High-throughput glycopeptide profiling of prostate-specific antigen from seminal plasma by MALDI-MS

An altered total seminal plasma glycosylation has been associated with male infertility, and the highly abundant seminal plasma glycoprotein prostate-specific antigen (PSA) plays an important role in fertilization. However, the exact role of PSA glycosylation in male fertility is not clear. To understand the involvement of PSA glycosylation in the fertilization process, analytical methods are required to study the glycosylation of PSA from seminal plasma with a high glycoform resolution and in a protein-specific manner. In this study, we developed a novel, high-throughput PSA glycopeptide workflow, based on matrix-assisted laser desorption/ionization-mass spectrometry, allowing the discrimination of sialic acid linkage isomers via the derivatization of glycopeptides. The method was successfully applied on a cohort consisting of seminal plasma from infertile and fertile men (N = 102). Forty-four glycopeptides were quantified in all samples, showing mainly complex-type glycans with high levels of fucosylation and sialylation. In addition, N,N-diacetyllactosamine (LacdiNAc) motives were found as well as hybrid-type and high mannose-type structures. Our method showed a high intra- and interday repeatability and revealed no difference in PSA glycosylation between fertile and infertile men. Next to seminal plasma, the method is also expected to be of use for studying PSA glycopeptides derived from other biofluids and/or in other disease contexts.Proteomic

All blood, No stool: enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 infection

Enterohemorrhagic Escherichia coli serotype O157:H7 is a pathotype of diarrheagenic E. coli that produces one or more Shiga toxins, forms a characteristic histopathology described as attaching and effacing lesions, and possesses the large virulence plasmid pO157. The bacterium is recognized worldwide, especially in developed countries, as an emerging food-borne bacterial pathogen, which causes disease in humans and in some animals. Healthy cattle are the principal and natural reservoir of E. coli O157:H7, and most disease outbreaks are, therefore, due to consumption of fecally contaminated bovine foods or dairy products. In this review, we provide a general overview of E. coli O157:H7 infection, especially focusing on the bacterial characteristics rather than on the host responses during infection

Multiple Neural Oscillators and Muscle Feedback Are Required for the Intestinal Fed State Motor Program

After a meal, the gastrointestinal tract exhibits a set of behaviours known as the fed state. A major feature of the fed state is a little understood motor pattern known as segmentation, which is essential for digestion and nutrient absorption. Segmentation manifests as rhythmic local constrictions that do not propagate along the intestine. In guinea-pig jejunum in vitro segmentation constrictions occur in short bursts together with other motor patterns in episodes of activity lasting 40–60 s and separated by quiescent episodes lasting 40–200 s. This activity is induced by luminal nutrients and abolished by blocking activity in the enteric nervous system (ENS). We investigated the enteric circuits that regulate segmentation focusing on a central feature of the ENS: a recurrent excitatory network of intrinsic sensory neurons (ISNs) which are characterized by prolonged after-hyperpolarizing potentials (AHPs) following their action potentials. We first examined the effects of depressing AHPs with blockers of the underlying channels (TRAM-34 and clotrimazole) on motor patterns induced in guinea-pig jejunum, in vitro, by luminal decanoic acid. Contractile episode durations increased markedly, but the frequency and number of constrictions within segmenting bursts and quiescent period durations were unaffected. We used these observations to develop a computational model of activity in ISNs, excitatory and inhibitory motor neurons and the muscle. The model predicted that: i) feedback to ISNs from contractions in the circular muscle is required to produce alternating activity and quiescence with the right durations; ii) transmission from ISNs to excitatory motor neurons is via fast excitatory synaptic potentials (EPSPs) and to inhibitory motor neurons via slow EPSPs. We conclude that two rhythm generators regulate segmentation: one drives contractions within segmentation bursts, the other the occurrence of bursts. The latter depends on AHPs in ISNs and feedback to these neurons from contraction of the circular muscle

Mainstreams of Horizontal Gene Exchange in Enterobacteria: Consideration of the Outbreak of Enterohemorrhagic E. coli O104:H4 in Germany in 2011

