Characterization of a rapid scan FTIR for ultrafast probing in the mid-IR region

En col·laboració amb la Universitat Autònoma de Barcelona (UAB) i la Universitat de Barcelona (UB)The properties of materials in the mid-infrared spectral region (3-15 \mu m) is vital for understanding their operation and performance. It is challenging to characterize femtosecond pulses in this spectral region. In this project, we build a simple Fourier Transform Infrared spectrometer to measure ultrafast infrared laser pulses. Due to the measurements in the mid-infared region is difficult, we demonstrate the functionality of the spectrometer at the visible region, where it has been characterized the autocorrelation, the pulse duration and the central wavelength of the pulse

Gateway to the World: Data Visualization Poetics

In my creative research practice, I am interested in stretching new technologies and programmable languages in order to explore multimodal digital textualities. During the last seven years, I have developed projects assisted by programmers in order to create language-art media work through the exploration of interactive grammars, aesthetics, and poetics in digital writing. My interest in new literacies, new text, the reader/writer/performer of generative texts, sound, and visual interfaces in a world of unstable, generative visual words, is reflected in my creative work, and this essay considers how these concerns have unfolded through the development of an application for the iPad. The application, titled Gateway to the World (2014), was developed specifically for an exhibition in Hamburg, Germany. It is an exploration of data visualization poetics that use open data to visualize the routes of the vessels arriving at and departing from the Port of Hamburg, with the names of the vessels being mapped to Wikipedia entries. This paper establishes a context for the app through the discussion of artists’ and designers’ works, the presentation of ideas, notions, and concerns related to the creation of data visualization projects, as well as the creative process involved in the production of the application

Afecciones más frecuentes en el pie durante el peregrinaje del camino de Santiago

Treball Final de Grau de Podología, Escola Universitaria d'Infermeria, Universitat de Barcelona, curs: 2013-2014, Tutor: Manuel Pérez QuirosRealizar el Camino de Santiago, experiencia en auge hoy en día, es una actividad que está muy relacionada con el senderismo, un deporte donde se exige una buena preparación física y donde los pies son los que más padecen a lo largo de esta aventura. En este estudio se ha comprobado, mediante cuestionarios y fotografías a 112 participantes, qué afecciones son más frecuentes entre los peregrinos de a pie, qué métodos utilizan para curarse si fuera necesario y cómo es su preparación antes, durante y después de recorrer alrededor de veinte kilómetros diarios. También se ha investigado sobre el origen de dichas afecciones para relacionarlas con factores extrínsecos que favorezcan su aparición y qué importancia tiene el Podólogo dentro del Camino para prevenirlas o tratarlas. Las dolencias en los pies, como consecuencia del esfuerzo diario y de la utilización de calzado distinto al de la vida habitual, son las principales lesiones que sufren los caminantes siendo la lesión más frecuente las ampollas. Los resultados fueron que la ampolla es la afección más frecuente en un 43%, siendo tratada normalmente con apósitos hidrocoloides previo drenaje. Los métodos utilizados por los peregrinos para curar sus lesiones son extraídos de blogs, del boca a boca o de bibliografía diversa. A pesar de que puedan parecer fuentes no fiables, cabe decir que la preparación del peregrino es buena. El calzado y el terreno son los factores extrínsecos que más influyen durante el recorrido, aunque la utilización de calcetines adecuados para el senderismo también juega un papel importante. La figura del Podólogo es clave en el Camino para dar soporte al peregrino ya sea de forma asistencial o preventiva aunque se puede concluir, mediante los resultados obtenidos, que la información que reciben para un peregrinaje sano y seguro es bastante adecuada

Revolution, Conflict, Revolt, Uprising, among other Adjectives: Resistance Movements in Colonial Sudan

I. Synthesis Essay………………………………3 II. Primary Documents and Headnotes……….21 III. Textbook Critique……………………………30 IV. New Textbook Entry………………………...33 V. Bibliography…………………………………..36https://digitalcommons.bard.edu/history_mat/1037/thumbnail.jp

