A Case of IFAP Syndrome with Severe Atopic Dermatitis

Introduction. The IFAP syndrome is a rare X-linked genetic disorder characterized by the triad of follicular ichthyosis, atrichia, and photophobia. Case Report. A three-month-old Caucasian, male patient was observed with noncicatricial universal alopecia and persistent eczema from birth. He had dystrophic nails, spiky follicular hyperkeratosis, and photophobia which became apparent at the first year of life. Short stature and psychomotor developmental delay were also noticed. Histopathological examination of skin biopsy on left thigh showed epidermis with irregular acanthosis, lamellar orthokeratotic hyperkeratosis, and hair follicles fulfilled by parakeratotic hyperkeratosis. The chromosomal study showed a karyotype 46, XY. Total IgE was 374 IU/mL. One missense mutation c.1360G>C (p.Ala454Pro) in hemizygosity was detected on the MBTPS2 gene thus confirming the diagnosis of IFAP syndrome. Conclusions. We describe a boy with a typical clinical presentation of IFAP syndrome and severe atopic manifestations. A novel missense mutation c.1360G>C (p.Ala454Pro) in MBTPS2 gene was observed. The phenotypic expression of disease is quantitatively related to a reduced function of a key cellular regulatory system affecting cholesterol and endoplasmic reticulum homeostasis. It can cause epithelial disturbance with failure in differentiation of epidermal structures and abnormal skin permeability barrier. However, no correlation phenotype/genotype could be established

Analysis of grassland degradation in Zona da Mata, MG, Brazil, based on NDVI time series data with the integration of phenological metrics.

Abstract: There is currently a lot of interest in determining the state of Brazilian grasslands. Governmental actions and programs have recently been implemented for grassland recovery in Brazilian states, with the aim of improving production systems and socioeconomic indicators. The aim of this study is to evaluate the vegetative growth, temporal vigor, and long-term scenarios for the grasslands in Zona da Mata, Minas Gerais State, Brazil, by integrating phenological metrics. We used metrics derived from the normalized difference vegetation index (NDVI) time series from moderate resolution imaging spectroradiometer (MODIS) data, which were analyzed in a geographic information system (GIS), using multicriteria analysis, the analytical hierarchy process, and a simplified expert system (ESS). These temporal metrics, i.e., the growth index (GI) for 16-day periods during the growing season; the slope; and the maximum, minimum, and mean for the time series, were integrated to investigate the grassland vegetation conditions and degradation level. The temporal vegetative vigor was successfully described using the rescaled range (R/S statistic) and the Hurst exponent, which, together with the metrics estimated for the full time series, imagery, and field observations, indicated areas undergoing degradation or areas that were inadequately managed (approximately 61.5%). Time series analysis revealed that most grasslands showed low or moderate vegetative vigor over time with long-term persistence due to farming practices associated with burning and overgrazing. A small part of the grasslands showed high and sustainable plant densities (approximately 8.5%). A map legend for grassland management guidelines was developed using the proposed method with remote sensing data, which were applied using GIS software and a field campaign

Evolução tecnológica da atividade leiteira no Brasil: uma visão a partir do Sistema de Produção da Embrapa Gado de Leite.

