238 research outputs found

    An upper bound of the numbers of minimally intersecting filling coherent pairs

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    Let SgS_g denoting the genus gg closed orientable surface. An {\em origami} (or flat structure) on SgS_g is obtained from a finite collection of unit Euclidean squares by gluing each right edge to a left one and each top edge to a bottom one. Coherent filling pairs of simple closed curves, (α,β)(\alpha,\beta) in SgS_g are pairs for which their minimal intersection is equal to their algebraic intersection. And, a minimally intersecting filling of (α,β)(\alpha,\beta) in SgS_g is a pair whose intersection number is the minimal among all filling pairs of SgS_g. A coherent pair of curves is naturally associated with an origami on SgS_g, and a minimally intersecting filling coherent pair of curves has the smallest number of squares in all origamis on SgS_g. Our main result introduce an algorithm to count the numbers of minimal filling pairs on SgS_g, and establish a new upper bound of this count using M\'enage Problem

    Storytelling Permutations in the Performance of Life Narrative Betty Roland's Caviar for Breakfast.

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    Throughout her life, Australian storyteller and playwright Betty Roland (1903-1996) was haunted by the lure of travel. Roland's extensive body of work reflects experiences in Joseph Stalin's Soviet Union in the 1930s, the UK in the 1950s and Greece in the 1960s and charts the evolution of a personal and political philosophy marked by world-wide social upheaval. Caviar for Breakfast (1979 revised 1989), the second volume of Roland's autobiographical trilogy, is the subject of this paper. When taken together, the three books provide a fascinating insight into the values and ideas of the mushrooming modern cultures in which Roland travelled, worked and lived. Caviar for Breakfast retraces Roland's adventures in Joseph Stalin's Soviet Union where she spent fifteen months during 1933-34 with her then lover, Guido Baracchi, a wealthy Marxist scholar. The narrative takes its life from the contents of a diary maintained by Roland during that time and her introductory remarks convey the notion that, what follows, is not a literary enterprise of the imagination. The author insists that Caviar for Breakfast is a first-hand account of past realities and not only does her diary hold the ordering of events together, but is the purveyor of truth. The truth status of the diary as a mode of representation is widely accepted in Western culture. This paper argues, however, that it is impossible for any transcription of a life to enjoy a one-to-one ratio with 'what actually happened' as it is for a ghost to re-enter a world which fully resembles the one it left. It is well within the capacity of any imaginative storyteller to construct a counterfeit, or simulated, sense of reality whether or not s/he works with the diary mode of representation

    Genome-wide association and HLA fine-mapping studies identify risk loci and genetic pathways underlying allergic rhinitis

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    Allergic rhinitis is the most common clinical presentation of allergy, affecting 400 million people worldwide, with increasing incidence in westernized countries1,2. To elucidate the genetic architecture and understand the underlying disease mechanisms, we carried out a meta-analysis of allergic rhinitis in 59,762 cases and 152,358 controls of European ancestry and identified a total of 41 risk loci for allergic rhinitis, including 20 loci not previously associated with allergic rhinitis, which were confirmed in a replication phase of 60,720 cases and 618,527 controls. Functional annotation implicated genes involved in various immune pathways, and fine mapping of the HLA region suggested amino acid variants important for antigen binding. We further performed genome-wide association study (GWAS) analyses of allergic sensitization against inhalant allergens and nonallergic rhinitis, which suggested shared genetic mechanisms across rhinitis-related traits. Future studies of the identified loci and genes might identify novel targets for treatment and prevention of allergic rhinitis

    Hybridization in an isolated population of blesbok and red hartebeest

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    Hybridization in antelope species has been widely reported in South African national parks and provincial reserves as well as on private land due to anthropogenic effects. In a closed management setting, hybridization may occur due to the crossbreeding of closely related species with unequal sex ratios, resulting in either sterile or fertile offspring. In this study, we used molecular techniques to evaluate the risk of anthropogenic hybridization between blesbok (Damaliscus pygargus phillipsi) and red hartebeest (Alcelaphus buselaphus caama) in an isolated group that purposely included the two species with unequal sex ratios (one red hartebeest male and 19 male and female blesbok). Genetic analysis based on microsatellites confirmed the presence of seven hybrid individuals. Mitochondrial analysis verified that hybridization occurred between blesbok females and the red hartebeest male. STRUCTURE and NEWHYBRIDS classified the hybrids as F1. It is suspected that the hybrid individuals were sterile as the males had undeveloped testes and only F1 hybrids were detected. Thus, the risk of hybridization between these two species may be limited in the wild. In captive settings, genetic monitoring should be included in management plans for blesbok and red hartebeest to ensure that the long-term consequences of wasted reproductive effort are limited