Acid digestion and symbiont: proton sharing at the origin of mitochondriogenesis?: proton production by a symbiotic bacterium may have been the origin of two hallmark eukaryotic features, acid digestion and mitochondria

The initial relationships between organisms leading to endosymbiosis and the first eukaryote are currently a topic of hot debate. Here, I present a theory that offers a gradual scenario in which the origins of phagocytosis and mitochondria are intertwined in such a way that the evolution of one would not be possible without the other. In this scenario, the premitochondrial bacterial symbiont became initially associated with a protophagocytic host on the basis of cooperation to kill prey with symbiontproduced toxins and reactive oxygen species (ROS). Subsequently, the cooperation was focused on the digestion stage, through the acidification of the protophagocytic cavities via exportation of protons produced by the aerobic respiration of the symbiont. The host gained an improved phagocytic capacity and the symbiont received organic compounds from prey. As the host gradually lost its membrane energetics to develop lysosomal digestion, respiration was centralized in the premitochondrial symbiont for energy production for the consortiu

Assessing the risk-return trade-off in loan portfolios

This paper analyses the risk and return of loans portfolios in a joint setting. I develop a model to obtain the distribution of loans returns. I use this model to describe the investment opportunity set of lenders using mean-variance analysis with a Value at Risk constraint. I also obtain closed form expressions for the interest rates that banks should set in compensation for borrowers’ credit risk under absence of arbitrage opportunities and I use these rates as a benchmark to interpret actual loans’ prices. Finally, I study the risk-return trade-off in an empirical application to the Spanish banking syste

Antimicrobial resistance in the Spanish swine production: Impact of the production system and the antimicrobial use = Resistencias antimicrobianas en la producción porcina española: impacto del sistema de producción y del uso de antibióticos

