Association préférentielle entre les mycorhizes à arbuscules et les <em>pseudomonas</em> saprophytes présentant des systèmes de sécrétion de type III

National audienceLes systèmes de sécrétion de type III (SST3) permettent aux bactéries à Gram négatif d'établir des interactions cellulaires avec des organismes eucaryotes. La plus grande fréquence de Pseudomonas spp. fluorescents saprophytes présentant des SST3 dans la rhizosphère (Mazurier et al., 2004) comparée au sol suggère leur possible rôle dans les interactions entre ces bactéries et les eucaryotes présents dans la rhizosphère, en particulier plante et champignon. L’objectif de cette étude était de différencier l’effet des racines et des mycorhizes à arbuscules (MA) sur la densité et la diversité des populations de Pseudomonas présentant des SST3. La stratégie adoptée a consisté à comparer les populations de Pseudomonas associées (i) aux racines mycorhizées de Medicago truncatula J5 (Myc+ Nod+ ) et du mutant TRV48 (Myc+ Nod- ), (ii) aux racines non mycorhizées du mutant TRV25 (Myc- Nod- ) cultivés dans le sol de Châteaurenard (France) et (iii) au sol nu correspondant. Cette comparaison a porté sur (i) la fréquence des isolats portant des gènes codant des SST3 (hrcRST), (ii) la diversité de ces séquences et de celle du fond génétique des isolats (BOX-PCR). Les résultats indiquent que la fréquence des isolats présentant des SST3 est significativement plus élevée sur les racines mycorhizées (J5 et TRV48) que sur les racines non mycorhizées (TRV25) ou dans le sol nu. L’étude de diversité des séquences hrcRST a révélé la présence de quatre génotypes dont deux spécifiquement associés aux racines mycorhizées. Les isolats présentant des SST3 ne sont repartis que dans 10 des 65 génotypes BOX-PCR décrits. Les MA ont donc un effet marqué sur les populations présentant des SST3, suggérant leur rôle dans l’interaction bactéries-mycorhizes. Pivato et coll. ont récemment montré qu’une souche modèle de P. fluorescens (C7R12) présentant un SST3 améliore la mycorhization. La contribution du SST3 dans cet effet bénéfique est en cours d’évaluation

Fluorescent pseudomonads harboring type III secretion genes are enriched in the mycorrhizosphere of Medicago truncatula

International audienceType III secretion systems (T3SSs) of Gram-negative bacteria mediate direct interactions with eukaryotic cells. Pseudomonas spp. harboring T3SS genes (T3SS+) were previously shown to be more abundant in the rhizosphere than in bulk soil. To discriminate the contribution of roots and associated arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) on the enrichment of T3SS+ fluorescent pseudomonads in the rhizosphere of Medicago truncatula, their frequency was assessed among pseudomonads isolated from mycorrhizal and nonmycorrhizal roots and from bulk soil. T3SS genes were identified by PCR targeting a conserved hrcRST DNA fragment. Polymorphism of hrcRST in T3SS+ isolates was assessed by PCR-restriction fragment length polymorphism and sequencing. Genotypic diversity of all pseudomonads isolated, whether or not harboring T3SS, was described by BOX-PCR. T3SS+ pseudomonads were significantly more abundant in mycorrhizal than in nonmycorrhizal roots and in bulk soil, and all were shown to belong to the phylogenetic group of Pseudomonas fluorescens on the basis of 16S rRNA gene identity. Four hrcRST genotypes were described; two only included isolates from mycorrhizal roots. T3SS+ and T3SS− pseudomonads showed different genetic backgrounds as indicated by their different BOX-PCR types. Taken together, these data suggest that T3SSs are implicated in interactions between fluorescent pseudomonads and AM in medic rhizosphere

Chromatin redistribution of the DEK oncoprotein represses hTERT transcription in leukemias.