    Powerful Prose

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    What makes a reading experience »powerful«? This volume brings together literary scholars, linguists, and empirical researchers to elucidate the effects and reader responses to investigate just that. The thirteen contributions theorize this widely-used, but to date insufficiently studied notion, and provide insights into the therefore still mysterious-seeming power of literary fiction. The collection investigates a variety of stylistic as well as readerly and psychological features responsible for short- and long-term effects - topics of great interest to those interested or specialized in literary studies and narratology, (cognitive) stylistics, empirical literary studies and reader response theory

    Les impacts de mitochondries étrangères sur le phénotype : une étude holistique chez le ventre rouge du nord Chrosomus eos

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    Les organismes cybrides souffrent généralement d'une altération de la spécificité des interactions mito-nucléaires, résultant en une détérioration du phénotype. Toutefois, diverses études démontrent que le transfert de mitochondries peut occasionnellement être positif. À l'heure actuelle, de nombreuses questions demeurent quant au degré d'influence de ces transferts sur les différents niveaux d'organisation du phénotype. Afin de répondre à ces questions, les formes sauvages et cybrides du poisson Chrosomus eos sont étudiées. Ainsi, le premier volet de ce projet de recherche démontre un impact des mitochondries Chrosomus neogaeus à différents niveaux d'organisation du phénotype des poissons C. eos, lorsque les formes sauvages et cybrides sont retrouvées en allopatrie. Le deuxième volet de cette thèse révèle, quant à lui, que ces modifications phénotypiques ne sont pas suffisantes pour induire un évènement de spéciation entre les deux biotypes, lorsqu'en sympatrie. De plus, cette étude suggère que la coévolution mito-nucléaire peut ne pas être une condition sine qua non à la perpétuation des individus en milieu naturel. Finalement, l'approche holistique considérée dans le troisième volet de cette recherche atteste de l'influence des mitochondries C. neogaeus à différents niveaux d'organisation du phénotype de C. eos, lorsque les formes sauvages et cybrides sont sympatriques. Cette influence est moins prononcée que celle observée à partir de biotypes allopatriques. Combinés, ces chapitres contribuent à une meilleure compréhension des liens existant entre les mitochondries et le phénotype d'un individu.Cybrid organisms generally suffer from a disruption of the mito-nuclear interactions specificity, resulting in a phenotype deterioration. However, several studies demonstrate that between-species transfers of mitochondria can occasionally be beneficial. Currently, many questions still remain about how much these transfers can impact the various biological organisation levels of the phenotype. To address these questions, Chrosomus eos wild type and cybrids fish are considered. Thus, the first part of this research project demonstrates that Chrosomus neogaeus mitochondria impact the C. eos phenotype, at various levels of biological organisation, when wild type and cybrids are found in allopatry. On the other hand, the second part of this thesis reveals that these phenotypic modifications cannot trigger a speciation event between the two sympatric biotypes. This study also suggests that mito-nuclear coevolution would not be a sine qua non condition to survive and perform in natural environments. Finally, the holistic approach considered in the third part of this research shows that C. neogaeus mitochondria influence various levels of C. eos phenotype, when wild type and cybrids are sympatric. The magnitude of this influence is less pronounced than the one observed from allopatric biotypes. Combined, all these parts contribute to a better understanding of the links existing between mitochondria and the phenotype of an individual

    Dynamique évolutive de Ralstonia solanacearum en réponse aux pressions de sélection de l'aubergine résistante : approche populationnelle, de génétique évolutive et fonctionnelle de la durabilité de la résistance