207[ES] La resistencia a los antimicrobianos es una amenaza global para la salud pública y el medioambiente derivada del uso prolongado y frecuentemente inadecuado de antibióticos en medicina humana y veterinaria. En producción animal se han descrito diversos factores que pueden repercutir en el uso de antibióticos y, en consecuencia, en las resistencias, entre los que destacan el sistema de producción y las medidas de bioseguridad implementadas en la granja. En este sentido, las producciones de cerdo ibérico ecológica y extensiva se basan en sistemas de cría sostenibles y respetuosos con el entorno, constituyendo una excelente oportunidad para evaluar cómo las diferencias sostenidas de las distintas formas de uso de antibióticos repercuten en las resistencias antimicrobianas, no solo en los animales, sino también en el ambiente de la granja. El objetivo general de la presente tesis doctoral es ofrecer una descripción exhaustiva de las resistencias antimicrobianas en la producción porcina española, tanto en granjas intensivas como en las de producción ecológica-extensiva. Los estudios realizados se desarrollan en cuatro capítulos que abordan la evaluación del potencial de los microorganismos centinela en la monitorización de resistencias a los antimicrobianos y la caracterización genómica y metagenómica del resistoma y del mobiloma de las explotaciones porcinas. Las bacterias centinela recuperadas de granjas de producción ecológica-extensiva presentaron de forma sistemática menores resistencias antimicrobianas que aquellas procedentes de explotaciones porcinas intensivas, siendo el uso de antibióticos el factor más influyente. Además, aunque no se observó una relación directa entre el uso de antibióticos y la bioseguridad en las granjas, ciertas medidas, como la aplicación de protocolos de limpieza y desinfección adecuados, tuvieron un impacto aparente en la reducción de resistencias en Escherichia coli y Enterococcus spp. de granjas intensivas. La combinación de la caracterización fenotípica y genotípica de las resistencias antimicrobianas demostró el potencial de Escherichia coli, Enterococcus spp. y Staphylococcus spp. en la monitorización de resistencias en porcino, ya que estas bacterias resultaron ser importantes reservorios de determinantes de resistencia potencialmente movilizables. La vigilancia de las resistencias en Campylobacter coli también se demostró útil, pese a portar un menor número de determinantes de resistencia en su genoma. Por el contrario, los resultados de Salmonella enterica indicaron que no es un buen indicador de resistencia en estas granjas debido a su presencia esporádica en porcino y que su resistencia a los antimicrobianos está condicionada por el serotipo. El estudio genómico de las bacterias centinela demostró que la estructura tanto del resistoma como del mobiloma dependía del taxón, con mayores similitudes entre aquellas bacterias más relacionadas filogenéticamente. Este hecho fue corroborado en el estudio metagenómico, donde se observó que la composición del resistoma estaba primariamente asociada al tipo de muestra debido a cambios en las poblaciones bacterianas predominantes en cada nicho biológico. Por último, tanto el abordaje genómico como el metagenómico revelaron una clara interacción del resistoma y el mobiloma, la cual era más compleja en las granjas intensivas. En conjunto, esta tesis doctoral demuestra que el desarrollo de resistencias a los antimicrobianos está fuertemente ligado a los elementos genéticos móviles y al uso de antimicrobianos. [EN] Antimicrobial resistance is a global threat to public health and the environment derived from the prolonged and often inappropriate use of antimicrobials in human and veterinary medicine. In food-producing animals, several factors have been described that may have an impact on the use of antimicrobials and, consequently, on antimicrobial resistance, among which we can highlight the production system and the biosecurity measures implemented on the farm. In this sense, organic and extensive Iberian pig productions are based on sustainable and eco-friendly farming systems, providing an excellent opportunity to evaluate how sustained differences in the various forms of antimicrobial use impact antimicrobial resistance, not only in the animals, but also in the farm environment. The general objective of this doctoral thesis is to provide an in-depth characterization of antimicrobial resistance in Spanish swine production, both on intensive and organic-extensive farms. The studies carried out are developed in four chapters that address the evaluation of the potential of sentinel microorganisms in the monitoring of antimicrobial resistance and the genomic and metagenomic characterization of the resistome and mobilome of pig farms. Sentinel bacteria recovered from organic-extensive farms consistently showed lower antimicrobial resistance than those from intensive pig herds, with antimicrobial use as the most influential factor. In addition, although no direct relationship was observed between antimicrobial use and on-farm biosecurity, certain measures, such as the application of standardized cleaning and disinfection protocols, had an apparent impact on the reduction of antimicrobial resistance in Escherichia coli and Enterococcus spp. recovered from intensive pig herds. The combination of phenotypic and genotypic characterization of antimicrobial resistance demonstrated the potential of Escherichia coli, Enterococcus spp. and Staphylococcus spp. as sentinel microorganisms for antimicrobial resistance surveillance in swine, as these bacteria emerged as important reservoirs of potentially mobilizable antimicrobial resistance determinants. Likewise, antimicrobial resistance monitoring in Campylobacter coli proved to be useful even though this species harbored a reduced number of antimicrobial resistance determinants in its genome. In contrast, Salmonella enterica was not a good bioindicator due to its sporadic presence in swine production and the serotype-biased antimicrobial resistance. The genomic study of sentinel bacteria evidenced that the structure of both the resistome and mobilome was taxon-dependent, with greater similarities among those bacteria more phylogenetically related. This fact was corroborated in the metagenomic study, in which it was observed that the composition of the resistome was primarily determined by the type of sample due to changes in the predominant bacterial populations in each microecosystem. Finally, both genomic and metagenomic approaches revealed a clear interaction of the resistome and the mobilome, which was more complex on intensive farms. Overall, this doctoral thesis demonstrates that the development of antimicrobial resistance is strongly associated with mobile genetic elements and antimicrobial use

