Fungal literature records database of the Northern West Siberia (Russia)

Background Mycological research in the Northern part of West Siberia has now become sufficient for review and digitisation as over 460 scientific works have been completed mainly since the beginning of the 20th century. The history of research in the region started from isolated studies at the beginning of the 20th century, but regular and systematic research started from the 1970s. Over the following decades, several dozens of researchers have worked in the area, but the reported occurrences were scattered amongst a broad variety of publications, mainly hardly available. The great need in digitisation and accumulation of fungal records reported in published literature in a standardised regional database has now become evident. The «Fungal records database of the Northern West Siberia» (FuNWS) was initiated in 2016 according to contemporary biodiversity data standards (Darwin Core), to be compatible and accessible by the broad research community. The database has been supplemented ever since by the collective effort of specialists working in the area. According to the database summary report, there are 3358 fungal and fungus-like species revealed in the Northern West Siberia at present. The richest in species number classes are Agaricomycetes (60%) and Lecanoromycetes (33%) with a total of 25 classes represented. The FuNWS database was uploaded to Global Biodiversity Information Facility (GBIF) (Ygra State University Biological Collection publisher) on 11 November 2017 (earlier titled «Fungal Records Database of Yugra, FReDY») to provide open access to the data and its reusability (Filippova et al. 2020). New information This publication summarises the results of the digitisation of literature-based occurrence records of fungi and fungus-like organisms initiated in the Northern part of West Siberia for the first time in the history of mycological research. The bibliography of regional mycological publications was created to include about 460 published works (Suppl. material 2). In total, about 140 literature sources were digitised and about 22000 occurrence records were integrated into the FuNWS database (Filippova et al. 2020). © Filippova N et al.20-04-00349Russian Foundation for Basic Research, Ð Ð¤Ð¤Ð : 18-05-00398Russian Foundation for Basic Research, Ð Ð¤Ð¤Ð : 13-01-20/39, 18-44-860017The research was funded by the Russian Fund for Basic Research and Government of the Khanty-Mansiysk Autonomous region according to the research project 18-44-860017 and grant 13-01-20/39 of the Yugra State University. Anton G. Shiryaev was partially funded by the Russian Foundation for Basic Research No 18-05-00398 А. Elena A. Zvyagina was supported by the KhMAO – Ugra government assignment for Surgut State University №20-04-00349. А. S. Arefyev was supported by the Fundemental research programme of the Tyumen Scientific Center SB RAS VI.52.1. project number AAAA-A17-117050400146-1. The authors are grateful to Ilya Filippov for preparation of a graph

The relation between the inductive capacity of an oxide surface structure of hard alloys and their wear resistance

The purpose of this research is to determine the value of specific inductive capacity of oxide structures formed on the contact surfaces of carbide cutting tools. This paper also deals with the study of the effect of specific inductive capacity of polyoxide structures on the wear resistance of cutting tools exposed to intensive adhesive wear. It was established that the decrease of specific inductive capacity of the oxide film mass formed on the contact surfaces of a wedge leads to the increase of the wear resistance of cutting tools

Протектор микрографтов кожи в ожоговой ране: аллодерма или гидрогелевое покрытие?

