Real-Time PCR in HIV/Trypanosoma cruzi Coinfection with and without Chagas Disease Reactivation: Association with HIV Viral Load and CD4+ Level

Chagas disease is endemic in Latin America and is caused by the flagellate protozoan T. cruzi. The acute phase is asymptomatic in the majority of the cases and rarely causes inflammation of the heart or the central nervous system. Most infected patients progress to a chronic phase, characterized by cardiac or digestive involvement when not asymptomatic. However, when patients are also exposed to an immunosuppressant (such as chemotherapy), neoplasia, or other infections such as HIV, T. cruzi infection may develop into a severe disease (Chagas disease reactivation) involving the heart and central nervous system. The current microscopic methods for diagnosing Chagas disease reactivation are not sensitive enough to prevent the high rate of death observed in these cases. Therefore, we propose a quantitative method to monitor blood levels of the parasite, which will allow therapy to be administered as early as possible, even if the patient has not yet presented symptoms

SARS-CoV-2 introductions and early dynamics of the epidemic in Portugal

Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in Portugal was rapidly implemented by the National Institute of Health in the early stages of the COVID-19 epidemic, in collaboration with more than 50 laboratories distributed nationwide. Methods By applying recent phylodynamic models that allow integration of individual-based travel history, we reconstructed and characterized the spatio-temporal dynamics of SARSCoV-2 introductions and early dissemination in Portugal. Results We detected at least 277 independent SARS-CoV-2 introductions, mostly from European countries (namely the United Kingdom, Spain, France, Italy, and Switzerland), which were consistent with the countries with the highest connectivity with Portugal. Although most introductions were estimated to have occurred during early March 2020, it is likely that SARS-CoV-2 was silently circulating in Portugal throughout February, before the first cases were confirmed. Conclusions Here we conclude that the earlier implementation of measures could have minimized the number of introductions and subsequent virus expansion in Portugal. This study lays the foundation for genomic epidemiology of SARS-CoV-2 in Portugal, and highlights the need for systematic and geographically-representative genomic surveillance.We gratefully acknowledge to Sara Hill and Nuno Faria (University of Oxford) and Joshua Quick and Nick Loman (University of Birmingham) for kindly providing us with the initial sets of Artic Network primers for NGS; Rafael Mamede (MRamirez team, IMM, Lisbon) for developing and sharing a bioinformatics script for sequence curation (https://github.com/rfm-targa/BioinfUtils); Philippe Lemey (KU Leuven) for providing guidance on the implementation of the phylodynamic models; Joshua L. Cherry (National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health) for providing guidance with the subsampling strategies; and all authors, originating and submitting laboratories who have contributed genome data on GISAID (https://www.gisaid.org/) on which part of this research is based. The opinions expressed in this article are those of the authors and do not reflect the view of the National Institutes of Health, the Department of Health and Human Services, or the United States government. This study is co-funded by Fundação para a Ciência e Tecnologia and Agência de Investigação Clínica e Inovação Biomédica (234_596874175) on behalf of the Research 4 COVID-19 call. Some infrastructural resources used in this study come from the GenomePT project (POCI-01-0145-FEDER-022184), supported by COMPETE 2020 - Operational Programme for Competitiveness and Internationalisation (POCI), Lisboa Portugal Regional Operational Programme (Lisboa2020), Algarve Portugal Regional Operational Programme (CRESC Algarve2020), under the PORTUGAL 2020 Partnership Agreement, through the European Regional Development Fund (ERDF), and by Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT).info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Práticas artísticas no ensino básico e secundário

