Circadian activity patterns and temporal overlap among cracids (Aves: Cracidae) within a vegetation mosaic in the Pantanal of Rio Negro, Brazil

Vertebrates, overall, present a daily activity pattern when managing their needs, such as foraging, resting or searching for sexual partners. Most of the available information regarding the circadian rhythm in birds comes from controlled laboratory conditions, and little is known about these patterns in the wild. In this study we used camera traps to describe the daily activity patterns of three cracid species in the Pantanal of Rio Negro, Brazil. We had a sampling effort of 9,617 camera trap-days along 231 days (5,544 hours) from September 2013 to May 2014. This resulted in 4,833 independent records of cracids from a total of 7,713 individuals. Crax fasciolata was the species with the most records (nrec = 3,792) and individuals (nind = 5,781), followed by Ortalis canicollis (nrec = 934; nind = 1,758) and Aburria grayi (nrec = 107; nind = 174). None of the species was uniformly distributed throughout the day, thus evidencing a periodization of their activities. The mean vectors of the activity patterns of C. fasciolata, O. canicollis and A. grayi were, respectively, mμ = 10:36 ± 04:26 (SD), mμ = 11:42 ± 03:57 and mμ = 11:44 ± 03:47. We observed a temporal overlap between A. grayi and O. canicollis, whereas C. fasciolata significantly differed from them. Because of their large home ranges, cracids are important indicators of environmental quality, and, as frugivores, they play key roles in the ecological dynamics of forests. In this sense, and given that cracids are notably more susceptible to extinction, the knowledge on their circadian activity patterns may be useful when establishing effective management and conservation strategies

Variabilidade genética em bandos de queixada (Tayassu pecari) do Parque Nacional das Emas utilizando marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)

Nowadays, the analysis of genetic variability has a highlighted roll in the definition of conservation strategies and natural populations management. In this context, the goal of this study was to evaluate the pattern of genetic variability on Tayassu pecari groups from Emas National Park, using RAPD markers. DNA from 182 individuals, distributed among eight groups, were extracted and used to amplify 10 primers previously selected through PCR. The obtained data were used to estimate the magnitude and distribution of variability within and among the groups using AMOVA. In order to analyze, in an explicit way, the patterns of spatial variation patterns, Pearson correlation coefficient (r) was estimated between the matrix of genetic distances and geographic among the groups, considering their central area of life, estimated from telemetry data. From the ten primers, 129 loci were obtained, which 88% (114) were polymorphic, ranging between 37% and 78% in the groups. The value of ?sT obtained from AMOVA was equal to 0.11 (P < 0.0001 - 10000 permutations); a high value considering the only local population distributed in regional scale. Distances among pares of groups (?sT) ranged between 4% and 29%, illustrating the heterogeneity of variability on spatial scale. Key words: Tayassu pecari, RAPD, genetic variability.O estudo das espécies presentes nos fragmentos remanescentes e/ou preservadas nos parques e reservas ainda existentes ajuda a definir estratégias de manejo, de conservação e de uso sustentado dos recursos naturais dos diferentes biomas. A análise da variabilidade genética possui hoje um papel de destaque na definição dessas estratégias. Nesse contexto, o objetivo deste trabalho foi avaliar os padrões de variabilidade genética em bandos de queixada (Tayassu pecari) do Parque Nacional das Emas (PNE), utilizando marcadores do tipo RAPD. O DNA de 182 indivíduos, distribuídos em oito bandos, foi extraído e utilizado para a amplificação via PCR (reação em cadeia da polimerase) de dez primers previamente selecionados. Os dados foram utilizados para estimar a magnitude e a distribuição da variabilidade entre bandos e dentro dos bandos por meio da Análise de Variância Molecular (AMOVA). Com base nos dez primers, foram obtidos 129 locos, dos quais 88% (114) foram polimórficos, variando entre 37% e 78% nos bandos. O valor das distâncias dos pares de bandos ?sT obtido pela AMOVA foi igual a 0,11 (P < 0,0001 - 10.000 permutações), que pode ser considerado elevado, já que se trata, de uma única grande população local distribuída em uma escala regional (PNE). As distâncias entre os pares de bandos (?sT) variaram entre 4% e 29%, ilustrando a heterogeneidade da variabilidade nessa escala espacial. Com base no cálculo indireto do fluxo gênico, podese perceber que o número médio de indivíduos migrantes, por geração, entre os bandos de queixada, foi igual a dois, valor suficiente para suprimir a maior parte dos efeitos da deriva genética sob a diferenciação entre os bandos. Palavras-chave: Tayassu pecari, RAPD, variabilidade genética