AIM OF STUDY Was to compare the dynamics of engraftment of skin micrographs in a burn wound when using protectors from an allodermal graft and from a hydrogel coating.MATERIAL AND METHODS The experimental study was conducted on 18 rats with a scab formed 3 days after modeling a deep burn with an area of 20% of the body surface. Partial fascial necrectomy was performed: two rounded sections of the sling with a diameter of 25 mm were excised. 6 automicrographs of skin 4x4 mm, 0.3 mm thick, were applied to each surface freed from the scab. In each animal, micrographs on one of the wounds were covered with a hydrogel protector, on the other with an allodermotransplant from another animal of the group. A secondary aseptic dressing was applied to the protectors. On the 5th and 20th days after the operation, the state of micrographs was studied: blood circulation — according to laser Doppler flowmetry, microstructure in vivo — using optical coherence tomography, microstructure ex vivo — according to histological examination of biopsies.ReSUlTS Differences in the rate of restoration of blood circulation of micrographs in the early stages of the postoperative period were found. In the first 5 days, the perfusion of micrographs under an allodermal protector exceeded the indicator in micrographs under a hydrogel coating by 44 [21; 51] % (p=0.031) due to the contribution of endothelial and neurogenic mechanisms of blood flow modulation. Starting from day 10, the differences in perfusion were levelled, but there were signs of more active endothelial regulation of blood flow under the skin (p=0.028). Histologically, the appearance of full-blooded capillaries was revealed earlier in micrographs under the alloderm than when using a hydrogel protector. By 20 days, under the condition of regular change of hydrogel coatings, the area of wound healing under the studied coatings did not significantly differ. However, the structure of the integumentary tissue under the alloderm according to the optical coherence tomography data was closer to normal skin than when using a hydrogel protector.CONClUSIONS From the point of view of the physiology of the wound process, alloderm is the preferred option of an autograft protector in comparison with a hydrogel coating, which is probably due to the paracrine biological activity of the alloderm. However, hydrogel coatings can provide a comparable level of efficiency, provided they are regularly changed and, potentially, given the properties of cytokine activity.ЦЕЛЬ ИССЛЕДОВАНИЯ Сравнить динамику приживления микрографтов кожи в ожоговой ране при использовании протекторов из аллодермального трансплантата и из гидрогелевого покрытия.МАТЕРИАЛ И МЕТОДЫ Экспериментальное исследование проведено на 18 крысах, имеющих струп, сформировавшийся через 3 суток после моделирования глубокого ожога площадью 20% поверхности тела. Выполнялась частичная фасциальная некрэктомия: иссечение двух округлых участков струпа диаметром по 25 мм. На каждую поверхность, освобожденную от струпа, наносились 6 ауто­микрографтов кожи 4х4 мм толщиной 0,3 мм. У каждого животного микрографты на одной из ран закрывались гидрогелевым протектором, на другой — аллодермотрансплантатом от другого животного группы. На протекторы накладывалась вторичная асептическая повязка. На 5-е и на 20-е сутки после операции исследовалось состояние микрографтов: кровообращение — по данным лазерной допплеровской флоуметрии, микроструктура in vivo — с помощью оптической когерентной томографии, микроструктура ex vivo — по данным гистологического исследования биоптатов.РЕЗУЛЬТАТЫ Обнаружены различия в скорости восстановления кровообращения аутомикрографтов на ранних этапах послеоперационного периода. В первые 5 суток перфузия микрографтов под аллодермальным протектором превысила показатель в микрографтах под гидрогелевым покрытием на 44 [21; 51] % (р=0,031) за счет вклада эндотелиального и нейрогенного механизмов модуляции кровотока. Начиная с 10-х суток различия в перфузии нивелировались, однако сохранялись признаки более активной эндотелиальной модуляции кровотока под аллокожей (p=0,028). Гисто­логически в микрографтах под аллокожей выявлено более раннее появление полнокровных капилляров, чем при использовании гидрогелевого протектора. К 20-м суткам, при условии регулярной смены гидрогелевых покрытий, площадь заживления ран под исследуемыми покрытиями значимо не различалась. Однако структура покровной ткани под аллодермой, по данным оптической когерентной томографии, была ближе к нормальной коже, чем при использовании гидрогелевого протектора.ЗАКЛЮЧЕНИЕ С точки зрения физиологии раневого процесса аллокожа является предпочтительным вариантом протектора аутотрансплантата в сравнении с гидрогелевым покрытием, что, вероятно, обусловлено паракринной биологической активностью аллодермы.Однако гидрогелевые покрытия могут обеспечить сопоставимый уровень эффективности при условии их регулярной смены и, потенциально, придания им свойств цитокиновой активности

First observation of Bs -> D_{s2}^{*+} X mu nu decays

Using data collected with the LHCb detector in proton-proton collisions at a centre-of-mass energy of 7 TeV, the semileptonic decays Bs -> Ds+ X mu nu and Bs -> D0 K+ X mu nu are detected. Two structures are observed in the D0 K+ mass spectrum at masses consistent with the known D^+_{s1}(2536) and $D^{*+}_{s2}(2573) mesons. The measured branching fractions relative to the total Bs semileptonic rate are B(Bs -> D_{s2}^{*+} X mu nu)/B(Bs -> X mu nu)= (3.3\pm 1.0\pm 0.4)%, and B(Bs -> D_{s1}^+ X munu)/B(Bs -> X mu nu)= (5.4\pm 1.2\pm 0.5)%, where the first uncertainty is statistical and the second is systematic. This is the first observation of the D_{s2}^{*+} state in Bs decays; we also measure its mass and width.Comment: 8 pages 2 figures. Published in Physics Letters