Resumo A cadeia produtiva do leite é uma das atividades mais importantes para o agronegócio brasileiro, especialmente na geração de emprego e renda. Apesar de sua importância, esta atividade apresentou desenvolvimento tecnológico mais acentuado somente a partir da década de 1990, com o fim do tabelamento dos preços do leite. Até então, a produção nacional era oriunda de fazendas com modelos extensivos de exploração, nas quais a baixa produtividade dos fatores, principalmente da terra e da mão de obra, constituía sua principal característica. A partir da liberação de preços, a atividade se modernizou e a oferta nacional de leite cresceu substancialmente, consolidando o Brasil como um dos quatro maiores produtores de lácteos do mundo. O presente estudo teve por objetivo analisar a atividade leiteira no Brasil e o processo de incorporação tecnológica nas últimas quatro décadas tendo como base um sistema de produção de leite instalado na Embrapa Gado de Leite em Coronel Pacheco (MG). Esse sistema apresenta como características básicas, um rebanho de composição genética mestiça entre Holandês e Zebu, criado predominantemente a pasto, com escala de produção e modelo de exploração de média tecnologia, que representa grande parcela das fazendas produtoras de leite do Brasil. Os fatores produtivos analisados foram capital, terra, mão de obra e animal. A presente análise mostrou que, desde a implantação do sistema em 1977 até o ano de 2016, a incorporação contínua de novas tecnologias desenvolvidas e/ou validadas pela pesquisa agropecuária refletiu em maior eficiência no uso de todos os fatores de produção. Nesse período, a produtividade da mão de obra teve um aumento de 329%, passando de 24.455 para 104.982 litros de leite por funcionário por ano. O resultado mais expressivo ficou por conta da produtividade da terra que cresceu 470%, saindo de 1.188 em 1977 para 6.779 litros de leite/ha em 2016, associado ao incremento da taxa de lotação das pastagens, que subiu de 0,63 U.A/ha para 2,07 U.A/ano. Por outro lado, as produtividades que menos cresceram foram a animal e do capital que apresentaram evolução de 47,9% e 82,2%, respectivamente. Já a produção de leite do sistema aumentou 352%, alcançando a média diária de 1.430 litros em 2016. O estudo evidenciou que os incrementos de produtividade mais relevantes aconteceram para os fatores cujos preços reais de mercado mais cresceram no período, quais sejam, terra e mão de obra. Interessante notar que mesmo diante de uma curva descendente de preços pagos ao produtor, a produção nacional de leite continuou crescendo, indicando que o avanço tecnológico foi capaz de reduzir os custos de produção mantendo ou até mesmo melhorando as margens e a rentabilidade da atividade. Isso foi possível devido, principalmente, ao aumento considerável da produtividade dos fatores de produção. Nesse cenário, destaca-se o importante papel da Embrapa Gado de Leite e dos demais parceiros do Sistema Nacional de Pesquisa Agropecuária e da área de assistência técnica e extensão rural, que contribuíram para, comprovando o sucesso desta Unidade no cumprimento da missão que moveu sua criação em 1976, de facilitar o acesso da população brasileira a leite e derivados de melhor qualidade a preços

Cadeia produtiva do leite no Brasil: produção primária.

Este estudo pretende analisar o panorama da produção primária de leite no Brasil e sua posição perante o mundo, apresentando a evolução da atividade ao longo das duas últimas décadas. Dados de produção total e inspecionada, rebanho de vacas ordenhadas, produtividade animal, além da estrutura produtiva como número de produtores e escala de produção serão abordados a seguir, detalhados nos níveis nacional, regional e estadual.bitstream/item/215880/1/CT-123.pd

