detectados diferentes grados de heterogeneidad de varianzas en función del criterio de clasificación de registros utilizado. Los resultados obtenidos en este estudio sugieren la necesidad de efectuar evaluaciones genéticas que consideren las diferencias en las varianzas entre regiones, con el objeto de reducir el sesgo e incrementar la precisión de los valores genéticos predichos.404 - 411BimestralAdditive genetic, permanent environmental, and temporary environmental variance components were estimated for 86,812 milk yield records for different regions, time periods and herd-years according their standard deviation levels for Holstein cattle in Mexico. Variances were estimated using REML and an animal model. Additive genetic and residual variances were bigger in the Northern region and for the most recent period 1991-1997, both being associated with higher production levels. Heritability estimates for regions were from 0.27 to 0.31 ± 0.02, and for time periods were from 0.20 to 0.27 ± 0.03 using all lactations. Heritability values for region and time periods in first lactation cows were from 0.21 to 0.25 ± 0.02 and 0.21 to 0.31 ± 0.02, respectively. Heritability according to the standard deviation levels were from 0.21 to 0.24 ± 0.01. Repeatability values ranged from 0.36 to 0.51. Differences (P<0.05) in the additive and environmental variances were found classifying herds-years for milk yield standard deviation level, through regions, periods of time and their combinations. Different degrees of heterogeneity of variances were found according to the classification criterion used. Results obtained in this study suggest the need to let genetic evaluation procedures account for these differences in variance according to region, in order to reduce bias and to increase the accuracy of predicted breeding values

Parámetros genéticos para características de conformación, habilidad de permanencia y producción de leche en ganado holstein en méxico

Heritabilities (h2) and genetic (rg) and phenotypic (rf) correlations were estimated for eleven primary conformation traits, first lactation milk yield (PL1) and stayability to 48 mo of age (HP48) in Holstein cattle in Mexico. Classification and milk production data were used to build two databases, one containing conformation traits and HP48 data (n=3,409), and another containing conformation traits and PL1 data (n=7,044). (Co)variance components were estimated with the REML method, using different animal models. Multi-trait indices were applied to estimate predicted responses to selection for HP48, PL1 and final score (PUFIN). The h2 values for the studied traits were low to moderate (0.001 to 0.34). The rg had values ranging from -0.30 to 0.69 with the highest positive values between HP48 and udder depth (0.52), and HP48 and leg set (0.69). All rf values estimated in this study were low. The highest response by generation for PL1 was 747 kg (index 1:0:0), that for PUFIN was 0.90 points (index 2:1:1) and that for HP48 was 0.44 % (index 1:0:0). The high genetic correlations observed here between stayability to 48 mo of age and front teat placement, udder depth, final score and leg set, indicate that incorporating some of these traits into first lactation selection indices could help to genetically improve production, conformation and stayability to 48 mo of age in the Holstein dairy cow population of Mexico.Se utilizaron registros de conformación, producción de leche en la primera lactancia (PL1) y habilidad de permanencia a los 48 meses de edad (HP48) de vacas Holstein, con el objeto de estimar heredabilidades (h2) así como correlaciones genéticas (rg) y fenotípicas (rf) entre todas las características. Se utilizaron dos archivos, el primero incluyó las características de conformación y HP48 (n=3,409), y en el segundo, las características de conformación y PL1 (n=7,044). Para la estimación de los componentes de (co)varianza se utilizó el método REML, con diferentes modelos animales. Se estimó la respuesta predicha a la selección usando índices para múltiples características, en donde se incluyó HP48, PL1 y puntos finales (PUFIN). Las h2 estimadas para las características estudiadas fueron de bajas a moderadas (de 0.001 a 0.34). Las rg tuvieron un rango de -0.30 a 0.69 y las más altas y positivas se estimaron entre HP48 con profundidad de ubre y HP48 con aplomos (0.52 y 0.69, respectivamente). Todas las rf estimadas en este estudio fueron bajas (de -0.02 a 0.13). Las respuestas por generación, considerando los mayores incrementos para PL1, PUFIN y HP48 fueron de 747 kg (índice 1:0:0), 0.90 puntos (índice 2:1:1) y 0.44 % (índice 1:0:0), respectivamente. La incorporación de algunas características de tipo como criterios de selección relacionadas a tipo y longevidad, como aplomos, ubre, puntos finales y HP48, permitirían mejorar simultáneamente la población Holstein de México para producción, conformación y permanencia en el hato, con el uso de índices de selección