A matéria-prima de que trata esta revista é base de trabalho para um ensino artístico alargado, estendendo-se fora dos limites da aula, transgredindo os limites formais dos curricula, implicando património e riqueza cultural, sensibilizando para o imaterial, criando públicos apreciadores e também agentes criadores. É toda uma comunidade que se interliga através dos valores imateriais que sempre foram os da arte. A tarefa do educador é muito alargada: exige-se que esteja à altura deste desígnio humanista, que é também um desafio ao destino da humanidade: pela educação artística constroem-se futuros, e sem arte há intolerância, materialismo, indiferença, alienação, morte. Os tempos que se vivem são exigentes. As questões da pós modernidade estão muito acesas, desde as que nos obrigam ao desassossego, como a sustentabilidade e a poluição, como as que nos implicam politicamente, como a justiça, os direitos civis, a desigualdade. Tudo isto é matéria com a qual se amassa um barro que pode ser mais ou menos criativo: trata-se de extrair a matéria-prima com que se pode fazer os blocos que constroem o futuro. Aos profissionais da educação e do ensino, esta consciência, ao mesmo tempo desamparada – os cortes da economia neoliberal transformaram a arte em indústria, e a sua educação em criação de consumidores – e ao mesmo tempo vigilante e interventiva. Os artigos que responderam a esta chamada, respondem, cada um a seu modo, a este desassossego, a este desconforto, a este mal-estar contemporâneo. Dispuseram-se segundo uma sequência que se articula com base em temas afins que se podem descrever sucintamente: Todos os que participaram neste número mostraram a sua matéria-prima, a sua reação à falta que a arte nos faz. A chamada soa, e ressoa, e é necessário que seja por todos ouvida, em todos os países. É simples: as artes estão em perigo. Perigo porque há menos horas, menos professores, menos opções, menos conhecimento. As reduções no horário, a eliminação de disciplinas tão importantes como a história da arte, fazem de cada professor um agente da resistência, um ser mais implicado na sobrevivência da chama da criação. Matéria-prima: matéria para resgatar a verdade humana, a arte, a expressão mais valiosa da sua vaidade. Resgatar o homem que Michel Foucault (1988: 412) vê ameaçado, como um rosto na areia, desenhado à beira-mar.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Dinâmicas de (investig)ação em contextos de promoção da língua portuguesa: a presença do CIDTFF na rede Camões, I.P.

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Trajetórias da Educomunicação nas Políticas Públicas e a Formação de seus Profissionais

Esta obra é composta com os trabalhos apresentados no primeiro subtema, TRAJETÓRIA – Educação para a Comunicação como Política pública, nas perspectivas da Educomunicação e da Mídia-Educação, do II Congresso Internacional de Comunicação e Educação. Os artigos pretendem propiciar trocas de informações e produzir reflexões com os leitores sobre os caminhos percorridos, e ainda a percorrer, tendo como meta a expansão e a legitimação das práticas educomunicativas e/ou mídia-educativas como política pública para o atendimento à formação de crianças, adolescentes, jovens e adultos, no Brasil e no mundo

The evolving SARS-CoV-2 epidemic in Africa: Insights from rapidly expanding genomic surveillance

INTRODUCTION Investment in Africa over the past year with regard to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) sequencing has led to a massive increase in the number of sequences, which, to date, exceeds 100,000 sequences generated to track the pandemic on the continent. These sequences have profoundly affected how public health officials in Africa have navigated the COVID-19 pandemic. RATIONALE We demonstrate how the first 100,000 SARS-CoV-2 sequences from Africa have helped monitor the epidemic on the continent, how genomic surveillance expanded over the course of the pandemic, and how we adapted our sequencing methods to deal with an evolving virus. Finally, we also examine how viral lineages have spread across the continent in a phylogeographic framework to gain insights into the underlying temporal and spatial transmission dynamics for several variants of concern (VOCs). RESULTS Our results indicate that the number of countries in Africa that can sequence the virus within their own borders is growing and that this is coupled with a shorter turnaround time from the time of sampling to sequence submission. Ongoing evolution necessitated the continual updating of primer sets, and, as a result, eight primer sets were designed in tandem with viral evolution and used to ensure effective sequencing of the virus. The pandemic unfolded through multiple waves of infection that were each driven by distinct genetic lineages, with B.1-like ancestral strains associated with the first pandemic wave of infections in 2020. Successive waves on the continent were fueled by different VOCs, with Alpha and Beta cocirculating in distinct spatial patterns during the second wave and Delta and Omicron affecting the whole continent during the third and fourth waves, respectively. Phylogeographic reconstruction points toward distinct differences in viral importation and exportation patterns associated with the Alpha, Beta, Delta, and Omicron variants and subvariants, when considering both Africa versus the rest of the world and viral dissemination within the continent. Our epidemiological and phylogenetic inferences therefore underscore the heterogeneous nature of the pandemic on the continent and highlight key insights and challenges, for instance, recognizing the limitations of low testing proportions. We also highlight the early warning capacity that genomic surveillance in Africa has had for the rest of the world with the detection of new lineages and variants, the most recent being the characterization of various Omicron subvariants. CONCLUSION Sustained investment for diagnostics and genomic surveillance in Africa is needed as the virus continues to evolve. This is important not only to help combat SARS-CoV-2 on the continent but also because it can be used as a platform to help address the many emerging and reemerging infectious disease threats in Africa. In particular, capacity building for local sequencing within countries or within the continent should be prioritized because this is generally associated with shorter turnaround times, providing the most benefit to local public health authorities tasked with pandemic response and mitigation and allowing for the fastest reaction to localized outbreaks. These investments are crucial for pandemic preparedness and response and will serve the health of the continent well into the 21st century