Фармакоэпидемиологический анализ антимикробной терапии ожоговой травмы в реальной клинической практике

Aim: to conduct a pharmacoepidemiological analysis of antimicrobial therapy of burn injury in the hospital settings. Materials and methods. The study was based on medical records of patients with burn injuries hospitalized in the Volga University Hospital (Nizhny Novgorod) in 2018. DDD (Defined Daily Dose) analysis was used to evaluate the actual drug consumption based on the defined daily dose; DU90% (Drug Utilization 90%) analysis allowed us to assess the consumption of drugs based on their representation in the total number of defined daily doses; the “cost of illness” and ABC analyses were also used. Results and discussion. For antimicrobial agents of interest, the NDDD (Number of DDD) per year, and the NDDD/100 bed-days were determined. Among these antimicrobial agents (AMA), the largest number of prescriptions was noted for vancomycin (18.06% of treatment courses and 92.86% of patients); amikacin (15.28% of treatments and 78.57% of patients); tigecycline (13.89% and 71.43%, respectively); cefoperazone / sulbactam (12.50% and 64.29%) and co-trimoxazole (12.50% and 64.29%). The NDDD/100 bed-days value for vancomycin was 100.73, followed by amikacin and co-trimoxazole: 86.85 and 71.93 NDDD/100 bed days, respectively. Other antimicrobial agents had significantly lower consumption rates. A group containing 90% of NDDD of antimicrobial agents used for burn injury included: vancomycin – 22.30% of total consumption; аmikacin – 19.23%; co-trimoxazole – 15.93%; cefoperazone / sulbactam – 10.72%; tigecycline – 10.54%; cefepime – 6.47%; levofloxacin – 3.04%. These agents accounted for 83.33% of all drug dose prescriptions. The costs of one DDD in segments DU10% and DU90% amounted to 1976.80 rubles and 1282.58 rubles, respectively. In group A, 80% of costs were for tigecycline – 41.98%; vancomycin – 19.06%; cefoperazone / sulbactam – 6.98%; cefepime – 6.82%. The average costs of treatments with AMA from group A were 15112.45 rubles, from group B – 24082.86 rubles, and from group C – 3498.58 rubles.Implications. The AMAs most commonly used in the treatment of burn injury are vancomycin, amikacin, tigecycline, cefoperazone / sulbactam and co-trimoxazole. The use of vancomycin, tigecycline, cefoperazone / sulbactam and co-trimoxazole is associated with the highest costs of AMA therapy. In the overall spending structure, the cost of amikacin therapy represents an insignificant part (i.e., group C according to the ABC analysis). Notably, amikacin is prescribed more often than other drugs because of its high efficacy in the hospital settings and its low price. We found that more expensive AMA (ertapenem, polymyxin B, linezolid, piperacillin / tazobactam) were used when the starting regimen of antimicrobial therapy produced no adequate clinical effect. Conclusion. This pharmacoepidemiological analysis made it possible to take a broader look at the cost of AMA consumed by the patients and not only those purchased by the hospital. The results provide for a rational approach to the selection of AMA names and doses. Цель – проведение фармакоэпидемиологического анализа антимикробной терапии ожоговой травмы в условиях реальной клинической практики стационара. Материалы и методы. Материалами для исследования послужили данные медицинских карт пациентов с ожоговой травмой, госпитализированных во