Density of ocelots in a semiarid environment in northeastern Brazil

PENIDO, G., ASTETE, S., FURTADO, M.M., JÁCOMO, A.T.A., SOLLMANN, R., TORRES, N., SILVEIRA, L., MARINHO FILHO, J. Density of ocelots in a semiarid environment in northeastern Brazil. Biota Neotropica. 16(4): e20160168. http://dx.doi.org/10.1590/1676-0611-BN-2016-0168 Abstract: Ocelots play a key role in ecological communities as mesopredators affecting the lower trophic level and other mesopredators. They show great variability in ecological traits across their distribution, but knowledge of this species is missing in several regions where it occurs. Here, we present the first study of ocelot in the Brazilian semiarid of Caatinga. Arid habitats might keep carnivore population density low and therefore vulnerable to environmental shocks and to human-induced changes, at risk of local extinction. To assess their population status, we used camera traps between September 2009 and January 2010. We estimated the density of ocelots using a spatially explicit capture-recapture method (SECR) to be 3.16 ± 0.46 individuals per 100 km 2 . This is a low-density estimate for ocelots, which might reflect the harsh conditions of the arid habitat. A longer population study of the ocelot can answer if this low population density is enough for a long-term persistence of this species in this and other arid environments. Keywords: Arid environments, Brazil, Density, Ocelot, SECR. Densidade da jaguatirica em um ambiente semiárido no nordeste do Brasil Resumo: Jaguatiricas possuem um papel fundamental em comunidades ecológicas como mesopredadores, afetando níveis tróficos inferiores e também outros mesopredadores. Esta espécie possui uma grande variabilidade em suas características ecológicas em toda a sua distribuição, no entanto, o conhecimento desta espécie possui lacunas em vários locais onde ela ocorre. Neste trabalho, nós apresentamos o primeiro estudo desta espécie no semiárido brasileiro da Caatinga. Ambientes áridos podem afetar negativamente as espécies carnívoras e, aliado a alterações antrópicas, esta espécie pode ser levada a extinção local se sua densidade populacional é baixa. Portanto, para verificar o nível populacional da jaguatirica em uma região protegida da Caatinga, instalamos armadilhas fotográficas, entre setembro de 2009 e janeiro de 2010. Com os dados obtidos, calculamos a densidade desta espécie através de métodos espacialmente explícitos (SECR). A densidade estimada da jaguatirica foi de 3.16 ± 0.46 indivíduos por 100 km 2 . Esta estimativa é muito baixa para esta espécie, o que pode ser um reflexo das condições áridas deste ambiente. Um estudo populacional de maior duração pode ajudar a responder se esta baixa densidade é o suficiente para a persistência desta espécie a longo prazo tanto neste, quanto em outros ambientes áridos onde ela ocorre. Palavras-chave: Ambientes áridos, Brasil, Densidade, Jaguatirica, SECR. Penido, G. et al.