Análisis genético para vida productiva en ganado Holstein de México

Se usó la metodología de análisis de supervivencia con un modelo de riesgos proporcionales de Weibull para estudiar la duración de vida productiva funcional (DVPF) de ganado Holstein en México, usando un modelo padre-abuelo materno con el software Survival Kit V3.12. La DVPF se calculó como el número de días entre la fecha de primer parto y la fecha de desecho o censura, con un crédito máximo de 305 días por lactación. Los datos analizados se obtuvieron de la Asociación Holstein de México. El archivo final constó de 36,507 registros para DVPF de vacas que parieron por primera vez entre 1995 y 2008. El modelo incluyó la función de riesgo basal de Weibull y los siguientes efectos fijos: edad al primer parto, número de lactación por fase de lactación con cortes en los días 29, 249 y 305 y nivel de producción estandarizado con 10 clases con cambios en cada lactación, incluidas como variables tiempo dependientes y los efectos aleatorios de hato-año de parto y efectos genéticos de padre y abuelo materno. El porcentaje de censura fue de 25.54 %. Todos los efectos fijos analizados fueron significativos (P<0.0001) y tuvieron una influencia importante en el riesgo de desecho de los animales. Las heredabilidades calculadas en escalas logarítmica, original, efectiva y equivalente resultaron de 0.08, 0.13, 0.12 y 0.10 respectivamente, indicando que este carácter se puede integrar efectivamente a los programas de mejoramiento genético como se ha hecho en otras poblaciones de ganado Holstein

Estudio de asociación genómica para resistencia a Cooperia punctata en bovinos cruzados en el trópico subhúmedo de México

This study is an evaluation of resistance to natural infection by Cooperia spp. in Zebu x Holstein crossbreed calves in the tropics. Fourteen four-month-old calves were dewormed and moved to pastures naturally infested with gastrointestinal nematodes under sub-humid tropical conditions. Fecal samples were collected from each animal every seven days for three months to quantify the number of eggs per gram of feces (EPG), and nematode species identified with end-point PCR. Hair samples were collected for genotyping using the GeneSeek Genomic Profiler HD-V3 panel, which contains 139,376 SNP markers. Variation in EPG per individual ranged from a minimum of 7+7 to a maximum of 4,657+1,886 EPG. The PCR identified breed differences between the Zebu x Holstein crossbreeds. Genome-wide association studies detected five statistically significant haplotypes (P<0.001). The haplotype in chromosome 2 includes four markers, that in chromosome 10 includes three, that in chromosome 15 includes two, that in chromosome 23 includes four and chromosome X includes three. Of these regions only chromosome 23 was found to be associated with parasite resistance, measured as EPG phenotypes. The remaining chromosomes exhibited no association in the studied animals. These regions could be sequenced and tested for gene expression against Cooperia and other gastrointestinal nematodes.El objetivo del presente estudio fue evaluar la resistencia a la infección natural por Cooperia spp. en bovinos jóvenes cruzados Cebú x Holstein, en trópico. Catorce (14) becerros de cuatro meses de edad fueron tratados con desparasitante y trasladados a potreros naturalmente contaminados con nematodos gastrointestinales bajo condiciones de trópico sub-húmedo. Muestras de heces se colectaron cada siete días durante tres meses por individuo, para cuantificar el número de huevos por gramo de heces (HPG) e identificar el género por PCR de punto final. Se colectaron muestras de pelo para llevar a cabo estudios de asociación genómica utilizando la plataforma GeneSeek Genomic Profiler HD-V3 que contiene139,376 marcadores SNP. Los resultados obtenidos indican variación en el número de HPG por individuo (mínimo 7+7 y máximo 4657+1886 HPG). En los análisis de componentes principales se identificaron diferencias raciales entre los animales con genes de las razas Cebú y Holstein. Los estudios de asociación del genoma completo detectaron 5 haplotipos estadísticamente significativos (P<0.001). El haplotipo del cromosoma 2 incluye cuatro marcadores, el 10 incluye a tres, el 15 incluye a dos, el 23 cuatro y el del cromosoma X incluye tres. De estas regiones sólo el cromosoma 23 se encontró asociado a resistencia por parásitos, medidos como fenotipo de HPG; los cromosomas restantes identificados no mostraron asociación en ninguno de los individuos en estudio. Se considera que estas regiones podrían ser secuenciadas y probar la expresión de genes para la resistencia contra este nematodo y de otros nematodos del complejo gastrointestinal

Estimación de factores de corrección edad-mes de parto para producción de leche en ganado holstein en México