взрослое ожоговое отделение Университетской клиники ФГБОУ ВО «ПИМУ» Минздрава России в 2018 г. В качестве методов исследования использовались DDD-анализ (англ. – Defined Daily Dose – установленная суточная доза) – анализ фактического потребления лекарственных препаратов на основе установленной суточной дозы и DU90%-анализ (англ. – Drug Utilization 90%) – анализ потребления лекарственных препаратов на основе их доли в общем числе установленных суточных доз, анализ стоимости болезни, АВС-анализ. Результаты и их обсуждение. Были определены NDDD (англ. – number of DDD – количество установленных суточных доз) в год для антимикробных препаратов, количество установленных суточных доз лекарственного препарата на 100 койко-дней (NDDD/100 кой-ко-дней). Наибольшее количество назначений антимикробных препаратов (АМП) сопряжено с использованием ванкомицина (18,06% от общего количества курсов, 92,86% от общего количества пролеченных больных); амикацина (15,28% от общего количества курсов, 78,57% от общего количества пролеченных больных); тигециклина (13,89% от общего количества курсов, 71,43% от общего количества пролеченных больных); цефоперазона/сульбактама (12,50% от общего количества курсов, 64,29% от общего количества пролеченных больных) и ко-тримоксазол (12,50% от общего количества курсов, 64,29% от общего количества пролеченных больных). Доля потребления ванкомицина составила 100,73 NDDD/100 койко-дней, далее следуют амикацин и ко-тримоксазол, 86,85 и 71,93 NDDD/100 койко-дней соответственно. У других антимикробных препаратов уровень потребления был значительно ниже. В группу, составляющую 90% всех потребляемых NDDD антимикробных препаратов при ожоговой травме, вошли: ванкомицин – 22,30% в общей структуре потребления; амикацин – 19,23%; ко-тримоксазол – 15,93%; цефоперазон/сульбактам – 10,72%; тигециклин – 10,54%; цефепим – 6,47%; левофлоксацин – 3,04%. Эти лекарственные препараты составляют 83,33% в реальной структуре назначения. Показатели стоимости одной DDD в сегменте DU10% и DU90% составили 1976,80 руб. и 1282,58 руб. соответственно. 80% затрат (группа А) составляют затраты на тигециклин – 41,98%; ванкомицин – 19,06%; цефоперазон/сульбактам – 6,98%; цефепим – 6,82%. Средняя стоимость курсов АМП, входящих в группу А, составила 15112,45 руб., входящих в группу В – 24082,86 руб., входящих в группу С – 3498,58 руб.Выводы. Наиболее используемыми АМП в терапии ожоговой травмы являются ванкомицин, амикацин, тигециклин, цефопера зон/сульбактам и ко-тримоксазол. С ванкомицином, тигециклином, цефоперазон/сульбактамом и ко-тримоксазолом связаны наибольшие затраты в структуре затрат на АМТ. Затраты на курсы амикацина в общей структуре затрат на АМТ составляют незначительную часть (группа С по результатам АВС-анализа) при высокой частоте применения, что может быть связано как с высокой чувствительностью возбудителей инфекции в стационаре к данному АМП, так и со случаями частого потребления ввиду низкой стоимости. Установлено использование более дорогостоящих курсов АМП (эртапенем, полимиксин В, линезолид, пиперациллин/тазобактам) в случаях отсутствия должного клинического эффекта от стартовой схемы антимикробной терапии. Заключение. Фармакоэпидемиологический анализ позволил шире взглянуть на систему затрат на АМП не с точки зрения закупаемых в стационаре ЛП, а с точки зрения потребления, что позволяет произвести комплексную оценку рациональности назначения АМП и правильности их дозирования. 

