Efeitos da exposição aguda ao selênio e ao cobre sobre as defesas antioxidantes de mexilhões marinhos Perna perna

TCC(graduação) - Universidade Federal de Santa Catarina. Centro de Ciências Biológicas. Biologia.Embora muitos metais, como o cobre, sejam essenciais para os organismos, o seu uso industrial e na agricultura tem levado a um aumento de sua concentração na natureza. Uma vez em altas concentrações, este metal pode tornar-se tóxico e ameaçar a saúde de organismos marinhos. Além disso, em corpos aquáticos, é freqüentemente relatada a presença de compostos protetores, como o selênio. Desta forma, este trabalho foi dividido em duas partes: na primeira, mexilhões Perna perna foram expostos a diversas concentrações de cobre por 96 horas, a fim de se ter uma estimativa da toxicidade deste metal. A concentração letal 50% em 96 horas foi de 245 μgl-1 (CL50,96h) e a maior concentração sem efeito foi a de 80 μgl-1 (CL0,96h). Após esta etapa, os animais foram expostos à 30, 60, 180 e 540 μgl-1 de cobre, a fim de determinar danos oxidativos em brânquias. Houve um aumento nos níveis de glutationa total para todas as concentrações testadas, exceto para 30 μgl-1. A atividade da enzima glutationa redutase foi menor nos animais expostos a 540 μgl-1, e a atividade da tioredoxina redutase foi menor em todas as concentrações exceto na de 60 μgl-1. Não foi detectada nenhuma alteração significativa na atividade das enzimas catalase e glutationa S-transferase. Houve um aumento no índice de dano no DNA de hemócitos de animais expostos a 180 e 540 μgl-1. Na segunda parte deste trabalho, mexilhões Perna perna foram expostos a 8 μgl-1 de selênio por 72 horas e mantidos por mais 72 horas, quando as análises bioquímicas foram realizadas. Após este período, enzimas antioxidantes e o estado tiólico foram mensurados nas brânquias destes animais. Nenhuma diferença significativa foi encontrada na atividade das enzimas glutationa redutase, tioredoxina redutase, glutationa peroxidase dependente de selênio e glutationa S-transferase. Os níveis de glutationa e tióis protéicos também não foram alterados pelo tratamento com selênio. Estes resultados demonstram que o cobre tem ação pró-oxidante em brânquias de mexilhões Perna perna, uma vez que causa dano ao DNA e diminui a atividade das enzimas glutationa redutase e tioredoxina redutase. Por outro lado, os níveis aumentados de glutationa parecem ser uma resposta de proteção contra os efeitos deletérios gerados pela exposição ao cobre. Além disso, este estudo demonstrou que exposição ao selênio não causa alteração em várias defesas antioxidantes na brânquia do mexilhão Perna perna. Estes dados diferem daqueles encontrados por outros autores que estudaram exposição ao selênio no mexilhão Mytilus edulis. Desta forma, pode-se concluir que a exposição ao selênio leva a respostas antioxidantes diferentes entre espécies que habitam clima temperado e subtropical.Although some heavy metals as copper have real importance for organisms, the industrial and agricultural use has increased its release in the environment. Once in excess this metal can turn to be toxic and hazard the marine organisms. Besides that, the presence of protective compounds such as selenium in the aquatic environment has been reported. In this way, this work was divided in two parts. At the first one, Perna perna mussels were expose to several concentrations of copper during 96 hours to estimate the toxicity of this metal. The 50% lethal concentration found for 96 hours exposure was 245μgl-1 (CL50,96h) and the highest concentration without effect was 60 μgl-1 (CL0,96h). Afterwards the mussels were exposed to 30, 60, 180 and 540 μgl-1 of copper to determine the oxidative damage caused on gills. There was an increase in glutathione levels for all the concentrations tested except for 30 μgl-1. The glutathione reductase activity was lower in animals exposed to 540 μl-1 and the thioredoxin reductase activity was lower for all concentrations tested except for 60 μgl-1. No changes were found in catalase and glutathione S-transferase enzyme activities. There was an increase in DNA damage index in haemocytes of animals exposed to 180 and 540 μgl-1. At the second part of this study, Perna perna were exposed to 8 μgl-1 of selenium for 72 hours and left for more 72 hours in clean sea water when the biochemical analyses were carried out. After this period, antioxidant enzymes and the thiolic status were measured on gills. No significant differences were found in the activity of glutathione reductase, thioredoxin reductase, selenium dependent glutathione peroxidase and glutathione S-transferase. An addition, the glutathione and protein thiol levels did not change with selenium treatment. These results demonstrated that copper has a pro-oxidant action on the Perna perna gills as it caused DNA damage and decreased the glutathione reductase and thioredoxin reductase enzymes activities. On the other hand, the increased levels of glutathione seem to be a protective response against the deleterious effects generated by copper exposure. Besides that, this work has shown that exposition to selenium did not cause any changes in a diverse of antioxidant enzymes measured in the mussel Perna perna. This data is in opposition to some results found for other authors that have studied selenium exposure in the mussel Mytilus edulis. In this way we can conclude that an exposition to selenium leads to different antioxidant responses between species that inhabits temperate and subtropical climate

