The Conserved nhaAR Operon Is Drastically Divergent between B2 and Non-B2 Escherichia coli and Is Involved in Extra-Intestinal Virulence

The Escherichia coli species is divided in phylogenetic groups that differ in their virulence and commensal distribution. Strains belonging to the B2 group are involved in extra-intestinal pathologies but also appear to be more prevalent as commensals among human occidental populations. To investigate the genetic specificities of B2 sub-group, we used 128 sequenced genomes and identified genes of the core genome that showed marked difference between B2 and non-B2 genomes. We focused on the gene and its surrounding region with the strongest divergence between B2 and non-B2, the antiporter gene nhaA. This gene is part of the nhaAR operon, which is in the core genome but flanked by mobile regions, and is involved in growth at high pH and high sodium concentrations. Consistently, we found that a panel of non-B2 strains grew faster than B2 at high pH and high sodium concentrations. However, we could not identify differences in expression of the nhaAR operon using fluorescence reporter plasmids. Furthermore, the operon deletion had no differential impact between B2 and non-B2 strains, and did not result in a fitness modification in a murine model of gut colonization. Nevertheless, sequence analysis and experiments in a murine model of septicemia revealed that recombination in nhaA among B2 strains was observed in strains with low virulence. Finally, nhaA and nhaAR operon deletions drastically decreased virulence in one B2 strain. This effect of nhaAR deletion appeared to be stronger than deletion of all pathogenicity islands. Thus, a population genetic approach allowed us to identify an operon in the core genome without strong effect in commensalism but with an important role in extra-intestinal virulence, a landmark of the B2 strains

Fertilización nitrogenada en girasol en el suroeste de Chaco

La producción de girasol en la provincia de Chaco se ubica en el tercer lugar a nivel nacional, con rindes para la campaña 2010/2011 de 1860 kg ha-1. En este trabajo se plantea evaluar la respuesta de la fertilización nitrogenada con urea en prefloración incorporada a dosis de 100 y 150 kg ha-1 en Labranza Cero, utilizando un material considerado de alto potencial DKSOL 4045, sembrado a 0.52 m entre líneas y testigo sin fertilizar con tres densidades de siembra (2.17 pl m-1; 3 pl m-1 y 3.83 pl x m-1 plantas logradas). Los resultados se analizaron con el software INFOGEN Ver. 2011/P. Se logró un stand de plantas promedio de 2.86 en un metro, 16.57 cm de diámetro de capítulo, 1.66 m de alto, 124.78 g el peso de mil semillas y un rendimiento promedio de 2348.2 kg ha-1. Existe una correlación positiva entre el peso de mil semillas (0.59) diámetro de capítulo (0.55), altura de planta (0.52) y dosis de urea (0.49) con el rendimiento. Existieron diferencias estadísticas en el rendimiento a dosis creciente de urea desde testigo 1737.54 kg ha-1, 150 kg de urea ha-1 2531.14 kg ha-1 de rendimiento y 100 kg de urea ha-1 con un rendimiento de 2775.92 kg ha-1. La fertilización respondió a una ecuación polinómica con Y= -0.0969 x2 + 1811.7 con un R2 =0.3114. La eficiencia de uso de urea fue de 27.75 kg de grano producido por kg de urea aplicado para 100 kg de urea y 16.87 kg de grano logrado por kg de urea aplicada en 150 kg de urea aplicada. El agregado de 100 kg de urea al inicio de floración incorporada al surco permitió incrementar los rendimientos de girasol en 59.7%

Survey de Protocolos Normalizados por IETF/IRTF para Aplicaciones de Internet of Things (IoT)

Por lo general, el término Internet de las Cosas se refiere a escenarios en los que la conectividad de red y la capacidad de cómputo se extienden a objetos y sensores de reducidas dimensiones y escaso poder de cálculo, permitiendo que estos dispositivos generen, intercambien y consuman datos con una mínima intervención humana. En la Internet tradicional, la interoperabilidad es el valor esencial; o sea el primer requisito de una buena conectividad a Internet es que los sistemas “conectados” deben poder “hablar el mismo idioma” en cuanto a protocolos y codificaciones. La interoperabilidad eficaz y bien definida, puede fomentar la innovación y ofrecer eficiencias a quienes fabrican dispositivos, aumentando así el valor económico total del mercado. IoT implica vincular dispositivos, que en muchos casos nunca se han conectado antes, o al menos no en otra cosa que no sea una red cerrada y especializada. En un entorno totalmente interoperable, cualquier dispositivo de la IoT se podría conectar a cualquier otro dispositivo o sistema e intercambiar información si así lo desean. La interoperabilidad, los estándares, los protocolos y las convenciones son temas fundamentales en el desarrollo y la adopción temprano de los dispositivos de la IoT. También implica administrar esos objetos y desarrollar aplicaciones para que hagan cosas juntas que nunca podrían hacer solos. Entonces, los productos de diferentes proveedores eventualmente tendrán que hablar el mismo idioma, en algún nivel. El Internet Engineering Task Force (IETF) es una de las más importantes entidades de estandarización de los protocolos de Internet. Como tal y desde hace unos años, ha venido generando varios protocolos para IoT. En esta comunicación se revisan estos nuevos potocolos como así también los grupos de trabajo donde fueron creados.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativ

Survey de Protocolos Normalizados por IETF/IRTF para Aplicaciones de Internet of Things (IoT)

Por lo general, el término Internet de las Cosas se refiere a escenarios en los que la conectividad de red y la capacidad de cómputo se extienden a objetos y sensores de reducidas dimensiones y escaso poder de cálculo, permitiendo que estos dispositivos generen, intercambien y consuman datos con una mínima intervención humana. En la Internet tradicional, la interoperabilidad es el valor esencial; o sea el primer requisito de una buena conectividad a Internet es que los sistemas “conectados” deben poder “hablar el mismo idioma” en cuanto a protocolos y codificaciones. La interoperabilidad eficaz y bien definida, puede fomentar la innovación y ofrecer eficiencias a quienes fabrican dispositivos, aumentando así el valor económico total del mercado. IoT implica vincular dispositivos, que en muchos casos nunca se han conectado antes, o al menos no en otra cosa que no sea una red cerrada y especializada. En un entorno totalmente interoperable, cualquier dispositivo de la IoT se podría conectar a cualquier otro dispositivo o sistema e intercambiar información si así lo desean. La interoperabilidad, los estándares, los protocolos y las convenciones son temas fundamentales en el desarrollo y la adopción temprano de los dispositivos de la IoT. También implica administrar esos objetos y desarrollar aplicaciones para que hagan cosas juntas que nunca podrían hacer solos. Entonces, los productos de diferentes proveedores eventualmente tendrán que hablar el mismo idioma, en algún nivel. El Internet Engineering Task Force (IETF) es una de las más importantes entidades de estandarización de los protocolos de Internet. Como tal y desde hace unos años, ha venido generando varios protocolos para IoT. En esta comunicación se revisan estos nuevos potocolos como así también los grupos de trabajo donde fueron creados.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativ

Estándares y descripciones semánticas para la interoperabilidad de internet de las cosas

Los estándares para los dispositivos con restricciones (cd - constrained devices), aplicados a Internet de las Cosas (IoT – Internet of Things), se están consoli-dando rápidamente y la disponibilidad de los protocolos TCP/IP, en los dispositivos con restricciones, permitió que estos dispositivos se conecten fácilmente a Internet. La IETF también ha creado un conjunto de especificaciones para que estos dispositivos funcionen de una manera similar al de la web. Uno de esos protocolos es el Protocolo de Aplicación Limitada (CoAP - ) que proporciona métodos similares a los del HTTP pero para uso en entornos restringidos. Sin embargo, el uso de protocolos estandarizados no garantiza la interoperabilidad en la ca-pa de aplicación. Por lo tanto, existe una clara necesidad de poder comunicarse utilizando mo-delos de datos estructurados sobre protocolos como CoAP y HTTP. En este artículo se presentan los principios y los fundamentos de la interoperabilidad para IoT. Tambien se mencionan los estándares y especificaciones, más usuales, para la interopera-bilidad semántica.Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativ

Smart Micro Grid de campus universitario

Desde un contexto global, la red eléctrica inteligente (o REI; smart grid en inglés) se puede definir como la integración dinámica de los desarrollos en ingeniería eléctrica, almacenamiento energético y los avances de las tecnologías de la información y comunicación (o TIC), dentro del negocio de la energía eléctrica (generación, transmisión, distribución, almacenamiento y comercialización, incluyendo las energías alternativas) El concepto de “micro smart grid” se diferencia de la “smart grid” en el concepto del alcance de la administración de la red, mientras una smart grid supone una sistema de distribución de energía con control administrativo público, una micro smart grid, es un sistema cerrado e interno a una entidad privada, que pretende administrar la energía de acuerdo a criterios y normas propias de la institución. En este proyecto se pretende diseñar e implementar una “micro smart grid” de alcance de campus universitario y que sirva para un uso racional y eficiente de la energía, haciendo uso de tecnologías de la información y las comunicaciones, diseñadas específicamente para este proyecto, que permitan una gestión inteligente del sistema.Eje: Arquitectura, Redes y Sistemas Operativos.Red de Universidades con Carreras en Informátic

