Dolor crónico post hernioplastia inguinal y su asociación con la calidad de vida

Determinar si el dolor crónico post hernioplastia inguinal afecta la calidad de vida en pacientes postoperados en el servicio de Cirugía General del Hospital Regional Docente de Trujillo durante enero y octubre del 2024. Material y métodos: Se realizó un estudio primario observacional, analítico, transversal en 110 pacientes operados de hernia inguinal. Se evaluó la presencia de dolor crónico mediante la escala EVA y la calidad de vida con el SF-12. Se aplicaron análisis descriptivos y pruebas estadísticas como Chi-cuadrado, t de student y regresión logística multivariada para identificar factores asociados. Resultados: Se encontró una prevalencia de mala calidad de vida del 30%. Los pacientes con peor calidad de vida tenían mayor edad (58.12 ± 22.71 años vs. 51.71 ± 18.97 años; p=0.065) y mayor frecuencia de complicaciones postoperatorias (36.36% vs. 14.29%; p=0.009), DM2 (18.18% vs. 3.90%; p=0.012) e hipertensión arterial (36.36% vs. 14.29%; p=0.009). El dolor crónico postquirúrgico fue significativamente más frecuente en pacientes con mala calidad de vida (42.42% vs. 14.29%; p=0.001). En el análisis multivariado, el IMC (ORa=1.12; p=0.048), el dolor preoperatorio (ORa=2.91; p=0.038), la DM2 (ORa=6.26; p=0.024) y el dolor crónico postoperatorio (ORa=4.44; p=0.004) fueron factores asociados a mala calidad de vida. Conclusiones: El dolor crónico post hernioplastia inguinal se asoció significativamente con una peor calidad de vida. Factores como IMC elevado, DM2 y dolor preoperatorio también influyeron negativamente. Estos hallazgos resaltan la importancia de estrategias para reducir el dolor postoperatorio y mejorar la calidad de vida en estos pacientes.To determine whether chronic pain after inguinal hernioplasty affects the quality of life of postoperative patients in the General Surgery Department of the Hospital Regional Docente de Trujillo during January and October 2024. Materials and methods: A primary, observational, analytical, cross-sectional study was conducted on 110 patients who underwent inguinal hernia repair. Chronic pain was assessed using the VAS scale, and quality of life was measured using the SF-12 questionnaire. Descriptive analysis, Chi-square, t student, and multivariate logistic regression tests were applied to identify associated factors. Results: The prevalence of poor quality of life was 30%. Patients with poor quality of life were older (58.12 ± 22.71 years vs. 51.71 ± 18.97 years; p=0.065) and had a higher frequency of postoperative complications (36.36% vs. 14.29%; p=0.009), DM2 (18.18% vs. 3.90%; p=0.012), and hypertension (36.36% vs. 14.29%; p=0.009). Chronic postoperative pain was significantly more frequent in patients with poor quality of life (42.42% vs. 14.29%; p=0.001). In the multivariate analysis, BMI (ORa=1.12; p=0.048), preoperative pain (ORa=2.91; p=0.038), DM2 (ORa=6.26; p=0.024), and chronic postoperative pain (ORa=4.44; p=0.004) were associated with poor quality of life. Conclusions: Chronic pain after inguinal hernioplasty was significantly associated with worse quality of life. Factors such as high BMI, DM2, and preoperative pain also negatively influenced outcomes. These findings highlight the need for strategies to reduce postoperative pain and improve patients' quality of life.Tesi