Evaluation of bladder function pre and post renal transplantation in patients without urological cause

Orientador: Carlos Arturo Levi D'AnconaDissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências MédicasResumo: Objetvos: Avaliar com realização do estudo urodinâmico, a recuperação da função vesical em pacientes com doença renal crônica sem causa urológica de base com longos períodos de oligúria / anúria, submetidos a transplante renal. Pacientes e Métodos: De abril de 2009 a junho de 2010, 30 pacientes apresentando oligúria / anúria, foram prospectivamente avaliados com estudo urodinâmico. Este foi realizado imediatamente antes e seis meses após o transplante renal. Os critérios de inclusão foram: idade > 18 anos, doença renal crônica sem causa urológica envolvida na sua etiologia, tempo de diálise superior a 12 meses, nome em lista de transplante com doador falecido. Foram excluídos pacientes com alteração no ultrassom de vias urinárias, uretrocistografia miccional e urianálise e com diurese residual de 24 horas superior a 1000ml. Resultados: Observou-se completa recuperação da função vesical após o retorno da diurese, no sexto mês pós-transplante, independente de haver ou não disfuncionalização vesical. As variações nos parâmetros urodinâmicos foram: primeira sensação de enchimento vesical: 88,8 para 168,7ml (p = 0,0005); primeiro desejo miccional: 137,2 para 251,1ml (p 18 years-old, end-stage renal disease secondary to non-urological disease, renal substitutive therapy longer than 12 months, waiting for deceased donor organ. Exclusion criteria was: abnormal urinary tract ultrasound, voiding cystourethrography or urinalyses and 24 hours residual diuresis higher than 1000ml. Results: Complete recovery of bladder function was observed after return of diuresis, on the sixth month post transplantation, independently of the presence of bladder defunctionalization. Urodynamics parameters changes from baseline to six months were: first sensation of bladder filling: 88.8 to 168.7ml (p = 0.0005); first desire to void: 137.2 to 251.1ml (p <0.0001); maximum cystometric capacity: 221.2 to 428.7ml (p <0.0001); bladder compliance: 73.9 to 138.6 ml/cm H2O (p = 0.03) and maximum flow rate: 8.1 to 15.8 ml/s (p <0.0001). The Abrams-Griffths number in men reduced from 31.8 to 15.2 (p = 0.002). No significant chances were observed in detrusor pressure at maximum flow rate and post void residual volume. Patients with 24 hours diuresis volume lower than 200ml tended to have more significant abnormalities in urodynamics parameters before transplantation. Conclusions: A complete recovery of bladder function was observed in patients with end stage renal disease, without urological disease, six months after transplant, associated with recovery of urine output by the renal graftMestradoFisiopatologia CirúrgicaMestre em Ciência

A hybrid-hierarchical genome assembly strategy to sequence the invasive golden mussel Limnoperna fortunei