Densidade da jaguatirica em um ambiente semiárido no nordeste do Brasil

Jaguatiricas possuem um papel fundamental em comunidades ecológicas como mesopredadores, afetando níveis tróficos inferiores e também outros mesopredadores. Esta espécie possui uma grande variabilidade em suas características ecológicas em toda a sua distribuição, no entanto, o conhecimento desta espécie possui lacunas em vários locais onde ela ocorre. Neste trabalho, nós apresentamos o primeiro estudo desta espécie no semiárido brasileiro da Caatinga. Ambientes áridos podem afetar negativamente as espécies carnívoras e, aliado a alterações antrópicas, esta espécie pode ser levada a extinção local se sua densidade populacional é baixa. Portanto, para verificar o nível populacional da jaguatirica em uma região protegida da Caatinga, instalamos armadilhas fotográficas, entre setembro de 2009 e janeiro de 2010. Com os dados obtidos, calculamos a densidade desta espécie através de métodos espacialmente explícitos (SECR). A densidade estimada da jaguatirica foi de 3.16 ± 0.46 indivíduos por 100 km2. Esta estimativa é muito baixa para esta espécie, o que pode ser um reflexo das condições áridas deste ambiente. Um estudo populacional de maior duração pode ajudar a responder se esta baixa densidade é o suficiente para a persistência desta espécie a longo prazo tanto neste, quanto em outros ambientes áridos onde ela ocorre.Ocelots play a key role in ecological communities as mesopredators affecting the lower trophic level and other mesopredators. They show great variability in ecological traits across their distribution, but knowledge of this species is missing in several regions where it occurs. Here, we present the first study of ocelot in the Brazilian semiarid of Caatinga. Arid habitats might keep carnivore population density low and therefore vulnerable to environmental shocks and to human-induced changes, at risk of local extinction. To assess their population status, we used camera traps between September 2009 and January 2010. We estimated the density of ocelots using a spatially explicit capture-recapture method (SECR) to be 3.16 ± 0.46 individuals per 100 km2. This is a low-density estimate for ocelots, which might reflect the harsh conditions of the arid habitat. A longer population study of the ocelot can answer if this low population density is enough for a long-term persistence of this species in this and other arid environments

Serosurvey of Smooth Brucella, Leptospira spp. and Toxoplasma gondii in Free-Ranging Jaguars (Panthera onca) and Domestic Animals from Brazil.

This study investigated the exposure of jaguar populations and domestic animals to smooth Brucella, Leptospira spp. and Toxoplasma gondii in the Cerrado, Pantanal and Amazon biomes of Brazil. Between February 2000 and January 2010, serum samples from 31 jaguars (Panthera onca), 1,245 cattle (Bos taurus), 168 domestic dogs (Canis lupus familiaris) and 29 domestic cats (Felis catus) were collected and analysed by rose bengal test for smooth Brucella, microscopic agglutination test for Leptospira spp. and modified agglutination test for T. gondii. Cattle populations from all sites (9.88%) were exposed to smooth Brucella, but only one jaguar from Cerrado was exposed to this agent. Jaguars captured in the Cerrado (60.0%) and in the Pantanal (45.5%) were seropositive for different serovars of Leptospira spp., cattle (72.18%) and domestic dogs (13.1%) from the three sites and one domestic cat from Pantanal were also seropositive for the agent. The most prevalent serotype of Leptospira spp. identified in jaguars from the Cerrado (Grippotyphosa) and the Pantanal (Pomona) biomes were distinct from those found in the domestic animals sampled. Jaguars (100%), domestic dogs (38.28%) and domestic cats (82.76%) from the three areas were exposed to T. gondii. Our results show that brucellosis and leptospirosis could have been transmitted to jaguars by domestic animals; and jaguars probably play an important role in the maintenance of T. gondii in nature

