Développement d'une méthode de comparaison de données asynchrones en vue de la formalisation d'un raisonnement par analogies (application à l'aide à la décision en viticulture)

L'objectif initial de ce travail de thèse est de valoriser les informations relatives au suivi temporel de la vigne, du raisin et de l'environnement de la plante et enregistrées dans des bases de données (BD) de traçabilité pour permettre la comparaison entre parcelles et millésimes, en vue de décisions par analogies.Les travaux réalisés durant cette thèse ont permis de proposer une méthode de transformation qui permet de représenter des ensembles de données asynchrones dans un espace commun afin de les comparer. Cette méthode s'appuie sur l'expertise du système de production. Dans ce travail de thèse, cette méthode a été appliquée à la comparaison de couples parcelle.millésime.L'expertise du système de production viticole permet, dans une première phase, de définir (i) la forme générale de la cinétique d'évolution de grandeurs de mesures évaluées sur la vigne, le raisin ou l'environnement de la plante et (ii) l'effet du climat sur la plante. Cette expertise est utilisée, dans une seconde phase, pour proposer des modèles paramétriques de l'évolution de chaque grandeur. Les données de suivi de chaque couple parcelle.millésime permettent d'ajuster les paramètres du modèle. Un vecteur de paramètres est défini par couple parcelle.millésime. Ce vecteur représente l'espace commun qui rend les couples parcelle.millésime comparables. Deux stratégies de comparaison sontalors possibles : (i) les comparaisons sont réalisées à partir des paramètres (méthode intensive), ou (ii) les comparaisons sont réalisées à partir de l'estimation de la valeur de la grandeur pour chaque couple parcelle.millésime et chaque unité de temps, commune à tous les couples (méthode extensive).Cette méthode a été appliquée à trois exemples différents.Dans une première application, les climats de différents millésimes intervenus sur différents cépages, entre la floraison et la véraison, ont été comparés entre eux après modélisation des grandeurs de mesure climatiques, à l'aide de modèles très simples.Dans une seconde puis une troisième application, la cinétique d'augmentation du pH et d'accumulation des sucres dans les baies de raisin pendant la maturation a été modélisée sous la forme d'une sigmoïde. Les comparaisons ont ensuite été réalisées en travaillant sur (i) la courbe représentative de chaque cinétique (pH), (ii) les paramètres du modèle (sucres) et (iii) une estimation journalière de la concentration en sucres dans les baies.Les bases de données utilisées dans ces applications proviennent de deux régions très différentes. Des données issues du suivi de la station expérimentale INRA Pech Rouge en Languedoc-Roussillon, dans le sud de la France, ont été utilisées pour l'application 1 et une partie de l'application 3. Des données de suivi de différents domaines de la Napa Valley en Californie ont servi pour l'application 2 et une partie de l'application 3.Le changement d'espace de représentation des données apporte une connaissance nouvelle pour décrire les individus et les phénomènes temporels de la vigne. Cette connaissance pourrait permettre de formaliser un raisonnement par analogies utilisant et valorisant l'expérience passée pour la gestion du millésime en cours.The initial objective of this thesis is to enhance the in-time follow-up information of the vine, the grape and the environment of the plant stored in traceability databases (BD) traceability to allow comparison between plots and vintages, to a future analogy-based decision support.The work done during this thesis allowed to propose a transformation method for representing sets of asynchronous data in a common space for comparison. This method relies on the expertise of the production system. In this thesis, this method was applied to the comparison of pairs of plot.vintage.The expert knowledge of the vineyard production system allows, in a first phase, to define (i) the general shape of the kinetics of on the vine, the grapes or the plant environment measured grandeurs, and (ii) the effect of the climate on the plant.This expertise is used in a second phase, to propose parametrical models that represent each grandeur kinetic. Monitoring data of each pair plot.vintage are used to adjust the model parameters. A vector of parameters is defined for each pair plot.vintage. This vector represents the common space that makes pairs of plot.vintage comparable. Two comparison strategies are possible: (i) comparisons are made from the parameters (intensive method), or (ii) comparisons are made from the estimation of the value of the quantity for each pair plot.vintage and each time unit, common to all pairs (extensive method).This method was applied to three different examples.In a first application, the climate of different vintages occurred on different grape varieties, between flowering and veraison, were compared with each other after modeling of the measured climate grandeurs, with very simple models.In a second and a third application, the kinetics of the increase of pH and accumulation of sugars in grape berries during ripening was modeled using a sigmoid. Comparisons were then made by working on (i) the graph of each kinetic (pH), (ii) parameters (sugars) and (iii) an estimation of the daily sugar concentration in berries.The databases used in these applications come from two very different winegrowing regions. Data from the monitoring of the INRA Pech Rouge Experimental Station, in Languedoc-Roussillon in the south of France, were used for the application 1 and part of the application 3. Monitoring data from different estates of Napa Valley in California were used for the application 2 and part of the application 3.The change of space where data are represented constitutes a new knowledge that permit one to describe individuals and temporal phenomena of the vine. This knowledge could allow to formalize an analogy-based reasoning that uses and promotes past experience to manage the current vintage.MONTPELLIER-SupAgro La Gaillarde (341722306) / SudocSudocFranceF

Performance evaluation of automated urine microscopy as a rapid, non-invasive approach for the diagnosis of non-gonococcal urethritis.