Essays about econometric models subject to sample selection and endogeneity in the field of Health Economics and Labour

RESUMEN: Campos como el de Economía Laboral y Economía de la Salud se han visto frecuentemente afectados por problemas econométricos asociados a estos tipos de modelos por sus peculiaridades. El método de mínimos cuadrados ordinarios permite obtener estimaciones de los efectos y una intuitiva interpretación de los mismos así como la consecuente inferencia estadística. Sin embargo, este método se basa en supuestos muy rígidos que no siempre se sostienen. Los modelos de elección discreta y con variable dependiente censurada han sido ampliamente estudiados en los últimos años tratando de dotarles de mayor flexibilidad. y así adecuarse a los problemas reales, usualmente sujetos a problemas de selección o endogeneidad. Así pues, en esta tesis se considera la especificación y estimación de este tipo de modelos, que si no son correctamente tratados conllevan a estimaciones inconsistentes. En concreto, es habitual que este tipo de modelos adolezcan de sesgo de selección si la población a estudiar no es elegida de manera aleatoria. En esta dirección, muchos trabajos se han centrado en ampliar el popular trabajo de estimación en dos etapas de Heckman (1979). Dicho enfoque consiste en obtener estimadores consistentes de la ecuación de selección en una primera etapa y en una segunda fase se estiman los parámetros de la ecuación estructural incluyendo una función de corrección con los estimadores de la primera etapa. A partir de este popular enfoque, basado en un contexto totalmente paramétrico, diversos autores han tratado de flexibilizar los supuestos necesarios en ese contexto, que resultan demasiado restrictivos. Los problemas de selección y endogeneidad resultan de especial interés en esta tesis, en la que se propone abordar dicha problemática de especial relevancia en problemas empíricos de oferta laboral de ciertos colectivos especiales como personas con discapacidad, mujeres casadas o empleados públicos. En este contexto expuesto, la motivación de esta tesis tiene una doble vertiente. Por un lado, se trata de desarrollar nuevas técnicas de estimación consistentes con la presencia de selección muestral y endogeneidad. Por otro lado, se basa en la aplicación de dichas propuestas capaces de manejar los incovenientes subrayados anteriormente a campos de interés en la Economía de nuestro país.ABSTRACT: Fields like that of Labor Economics and Health economics have seen frequently concerned by econometric problems associated these types of models for his peculiarities. The method of ordinary least squares allows to obtain estimations of the effects as well as an intuitive interpretation and the consistent statistical inference. Nevertheless, this method is based on very rigid assumptions that not always are supported. Discrete choice models and with censured dependent variable have been widely studied in the last years trying to provide them more flexibility related with real cases, usually subject to problems of selection or endogeneity. So that, in this thesis we are concerned with the specification and estimation of this type of models, which if they are not correctly treated provide us inconsistent estimations. Concretely, it is usual that this type of models suffer from selection bias if the population of interest is not chosen in a random way. In this direction, a lot of studies have focused on extending the popular work of estimation in two stages of Heckman (1979). The above mentioned approach consists in obtaining consistent estimators of the equation of selection in the first stage and thus in a second phase, to estimate the parameters of the structural equation including a function of correction with the first stage estimators. From this popular approach, based on a context totally parametric, diverse authors have tried to adapt the necessary assumptions which are considered too restrictive. The problems of selection and endogeneity have special interest in this thesis, in which some methods are proposed to deal with the above mentioned problems. These problems have special relevancy in empirical problems of labor offer of certain special groups as persons with disability, married women or civil servants. In this context, the motivation of this thesis is twofold. On the one hand, it is about developing new estimation techniques consistent with the presence of sample selection and endogeneity. On the other hand, it is based on the application of some proposals able of handling with problems previously highlighted and appliying it to fields of interest in the Economy of our country

The application of broadband ultrafast spectroscopy to reveal structural, magnetic and electronic dynamics in quantum materials