Повышение кардиального тропонина-Т у больных без инфаркта миокарда

There have been recently reports on elevated levels of cardiac troponins in patients without acute myocardial infarction (AMI). The purpose of the study was to analyze final diagnoses in patients with elevated cardiac troponin-T levels without clinical manifestations and characteristic ECG changes in AMI. Subjects and materials. The study included 72 patients (48 males and 24 females whose age ranged from 54 to 87 years (mean 69.8±11.2 years)). The criterion for inclusion was increased cardiac troponin-T; the primary criteria for exclusion were AMI-specific anginal pains and characteristic ECG changes (ST-segment elevation, abnormal Q waves). The definitive diagnosis of AMI was established only in 29 (40.3%) patients; the remaining 43 patients were diagnosed as having the following diseases: sepsis (n=21), cancer (n=10), diabetic nephropathy with chronic renal failure (n=6), cerebral infarction (n=4), and B12-deficiency anemia (n=2). In deceased patients, the level of troponin-T was higher than that in those who was discharged from hospital irrespective of the underlying disease. Results. There was a direct correlation between the level of cardiac troponin-T and the SAPS II index that reflects the general condition of a patient (r=0.44; p=0.0001) and an inverse correlation between the former and the left ventricular ejection fraction (r=-0.45; p=0.003). Conclusion. Thus, despite its cardiac specificity and its detection in the blood of critically ill patients without other manifestations of AMI, cardiac troponin-T is not a specific symptom of AMI, but suggests the severity of the disease, possibly, with the involvement of the myocardium in the pathological process. Key words: cardiac troponins, myocardial infarction, multiple organ dysfunction, systemic inflammatory reaction.В настоящее время появляются сообщения о повышении уровня кардиальных тропонинов у больных без острого инфаркта миокарда (ОИМ). Цель настоящего исследования — анализ заключительных диагнозов у больных с повышением уровня кардиального тропонина-T без клинической картины и характерных изменений ЭКГ при ОИМ. Материал и методы. В исследование было включено 72 больных (48 мужчин, 24 — женщин, в возрасте от 54 до 87 лет, в среднем — 69,8±11,2). Критерием включения было повышение кардиального тропонина-Т, основными критериями исключения были — типичные для ОИМ ангинозные боли и характерные изменения ЭКГ (элевация сегмента ST, появление патологических зубцов Q). Окончательный диагноз ОИМ был установлен только у 29 больных (40,3%), у остальных 43-х больных были диагностированы следующие заболевания: у 21 — септическое состояние, у 10 — онкопатология, у 6 — диабетическая нефропа-тия с ХПН, у 4-х — инфаркт головного мозга, у 2-х — В12-дефицитная анемия. У умерших больных уровень тропонина-Т был достоверно выше, чем у выписанных из стационара, независимо от основного заболевания. Результаты. Была выявлена прямая корреляционная связь между уровнем кардиального тропонина-Т и индексом SAPS II, отражающим тяжесть общего состояния больного (r=0,44, р=0,0001) и обратная корреляционная связь между уровнем кардиального тро-понина и фракцией выброса левого желудочка (r=-0,45 р=0,003). Заключение. Таким образом, несмотря на кардиоспецифичность тропонина-Т, обнаружение его в крови пациентов, находящихся в крайне тяжелом состоянии, при отсутствии других проявлений ОИМ, не является специфическим симптомом ОИМ, а свидетельствует о тяжести заболевания, возможно с вовлечением миокарда в патологический процесс. Ключевые слова: кардиальные тропонины, инфаркт миокарда, полиорганная недостаточность, системная воспалительная реакция

Prompt K_short production in pp collisions at sqrt(s)=0.9 TeV

The production of K_short mesons in pp collisions at a centre-of-mass energy of 0.9 TeV is studied with the LHCb detector at the Large Hadron Collider. The luminosity of the analysed sample is determined using a novel technique, involving measurements of the beam currents, sizes and positions, and is found to be 6.8 +/- 1.0 microbarn^-1. The differential prompt K_short production cross-section is measured as a function of the K_short transverse momentum and rapidity in the region 0 < pT < 1.6 GeV/c and 2.5 < y < 4.0. The data are found to be in reasonable agreement with previous measurements and generator expectations.Comment: 6+18 pages, 6 figures, updated author lis

Information forecasting state transportation system

W artykule został przedstawiony, oparty na prognozie, model oceny informacji przy podejmowaniu decyzji w zarządzaniu systemem transportowym. Wskazano, że zadanie określenia głębi retrospekcji, opartej na prognozie wstępnej z uwzględnieniem starzenia się informacji, może być w pełni rozwiązane przy wykorzystaniu tradycyjnych metod statystyki matematycznej.The paper presents a predictive model for evaluating information in making decisions on management of the transport system. It is shown that the problem of determining the depth forecast’s flashbacks to the aging information can be adequately solved by traditional methods of mathematical statistics

Method of the assessment of the river craft technical condition on the basis of the microstatistics

One of the major problems of transport systems is the movement organization without catastrophes. It is particularly important for the rolling stock of the river fleet. In this paper, the authors propose the evaluation method of the technical condition of inland waterway vessels on the statistics of accidents and disasters of previous navigation. The method is based on the statistics for the “small samples”