Seleção genômica ampla para curvas de crescimento

Foi proposta uma metodologia para avaliação genética de curvas de crescimento considerando-se informações de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Em um primeiro passo foram ajustados modelos de crescimento não lineares (logístico) aos dados de peso-idade de cada animal, e em um segundo passo as estimativas dos parâmetros de tais modelos foram consideradas como fenótipos em um modelo de regressão (LASSO Bayesiano – BL) cujas covariáveis foram os genótipos dos marcadores SNPs. Este enfoque possibilitou estimar os valores genéticos genômicos (GBV) para peso em qualquer tempo da trajetória de crescimento, refletindo na confecção de curvas de crescimento genômicas, as quais permitiram a identificação de grupos de indivíduos geneticamente superiores em relação à eficiência de crescimento. Os dados simulados utilizados neste estudo foram constituídos de 2000 indivíduos (1000 na população de treinamento e 1000 na população de validação) contendo 453 marcadores SNPs distribuídos sobre cinco cromossomos. Os resultados indicaram a alta eficiência do método BL em predizer GBVs da população de validação com base na população de treinamento (coeficientes de correlação variaram entre 0,79 e 0,93), bem como a alta eficiência na detecção de QTLs, uma vez que os marcadores com maiores efeitos estimados encontravam-se em posições dos cromossomos próximas àquelas nas quais se encontravam os verdadeiros QTLs postulados na simulação.A methodology was proposed for the genetic evaluation of growth curves considering SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) markers. At the first step, nonlinear regression growth models (Logistic) were fitted to the weight-age of each animal, and on second step the parameter estimates of the Logistic model were used as phenotype in a regression model (Bayesian LASSO - BL) which covariates were given by SNP genotypes. This approach allows the estimation of GBV (Genomic Breeding Values) for weight at either time of growth trajectory, allowing also the production of genomic growth curves, which selected groups of individuals with larger growth efficiency. The simulated data set was constituted of 2,000 individuals (being 1,000 in the training and 1,000 in the validation population) each one with 453 SNP markers distributed along 5 chromosomes. The results indicated high efficiency of the BL method to predict GBV in the validation population using information from the training population (correlation coefficients varying between 0.79 and 0.93). The BL also presented high efficiency to detect QTL, once the most expressive estimated SNP effects were located at positions closed to true QTL position fixed in the simulation

MODELAGEM HÍBRIDA EM TRÊS ESCALAS PARA O CRESCIMENTO TUMORAL

O crescimento tumoral é resultado de uma série de complexos fenômenos que ocorrem em múltiplas escalas de tempo e espaço. Neste trabalho, desenvolvemos um modelo híbrido que representa fenômenos do crescimento tumoral avascular que ocorrem nas escalas tecidual, celular e sub-celular. A dispersão de nutrientes e de fatores de crescimento ocorrem na escala do tecido. Na escala da célula, destacam-se as interações mecânicas entre células e entre os componentes do microambiente. Na escala sub-celular ocorre uma variedade de cascatas de reações moleculares que regulam as atividades celulares. Eventos que ocorrem em distintas escalas se inter-relacionam, de modo que o entendimento destes mecanismos é fundamental para a compreensão da doença e para o desenvolvimento de terapias. Experimentos computacionais são realizados para demonstrar o potencial uso da metodologia desenvolvida

Reconstructing genome-scale metabolic models with merlin

The Metabolic Models Reconstruction Using Genome-Scale Information (merlin) tool is a user-friendly Java application that aids the reconstruction of genome-scale metabolic models for any organism that has its genome sequenced. It performs the major steps of the reconstruction process, including the functional genomic annotation of the whole genome and subsequent construction of the portfolio of reactions. Moreover, merlin includes tools for the identification and annotation of genes encoding transport proteins, generating the transport reactions for those carriers. It also performs the compartmentalisation of the model, predicting the organelle localisation of the proteins encoded in the genome and thus the localisation of the metabolites involved in the reactions promoted by such enzymes. The gene-proteins-reactions (GPR) associations are automatically generated and included in the model. Finally, merlin expedites the transition from genomic data to draft metabolic models reconstructions exported in the SBML standard format, allowing the user to have a preliminary view of the biochemical network, which can be manually curated within the environment provided by merlin.PhD grant to O. D. [SFRH /BD/47307/2008]; ERDF-European Regional Development Fund through the COMPETE Programme (operational programme for competitiveness); National Funds through the FCT within the projects FCOMP-01-0124-FEDER-009707 (HeliSysBio-molecular Systems Biology in Helicobacter pylori) and FCOMP-01-0124-FEDER-015079 (ToMEGIM-Computational Tools for Metabolic Engineering using Genome-scale Integrated Models)

Cholinergic Signaling Exerts Protective Effects in Models of Sympathetic Hyperactivity-Induced Cardiac Dysfunction