Escherichia coli O104:H4 caused a severe outbreak in Europe in 2011. The strain TY-2482 sequenced from this outbreak allowed the discovery of its closest relatives but failed to resolve ways in which it originated and evolved. On account of the previous statement, may we expect similar upcoming outbreaks to occur recurrently or spontaneously in the future? The inability to answer these questions shows limitations of the current comparative and evolutionary genomics methods.status: publishe

ISOLATION AND MOLECULAR IDENTIFICATION OF POTENTIALLY PATHOGENIC Escherichia coli AND Campylobacter jejuni IN FERAL PIGEONS FROM AN URBAN AREA IN THE CITY OF LIMA, PERU

SUMMARY Feral pigeons (Columbia livia) live in close contact with humans and other animals. They can transmit potentially pathogenic and zoonotic agents. The objective of this study was to isolate and detect strains of diarrheagenic Escherichia coli and Campylobacter jejuniof urban feral pigeons from an area of Lima, Peru. Fresh dropping samples from urban parks were collected for microbiological isolation of E. coli strains in selective agar, and Campylobacterby filtration method. Molecular identification of diarrheagenic pathotypes of E.coliand Campylobacter jejuni was performed by PCR. Twenty-two parks were sampled and 16 colonies of Campylobacter spp. were isolated. The 100% of isolates were identified as Campylobacter jejuni. Furthermore, 102 colonies of E. coli were isolated and the 5.88% resulted as Enteropathogenic (EPEC) type and 0.98% as Shiga toxin-producing E. coli (STEC). The urban feral pigeons of Lima in Peru can act as a reservoir or carriers of zoonotic potentially pathogenic enteric agents

Własności energetyczne kory

Ilość energii zawartej w korze pozyskiwanej razem z drewnem w polskich lasach można szacować na równowartość 1-2 milionów ton węgla. Biomasa ta może być stosowana jako paliwo, ma wysoką kaloryczność i stwarza małe zagrożenie dla środowiska w czasie spalania. W pracy analizowano własności czterech różnych kor pochodzących z głównych rodzajów drzew pozyskiwanych w kraju. Stwierdzono większą zawartość pierwiastka węgla w korze w stosunku do innych paliw pochodzenia roślinnego, wyższą kaloryczność oraz mniejszą zawartość części lotnych. Substancja mineralna w korach zawiera głównie związki wapnia, co powoduje zmiany w ilości oznaczonego popiołu w zależności od temperatury spopielania paliwa. Kory moga stwarzać zagrożenie żużlowaniem i popieleniem

Analiza zmiany składu stałych produktów pirolizy biomasy

W pracy analizowano zmiany zachodzące w próbkach biomasy w procesie wolnej pirolizy. Badania prowadzono w warunkach złoża stacjonarnego dla trzech prób biomasy: zrębków wierzby, łusek słonecznika i odpadu po procesie parzenia kawy, w zakresie temperatur 250-850°C. Przeprowadzono porównawcze badania pirolizy w warunkach TGA z szybkością nagrzewu 10° C/min. Oceniano zmiany składu chemicznego pozostałości po odgazowaniu w zależności od temperatury procesu. Na podstawie otrzymanych wyników wyznaczono ilość wybielanych części lotnych oraz zmiany ilości energii chemicznej zawartej w próbkach. Stwierdzono, że proces pirolizy prowadzi do prawie całkowitego wydzielenia związków wodoru i tlenu z koksów, z tym, że proces wydzielania wodoru jest proporcjonalny do stopnia odgazowania paliwa a proces wydzielania tlenu wyprzedza proces odgazowania. Wydzielanie węgla oraz azotu jest znacznie wolniejsze i prowadzi do wzrostu udziału tych pierwiastków w koksach. Po procesie odgazowania, w pozostałości koksowej pozostaje około 30% energii początkowej