High Proportion of Male Faeces in Jaguar Populations

Faeces provide relevant biological information which includes, with the application of genetic techniques, the sex and identity of individuals that defecated, thus providing potentially useful data on the behaviour and ecology of individuals, as well as the dynamics and structure of populations. This paper presents estimates of the sex ratio of different felid species (jaguar, Panthera onca; puma, Puma concolor; and ocelot/margay, Leopardus pardalis/Leopardus wiedi) as observed in field collected faeces, and proposes several hypotheses that could explain the strikingly high proportion of faeces from male jaguars. The proportion of male and female faeces was estimated using a non-invasive faecal sampling method in 14 study areas in Mexico and Brazil. Faecal samples were genetically analysed to identify the species, the sex and the individual (the latter only for samples identified as belonging to jaguars). Considering the three species, 72.6% of faeces (n = 493) were from males; however, there were significant differences among them, with the proportion from males being higher for jaguars than for pumas and ocelots/margays. A male-bias was consistently observed in all study areas for jaguar faeces, but not for the other species. For jaguars the trend was the same when considering the number of individuals identified (n = 68), with an average of 4.2±0.56 faeces per male and 2.0±0.36 per female. The observed faecal marking patterns might be related to the behaviour of female jaguars directed toward protecting litters from males, and in both male and female pumas, to prevent interspecific aggressions from male jaguars. The hypothesis that there are effectively more males than females in jaguar populations cannot be discarded, which could be due to the fact that females are territorial and males are not, or a tendency for males to disperse into suboptimal areas for the species. © 2012 Palomares et al

Abundância relativa de mamíferos de médio e grande porte na região do Parque Nacional das Emas-GO

Com o avanço do crescimento populacional humano, observa-se o aumento das áreas de produção agrícola. Esse aumento acarreta na fragmentação da paisagem e na redução do habitat para os animais silvestres. O objetivo deste trabalho foi verificar quais espécies de mamíferos ocorrem na região do Parque Nacional das Emas (PNE). Os dados foram coletados por meio de armadilha fotográficas (AF), as quais são ativadas por um sensor de movimento e calor quando algum animal passa em frente à câmera, registrando a espécie, data e hora do registro. O levantamento de mamíferos da região do PNE foi realizado em 10 amostragens entre os anos de 2001 e 2012. Os valores das abundâncias relativas são a razão entre o número de registros de cada espécie e o total de horas de funcionamento das câmeras. Os resultados mostram que 33 espécies ocorrem na região e pode-se concluir que o Parque Nacional das Emas apresenta papel fundamental na conservação de mamíferos ameaçados de extinção na região; os fragmentos de vegetação nativa, representados pelas Reservas Legais e Áreas de Preservação Permanente das propriedades rurais exigidos no Código Florestal Brasileiro, são importantes para as espécies estudadas e os impactos negativos presentes nas áreas de produção agrícola no entorno podem ser reduzidos com o manejo apropriado, principalmente com o cumprimento das exigências do novo código florestal de maneira a proporcionar maior qualidade da área de produção agrícola

Combining camera-trapping and noninvasive genetic data in a spatial capture–recapture framework improves density estimates for the jaguar

Abundance and density are key pieces of information for questions related to ecology and conservation. These quantities, however, are difficult to obtain for rare and elusive species, where even intensive sampling effort can yield sparse data. Here, we combine data from camera-trapping and noninvasive genetic sampling (scat surveys) of a jaguar population in the Caatinga of northeastern Brazil, where the species is threatened and little studied. We analyze data of both survey types separately and jointly in the framework of spatial capture–recapture. Density estimates were 1.45 (±0.46) for the camera-trap data alone, 2.03 (±0.77) for the genetic data alone, and 1.57 (±0.43) and 2.45 (±0.70) for the two methods, respectively, in the joint analysis. Density and other parameters were estimated more precisely in the joint model. Particularly the differences in movement between males and females were estimated much more precisely when combining both data sources, especially compared to the genetic data set alone. When compared to a previous non-spatial capture–recapture approach, present density estimates were more precise, demonstrating the superior statistical performance of spatial over non-spatial capture recapture models. The ability to combine different surveys into a single analysis with shared parameter allows for more precise population estimates, while at the same time enabling researchers to employ complementary survey techniques in the study of little known speciesPeer reviewe