Cholinergic control of the heart is exerted by two distinct branches; the autonomic component represented by the parasympathetic nervous system, and the recently described non-neuronal cardiomyocyte cholinergic machinery. Previous evidence has shown that reduced cholinergic function leads to deleterious effects on the myocardium. Yet, whether conditions of increased cholinergic signaling can offset the pathological remodeling induced by sympathetic hyperactivity, and its consequences for these two cholinergic axes are unknown. Here, we investigated two models of sympathetic hyperactivity: i) the chronic beta-adrenergic receptor stimulation evoked by isoproterenol (ISO), and ii) the alpha(2A)/alpha(2C)-drenergic receptor knockout (KO) mice that lack pre-synaptic adrenergic receptors. In both models, cholinergic signaling was increased by administration of the cholinesterase inhibitor, pyridostigmine. First, we observed that isoproterenol produces an autonomic imbalance characterized by increased sympathetic and reduced parasympathetic tone. Under this condition transcripts for cholinergic proteins were upregulated in ventricular myocytes, indicating that non-neuronal cholinergic machinery is activated during adrenergic overdrive. Pyridostigmine treatment prevented the effects of ISO on autonomic function and on the ventricular cholinergic machinery, and inhibited cardiac remodeling. alpha(2A)/alpha(2C)-KO mice presented reduced ventricular contraction when compared to wild-type mice, and this dysfunction was also reversed by cholinesterase inhibition. Thus, the cardiac parasympathetic system and non-neuronal cardiomyocyte cholinergic machinery are modulated in opposite directions under conditions of increased sympathetic drive or ACh availability. Moreover, our data support the idea that pyridostigmine by restoring ACh availability is beneficial in heart disease

New Multicomponent Forms of the Antiretroviral Nevirapine with Improved Dissolution Performance

In the pharmaceutical area, some drugs exhibit physicochemical properties that adversely affect the formulation processes for bioavailability and effectiveness. Nevirapine (NVP) is an antiretroviral drug that presents low aqueous solubility, which directly impacts its bioavailability. Among all possible modifications, multicomponent crystals, such as cocrystals and eutectic compositions, have been successfully used to improve the solubility of drugs. In this work, the propensity of the formation of multicomponent systems of NVP with seven possible coformers were predicted and tested: salicylic acid (SA), 3-hydroxybenzoic acid (3HBZC), 4-hydroxybenzoic acid (4HBZC), saccharin (SAC), theophylline (THEO), caffeine (CAF), and urea (URE). Results indicate that NVP-SA, NVP-SAC, NVP-3HBZC, and NVP-4HBZC are cocrystals, whereas NVP-THEO and NVP-CAF are eutectic materials, and NVP-URE is a solid physical mixture. A temperature-dependent disorder behavior was identified for NVP-SA cocrystal. Dissolution studies for the eutectic materials are reported, evidencing that these materials exhibit a significant increase in NVP dissolution kinetics.Fil: Costa, Rogeria Nunes. Universidade Federal de Sao Paulo; BrasilFil: Reviglio, Ana Lucía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía y Física; ArgentinaFil: Siedler, Sana. Universidade Federal de Santa Catarina; BrasilFil: Cardoso, Simone G.. Universidade Federal de Santa Catarina; BrasilFil: Garro Linck, Yamila. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía y Física; ArgentinaFil: Monti, Gustavo Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola. Universidad Nacional de Córdoba. Instituto de Física Enrique Gaviola; Argentina. Universidad Nacional de Córdoba. Facultad de Matemática, Astronomía y Física; ArgentinaFil: Carvalho, Alexandre Magnus G.. Centro Nacional de Pesquisa em Energia e Materiais; BrasilFil: Resende, Jackson A. L. C.. Universidade Federal do Mato Grosso do Sul; BrasilFil: Chaves, Marcelo H. C.. Fundación Oswaldo Cruz; BrasilFil: Rocha, Helvético Vinícius Antunes. Fundación Oswaldo Cruz; BrasilFil: Choquesillo Lazarte, Duane. Consejo Superior de Investigaciones Científicas; España. Universidad de Granada; EspañaFil: Infantes, Lourdes. Consejo Superior de Investigaciones Científicas; España. Instituto de Química Física Rocasolano; EspañaFil: Cuffini, Silvia Lucia. Universidade de Sao Paulo; Brasi