Utilisation d'un modèle FARIMA pour la prédiction d'un bruit de mesure de température

Les astrophysiciens mettent au point un système sophistiqué de mesure de température pour compléter leur connaissance de l'univers dans les ondes millimétriques. Les signaux sont très faibles, et la présence d'un bruit en 1/f perturbe fortement cette mesure. Nous essayons ici de le diminuer par prédiction en modélisant la fonction de transfert entre deux mesures par un modèle FARIMA. On soulignera surtout ici les difficultés soulevées par cette étude, et les besoins de développement théoriques sur les effets du lissage sur la longue dépendance, les perturbations de l'estimation des paramétres ARMA par la présence d'un opérateur de dérivation fractionnaire,...etc

Identificação genética da carne comercializada de pirarucu no Amazonas-BR

O presente trabalho trata-se de uma comunicação científica, relacionada a identificação genética da carne comerciliazada de Arapaiama sp. O pirarucu (Arapaima sp., Müller) é um peixe amazônico de água doce, considerado uma das maiores espécies de escama da América do Sul, podendo crescer até 3 m de comprimento e pesar mais de 200 kg. Este peixe representa uma importante fonte de proteína e renda econômica para a região amazônica, sendo frequentemente comercializado na forma seca, pois tem maior rendimento e valor agregado de sua pesca ao pescador. Sua pesca intensa compromete suas populações naturais e vem sendo registrada desde 1975 até hoje, o que a deixa classificada como II na Convenção Internacional de Comércio de Espécies Selvagens Fauna e Flora Ameaçadas (CITES) e na categoria de Dados Deficientes pela Lista Vermelha da IUCN. Diante do risco de colapso pela sobrepesca, o governo federal tem aplicado medidas de proibição e controle do comércio e da pesca do pirarucu por meio das Instruções Normativas n° 34/2004 e n° 01/2005, procedimentos conhecidos como “defeso”. Mesmo diante das ações atuais no controle, regularização e fiscalização do comércio e da pesca de Arapaima sp., ainda é comum a pesca e a venda ilegal de sua carne, frequentemente documentado em reportagens, assim como é rotina a venda fraudulenta de produtos de pirarucu, com a troca de espécies, o que configura fraude por substituição entre espécies. A fraude no comércio de peixe é possível porque os pescados apresentam semelhanças de sabor e de textura, principalmente, quando o peixe é entregue sem partes do corpo de diagnóstico ou quando é processado em filetes ou fatias. Assim, o presente trabalho tem como objetivo usar técnica genético-molecular do DNA Barcode para verificar a validade da carne de pirarucu comercializada no estado do Amazonas, tendo como base o banco de dados de identificação molecular: BOLD systems. Foram coletadas 85 amostras de carne seca de pirarucu de mercados e feiras de municípios do médio Solimões - AM, em diferentes períodos, incluindo o referente ao defeso. A partir das amostras, foi realizada a extração do DNA genômico, que foi submetido a PCR (Reação de Polimerase em Cadeia) para a região Barcode de peixes (Região da Citocromo Oxidase, subunidade I - COI). As amostras que tiveram sua PCR verificada por eletroforese foram submetidas a reação de sequenciamento, seguindo as especificações do fabricante. Até o presente momento, seis amostras tiveram sua sequência analisada, sendo que uma foi detectada como não sendo de Pirarucu, apresentando a similaridade genética acima de 98% para Colossoma macropomum (Tambaqui), em comparação ao BOLD systems, sendo proveniente de Coari/AM. Entre todos os locais coletados o preço médio observado foi de R$12,60, variando entre R$ 7,00 e R$ 22,00 o kilograma seco. A carne de Pirarucu é muito procurada, o que incentiva a pesca, a venda ilegal e até fraude nos produtos dessa espécie. O fato de se ter encontrado carne de Tambaqui em amostras de manta de pirarucu na região de Coari pode estar relacionada ao fato da existência da forte atividade da piscicultura desta espécie na cidade de Coari, o que gera excedente e disponibilidade desta espécie, comprometendo os direitos do consumidor. Através dos resultados, conclui-se que a técnica de DNA Barcode é eficiente para identificação de produtos de origem animal tanto “in natura”, quanto manipulados