Background: For more than 25 years, the golden mussel Limnoperna fortunei has aggressively invaded South American freshwaters, having travelled more than 5,000 km upstream across five countries. Along the way, the golden mussel has outcompeted native species and economically harmed aquaculture, hydroelectric powers, and ship transit. We have sequenced the complete genome of the golden mussel to understand the molecular basis of its invasiveness and search for ways to control it. Findings: We assembled the 1.6 Gb genome into 20548 scaffolds with an N50 length of 312 Kb using a hybrid and hierarchical assembly strategy from short and long DNA reads and transcriptomes. A total of 60717 coding genes were inferred from a customized transcriptome-trained AUGUSTUS run. We also compared predicted protein sets with those of complete molluscan genomes, revealing an exacerbation of protein-binding domains in L. fortunei. Conclusions: We built one of the best bivalve genome assemblies available using a cost-effective approach using Illumina pair-end, mate pair, and PacBio long reads. We expect that the continuous and careful annotation of L. fortunei’s genome will contribute to the investigation of bivalve genetics, evolution, and invasiveness, as well as to the development of biotechnological tools for aquatic pest control

A DITONGAÇÃO DAS SÍLABAS TÔNICAS FINAIS TRAVADAS NOS FALARES BLUMENAUENSE E PORTO-ALEGRENSE: UMA ANÁLISE PRELIMINAR

Os ditongos são constituídos por uma sequência de dois segmentos vocálicos em uma mesma sílaba. O objetivo deste estudo foi analisar o fenômeno da ditongação no português brasileiro, considerando os falares de Porto Alegre (RS) e Blumenau (SC). Os dados foram coletados em experimentos controlados, realizados com três informantes. Em seguida, foram examinados qualitativa e quantitativamente, com base em análises acústicas relativas aos dois primeiros formantes vocálicos das vogais aqui investigadas ([ ]). Para essas análises, o software Praat (5.3.53) foi utilizado. Os resultados mostraram três tipos de produções: a vogal preservada, a ditongada e uma produção gradiente. Houve predomínio da ditongação em contextos de vogal [a] e [e] para ambos os dialetos. No entanto, as produções com qualidade gradiente ocorreram em contexto de vogal [a] e [e], no falar de Blumenau, e apenas em contexto de vogal [a], no falar de Porto Alegre

Consumo alimentar, conhecimento nutricional e composição corporal de jovens atletas femininas de rugby