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    Ralstonia Solanacearum is a soilborn beta-proteobacterium responsible of bacterial wilt on Solanaceaous crops. This bacterium is considered as one of the most harmful plant disease worldwide. This bacterium possesses the ability to infect more than 250 different species, including crops with major economic importance (tomato, potato, tobacco, eucalyptus…). R. solanacearum is divided into four phylotypes originated from different areas: I (Asian), IIA and IIB (American), III (African), IV (Indonesian). Among these phylotype, phylotype I is currently in demographic expansion, is highly recombinogenic and has a wide hosts range. Thus, altogether, these characteristics demonstrated that this phylotype has a high evolutionary potential (sensu McDonald and Linde, 2002). In order to control this bacterium, genetic plant resistance seems to be the most promising method. This method consists in using cultivars with different source of resistance such as resistance genes and/or resistant QTLs. The AG91-25 (E6), an eggplant cultivar possessing a major resistance gene (ERs1), is capable to control some of phylotype I strains of R. solanacearum. However, in order to optimize the management of this resistance and to avoid its fast breakdown, we need to deeply investigate the durability of this resistant gene. Durability can be estimated by studying the evolutionary potential of our pathogen faced to E6 source of resistance and by understanding the molecular mechanisms underlying the interaction between the host (R gene) and its pathogene (Type III Effector – T3E). In order to study R. solanacearum evolutionary dynamics under selective pressure from E6 resistant cultivar, we set up an experimental evolution trial in the field. This trial consisted of three couples of resistant (E6) and susceptible eggplants (E8) microplots, implanted twice a year during three years, hence consisting of 5 cycles. A Multi-Locus VNTR Analysis (MLVA) scheme, consisting of 8 minisatellite loci, was developed in order to characterize the strains extracted from these crop cycles. These VNTRs were specific to R. solanacearum phylotype I strains, they were highly polymorphic and discriminatory at different scale: globally, regionally and locally.Our results showed no breakdown of E6 resistance by R. solanacearum populations, which confirms that this resistance is durable. It seemed that this cultivar reduced the soil bacterial population, preventing bacterial population to infest the resistant host. At the same time, 100% of the E8 plants have died, starting at cycle 2. Bacterial wilt seemed to spread with a “plant-to-plant” dynamics within each microplot. Genetic diversity reduction was also observed during the successive cycle of susceptible eggplant, associated with the increase of frequency of two main haplotypes. However, we failed to identify a clear genetic structuration, neither at the plot scale nor at the microplot scale. Nevertheless, isolation-by-distance data seemed to show that a spatial structure is currently establishing. Altogether, our results suggested that our plot populations appeared to have a clonal epidemic structure.We also looked into 10 T3Es' involvement in the interaction between R. solanacearum and the resistant eggplant (E6). Their distribution was completely different within a collection of phylogenetically diverse strains (91 strains): ripAJ and ripE1 are the most shared T3Es whereas ripP1 and ripP2 were the less common T3E whithin our collection of strains. Some T3Es showed few (ripAJ) or no length polymorphism at all (ripE1 and ripP2) whereas some other (ripAU) are extremely polymorphic. Nevertheless, the T3E effector repertoire did not seemed to be correlated to a specific phenotype on E6 eggplant. Its recognition by E6 seemed to occur in the hypocotyle region rather than in the mesophyll, highlighting a possible organ-specificity of the interaction between ERs1 and ripAX2.Ralstonia solanacearum, une béta-proteobactérie d'origine tellurique, est l'une des phytobactérioses les plus nuisibles au niveau mondial. Cette bactérie est capable d'infecter plus de 250 espèces différentes dont certaines présentent un intérêt économique majeur (tomate, pomme de terre, tabac). R. solanacearum est divisée en 4 phylotypes distincts présentant des origines géographiques différentes : I (asiatique), IIA et IIB (américain), III (africain), IV (indonésien). Parmi ces phylotypes, le phylotype I est en expansion démographique, hautement recombinogène, réparti mondialement et possède une large gamme d'hôtes. Il possède donc un fort potentiel évolutif (sensu McDonald et Linde, 2002). Afin de contrôler cette bactérie, la lutte génétique reste la méthode la plus prometteuse : elle consiste à déployer des cultivars possédant différents sources de résistance (i.e., des gènes de résistance). La variété d'aubergine AG91-25 (E6) possède un gène majeur de résistance (ERs1) lui permettant de contrôler certaines souches de R. solanacearum de phylotype I. Cependant, la gestion de cette résistance requiert d'étudier au préalable sa durabilité afin d'en éviter le contournement. Cette durabilité peut être estimée en étudiant le potentiel évolutif d'un agent pathogène face à cette source de résistance, ainsi qu'en décryptant les mécanismes moléculaires de l'interaction entre l'hôte (gène R) et le pathogène (effecteur de types trois). Afin d'étudier la dynamique évolutive de R. solanacearum sous une pression de sélection exercée par la variété résistante E6, nous avons mis en place un essai d'évolution expérimentale au champ. Cet essai est composé de trois couples de microparcelles d'aubergines résistantes E6 et d'aubergines sensibles E8, implantées deux fois par an, pendant trois ans (soit 5 cycles). Un schéma MLVA (« Multi-Locus VNTR Analysis ») composé de 8 loci minisatellites a été développé afin de caractériser les souches extraites de ces cycles de cultures. Ces VNTR sont spécifiques aux souches de R. solanacearum de phylotype I, hautement polymorphes et discriminants à toutes les échelles : mondiale, régionale et locale. Nos résultats démontrent une absence de contournement de la résistance d'E6 par les populations parcellaires de R. solanacearum, confirmant le caractère durable de cette résistance. Cette variété aurait fortement réduit les populations bactériennes du sol, ne leur permettant plus d'infecter l'hôte résistant. Parallèlement, 100% des plants d'E8 sont morts à partir du cycle 2. La maladie au sein des microparcelles semble progresser selon une dynamique de « plante-à-plante ». Une baisse de la diversité génétique a aussi été observée au cours des cycles de culture répétés d'E8, associée à l'augmentation en fréquence de deux haplotypes. Cependant, aucune structuration génétique claire n'a été observée à l'échelle de la parcelle entière ou de la microparcelle. En revanche, les données d'isolement par la distance semblent indiquer qu'une structure spatiale semble être en cours d'établissement. L'ensemble de nos résultats suggère une structure épidémique clonale de nos populations parcellaires. Nous nous sommes aussi intéressés à l'implication de 10 ET3 dans l'interaction R. solanacearum vs aubergine résistante (E6). La distribution des 10 ET3 candidats est variable au sein d'une collection de souches phylogénétiquement diverses (91 souches) : ripAJ et ripE1 sont les ET3 les plus partagés alors que ripP1 et ripP2 sont les moins fréquemment. Certains ET3 présentent peu (ripAJ) voire pas (ripE1 et ripP2) de polymorphisme de taille, alors que d'autres (ripAU) sont extrêmement polymorphes. Cependant la composition en effecteurs d'une souche ne semble pas être corrélée à un phénotype sur aubergine E6. Nous avons identifié le gène d'effecteur ripAX2 comme ayant une fonction d'avirulence sur aubergine résistante E6. Sa reconnaissance par E6 semble s'opérer au niveau de la zone hypocotylaire