Condições socioenoconômicas e sua influência no diagnóstico antropométrico de escolares do 1º ao 5º ano das escolas municipais Raimunda Cruz (anexo Tanta) e Maria Elizangela Litaiff, no município de Coari-AM

No Brasil, tem sido detectada a progressão da transição nutricional da população, caracterizada fundamentalmente por redução nas prevalências dos déficits nutricionais e ocorrência mais expressiva de sobrepeso e obesidade. Este processo, embora atinja o conjunto da população, diferencia-se em momentos e em intensidade, conforme o segmento socioeconômico considerado (SOUZA et al., 2011). A avaliação antropométrica de escolares do 1º ao 5º ano do ensino fundamental na referida escola, traz a possibilidades de correção dos possíveis desvios nutricionais encontrados na população em estudo. Objetivos: Diagnosticar estado nutricional de alunos, na faixa etária de 6 - 14 anos nas referidas escolas. Orientar os responsáveis das crianças que foram diagnosticados com desvios, fora dos padrões de normalidades para percentil e escore-z, oferecer atendimento nutricional individualizado no Instituto de Saúde e Biotecnologia (ISB) – UFAM. Metodologia: É um estudo transversal, fruto do Estágio Supervisionado em Nutrição Social em andamento, realizado no mês de maio de 2017 nas escolas municipais, onde foram escolhidas duas dessas escolas par realização do estudo. A amostra foi gerada de acordo com a disponibilidade da direção escolar. Foram coletados dados como condições socioeconômicas, data de nascimento, e aferidos peso e estatura dos quais a partir daí avaliou-se o estado nutricional pelos índices peso por idade, estatura por idade e índice de massa corporal por idade, de acordo com os métodos de avaliação do Sistema de Vigilância Alimentar e Nutricional (SISVAM, 2011). Após avaliação e diagnóstico do estado nutricional, os pais foram convidados para uma preliminar orientação quanto aos resultados encontrados posteriormente encaminhados para acompanhamento nutricional no ambulatório de Nutrição do ISB com o objetivo de reverter tal situação nutricional. Resultados: Foram avaliadas 101 estudantes na escola Anexo Raimunda Cruz, dentre os quais o IMC/IDADE, 1% encontra-se com magreza, 88,1% adequados, 7% sobrepeso e 3,9% obesos; no que se refere à ALTURA/IDADE, 0% muito baixo peso, 10% baixo peso e 90% adequado; e para PESO/IDADE, foram diagnosticados 0% muito baixo peso, 25% baixo peso, 97,5% adequados. Na escola Maria Elizangela Litaiff foram avaliadas 192 crianças no qual para o parâmetro IMC/IDADE 3,6% com magreza, 81% adequados, 7,7% sobrepeso, 7,7% obesidade; em relação ALTURA/IDADE, 0,5% estavam muito baixa estatura, 7,2% baixa estatura e 92,7 encontravam adequado; e PESO/IDADE,  0,6 muito baixo peso para idade, 7,1 baixo peso para peso para idade, 82,5% adequados e 9,8 peso elevado para idade. De acordo com os resultados foi possível observar que os índices se diferem entre as escolas enquanto uma quantidade de baixo peso excedida, a outra revela uma quantidade de sobrepeso e obesidade. Conclusões: As condições socioeconômicas dos escolares matriculados nas referidas escolas, pode-se ter sido um fator que possivelmente tenha interferido nos resultados encontrados, uma vez que essas condições influenciam nos hábitos e escolhas alimentares. Na escola Raimunda Cruz, a renda familiar é considerada baixa, o que justifica os valores dos percentis e escores-z encontrados, A/I 10% baixo peso, P/I 25% baixo peso. Enquanto na escola Maria Elizangela Litaiff, os índices IMC/I 7,7% de sobrepeso P/I 9,8% obesidade. Diante disso, observa-se que as condições socioeconômicas exercem uma grande influência nos hábitos alimentares e consequentemente refletem no baixo peso e elevado peso para idade