Hypothyroidism Enhances Tumor Invasiveness and Metastasis Development

11 pages, 9 figures.[Background]: Whereas there is increasing evidence that loss of expression and/or function of the thyroid hormone receptors (TRs) could result in a selective advantage for tumor development, the relationship between thyroid hormone levels and human cancer is a controversial issue. It has been reported that hypothyroidism might be a possible risk factor for liver and breast cancer in humans, but a lower incidence of breast carcinoma has been also reported in hypothyroid patients [Methodology/Principal Findings]: In this work we have analyzed the influence of hypothyroidism on tumor progression and metastasis development using xenografts of parental and TRβ1–expressing human hepatocarcinoma (SK-hep1) and breast cancer cells (MDA-MB-468). In agreement with our previous observations tumor invasiveness and metastasis formation was strongly repressed when TRβ–expressing cells were injected into euthyroid nude mice. Whereas tumor growth was retarded when cells were inoculated into hypothyroid hosts, tumors had a more mesenchymal phenotype, were more invasive and metastatic growth was enhanced. Increased aggressiveness and tumor growth retardation was also observed with parental cells that do not express TRs. [Conclusions/Significance]: These results show that changes in the stromal cells secondary to host hypothyroidism can modulate tumor progression and metastatic growth independently of the presence of TRs on the tumor cells. On the other hand, the finding that hypothyroidism can affect differentially tumor growth and invasiveness can contribute to the explanation of the confounding reports on the influence of thyroidal status in human cancer.This work was supported by grants BFU2007-62402 from MEC; RD06/0020/0036 from FIS and from the EU Project CRESCENDO (FP6-018652.Peer reviewe

Local hyperthyroidism promotes pancreatic acinar cell proliferation during acute pancreatitis

Proliferation of pancreatic acinar cells is a critical process in the pathophysiology of pancreatic diseases, because limited or defective proliferation is associated with organ dysfunction and patient morbidity. In this context, elucidating the signalling pathways that trigger and sustain acinar proliferation is pivotal to develop therapeutic interventions promoting the regenerative process of the organ.In this study we used genetic and pharmacological approaches to manipulate both local and systemic levels of thyroid hormones to elucidate their role in acinar proliferation following caerulein‐mediated acute pancreatitis in mice. In addition, molecular mechanisms mediating the effects of thyroid hormones were identified by genetic and pharmacological inactivation of selected signalling pathways.In this study we demonstrated that levels of the thyroid hormone 3,3’,5‐triodo‐L‐thyronine (T3) transiently increased in the pancreas during acute pancreatitis. Moreover, by using genetic and pharmacological approaches to manipulate both local and systemic levels of thyroid hormones, we showed that T3 was required to promote proliferation of pancreatic acinar cells, without affecting the extent of tissue damage or inflammatory infiltration.Finally, upon genetic and pharmacological inactivation of selected signalling pathways, we demonstrated that T3 exerted its mitogenic effect on acinar cells via a tightly controlled action on different molecular effectors, including histone deacetylase, AKT, and TGFβ signalling.In conclusion, our data suggest that local availability of T3 in the pancreas is required to promote acinar cell proliferation and provide the rationale to exploit thyroid hormone signalling to enhance pancreatic regeneration

Generation of ribosome imprinted polymers for sensitive detection of translational responses

Whilst the profiling of the transcriptome and proteome even of single-cells becomes feasible, the analysis of the translatome, which refers to all messenger RNAs (mRNAs) engaged with ribosomes for protein synthesis, is still an elaborate procedure requiring millions of cells. Herein, we report the generation and use of “smart materials”, namely molecularly imprinted polymers (MIPs) to facilitate the isolation of ribosomes and translated mRNAs from merely 1,000 cells. In particular, we show that a hydrogel-based ribosome imprinted polymer could recover ribosomes and associated mRNAs from human, simian and mice cellular extracts, but did not selectively enrich yeast ribosomes, thereby demonstrating selectivity. Furthermore, ribosome imprinted polymers enabled the sensitive measurement of an mRNA translational regulatory event, requiring 1,000-fold less cells than current methodologies. These results provide first evidence for the suitability of MIPs to selectively recover ribonucleoprotein complexes such as ribosomes, founding a novel means for sensitive detection of gene regulation