    Shift in virus composition in honeybees (Apis mellifera) following worldwide invasion by the parasitic mite and virus vector Varroa destructor

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    Invasive vectors can induce dramatic changes in disease epidemiology. While viral emergence following geographical range expansion of a vector is well known, the influence a vector can have at the level of the host's pathobiome is less well understood. Taking advantage of the formerly heterogeneous spatial distribution of the ectoparasitic mite Varroa destructor that acts as potent virus vector among honeybees Apis mellifera, we investigated the impact of its recent global spread on the viral community of honeybees in a retrospective study of historical samples. We hypothesized that the vector has had an effect on the epidemiology of several bee viruses, potentially altering their transmissibility and/or virulence, and consequently their prevalence, abundance, or both. To test this, we quantified the prevalence and loads of 14 viruses from honeybee samples collected in mite-free and mite-infested populations in four independent geographical regions. The presence of the mite dramatically increased the prevalence and load of deformed wing virus, a cause of unsustainably high colony losses. In addition, several other viruses became more prevalent or were found at higher load in mite-infested areas, including viruses not known to be actively varroa-transmitted, but which may increase opportunistically in varroa-parasitized bees

    Characteristics of goat farming and efficiency of digestive use of fodder in two breeds of goats, local (Sahelian) and imported (Majorera) in the Fatick area (Senegal)