Introduction and objective: Rugby is an intermittent and high-intensity team sport. It is known that the performance of athletes is directly linked to an adequate intake of nutrients, and inadequacies in the diet can impact their performance and recovery. Therefore, the present study aims to evaluate food consumption, nutritional knowledge and body composition of athletes from a youth rugby team in Pelotas, in the interior of Rio Grande do Sul. Materials and Methods: This is a descriptive cross-sectional study, with young athletes from the Vem Ser Rugby Project, from the Federal University of Pelotas. Due to a previously established institutional bond, 13 schoolchildren aged between 16 and 18 were intentionally involved. A 24-hour food recall and the NUKYA questionnaire were applied, as well as anthropometric measurements of weight, height, waist circumference, hip circumference and a protocol of 3 skinfolds (triceps, suprailiac and thigh). Results: Food consumption was inadequate for most nutrients, nutritional knowledge was insufficient, but body composition was adequate. Conclusion: Due to inadequate energy consumption and low nutritional knowledge, it is essential that the team receive nutritional monitoring, aiming to improve nutritional aspects, the health of athletes and maintenance of body composition.Introducción y objetivo: El rugby es un deporte de equipo intermitente y de alta intensidad. Se sabe que el rendimiento de los atletas está directamente relacionado con una ingesta adecuada de nutrientes, y las insuficiencias en la dieta pueden afectar su rendimiento y recuperación. Por lo tanto, el presente estudio tiene como objetivo evaluar el consumo de alimentos, el conocimiento nutricional y la composición corporal de atletas de un equipo juvenil femenino de rugby de Pelotas, en el interior de Rio Grande do Sul. Materiales y Métodos: Se trata de un estudio descriptivo transversal, con jóvenes deportistas del Proyecto Vem Ser Rugby, de la Universidad Federal de Pelotas. Trece estudiantes de entre 16 y 18 años se involucraron intencionalmente, debido a un vínculo institucional previamente establecido. Se aplicó un Recordatorio de Alimentos de 24 horas y el cuestionario NUKYA, así como medidas antropométricas de peso, talla, circunferencia de cintura, circunferencia de cadera y el protocolo de los 3 pliegues cutáneos (tríceps, suprailíaco y muslo). Resultados: El consumo de alimentos fue inadecuado para la mayoría de los nutrientes, el conocimiento nutricional fue insuficiente, pero la composición corporal fue adecuada. Conclusión: Debido al consumo inadecuado de energía y al bajo conocimiento nutricional, es fundamental que el equipo reciba un seguimiento nutricional, con el objetivo de mejorar los aspectos nutricionales, la salud de los atletas y el mantenimiento de la composición corporal.Introduzione e obiettivo: il rugby è uno sport di squadra intermittente e ad alta intensità. È noto che le prestazioni degli atleti sono direttamente collegate a un adeguato apporto di nutrienti e le inadeguatezze nella dieta possono influire sulle loro prestazioni e sul loro recupero. Pertanto, il presente studio si propone di valutare il consumo di cibo, le conoscenze nutrizionali e la composizione corporea degli atleti di una squadra giovanile di rugby femminile a Pelotas, nell'interno del Rio Grande do Sul. Materiali e metodi: questo è uno studio trasversale descrittivo, con giovani atleti del Vem Ser Rugby Project, presso l'Università Federale di Pelotas. Tredici studenti tra i 16 ei 18 anni sono stati coinvolti intenzionalmente, per un legame istituzionale prestabilito. Sono stati applicati un richiamo alimentare di 24 ore e il questionario NUKYA, nonché misurazioni antropometriche di peso, altezza, circonferenza della vita, circonferenza dell'anca e il protocollo delle 3 pliche cutanee (tricipite, soprailiaco e coscia). Risultati: il consumo di cibo era inadeguato per la maggior parte dei nutrienti, le conoscenze nutrizionali erano insufficienti, ma la composizione corporea era adeguata. Conclusione: a causa del consumo energetico inadeguato e delle scarse conoscenze nutrizionali, è essenziale che la squadra riceva un monitoraggio nutrizionale, con l'obiettivo di migliorare gli aspetti nutrizionali, la salute degli atleti e il mantenimento della composizione corporea.Introdução e objetivo: O rugby é um esporte coletivo intermitente e de alta intensidade. Sabe-se que o rendimento dos atletas está diretamente ligado a uma ingestão adequada de nutrientes, e inadequações na dieta podem impactar seu desempenho e recuperação. Portanto, o presente estudo tem como objetivo avaliar o consumo alimentar, o conhecimento nutricional e a composição corporal de atletas de uma equipe feminina juvenil de rugby de Pelotas, interior do Rio Grande do Sul. Materiais e Métodos: Trata-se de um estudo transversal descritivo, com jovens atletas do Projeto Vem Ser Rugby, da Universidade Federal de Pelotas. Foram envolvidas de modo intencional, devido a vínculo institucional previamente estabelecido, 13 escolares de 16 a 18 anos de idade. Foi aplicado um Recordatório Alimentar de 24h e o questionário NUKYA, bem como foram aferidas as medidas antropométricas de peso, estatura, circunferência da cintura, circunferência do quadril e protocolo de 3 dobras cutâneas (tríceps, supra-ilíaca e coxa). Resultados: O consumo alimentar estava inadequado para a maioria dos nutrientes, o conhecimento nutricional foi insuficiente, todavia a composição corporal estava adequada. Conclusão: Devido ao consumo energético inadequado e ao baixo conhecimento nutricional, é fundamental que a equipe receba acompanhamento nutricional, visando melhorar os aspectos nutricionais, a saúde das atletas e manutenção da composição corporal.&nbsp;Introdução e objetivo: O rugby é um esporte coletivo intermitente e de alta intensidade. Sabe-se que o rendimento dos atletas está diretamente ligado a uma ingestão adequada de nutrientes, e inadequações na dieta podem impactar seu desempenho e recuperação. Portanto, o presente estudo tem como objetivo avaliar o consumo alimentar, o conhecimento nutricional e a composição corporal de atletas de uma equipe feminina juvenil de rugby de Pelotas, interior do Rio Grande do Sul. Materiais e Métodos: Trata-se de um estudo transversal descritivo, com jovens atletas do Projeto Vem Ser Rugby, da Universidade Federal de Pelotas. Foram envolvidas de modo intencional, devido a vínculo institucional previamente estabelecido, 13 escolares de 16 a 18 anos de idade. Foi aplicado um Recordatório Alimentar de 24h e o questionário NUKYA, bem como foram aferidas as medidas antropométricas de peso, estatura, circunferência da cintura, circunferência do quadril e protocolo de 3 dobras cutâneas (tríceps, supra-ilíaca e coxa). Resultados: O consumo alimentar estava inadequado para a maioria dos nutrientes, o conhecimento nutricional foi insuficiente, todavia a composição corporal estava adequada. Conclusão: Devido ao consumo energético inadequado e ao baixo conhecimento nutricional, é fundamental que a equipe receba acompanhamento nutricional, visando melhorar os aspectos nutricionais, a saúde das atletas e manutenção da composição corporal.&nbsp