Deltex-1 mutations predict poor survival in diffuse large B-cell lymphoma

Non peer reviewe

Transcriptomics analysis and its applications in cancer

Cancer is a collection of diseases that combined are one of the leading causes of deaths worldwide. Although great strides have been made in finding cures for certain cancers, the heterogeneity caused by both the tissue in which cancer originates and the mutations acquired in the cell’s DNA results in unsuccessful treatments for some patients. The genetic alterations caused by carcinogenics or by random mutations acquired during normal cell division promotes changes in the cell’s metabolism. These changes are usually reflected in abnormal gene expression that can be studied to understand the underlying mechanisms giving rise to cancer as well as suggest treatments that can exploit each tumor’s specific vulnerabilities. RNA-Seq is a technology that allows the identification and quantification of the genes that are being expressed inside the cell in a given moment. RNA-Seq has several characteristics and advantages that allow a diversity of applications to exist. For example, apart from quantifying gene expression, it can be used to detect different variants of the same gene, has base pair resolution which is informative of the gene sequence, and can also be used to quantify other RNA molecules besides messenger RNA (mRNA), such as microRNAs. The two main aims of this work are to provide computational methods for data analysis of RNA-Seq and to show specific applications of RNA-Seq that can shed light into cancer mechanisms. In Publications I and IV we developed the Sequence Processesing Integration and Analysis (SePIA) and the Fusion Gene Integration (FUNGI) toolsets that facilitate the creation of reproducible pipelines for investigating different aspects of the cancer transcriptome. SePIA’s utility is showcased with the analysis of datasets from two public data repositories. One of the analysis shows a standard RNA-Seq analysis, while the second one produced a pipeline for mRNA-microRNA integration. The second toolset, FUNGI, is aimed specifically at finding reliable gene fusions with oncogenic potential. To demonstrate FUNGI’s features, we analyzed 107 in-house samples and processed over 400 public samples from a public data repository. FUNGI allowed us to detect fusions in ovarian cancer with a higher prevalence than previously recognized. Additionally, we identified a fusion gene that has not been reported before in ovarian cancer, but that can be targeted with a drug currently in clinical trials. In Publication II we investigated the role of alternative splicing in diffuse large B-cell lymphoma and were able to show that isoform-level instead of gene-level is better at discriminating between subtypes. Additionally, specific isoforms, such as APH1A, KCNH6, and ABCB1, were correlated with survival. In Publication III, we used RNA-Seq to complement the phasing of genetic variants with somatic mutations in tumor suppressor genes. In this study we found enrichment of haplotype combinations that suggest that haploinsufficiency of tumor suppressor genes is enriched in cancer patients. SePIA and FUNGI are tools that can be used by the community to explore their datasets and contribute to the acquisition of knowledge in the field of cancer genetics with next generation sequencing. The applications of RNA-Seq studies included in this dissertation showed that RNA-Seq can be effectively used to aid in the classification of cancer subtypes, and that RNA-Seq can be used in combination with DNA sequencing to explore gene expression mediated by genetic variation in cancer.Syöpä on kokoelma sairauksia, jotka yhdessä ovat yksi suurimmista kuolemaan johtavista syistä maailmanlaajuisesti. Vaikka monien syöpien hoidossa on tapahtunut suuria edistysaskelia, joidenkin potilaiden kohdalla hoidot epäonnistuvat koska kudos, josta kasvain saa alkunsa, sekä muutokset, joita kertyy solun DNA:han, aiheuttavat suuria eroavaisuuksia sekä kasvainten kesken, että niiden sisällä. Karsinogeenien aiheuttamat tai normaalin solunjakautumisen yhteydessä sattumalta tapahtuvat muutokset solun perimässä aiheuttavat muutoksia solun aineenvaihdunnassa. Nämä muutokset heijastuvat yleensä epänormaalina geenien ilmentymisenä, joita tutkimalla voidaan selvittää syövän syntyyn vaikuttavia mekanismeja ja ehdottaa hoitoja, jotka kohdistuvat yksittäisen kasvaimen erityisiin heikkouksiin. Tämän väitöskirjatyön päätavoitteina on ollut kehittää laskennallisia menetelmiä geenien ilmentymisen analysointiin sekä osoittaa käytännössä, miten niiden avulla saadaan lisätietoa syövän syntymekanismeista. Tätä varten kehitimme kaksi työkalupakettia, jotka edesauttavat luotettavasti toistettavien työnkulkujen luomista sýövän transkriptomin, eli sen kaikkien RNA-molekyylien, tutkimiseen. Näiden työkalujen avulla pystyimme vakioimaan transkriptiodatan analyysin ja tunnistamaan sellaisia poikkeuksia geenisekvensseissä tai muutoksia geenien ilmentymisessä, joilla on merkitystä syövän etenemisessä tai jotka liittyvät syövän eri alatyyppeihin

Computational framework for systematic and scalable analysis of deep sequencing transcriptomics data