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    The challenges of animal production in Southern countries are to increase productivity, preserve environment, maintain rural manufacturing, fight against poverty and promote economic integration. These points strongly commit Research to development of animal production. In Senegal, changes in the agricultural context have gradually led to marginalisation of livestock farming, in particular goat farming, and this makes it necessary to identify new strategies for adapting this speculation in order to be productive and at the service of the population. Major livestock development programs focus mainly on large ruminants. However, in the small ruminant sector, particularly goats, the State encourages genetic improvement using non-indigenous breeds, without any accompanying measures, either organisational or technical. The aim of this thesis is to provide knowledge that could be used to guide goat breeding programs and to promote improved breed productivity in low-input production systems. It aims to gain better understanding of goat farming systems in Senegal, and to work with farmers to propose ways to improve the sector, taking into account family considerations, cultural context and socio-political regulations of the Institutions. As the current requirements are those of productive and sustainable livestock production, it was necessary to compare the feed efficiency of indigenous (Sahelian) and imported (Majorera) breeds in order to highlight the allocation of nutrients between the physiological functions of production and adaptation in a constrained goat environment. Therefore four studies were carried out. The first study was the characterisation of goat production systems on family farms in the area of Fatick, Senegal. A survey was conducted among 45 farmers in four localities. It revealed that the farmers were all agro-pastoralists practising a mixed farming system. The majority (93%) supplemented their animals with agricultural by-products, agroforestry resources and kitchen scraps. A multiple correspondence analysis identified three groups: a first group, consisting of producers and processors of milk into traditional curdled milk, practising the sale of animals for household needs; a second, more specialised group of milk processors into yoghurt and cheese; and a third, (agro) pastoral group of goat sellers. Identification of goat husbandry practices related to feeding and housing and prospects for improvement in the same area was the focus of the second study. Surveys were conducted among eighty (80) herders (19% male and 81% female) in five villages. Based on the associated practices and objectives, an analysis of the main components revealed three categories of herders: "Innovators - Milk", "Innovators - Intermediate" and "Tradition". The first two groups were the largest (32.5 and 40%, respectively). The first group used natural pastures, agricultural residues, and natural woodland and raised goat herds. Its members gave particular importance to these practices to achieve milk production targets. The second group favoured fodder and woody crops and employed goat farm, all associated with a main objective of organic manure production. The third group used traditional housing combined with livestock farming based on sale of animals and meat consumption. However, it appeared that goat housing and feeding practices based on fodder crops were similar and highlighted herders wishes to "stabilise" the goats permanently, close to the house, mainly to protect their animals from bad weather. Heavy rainfall during rainy season, in particular, favours diseases and mortality, especially among young animals. Studies 3 and 4 aimed to provide zootechnical advice to livestock farmers. They compared the Spanish breed Majorera, which has a good performance in milk production, with the local breed, Sahelian goat, on dietary efficiency of energy and nitrogen of a locally available resource, cowpea haulm, Vigna unguiculata, variety 58/74, and their possible relationships with faecal microbiota. The results showed that the Majorera and Sahelian goats had similar levels of dry matter (DM) intake and nutrient digestibility. On the basis of metabolic weight, intake of dry matter, gross energy, digestible energy, metabolisable energy and net energy , and energy lost as methane production were significantly higher (p < 0.01) in the non-native goats than in the Sahelian goats. Urinary excretion of energy was similar (p = 0.9) between breeds, while the loss of faecal energy was higher in Majorera than in Sahelian goats. The milk energy production of Majorera goats was higher than that of Sahelian goats (p < 0.05). However, the conversion yield from metabolisable energy to net energy (klm) was not affected by breed (p = 0.37), while nitrogen intake, milk nitrogen to nitrogen conversion yield and