Kaloryczność paliw stałych

W pracy analizowano wpływ pochodzenia oraz składu paliw stałych na ciepło spalania i wartość opałową. Stwierdzono dominujący wpływ zawartości pierwiastka węgla oraz balastu, rozumianego jako suma udziałów popiołu i tlenu, na kaloryczność paliw stałych. Porównano ciepło spalania i wartość opałową paliw i wykazano, że różnica między tymi wielkościami jest charakterystyczna dla danej grupy paliw. Zestawiono formuły pozwalające oceniać ciepło spalania paliw na podstawie ich składu pierwiastkowego oraz na podstawie zawartości części palnych i balastu. Przeprowadzono porównanie wartości uzyskanych przy pomocy tych formuł z wartościami mierzonymi i dokonano ich oceny dokładności

Kaloryczność części lotnych biomasy

Biomasa jest obecnie powszechnie stosowana jako paliwo w energetyce i instalacjach grzewczych. Charakteryzuje się wysoką zawartością części lotnych, których udział może przekraczać 80 procent masy paliwa w stanie suchym. Taki wysoki udział części lotnych powoduje odmienne zachowanie sie biomasy podczas spalania w stosunku do paliw kopalnych. Dla warunków pracy kotła istotne jest, jaka część energii w czasie spalania jest uzyskiwana z części lotnych. W pracy określono kaloryczność części lotnych wydzielanych z biomasy i udział energii pochodzącej ze spalania części lotnych

Rheological parameters of fresh sealing slurries depending on the time of their preparation

Przy wyborze technologii cementowania kolumny rur okładzinowych, zależnie od warunków geologiczno-złożowych i technicznych, niesłychanie ważną rolę odgrywa jakość oraz parametry fizyczne i chemiczne spoiw hydraulicznych, a także właściwości fizykochemicznych świeżego, a później stwardniałego cementu. Zaczyny uszczelniające powinny odznaczać się odpowiednimi właściwościami technologicznymi, aby w najwyższym stopniu spełniały swoje zadanie w otworze. Zaczyny powinny wykazywać ściśle określony czas wiązania, powinny mieć dobrą przetłaczalność przez cały czas trwania zabiegu cementacyjnego. Ich właściwości reologiczne oraz technologiczne powinny odznaczać się minimalną zmiennością pod wpływem dużych zmian temperatur oraz ciśnienia jakie panują w warunkach otworowych na znacznych głębokościach. Parametry reologiczne świeżego zaczynu uszczelniającego, regulowane poprzez wszelkiego rodzaju dodatki i domieszki, powinny zapewnić skuteczne wytłoczenie płuczki wiertniczej z przestrzeni pierścieniowej otworu wiertniczego. W artykule przedstawiono wyniki badań wpływu czasu cementowania na zmiany właściwości reologicznych zaczynów uszczelniających sporządzanych na osnowie cementu portlandzkiego CEM I 42,5 R. Pomiary wykonywane były w różnych odstępach czasowych. Przez pierwsze dwie godziny od dokładnego wymieszania zaczynów pomiary odbywały się co pół godziny, każdy następny - co godzinę. Maksymalny czas, po którym dokonywano pomiaru to 6 godzin. Badania obejmowały pomiar własności reologicznych zaczynów za pomocą lepkościomierza typu Chan 35, kubka Forda nr 4 oraz rozlewności za pomocą ściętego stożka AzNII.The selection of casing cementation technology in view of geologic, reservoir and technological conditions is largely conditioned ob. the physical and chemical parameters of hydraulic binders and also physicochemical properties of fresh and then set cement. Sealing slurries should have suitable technological properties, enabling their optimum operation in the borehole. Sealing slurries should have a strictly defined time of setting, good pumpability over the cementation process. Their rheological and technological properties should have little variability under high temperature and pressure changes in deep borehole conditions. Rheological parameters of fresh sealing slurry, regulated by all kinds of additives and admixtures should guarantee efficient pumping out of drilling mud from the annular space. The results of analyses of cementation time on changes of rheological parameters of sealing slurries based on Portland cement CEM I 42,5 R are presented in the paper. Measurements were performed in various spans of time. Over the first two hours after thorough mixing of the slurry, the measurements were made every half an hour, then every hour. The maximum time after which the measurements were made was 6 hrs. The investigations covered rheological properties of slurries with a viscometer Chan 35, Ford cup no. 4 and fluidity with a truncated cone AzNII