High-throughput technologies have had a profound impact in transcriptomics. Prior to microarrays, measuring gene expression was not possible in a massively parallel way. As of late, deep RNA sequencing has been constantly gaining ground to microarrays in transcriptomics analysis. RNA-Seq promises several advantages over microarray technologies, but it also comes with its own set of challenges. Different approaches exist to tackle each of the required processing steps of the RNA-Seq data. The proposed solutions need to be carefully evaluated to find the best methods depending on the particularities of the datasets and the specific research questions that are being addressed. In this thesis I propose a computational framework that allows the efficient analysis of RNA-Seq datasets. The parallelization of tasks and organization of the data files was handled by the Anduril framework on which the workflow was implemented. Particular emphasis was bestowed on the quality control of the RNA-Seq files. Several measures were taken to prune the data of low quality bases and reads that hamper the alignment step. Furthermore, various existing processing algorithms for transcript assembly and abundance estimation were tested. The best methods have been coupled together into an automated pipeline that takes the raw reads and delivers expression matrices at isoform and gene level. Additionally, a module for obtaining sets of differentially expressed genes under different conditions or when measuring an experiment across a time course is included

A survey of best practices for RNA-seq data analysis.

RNA-sequencing (RNA-seq) has a wide variety of applications, but no single analysis pipeline can be used in all cases. We review all of the major steps in RNA-seq data analysis, including experimental design, quality control, read alignment, quantification of gene and transcript levels, visualization, differential gene expression, alternative splicing, functional analysis, gene fusion detection and eQTL mapping. We highlight the challenges associated with each step. We discuss the analysis of small RNAs and the integration of RNA-seq with other functional genomics techniques. Finally, we discuss the outlook for novel technologies that are changing the state of the art in transcriptomics.This is the final published version. It first appeared at http://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-016-0881-8

Public Passenger Transportation in Colombia: Is it an area of Competition Law, administrative law, free competition? Or, on the contrary: is it a public service, subject to the laws of the free, arbitrary and self-sufficient market?

El transporte público individual, y colectivo, de pasajeros, se ha transformado dentro del derecho. Ha pasado de ser un servicio público de regulación y garantía por parte del derecho administrativo, a ser considerado, posteriormente, como un derecho fundamental, considerado a la fecha como un derecho fundamental esencial. Las ramas del derecho clásico, como lo son el derecho administrativo y el derecho constitucional, han sido garantes de su prestación eficiente. En este momento la evolución del servicio, las necesidades de los ciudadanos, la expansión de las ciudades, las nuevas tecnologías, la protección del medio ambiente y los retos urbanísticos; nos generan mayores desafíos que son abordados por el Derecho de la Competencia, el Derecho de los Mercados y el Derecho a la Ciudad. Este trabajo revisa los antecedentes, las nociones del transporte como servicio público, su evolución y plantea como reto la multidisciplinariedad del fenómeno, así como la necesidad de actuar de manera coordinada entre las ramas del derecho para asegurar el cumplimiento eficiente del mismo.Individual and collective public transportation of passengers has been transformed within the law. It has gone from being a public service regulated and guaranteed by administrative law, to being considered, subsequently, as a fundamental right, and as to this day an essential fundamental right. The branches of classical law, such as administrative law and constitutional law, have been guarantors of its efficient provision. At this time the evolution of the service, the needs of citizens, the expansion of cities, the new technologies, the environmental protection and urban challenges generate greater hurdles which are the ones addressed by the Competition Law, Market Law and the Right to the City branches. This work reviews the background, the notions of transportation as a public service, its evolution and poses the challenging and multifaceted character of this phenomenon, as well as the need to act in a coordinated manner between the branches of law to ensure its efficient compliance

La aplicación del contrato electrónico y el deber de idoneidad, Sullana, 2022

La investigación tuvo como objetivo general analizar si la aplicación del contrato electrónico es suficiente para garantizar el deber de idoneidad, Sullana, 2022. La investigación mantuvo un enfoque cualitativo, de tipo básico, nivel descriptivo, haciendo uso de la teoría fundamentada. Para la obtención de los datos de información se empleó la guía de entrevista y guía de análisis documental, los mismos que fueron validados por tres expertos, aplicándose el primero a 10 abogados especialistas en derecho civil y comercial y el segundo a 6 resoluciones emitidas por INDECOPI. De los resultados obtenidos se concluyó que, la aplicación del contrato electrónico no es suficiente para garantizar el deber de idoneidad, debido a la ausencia de elementos de seguridad jurídica ante su suscripción, tal como la dificultad de acceso a la justicia, la adecuada tutela judicial y el aprovechamiento por parte de los proveedores ante vacíos legales

