Studies of genetic mosaicism in rare diseases

Mosaicism in human genetics refers to an individual harboring two or more genetic compositions, all derived from the same fertilized egg. Common signs of genetic mosaicism are asymmetric growth, skin aberrations or vascular malformations. Each clinical picture is in itself rare, but together mosaic disorders form a growing group of identifiable characteristic abnormalities. Interestingly, several pharmacological treatment possibilities for these conditions have evolved in the last couple of years. In study I, we found mosaic hotspot PIK3CA variants in two patients with ectopic muscles and muscular overgrowth, by performing whole genome sequencing and digital PCR. This adds information about timing of PIK3CA mutagenesis during embryogenesis in correlation to phenotype and confirms the diagnostic entity PIK3CA-related muscular overgrowth with ectopic muscles. In study II, we describe a genetic mechanism in DICER1-related overgrowth. We show that a constitutional DICER1 variant encoding the RNase IIIa domain causes a severe subtype of DICER1 syndrome with intellectual disability, macrocephaly, extensive bilateral lung cysts, early onset of Wilms tumor, and well-differentiated fetal lung adenocarcinoma. This phenotype is similar to, but distinct from, the phenotype reported in two patients with GLOW syndrome caused by mosaic hotspot variants encoding the RNase IIIb domain. In study III, we add knowledge of genotype-phenotype correlations in male focal dermal hypoplasia patients by describing a previously unknown disease-causing variant in a male patient, and by highlighting that focal dermal hypoplasia can be suspected in patients with characteristic limb malformations, such as ectrodactyly, or ocular manifestations, even in the absence of typical skin findings. In study IV, we used droplet digital PCR to analyze blood- and sperm-derived DNA from 87 parents to children with intellectual disability syndromes caused by de novo variants. We found germline mosaicism in two fathers and showed that analysis of blood alone may underestimate germline mosaicism. Taken together, these studies have improved our understanding of methodological approaches in mosaicism diagnostics. In addition, these studies contribute to our understanding of the phenotypic and/or genetic spectrum of PIK3CA-related overgrowth, DICER1-related overgrowth, focal dermal hypoplasia and germline mosaicism in rare diseases

The human cathelicidin hCAP-18 in serum of children with haemato-oncological diseases

The human cathelicidin hCAP-18 (pro-LL-37) is the pro-protein of the antimicrobial peptide LL-37. hCAP-18 can be produced by many different cell types; bone marrow neutrophil precursors are the main source of hCAP-18 in the circulation. Neutrophil count is used as a marker for myelopoiesis but does not always reflect neutrophil production in the bone marrow, and thus additional markers are needed. In this study, we established the reference interval of serum hCAP-18 level in healthy children and compared serum hCAP-18 levels between different diagnostic groups of children with haemato-oncological diseases, at diagnosis. We found that children with diseases that impair myelopoiesis, such as acute leukaemia, aplastic anaemia, or myelodysplastic syndrome, presented with low hCAP-18 levels, whereas patients with non-haematological malignancies displayed serum hCAP-18 levels in the same range as healthy children. Children with chronic myeloid leukaemia presented with high circulating levels of hCAP-18, probably reflecting the high number of all differentiation stages of myeloid cells. We suggest that analysis of serum hCAP-18 provides additional information regarding myelopoiesis in children with haemato-oncological diseases, which may have future implications in assessment of myelopoiesis in clinical management.Peer reviewe

Skriftliga omdömens komplexitet - En intervjustudie utifrån sex perspektiv om skriftliga omdömens syfte och funktion