OBJECTIVES: Gram-stained urethral smear (GSUS), the standard point-of-care test for non-gonococcal urethritis (NGU) is operator dependent and poorly specific. The performance of rapid automated urine flow cytometry (AUFC) of first void urine (FVU) white cell counts (UWCC) for predicting Mycoplasma genitalium and Chlamydia trachomatis urethral infections was assessed and its application to asymptomatic infection was evaluated. METHODS: Receiver operating characteristic curve analysis, determining FVU-UWCC threshold for predicting M. genitalium or C. trachomatis infection was performed on 208 'training' samples from symptomatic patients and subsequently validated using 228 additional FVUs obtained from prospective unselected patients. RESULTS: An optimal diagnostic threshold of >29 UWC/µL gave sensitivities and specificities for either infection of 81.5% (95% CI 65.1% to 91.6%) and 85.8% (79.5% to 90.4%), respectively, compared with 86.8% (71.1% to 95%) and 64.7% (56.9% to 71.7%), respectively, for GSUS, using the training set samples. FVU-UWCC demonstrated sensitivities and specificities of 69.2% (95% CI 48.1% to 84.9%) and 92% (87.2% to 95.2%), respectively, when using validation samples. In asymptomatic patients where GSUS was not used, AUFC would have enabled more infections to be detected compared with clinical considerations only (71.4% vs 28.6%; p=0.03). The correlation between UWCC and bacterial load was stronger for M. genitalium compared with C. trachomatis (τ=0.426, p≤0.001 vs τ=0.295, p=0.022, respectively). CONCLUSIONS: AUFC offers improved specificity over microscopy for predicting C. trachomatis or M. genitalium infection. Universal AUFC may enable non-invasive diagnosis of asymptomatic NGU at the PoC. The degree of urethral inflammation exhibits a stronger association with pathogen load for M. genitalium compared with C. trachomatis

A coupled, pore-scale model for methanogenic microbial activity in underground hydrogen storage.

Underground hydrogen storage (UHS) as a means of energy storage is an efficient way of compensating for seasonal fluctuations in the availability of energy. One important factor which influences this technology is the activity of methanogenic microorganisms capable of utilising hydrogen and carbon dioxide for metabolism and leading to a change in the stored gas composition. A coupled, pore-scale model is presented which aids in the investigation of the mechanisms that govern the conversion of hydrogen to methane, i.e. advective hydrogen flow, its diffusion into microbial biofilms of multiple species, and its consumption within these biofilms. The model assumes that spherical grains are coated by a film of residual water and treats the biofilm development within each film in a quasi one-dimensional manner. A sample simulation using the presented model illustrates the biofilm growth process in these films as well as the competition between three different microbial species: methanogens, acetogens, and acetotrophs

Droplets Formation and Merging in Two-Phase Flow Microfluidics

Two-phase flow microfluidics is emerging as a popular technology for a wide range of applications involving high throughput such as encapsulation, chemical synthesis and biochemical assays. Within this platform, the formation and merging of droplets inside an immiscible carrier fluid are two key procedures: (i) the emulsification step should lead to a very well controlled drop size (distribution); and (ii) the use of droplet as micro-reactors requires a reliable merging. A novel trend within this field is the use of additional active means of control besides the commonly used hydrodynamic manipulation. Electric fields are especially suitable for this, due to quantitative control over the amplitude and time dependence of the signals, and the flexibility in designing micro-electrode geometries. With this, the formation and merging of droplets can be achieved on-demand and with high precision. In this review on two-phase flow microfluidics, particular emphasis is given on these aspects. Also recent innovations in microfabrication technologies used for this purpose will be discussed

A História da Alimentação: balizas historiográficas

Os M. pretenderam traçar um quadro da História da Alimentação, não como um novo ramo epistemológico da disciplina, mas como um campo em desenvolvimento de práticas e atividades especializadas, incluindo pesquisa, formação, publicações, associações, encontros acadêmicos, etc. Um breve relato das condições em que tal campo se assentou faz-se preceder de um panorama dos estudos de alimentação e temas correia tos, em geral, segundo cinco abardagens Ia biológica, a econômica, a social, a cultural e a filosófica!, assim como da identificação das contribuições mais relevantes da Antropologia, Arqueologia, Sociologia e Geografia. A fim de comentar a multiforme e volumosa bibliografia histórica, foi ela organizada segundo critérios morfológicos. A seguir, alguns tópicos importantes mereceram tratamento à parte: a fome, o alimento e o domínio religioso, as descobertas européias e a difusão mundial de alimentos, gosto e gastronomia. O artigo se encerra com um rápido balanço crítico da historiografia brasileira sobre o tema

Michel Dupin : témoignage

National audienc

Michel Dupin : témoignage

National audienc

« Les pouvoirs publics doivent intégrer la notion de risque »

Fin 2021, le président de la République annonçait un grand programme d’investissement baptisé « France 2030 ». Au programme, entre autres choses, un appel à projets pour des « réacteurs nucléaires innovants ». Michel Viktorovitch, directeur adjoint au SGPI, nous décrit la stratégie de l’État pour doper les acteurs émergents dans ce secteur-clé de l’économie française

Mode d'action de la calcimycine (A. 23187)

Dans le cadre d’une étude générale du mode d’action des antibiotiques ionophores carboxyliques, on étudie, par une méthode potentiométrique les équilibres, dans le méthanol, de la calcimycine avec les ions alcalins et alcalinoterreux. Pour ces derniers, on montre l’existence de deux types de complexes de stœchiométrie 1 : 1 et 1 : 2. Les constantes d’équilibre correspondantes sont obtenues. La forte sélectivité pour le calcium et le magnésium est soulignée. Ces résultats sont comparés à ceux obtenus pour d’autres ionophores du même type