Évaluation de l’aléa et du risque sismique en Haïti dirigée vers la conception parasismique

Après le séisme qui eut lieu en Haïti le 12 janvier 2010, dont l’épicentre a été localisé non loin de la capitale, Port-au-Prince (25 km en direction sud-est), d’une magnitude Mw 7.0 et à une profondeur de 13 km, le pays s’est retrouvé dans une situation catastrophique et d’extrême pauvreté, avec des graves carences en matière de santé, nutrition, éducation et logement. Les effets du tremblement de terre ont été dévastateurs pour la population : on compte plus de 300.000 morts, presque autant de blessés et 1,3 millions de sans-abri logès dans des campements « provisoires ». Quant aux conséquences matérielles, le séisme a totalement détruit près de 100.000 maisons et endommagé près de 200.000 (source : USGS). Ce tremblement de terre a été le plus fort enregistré dans la zone depuis 1770. De plus le séisme fut perceptible dans des pays voisins comme Cuba, la Jamaïque et la République Dominicaine, où il a provoqué l’alarme et des évacuations préventives. La reconstruction du pays reste un sujet prioritaire pour la coopération internationale. Le présent projet, SISMO-HAITÍ, a été développé dans le but d’apporter la connaissance et l’information nécessaires afin de faciliter la prise de mesures préventives face au risque sismique existant, afin d’éviter qu’un éventuel futur séisme ne déclenche une nouvelle catastrophe. Dans le cas d’Haïti, aucune institution n’était chargée d’assurer une surveillance sismique, mais un contact direct a été établi avec l’Observatoire National de l’Environnement et de la Vulnérabilité (ONEV) en Haïti à travers son directeur Dwinel Belizaire Ing. M. Sc., qui est précisément celui qui a sollicité l’aide qui a motivé la présente proposition. Le but ultime de ce projet est l’étude des mesures d’atténuation du risque élevé qui demeure, contribuant ainsi au développement durable de la région. Dans cette optique, la menace sismique en Haïti a été évaluée, constituant la base sur laquelle on prétend élaborer des critères de conception parasismique pour la reconstruction du pays qui pourront être inclus dans la première version de la norme antisismique, ainsi que le risque sismique à Port-au-Prince, dont les résultats serviront de base pour élaborer les plans d’urgence face à ce risque naturel. Les objectifs spécifiques atteints sont : • Évaluation de l'aléa sismique en Haïti. On en obtient des cartes de différents paramètres de mouvement pour différentes probabilités de dépassement (ce qui suppose connaître la probabilité associée aux mouvements dus à des tremblements futurs). • Évaluation de l'effet local à Port-au-Prince et élaboration d'une carte de microzonage de la ville. • Étude de la vulnérabilité sismique locale à Port-au-Prince. • Estimation du risque sismique à Port-au-Prince. • Mesures d'atténuation du risque et de conception parasismique. Ce rapport résume les activités et les résultats obtenus a cours de l'année 2011 lors de la mise en œuvre de ce projet. Le groupe de travail est une équipe multidisciplinaire composée de chercheurs de différents établissements universitaires et de recherche (Université Polytechnique de Madrid-UPM-, Conseil Supérieur de la Recherche Scientifique (CSIC) ; U. Complutense de Madrid-UCM-, U-UA-Alicante, Almeria-UAL-U., U. Autonome de Saint-Domingue, UASD et Université de Porto Rico Mayagüez--UPRM) experts dans les diverses matières impliquées dans le projet: géologie, sismologie, génie parasismique, architecture et gestion de l'information géographique. Tous les membres de cette équipe ont travaillé ensemble tout au long de l'année, en réalisant des réunions, des ateliers de travail, des vidéoconférences, en plus d'une visite à Port-au-Prince en Juillet 2011 afin de procéder à la première collecte de données

Evaluación de la peligrosidad y el riesgo sísmico en Haití y aplicación al diseño sismorresistente