Sammanfattning: Syftet med studien är att belysa hur skriftliga omdömen bemöts av elever, vårdnadshavare, lärare, lärarstudenter, rektorer och politiker. Vi vill synliggöra skillnader och likheter mellan dessa informanters uppfattningar kring vad skriftliga omdömen har för syfte och funktion. Vår studie bygger på kvalitativa samtalsintervjuer med två lärare, två lärarstudenter, två elever, två rektorer, två vårdnadshavare och två politiker. Intervjuerna har tolkats utifrån hermeneutiken som metodlära. Dessa tolv personers uppfattningar om skriftliga omdömen är tänkt att ligga till grund för en större diskussion om skriftliga omdömen och bedömning. Resultatet av vår studie uppdagade två perspektiv där syftet antingen var att informera om elevens skolgång eller att skriftliga omdömen skall fungera som ett verktyg för pedagogerna. Vårdnadshavarna, lärarna och politikerna var eniga om att syftet med skriftliga omdömen var information om elevens skolgång. Lärarstudenterna och eleverna ansåg dock att skriftliga omdömen skall fungera som ett verktyg för pedagogerna. Våra informanters erfarenhet om skriftliga omdömens funktion visade sig dels vara att de användes i samband med utvecklingssamtal och dels att de fungerade som ett mätinstrument. Alla informanter förutom två ansåg att skriftliga omdömen är bra om de är formativt utformade och fungerar som ett stöd för elevens fortsatta utveckling. En av de vårdnadshavare och en av de politiker vi har intervjuat tyckte dock även att en summativ bedömning kan ha effekt i olika aspekter. Med hjälp av våra resultat ser vi att åsikterna kring skriftliga omdömen skiljer sig åt och att en stor förändring inom skolan tar lång tid. Våra slutsatser kan vi därför sammanfatta i följande påstående: Vi måste komma överens om vilka syften bedömning bör ha för att få ett framtida förbättringsarbete inom skriftliga omdömen och bedömning. Med vår studie har vi vidgat vårt perspektiv och vår förståelse för skriftliga omdömen och bedömning. De resultat vi fick fram angående att lärarstudenterna kände sig dåligt insatta i arbetet med skriftliga omdömen tycker vi borde ligga till grund för vikten av att lyfta detta innehåll under utbildningen för blivande lärare

Language development - for all? : A study of how teaching methods in the educational work can affect language development for children with deviant language development

Studiens syfte var att undersöka vilka metoder som används i det didaktiska arbetet med barns språkutveckling i förskola och skola, vilka metoder som rekommenderas för barn med avvikande språkutveckling, samt hur arbetet med språkutveckling kan läggas upp i en barngrupp. Metoden som användes var en kvalitativ forskningsansats där intervjuer gjordes med sex verksamma pedagoger. Urvalet av informanter gjordes med utgångspunkt i deras arbetsuppgifter; tre specialpedagoger, en logoped och två pedagoger verksamma i förskoleklass. De viktigaste resultaten som framkom var vikten av att pedagoger som arbetar med barns språkutveckling inte bara har kunskap om metoderna för att arbeta med denna, utan att de även har kunskap om hur barn utvecklar språk. De måste dessutom känna till tidiga tecken på avvikande språkutveckling, samt på vilka sätt de kan stödja barn i behov av särskilt stöd för att tidigt sätta in rätt insatser

"Det här är ju också ett begrepp som bara dök upp" : En kvantitativ och kvalitativ studie av elevers användning av och lärares uppfattning om nominaliseringar i gymnasieskolan