Valencia PM, Ruíz LFJ, Montalvo VH, Trejo VB, Keown JF, Van Vleck LD. Téc Pecu Méx. 2000;38(1)9-18. In order to estimate age-month multiplicative correction factors for milk production in Mexican Holstein cattle, 72,111 lactation records from 43,267 Holstein cows for the period 1970- 1997 were used. An animal model was used and it included all available genetic relationships among animals. Separate analysis were made to estimate correction factors for North, Central and South regions of Mexico. Correction factors currently used and those obtained in this study were different (PValencia PM, Ruíz LFJ, Montalvo VH, Trejo VB, Keown JF, Van Vleck LD. Téc Pecu Méx. 2000;38(1)9-18. Se utilizaron 72,111 registros de producción de leche de 43,267 vacas de raza Holstein obtenidos en el período 1970-1997, con el objeto de estimar factores de corrección multiplicativos para edad-mes de parto con un modelo animal y usando todas las relaciones genéticas disponibles entre los animales. Se hicieron análisis por separado para las regiones Norte, Centro y Sur de México. Los factores en uso y los obtenidos en este estudio fueron diferentes (

Quorum sensing network in clinical strains of A. baumannii : AidA is a new quorum quenching enzyme

Acinetobacter baumannii is an important pathogen that causes nosocomial infections generally associated with high mortality and morbidity in Intensive Care Units (ICUs). Currently, little is known about the Quorum Sensing (QS)/Quorum Quenching (QQ) systems of this pathogen. We analyzed these mechanisms in seven clinical isolates of A. baumannii. Microarray analysis of one of these clinical isolates, Ab1 (A. baumannii ST-2-clon-2010), previously cultured in the presence of 3-oxo-C12-HSL (a QS signalling molecule) revealed a putative QQ enzyme (α/β hydrolase gene, AidA). This QQ enzyme was present in all nonmotile clinical isolates (67% of which were isolated from the respiratory tract) cultured in nutrient depleted LB medium. Interestingly, this gene was not located in the genome of the only motile clinical strain growing in this medium (A. baumannii strain Ab421-GEIH-2010 [Ab7], isolated from a blood sample). The AidA protein expressed in E. coli showed QQ activity. Finally, we observed downregulation of the AidA protein (QQ system attenuation) in the presence of HO (ROS stress). In conclusion, most of the A. baumannii clinical strains were not surface motile (84%) and were of respiratory origin (67%). Only the pilT gene was involved in surface motility and related to the QS system. Finally, a new QQ enzyme (α/β hydrolase gene, AidA protein) was detected in these strains

The immunogenetic diversity of the HLA system in Mexico correlates with underlying population genetic structure

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Impacto de la COVID-19 en el tratamiento del infarto agudo de miocardio con elevación del segmento ST. La experiencia Española

The COVID-19 outbreak has had an unclear impact on the treatment and outcomes of patients with ST-segment elevation myocardial infarction (STEMI). The aim of this study was to assess changes in STEMI management during the COVID-19 outbreak. Using a multicenter, nationwide, retrospective, observational registry of consecutive patients who were managed in 75 specific STEMI care centers in Spain, we compared patient and procedural characteristics and in-hospital outcomes in 2 different cohorts with 30-day follow-up according to whether the patients had been treated before or after COVID-19. Suspected STEMI patients treated in STEMI networks decreased by 27.6% and patients with confirmed STEMI fell from 1305 to 1009 (22.7%). There were no differences in reperfusion strategy (> 94% treated with primary percutaneous coronary intervention in both cohorts). Patients treated with primary percutaneous coronary intervention during the COVID-19 outbreak had a longer ischemic time (233 [150-375] vs 200 [140-332] minutes, P < .001) but showed no differences in the time from first medical contact to reperfusion. In-hospital mortality was higher during COVID-19 (7.5% vs 5.1%; unadjusted OR, 1.50; 95%CI, 1.07-2.11; P < .001); this association remained after adjustment for confounders (risk-adjusted OR, 1.88; 95%CI, 1.12-3.14; P = .017). In the 2020 cohort, there was a 6.3% incidence of confirmed SARS-CoV-2 infection during hospitalization. The number of STEMI patients treated during the current COVID-19 outbreak fell vs the previous year and there was an increase in the median time from symptom onset to reperfusion and a significant 2-fold increase in the rate of in-hospital mortality. No changes in reperfusion strategy were detected, with primary percutaneous coronary intervention performed for the vast majority of patients. The co-existence of STEMI and SARS-CoV-2 infection was relatively infrequent.S