Tras el terremoto ocurrido en Haití el 12 de enero de 2010, con un epicentro próximo a la capital, Puerto Príncipe (25 km), de magnitud Mw 7,0 y profundidad de 13 km, el país ha quedado en una situación catastrófica y de extrema pobreza, con necesidades básicas de salud, nutrición, educación y habitabilidad. Los efectos del terremoto han sido devastadores en la población, con más de 300.000 personas que han perdido la vida, otras tantas que han resultado heridas y 1,3 millones de personas que han quedado sin hogar y viviendo en campamentos. En cuanto a los efectos materiales, el sismo ha dejado cerca de 100.000 residencias totalmente destruidas y casi 200.000 dañadas fuertemente (fuente: USGS). Este terremoto ha sido el más fuerte registrado en la zona desde el acontecido en 1770. Además, el sismo fue perceptible en países cercanos como Cuba, Jamaica y República Dominicana, donde provocó temor y evacuaciones preventivas. La reconstrucción del país es un tema prioritario en el marco de la cooperación internacional y el presente proyecto, SISMO-HAITÍ, se ha desarrollado con el fin de aportar conocimiento e información para facilitar la toma de medidas preventivas ante el riesgo sísmico existente, tratando de evitar que un terremoto futuro en el país produzca una catástrofe como el recientemente vivido. En el caso de Haití, no existía ninguna institución responsable del monitoreo sísmico, pero se ha establecido contacto directo con el Observatorio Nacional de Medio Ambiente y Vulnerabilidad de Haití (ONEV) a través de su director Dwinel Belizaire Ing. M. Sc. Director, que es precisamente quien ha solicitado la ayuda que ha motivado la presente propuesta. El fin último de este proyecto es el estudio de acciones de mitigación del elevado riesgo existente, contribuyendo al desarrollo sostenible de la región. Para ello, se ha evaluado la amenaza sísmica en Haití, en base a la cual se pretenden establecer criterios de diseño sismorresistente para la reconstrucción del país, que se podrán recoger en la primera normativa antisísmica, así como el riesgo sísmico en Puerto Príncipe, cuyos resultados servirán de base para elaborar los planes de emergencia ante este riesgo natural. Los objetivos específicos alcanzados son: • Evaluación de amenaza sísmica en Haití, resultando mapas de distintos parámetros de movimiento para diferentes probabilidades de excedencia (lo que supone conocer la probabilidad asociada a movimientos por futuros terremotos). • Evaluación del efecto local en Puerto Príncipe y elaboración de un mapa de microzonación de la ciudad. • Estudio de vulnerabilidad sísmica a escala local en Puerto Príncipe • Estimación del riesgo sísmico en Puerto Príncipe • Medidas de mitigación del riesgo y de diseño sismorresistente En este informe se resumen las actividades desarrolladas y los resultados obtenidos a lo largo del año 2011 durante la ejecución del presente proyecto. El grupo de trabajo es un equipo multidisciplinar, compuesto por investigadores de diferentes universidades (Universidad Politécnica de Madrid- UPM-, U. Complutense de Madrid -UCM-, U. Alicante -UA-, U. Almería -UAL-, U. Autónoma de Santo Domingo -UASD- y U. de Mayagüez de Puerto Rico -UPRM-) que cubren todas las ramas involucradas en la ejecución del proyecto: geología, sismología, ingeniería sísmica, arquitectura y gestión de geoinformación. Todos los miembros de este equipo han trabajado conjuntamente durante todo el año, manteniendo reuniones, jornadas de trabajo y videoconferencias, además de realizar una visita a Puerto Príncipe en julio de 2011 para llevar a cabo la primera toma de datos

Recent Development in the Preharvest 1-MCP Application to Improve Postharvest Fruit Quality

1-Methylcyclopropene (1-MCP), an ethylene action inhibitor, is routinely applied to fruit as a postharvest treatment prior to cold storage to extend fruit storability and posterior shelf life. Nevertheless, preharvest 1-MCP applied as a liquid spray to trees is a novel treatment for maintaining fruit quality throughout the postharvest in some crops and can be a very useful tool for improving handling operations in packing houses. This chapter aims to provide an overview of not only employing 1-MCP as a preharvest treatment in different crops, but also of its effect on the biochemical and physico-chemical parameters that influence fruit postharvest quality, storage capacity, and chilling injury development. It also intends to address the main factors related to the preharvest 1-MCP application effect, such as application time, optimum concentrations, and its combination with other preharvest treatments