Laccase-catalyzed cross-linking of BSA mediated by tyrosine

Tyrosine was explored as a cross-linking agent to form cross-linked bovine serum albumin (BSA) using laccase as a catalyst. Liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS) and fluorescence spectra indicated that tyrosine can be mainly oxidized to be dityrosine. Spectra analysis and molecular weight were used to characterize the BSA treated with tyrosine and laccase. Both SDS-PAGE and size exclusion chromatography confirmed the formation of cross-linked BSA, while most of the protein products existed as BSA–tyrosine conjugates. The MALDI-TOF analysis revealed that five tyrosine units were grafted on one BSA monomer, however one cross-linked BSA consists of two BSA monomers and 18 tyrosine. Furthermore, the content of the amino acid of BSA was identified using amino acid analysis, among those the percentage of lysine presented a visible decline from 12.36% to 11.43%, corresponding to 4-5 lysine residues. The pure and modified BSA were hydrolyzed by trypsin and the corresponding peptides were obtained. Different mass of five peptides from LC-MS spectra after hydrolysis indicated that tyrosine could react with Lys-136, Lys-204, Lys-224, Lys-322 and Lys-537 in BSA, promoting the formation of BSA–tyrosine conjugates and cross-linked BSA.This study was supported by Chinese Government Scholarship under China Scholar Council (NO. 201906790043) and “the Fundamental Research Funds for the Central Universities (NO. JUSRP52007A). This study was also supported by the Portuguese Foundation for Science and Technology (FCT) under the scope of the strategic funding of UIDB/04469/2020 unit and BioTecNorte operation (NORTE-01-0145-FEDER-000004) funded by the European Regional Development Fund under the scope of Norte2020 - Programa Operacional Regional do Norte

Antibodies towards Tyrosine Amyloid-Like Fibrils Allow Toxicity Modulation and Cellular Imaging of the Assemblies

The amino acid tyrosine forms cytotoxic amyloid-like fibrils by molecular self-assembly. However, the production of antibodies towards tyrosine assemblies, reflecting their presentation to the immune system, was not demonstrated yet. Here, we describe the production of antibodies that specifically recognize tyrosine in its fibrillated form. The antibodies were demonstrated to specifically bind self-assembled tyrosine, in contrast to its non-aggregated form or disintegrated fibrils. The antibodies could be used for immunostaining of tyrosine fibrils in cultured cells. Furthermore, confocal microscopy allowed a demonstration of the intracellular presence of the metabolite amyloids in a neuroblastoma cell model. Finally, pre-incubation of tyrosine fibrils with the antibodies resulted in significant reduction in their cytotoxicity. Taken together, we provide an experimental proof for the immunogenicity of tyrosine amyloid fibrillary assemblies. These specific antibodies against tyrosine structures could be further used as a research tool to study the dynamics, toxicity and cellular localization of the assemblies

CARACTERIZAÇÃO GENÉTICA DA ESPÉCIE P. BREVIS (PYRRHULINA - CHARACIFORMES: LEBIASINIDAE) EM IGARAPÉS E POÇAS NA RESERVA FLORESTAL ADOLPHO DUCKE PERSPECTIVAS DA DISTRIBUIÇÃO GENÉTICA E DINÂNICA POPULACIONAL DE IGARAPÉS.