In the last decades, quantum materials have received much attention in the field of condensed matter physics due, in part, to their exotic properties. These are difficult to understand as they result from multiple physical interactions with similar strength, such as charge, spin, orbitals and phonon degrees of freedom. To study and control these interactions, the use of light has emerged as a powerful tool. For example, thanks to recent advantages on X-ray sources it has been possible to improve our understanding of how the atomic structure of quantum materials changes upon photo-excitation. However, these experiments are difficult and there are only a few facilities in the world to perform them. In contrast to X-ray sources, table-top ultrafast laser systems allow us to measure in a systematic manner by performing optical pump-probe spectroscopy. The versatility of this approach enables the simultaneous monitoring of the different degrees of freedom that dictate the properties of quantum materials. In this thesis, we use pump-probe broadband spectroscopy in the visible region to study the structural, electronic and magnetic dynamics with unprecedented detail in two key quantum materials such as Sr3Ir2O7 and V2O3. In Sr3Ir2O7, a compound that undergoes a magnetic phase transition, firstly we study how photo-excitation affects to the reflectivity at a wide range of energies. This provides us information about the electronic and structural properties of this compound. Secondly, we show how to control magnetic order by photoexcitation and demonstrate that light can non-thermally suppress the magnetic long-range order in this material. In V2O3 we characterize its insulator to metal and structural phase transitions. In the metallic state, we show that a key phonon mode is very sensitive to sample inhomogeneity. When taking this into account, we find no evidence for non-thermal lattice dynamics in contrast to existing literature. Furthermore, we show that the light induced transition from the insulator to metallic phase proceeds along a highly damped and incoherent pathway, where vibrational coherence is not observed.En las últimas décadas, los materiales cuánticos han generado un gran interés en el campo de la materia condensada debido, en parte, a sus exóticas propiedades. Éstas son difíciles de comprender ya que surgen de una compleja interacción física entre los distintos grados de libertad como la carga, el espín, el momento orbital y fonones. El uso de la luz surge como una herramienta poderosa para estudiar y controlar estas interacciones. Por ejemplo, gracias a los avances en los sistemas de rayos X se ha mejorado nuestra comprensión de cómo la estructura atómica de los materiales cuánticos cambia bajo la fotoexcitación. Sin embargo, estos experimentos son difíciles y, además, hay escasas instalaciones alrededor del mundo para poder realizarlos. A diferencia de los sistemas de rayos X, los sistemas láseres ultrarrápidos nos permiten medir de una manera sistemática mediante la espectroscopía de bomba-sonda. La versatilidad de esta técnica permite monitorizar de manera simultánea los diferentes grados de libertad que determinan las propiedades de los materiales cuánticos. En esta tesis, utilizamos espectroscopía de bomba-sonda de banda ancha en la región visible para estudiar las dinámicas estructurales, electrónicas y magnéticas con detalles sin precedentes en dos materiales cuánticos clave como Sr3Ir2O7 y V2O3. En Sr3Ir2O7, compuesto que experimenta una transición de fase magnética, estudiamos en primer lugar cómo la fotoexcitación afecta a la reflectividad en un amplio rango de energías. Esto nos proporciona información sobre las propiedades estructurales y electrónicas de dicho compuesto. En segundo lugar, mostramos cómo se puede controlar el orden magnético mediante la fotoexcitación, demostrando que la luz puede suprimir el orden magnético de largo alcance de manera no térmica en este material. En V2O3 caracterizamos las transiciones metal-aislante y estructurales del material. En el estado metálico mostramos que un modo de los fonones clave es muy sensible a la falta de homogeneidad de la muestra. Al tener esto en cuenta, no encontramos pruebas de cambios estructurales no-termodinámicos, en contraste con la literatura existente. Además, mostramos que la transición de fase metal-aislante inducida por la luz se realiza de una manera altamente amortiguada e incoherente, donde no se observa la frecuencia vibratoria.Postprint (published version