Although numerous factors have been found to modulate hTERT transcription, the mechanism of its repression in certain leukemias remains unknown. We show here that DEK represses hTERT transcription through its enrichment on the hTERT promoter in cells from chronic and acute myeloid leukemias, chronic lymphocytic leukemia, but not acute lymphocytic leukemias where hTERT is overexpressed. We isolated DEK from the hTERT promoter incubated with nuclear extracts derived from fresh acute myelogenous leukemia (AML) cells and from cells expressing Tax, an hTERT repressor encoded by the human T cell leukemia virus type 1. In addition to the recruitment of DEK, the displacement of two potent known hTERT transactivators from the hTERT promoter characterized both AML cells and Tax-expressing cells. Reporter and chromatin immunoprecipitation assays permitted to map the region that supports the repressive effect of DEK on hTERT transcription, which was proportionate to the level of DEK-promoter association but not with the level of DEK expression. Besides hTERT repression, this context of chromatin redistribution of DEK was found to govern about 40% of overall transcriptional modifications, including those of cancer-prone genes. In conclusion, DEK emerges as an hTERT repressor shared by various leukemia subtypes and seems involved in the deregulation of numerous genes associated with leukemogenesis

Development of genomic resources for <em>Medicago truncatula</em> and related legume crops

National audienc

Les intermittences du sujet

Cent ans après À la Recherche du temps perdu de Marcel Proust, les intermittences du cœur demeurent, mais les mots pour le dire s'inscrivent dans un nouveau paradigme, celui du discontinu. L'écriture de soi ne cesse d'imploser dans d'infinies intermittences génériques et scripturales qui témoignent d'un sujet désireux moins de se prendre intus et in cute que de se déprendre en privilégiant la recherche d'un soi à travers ses métamorphoses et ses virtualités. La notion de vérité se déplace, comme le montre déjà Michel Leiris cherchant sa vérité dans les tableaux de Cranach, ou Serge Doubrovsky, inventeur du terme « autofiction ». Si la psychanalyse change la donne de la recherche de soi, la grande hache de l'Histoire entre pour une large part dans cette nouvelle écriture d'un soi comme exproprié de lui-même, notamment de son passé et de sa filiation, contraint, comme Jorge Semprun ou Alain Fleischer, à s'inventer. Théâtre, cinéma, arts plastiques et multimédias s'en font l'écho dans des pratiques comparables de bricolage et de recomposition, à l'image d'Agnès Varda, qui, dans ses films ou ses installations, met en scène l'éphémère et le précaire. L'originalité de cet ouvrage tient à sa problématique audacieuse, urgente, complexe autant que mouvante, à laquelle elle tente de répondre en interrogeant des œuvres canoniques aussi bien que récentes grâce à des approches multiples et diverses qui mettent la littérature au cœur d'un dialogue avec les arts et la pensée de son temps

The Medicago genome provides insight into the evolution of rhizobial symbioses

Legumes (Fabaceae or Leguminosae) are unique among cultivated plants for their ability to carry out endosymbiotic nitrogen fixation with rhizobial bacteria, a process that takes place in a specialized structure known as the nodule. Legumes belong to one of the two main groups of eurosids, the Fabidae, which includes most species capable of endosymbiotic nitrogen fixation(1). Legumes comprise several evolutionary lineages derived from a common ancestor 60 million years ago (Myr ago). Papilionoids are the largest clade, dating nearly to the origin of legumes and containing most cultivated species(2). Medicago truncatula is a long-established model for the study of legume biology. Here we describe the draft sequence of the M. truncatula euchromatin based on a recently completed BAC assembly supplemented with Illumina shotgun sequence, together capturing similar to 94% of all M. truncatula genes. A whole-genome duplication (WGD) approximately 58 Myr ago had a major role in shaping the M. truncatula genome and thereby contributed to the evolution of endosymbiotic nitrogen fixation. Subsequent to the WGD, the M. truncatula genome experienced higher levels of rearrangement than two other sequenced legumes, Glycine max and Lotus japonicus. M. truncatula is a close relative of alfalfa (Medicago sativa), a widely cultivated crop with limited genomics tools and complex autotetraploid genetics. As such, the M. truncatula genome sequence provides significant opportunities to expand alfalfa's genomic toolbox