No intuito de avaliar a distribuição da variabilidade genética existente nas populações das espécie de Pyrrhulina brevis (Characiformes: Lebiasinidae), grupo de organismos de pequeno porte, abundante e de ampla distribuição entre ambientes relacionados aos igarapés, optou-se por utilizar marcadores tipo RAPD, pois são marcadores arbitrários, polimórficos, inespecíficos, abrangem todo o genoma e não tem a necessidade de equipamentos e tecnologias moleculares muito sofisticadas e conhecimento prévio de genoma alvo, podendo-se encontrar altos níveis de polimorfismos, possibilitando análises populacionais abrangentes de maneira rápida, simples, confiável e relativamente barata, quando comparados com outros métodos marcadores de DNA. A caracterização de espécies encontradas em igarapés, como as do gênero Pyrrhulina, se faz importante porque auxiliam nas pesquisas que pretendem acessar a variabilidade genética, estrutura populacional e comportamento evolutivo e filogeográfico de organismos habitantes de ambientes tão pouco estudados sobre este aspecto, como os igarapés, servindo na elucidação da dinâmica e padrões biológicos de espécies relacionadas e associados às condições inerentes deste tipo de ambiente, tão numeroso e pouco estudado. A espécie P. brevis (Characiformes: Lebiasinidae) possui ampla distribuição, abundância e pequeno porte, que é o biótipo comum na maioria das espécies de peixes de igarapés, ambiente importante para o ciclo reprodutivo e de vida de muitas espécies, servindo como fonte energética primária ou de base, berçário e refúgio durante as épocas de cheia e vazante, funcionando, também, como o principal sistema de manutenção biológica, drenagem e irrigação dos grandes rios, auxiliando na qualidade dos estoques pesqueiros, cuja comunidade ribeirinha e comerciantes regionais são dependentes para a sobrevida e trabalho. Contudo, por serem pequenos e numerosos, estes ambientes ainda são negligenciados e tem sua dinâmica desconhecida, sendo os dados de origem genética quase que inexistentes. Diversos estudos têm sido feitos em igarapés quanto à ocupação dos nichos pelas as espécies e as mudanças nas diversidades, riqueza e abundância das espécies ao longo das estações climáticas da Amazônia, no entanto, nenhum estudo foi desenvolvido ao nível genético relacionado a distribuição dos indivíduos de uma espécie em relação ao curso de água e sua capacidade e estratégias de locomoção e transposição de supostas barreiras biológicas de espécies de peixes de pequeno porte, morfologia da maioria das espécies de igarapés. Dessa forma, elucidações sobre o relacionamento genético entre os indivíduos de uma espécie em relação a sua distribuição geográfica, como os igarapés, podem servir como um modelo e significar informações sobre hábitos, capacidades biológicas e padrões evolutivos de muitas espécies de peixes e de igarapés similares entre si.FAPEA

Data from: Considerations used by desert isopods to assess scorpion predation risk

Animals adjust behaviors to balance changes in predation risk against other vital needs. Animals must therefore collect sensory information and use complex risk assessment process that estimates risks and weigh costs and benefits entailed in different reactions. Studying this cognitive process is challenging, especially in nature because it requires inferring sensory abilities and conscious decisions from behavioral reactions. Our goal was to address this empirical challenge by implementing psychophysical principles to field research that explores considerations used by desert isopods (Hemilepistus reaumuri) to assess the risk of scorpions that hunt exclusively from within their burrows. We introduced various combinations of chemical and physical cues to the vicinity of the isopods' burrows and recorded their detailed reactions upon first encountering the cues. The isopods reacted defensively to scorpion odor but only when accompanied with excavated-soil or other odors typically found near scorpion burrows. Isopods also reacted defensively to piles of excavated soil without scorpion olfactory cues, suggesting that isopods take precautions even against physical disturbances that do not necessarily reflect predator activity. Simultaneous presence of different cues provoked graded responses, possibly reflecting an additive increase in risk estimation. We conclude that wild isopods use defensive reactions toward environmental signals only when the integrated perceptual information implies an active scorpion burrow, or when they lack data to refute this possibility

Dust you shall eat: Complex considerations underlying a simple diet

Animals assimilate macronutrients and mineral nutrients in specific quantities and ratios to maximize fitness. To achieve this, animals must ingest different foods that contain the needed nutrients or facilitate the digestion of those nutrients. We explored how these multidimensional considerations affect the desert isopods (Hemilepistus reaumuri) food selection, using field and laboratory experiments. Wild isopods consumed 3-fold more macronutrient-poor biological soil crust (BSC) than plant litter. Isopods tightly regulated macronutrient and calcium intake, but not phosphorus when eating the two natural foods and when artificial calcium and phosphorus sources substituted the BSC. Despite the equivalent calcium ingestion, isopods performed better when eating BSC compared to artificial foods. Isopods that consumed BSC sterilized by gamma-radiation ate more but grew slower than isopods that ate live BSC, implying that ingested microorganisms facilitate litter digestion. Our work highlights the need to reveal the multifaceted considerations that affect food-selection when exploring trophic-interactions.Funding provided by: European Research CouncilCrossref Funder Registry ID: http://dx.doi.org/10.13039/501100000781Award Number: ERC-2013-StG-337023 (ECOSTRESS)Funding provided by: Israel Science FoundationCrossref Funder Registry ID: http://dx.doi.org/10.13039/501100003977Award Number: ISF- No. 1391/19Please refer to the Methods section in the manuscript and Appendix 1, which elaborates on the method even further

All Behavioral data

The data is divided into 3 parts - each for each trial. The first 2 columns describe the treatment and the replicate number, and the rest 10 columns have the number of times that each behavioral sequence was observed