faecal nitrogen losses, relative to metabolic weight, were significantly higher (p < 0.05) in Majorera goats than in Sahelian goats. In contrast, the fraction of dietary nitrogen excreted in urine was higher in Sahelian animals. Breed factor had no effect on nitrogen retention, nitrogen digestibility, urine nitrogen and nitrogen utilization efficiency. Amplicon profiling of the 16S ribosomal RNA gene showed that the relative abundance of phyla in the faecal microbiota was similar between breeds, highlighting the dominance of phyla firmicutes with 94.4% of the total sequences, followed by Actinobacteria with 3.7% of the sequences. Bacteroidetes represented 0.7% of the total sequences. The proportions of Lactobacillales, Erysipelotrichales and Bifidobacteria were higher in Majorera goats than in Sahelian goats (p ≤ 0.05), in contrast to Elusimicrobials (p ≤ 0.04). No significant effect of breed on bacterial diversity was observed (R-ANOSIM = 0.198; P = 0.082). However, out of the 284 genera identified in our samples, eight (08) genera of bacteria showed breed difference, i.e, the genera Atopostipes, Bifidobacteriacea_ge, Defluviitaleacea-UCG-011, Enteractinicoccus, Lachnospiraceae-UCG-008, Muribaculaceae_ge and Roseburia were significantly more represented in animals of allochthonous race (p = 0.037), as opposed to Bacillus (p = 0.045). In conclusion, goats of both breeds were similar in terms of energy efficiency and nitrogen use, despite higher daily milk production and dry matter consumption in Majorera goats. The goats were also similar in terms of energy and nitrogen digestibility and faecal microbiota. In conclusion, the Majorera breed is likely to be more dependent on a high nergy diet than the Sahelian breed as suggested by a higher basal metabolism.Les enjeux des productions animales dans les pays du Sud sont d’accroître la productivité, de préserver l’environnement, de maintenir le tissu rural, de lutter contre la pauvreté et de favoriser l’intégration économique. Ces points engagent fortement la Recherche au service du développement des productions animales. Au Sénégal, des mutations du contexte agricole ont progressivement entraîné une marginalisation de l’élevage, en particulier l’élevage caprin qui impose d’identifier de nouvelles stratégies d’adaptation de cette spéculation pour lui permettre d’être productive et au service des populations. Les grands programmes de développement de l’élevage se focalisent en effet surtout sur les grands ruminants. Cependant l’Etat encourage dans le secteur des petits ruminants, en particulier les chèvres, une amélioration génétique par recours à des races non indigènes, sans aucune mesures d’accompagnement, ni organisationnelles, ni techniques. Cette thèse vise à fournir des connaissances pouvant être utilisées pour orienter les programmes d'élevage caprins et favoriser l'amélioration de la productivité des races dans les systèmes de production à faibles intrants. Elle ambitionne de mieux comprendre les systèmes d’élevage des chèvres au Sénégal, et de mener des réflexions avec les éleveurs pour proposer les voies d’améliorations du secteur, tenant compte des considérations familiales, du contexte culturel et des règlementations sociopolitiques des institutions en place. Les exigences actuelles étant celles d’un élevage productif et durable, il convenait de comparer l’efficacité alimentaire de races autochtone (Sahélienne) et importée (Majorera) afin de préciser l’allocation des nutriments entre fonctions physiologiques de production et d’adaptation en milieu contraignant de chèvre. Par conséquent quatre études ont été réalisées. La caractérisation des systèmes de production caprine d’élevages familiaux dans la région de Fatick, Sénégal, a constitué la première étude. Une enquête a été menée auprès de 45 agriculteurs dans quatre localités. Elle a révélé que les agriculteurs étaient tous des agro-pasteurs pratiquant un système d'agriculture mixte. La majorité (93 %) complémentaient leurs animaux avec des sous-produits agricoles, des ressources de l'agroforesterie et des restes de cuisine. Une analyse des correspondances multiples a permis d'identifier trois groupes : un premier, constitué de producteurs et transformateurs de lait en lait caillé traditionnel, pratiquant la vente d'animaux pour les besoins du ménage ; un second plus spécialisé de transformateurs de lait en yaourt et fromage ; et un troisième groupe, (agro-) pastoral, de vendeurs de chèvres. L’identification de pratiques d’élevage caprin liées à l’affouragement et au logement et des perspectives d’amélioration dans la même région a concerné la deuxième étude. Des enquêtes ont été menées auprès de quatre-vingt (80) éleveurs (19% d’hommes et 81% de femmes), dans cinq villages. En fonction des pratiques et objectifs associés, une analyse des composantes principales a mis en évidence trois catégories d'éleveurs surnommés « Innovateurs – lait », « Innovateurs-intermédiaire » et « Tradition ». Les deux premiers groupes sont les plus importants (32,5 et 40%, respectivement). Le premier groupe utilise les pâturages naturels, les résidus agricoles, les ligneux naturels et dispose de chèvreries. Ses membres donnent une importance particulière à ces pratiques pour atteindre des objectifs de production de lait. Le deuxième groupe privilégie les cultures fourragères et ligneuses et emploie des chèvreries, le tout associé à un objectif principal de production de fumure organique. Le troisième groupe a recours aux logements traditionnels associés à un élevage basé sur la vente d’animaux et la consommation de la viande. Toutefois, il est clairement apparu que les pratiques de logement en chèvrerie et d’alimentation à base de cultures fourragères, se rejoignent et synthétisent une volonté des éleveurs de « stabiliser » les chèvres à demeure, dans une chèvrerie proche de la maison, principalement pour protéger leurs animaux des intempéries. Les précipitations importantes lors de la saison des pluies, notamment, favorisent le développement de maladies et la mortalité, en particulier chez les jeunes. Les études 3 et 4 ont visé à apporter des éléments de conseil zootechnique aux éleveurs. Elles ont comparé la race Majorera, qui présente une bonne performance de production laitière, à la race locale, chèvre du Sahel, des points de vue de l’efficacité d’utilisation digestive de l’énergie et de l’azote d’un fourrage local, le niébé fourrager, Vigna unguiculata, variété 58/74 de l’ISRA, et de leurs relations éventuelles avec le microbiote fécal comme élément éventuel d’explication de l’efficacité digestive des chèvres. Il ressort de l’ensemble de ces résultats que les chèvres Majorera et Sahelienne présentaient des niveaux similaires d’ingestion de matière sèche (MS) ainsi que de digestibilité des nutriments. Sur la base du poids métabolique, la matière sèche ingérée, l'énergie brute ingérée, l’énergie digestible ingérée, l'énergie métabolisable, l’énergie nette ingérée, et l'énergie perdue sous forme de production de méthane étaient significativement plus élevées (p < 0,01) chez les chèvres allochtones que chez les chèvres Saheliennes. L'excrétion urinaire d'énergie était similaire (p = 0,9) entre les races, tandis que la perte d'énergie fécale était plus élevée chez les chèvres Majorera que chez les chèvres Sahéliennes. La production d'énergie laitière des chèvres Majorera était plus élevée que celle des chèvres Saheliennes (p < 0,05). Cependant, le rendement de conversion de l'énergie métabolisable en énergie nette (klm) n'a pas été affecté par la race (p = 0,37), tandis que l'ingestion d’azote, le rendement de conversion de l’azote en azote du lait et les pertes fécales en azote, relativement au poids métabolique, étaient significativement plus élevés (p < 0,05) chez les chèvres Majorera que chez les chèvres Saheliennes. Par contre, la fraction d’azote alimentaire excrété dans l'urine était plus élevée chez les animaux de race Sahelienne. Le facteur de race n'a eu aucun effet sur la rétention d'azote, la digestibilité de l'azote, l'azote urinaire et l'efficacité d'utilisation de l'azote. Le profilage de l'amplicon du gène de l'ARN ribosomique 16S a montré que l'abondance relative des phyla dans le microbiote fécal était similaire entre les races, mettant en évidence la dominance des phyla firmicutes représentant 94,4 % des séquences totales, suivis par les Actinobactéries avec 3,7 % des séquences. Les bacteroidetes représentaient 0,7 % des séquences totales. Les proportions de Lactobacillales, Erysipelotrichales et Bifidobactéries étaient plus élevées chez les chèvres Majorera que chez les chèvres Saheliennes (p ≤ 0,05), à l’opposé des Elusimicrobiens (p ≤ 0,04). Aucun effet significatif de la race sur la diversité bactérienne n'a été observé (R-ANOSIM = 0,198 ; P = 0,082). Cependant, sur les 284 genres identifiés dans nos échantillons, huit (08) genres de bactéries ont montré une différence entre races, à savoir les genres Atopostipes, Bifidobacteriacea_ge, Defluviitaleacea-UCG-011, Enteractinicoccus, Lachnospiraceae-UCG-008, Muribaculaceae_ge et Roseburia étaient significativement plus représentés chez les animaux de racce allochtone (p = 0,037), à l’opposé de Bacillus (p = 0,045). En conclusion, les chèvres des deux races étaient similaires en termes d'efficacité énergétique et d'utilisation de l'azote, malgré une production laitière quotidienne et une consommation de matière sèche plus élevées chez les chèvres Majorera. Les chèvres étaient également similaires en termes de digestibilité de l’énergie et de l’azote, et de microbiote fécal. En conclusion, la race Majorera est vraisemblablement plus dépendante d’une alimentation plus riche en énergie que la race Sahélienne comme le suggère un métabolisme basal supérieur
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