Att studera nominaliseringar i gymnasieelevers texter ger en bild av elevers skrivkunskaper inför vidare studier och tydliggör arbetet med ett vetenskapligt skrivande i kursen svenska 3 i gymnasieskolan. Nominaliseringar bidrar bland annat till att skapa informationstäta texter, vilket är något som det vetenskapliga skrivandet kan kännetecknas av. Syftet med studien är att studera det vetenskapliga skrivandet genom nominaliseringar i elevtexter och med syftet vill vi också ge en bild av gymnasielärares arbete med och uppfattning om vetenskapligt skrivande genom nominaliseringar. Metoden grundar sig i en huvudsaklig kvantitativ metod med ett kvalitativt komplement. Den kvantitativa metoden består av en beräkning och en indelning av nominaliseringar i kategorier och den kvalitativa metoden omfattas av två intervjuer. Materialet utgörs av 72 elevtexter fördelat på två uppgifter som är hämtade från två klasser i kursen svenska 3 på gymnasiet. Utöver detta har vi genomfört intervjuer med svensklärarna i de två klasser som elevtextmaterialet är hämtat ifrån. Resultatet visar att fördelningen av nominaliseringar inte skiljer sig särskilt mycket mellan de två uppgifterna och att de flesta elever använder mellan 21 och 30 nominaliseringar per text. Den mest förekommande ändelsen är -ning. Intervjuerna tydliggör att nominaliseringar får ett begränsat utrymme i undervisningen trots att de ses som en viktig del av det vetenskapliga skrivandet och att användningen av nominaliseringar sällan är ett medvetet och aktivt val av eleverna.

Att vårda patienter med HIV – Sjuksköterskans upplevelse : - En litteraturöversikt

Bakgrund: Inom vården för smittsamma sjukdomar ställs det krav på sjuksköterskan att känna till sina egna kunskaper och fördomar väl för att kunna ge en god vård. Hiv är en sjukdom utan botemedel, detta gör att sjuksköterskan kan uppleva osäkerhet inför vårdandet av denna patientgrupp. Syfte: Att belysa sjuksköterskors attityder och bemötande till omvårdnaden av Hivsmittade patienter. Metod: Designen på studien är en systematisk litteraturöversikt. Orden i syftet har omvandlats till ämnesord i databaserna Cinahl och PubMed. 12 artiklar valdes ut till resultatet. Den vetenskapliga kvalitén på artiklarna granskades med hjälp av granskningsmallar. Resultat: Resultatet visar att sjuksköterskor har både positiva och negativa attityder mot dessa patienter och att stigmatiseringen runt denna patientgrupp är allt för verklig. Innehållsanalysen gav två huvudkategorier och fyra subkategorier. Sjuksköterskans attityder till att vårda Hivsmittade patienter – Positiva attityder till att vårda, Negativa attityder till att vårda., Påverkande faktorer till sjuksköterskans attityder - Stigmatiseringen i dig själv eller utifrån, Stigmatisering på grund av kunskapsbrist. Diskussion: Belyser påverkande faktorer till sjuksköterskans attityder. Slutsats: Fortsatt forskning krävs på ämnet eftersom det visar på hur viktigt det är med sjuksköterskors kunskap kring Hiv och deras attityder kring Hivsmittade och vilken effekt det får på bemötandet och vården i stort.Godkännande datum: 2017-03-20</p

Inflytande och delaktighet i förskolan : Föräldrars medvetenhet om förskolans pedagogiska arbete

Syftet med undersökningen är att ta reda på hur medvetna föräldrar på sju förskolor är om det pedagogiska arbetet i förskolan. Vi vill också ta reda på hur deras möjlighet till inflytande och delaktighet ser ut. Våra frågeställningar är: • Känner föräldrarna till att det finns en läroplan för förskolan? • Synliggör personalen det pedagogiska arbetet för föräldrarna? • Är föräldrarna nöjda med det pedagogiska arbetet i förskolan? • Känner föräldrarna till vilka möjligheter de har att vara med och påverka förskolans pedagogiska arbete? Vi har använt oss av enkäter riktade till föräldrar och personal för att få svar på våra frågeställningar. I undersökningen deltog 73 föräldrar och 35 personal. Resultaten visar att majoriteten av föräldrarna är medvetna om förskolans läroplan men att de inte är särskilt delaktiga när det kommer till att påverka det pedagogiska arbetet. Synliggörandet av det pedagogiska arbetet kan bli ännu tydligare och föräldrainflytandet kan utvecklas vidare. Både föräldrar och personal är sammanfattningsvis nöjda med verksamheten men uttrycker en önskan om färre antal barn i grupperna alternativt en ökad personaltäthet