A Long-Term Conserved Satellite DNA That Remains Unexpanded in Several Genomes of Characiformes Fish Is Actively Transcribed

Eukaryotic genomes contain large amounts of repetitive DNA sequences, such as tandemly repeated satellite DNAs (satDNAs). These sequences are highly dynamic and tend to be genus- or species-specific due to their particular evolutionary pathways, although there are few unusual cases of conserved satDNAs over long periods of time. Here, we used multiple approaches to reveal that an satDNA named CharSat01-52 originated in the last common ancestor of Characoidei fish, a superfamily within the Characiformes order, ∼140-78 Ma, whereas its nucleotide composition has remained considerably conserved in several taxa. We show that 14 distantly related species within Characoidei share the presence of this satDNA, which is highly amplified and clustered in subtelomeric regions in a single species (Characidium gomesi), while remained organized as small clusters in all the other species. Defying predictions of the molecular drive of satellite evolution, CharSat01-52 shows similar values of intra- and interspecific divergence. Although we did not provide evidence for a specific functional role of CharSat01-52, its transcriptional activity was demonstrated in different species. In addition, we identified short tandem arrays of CharSat01-52 embedded within single-molecule real-time long reads of Astyanax paranae (536 bp-3.1 kb) and A. mexicanus (501 bp-3.9 kb). Such arrays consisted of head-to-tail repeats and could be found interspersed with other sequences, inverted sequences, or neighbored by other satellites. Our results provide a detailed characterization of an old and conserved satDNA, challenging general predictions of satDNA evolution

The genome sequence of the Norway rat, Rattus norvegicus Berkenhout 1769.

We present a genome assembly from an individual male Rattus norvegicus (the Norway rat; Chordata; Mammalia; Rodentia; Muridae). The genome sequence is 2.44 gigabases in span. The majority of the assembly is scaffolded into 20 chromosomal pseudomolecules, with both X and Y sex chromosomes assembled. This genome assembly, mRatBN7.2, represents the new reference genome for R. norvegicus and has been adopted by the Genome Reference Consortium

A hybrid-hierarchical genome assembly strategy to sequence the invasive golden mussel Limnoperna fortunei

ABSTRACT Background: For more than 25 years, the golden mussel Limnoperna fortunei has aggressively invaded South American freshwaters, having travelled more than 5,000 km upstream across five countries. Along the way, the golden mussel has outcompeted native species and economically harmed aquaculture, hydroelectric powers, and ship transit. We have sequenced the complete genome of the golden mussel to understand the molecular basis of its invasiveness and search for ways to control it. Findings: We assembled the 1.6 Gb genome into 20548 scaffolds with an N50 length of 312 Kb using a hybrid and hierarchical assembly strategy from short and long DNA reads and transcriptomes. A total of 60717 coding genes were inferred from a customized transcriptome-trained AUGUSTUS run. We also compared predicted protein sets with those of complete molluscan genomes, revealing an exacerbation of proteinbinding domains in L. fortunei. Conclusions: We built one of the best bivalve genome assemblies available using a cost-effective approach using Illumina pair-end, mate pair, and PacBio long reads. We expect that the continuous and careful annotation of L. fortunei&apos;s genome will contribute to the investigation of bivalve genetics, evolution, and invasiveness, as well as to the development of biotechnological tools for aquatic pest control