Toxicity of mustard essential oil to populations of Sitophilus zeamais

O objetivo deste trabalho foi avaliar a toxicidade do óleo essencial de mostarda (OEM) para adultos de cinco populações de Sitophilus zeamais (Coleoptera: Curculionidae) e verificar a influência do óleo essencial sobre o comportamento locomotor dos insetos. Foi utilizado OEM com 90% do componente volátil Isotiocianato alilo (ITCA), diluído em óleo de soja, na proporção de 1:9 v/v, para obter solução oleosa de 9% de ITCA. O OEM foi aplicado em papel-filtro colocado em placas de Petri (5,0 cm diâmetro), que foram cobertas com organza e colocadas no interior de frascos de vidro de 0,8 L, aos quais foram acrescentados posteriormente 50 insetos adultos. Os frascos foram mantidos fechados por 48h. Utilizou-se o OEM em concentrações variando de 1,2 a 2,8 μL L-1. As populações de S. zeamais utilizadas foram Abre Campo, Machado, Paracatu, Piracicaba e Tunápolis. Avaliou-se a toxicidade do OEM por meio da estimativa das concentrações letais (CL) para 50 (CL50) e 95% (CL95) dos insetos adultos. As CL50 e CL95 foram usadas para calcular as respectivas razões de toxicidade. Foram avaliadas também as características comportamentais de caminhamento: distância percorrida, velocidade de caminhamento, tempo de repouso e número de paradas, bem como as características de voo como número de decolagens e altura de voo dos insetos. Adicionalmente, foram avaliadas as taxas instantâneas de crescimento populacional (ri), as taxas respiratórias (produção de CO2) e massa corpórea para todas as populações. A população padrão de susceptibilidade foi a da cidade de Piracicaba, pois apresentou menor CL50 (1,49 μL L- 1). Esta concentração foi utilizada para todos os bioensaios tratados com o OEM, exceto para a taxa instantânea de crescimento populacional, em que não se utilizou o tramento com OEM. A população de Paracatu foi a que apresentou maior CL50 (2,97 μL L-1) e CL95 (6,82 μL L-1), enquanto Machado foi a população que apresentou menor CL95 (2,16 μL L-1). A razão de toxicidade com base na CL50 variou entre 1,08 e 1,99 vezes, e entre 0,76 e 2,42 vezes baseada na CL95. As inclinações das curvas de concentração-mortalidade variaram entre as populações, sendo menor (4,56 ± 0,72) para a população de Paracatu e maior (13,14 ± 0,75) para a de Tunápolis. Não houve diferença significativa na distância percorrida entre os tratamentos com OEM e controle, nem entre as populações. No entanto, o tempo de repouso dos insetos foi reduzido pelo tratamento com OEM em todas as populações. Para os outros padrões comportamentais de caminhamento (velocidade de caminhamento e número de paradas), de voo (altura de voo e número de decolagens), taxa respiratória e de massa corpórea, houve diferença apenas entre as populações, não diferindo quando na presença ou ausência do OEM. Com isso, conclui-se que o OEM foi tóxico para as cinco populações de S. zeamais e que este óleo não promoveu grandes alterações no comportamento locomotor dos insetos. Diferentes padrões comportamentais, respiratórios e de massa corpórea foram observados nas populações de S. zeamais, porém com uniformidade de resposta ao óleo de mostarda, sendo que estas diferenças devem ser inerentes à constituição genética das populações.The aim of this study was to evaluate the toxicity of the essential oil of mustard (EOM) for adults of five populations of Sitophilus zeamais (Coleoptera: Curculionidae) and the influence of the essential oil on the locomotory behavior of the populations. EOM was used with 90% of allyl isothiocyanate volatile component (ITCA), diluted in soybean oil at 1:9 v/v to obtain a 9% solution of ITCA. EOM was applied on filter paper placed in Petri dishes (5.0 cm diameter). The dishes were covered with organza and placed inside glass jars of 0.8 L, and 50 adult insects were transferred to the jars, which were kept closed for 48 hours. EOM was used at concentrations ranging from 1.2 to 2.8 μL L-1. The S. zeamais populations used were from Abre Campo, Machado, Paracatu, Piracicaba and Tunápolis. The toxicity of EOM was evaluated by determining the lethal concentrations (CL) to 50 (LC50) and 95% (LC95) of adult insects, which were then used to estimate the toxicity ratio. The following locomotory behavioral parameters were studied: walked distance, walking velocity, resting time, and number of stops, as well as the number of takeoffs and flying height of the insects. Additionally, the instantaneous rates of increase (ri), the respiration rate (CO2 production) and body mass were evaluated for all populations. The most susceptible population to EOM was Piracicaba for wich the lowest LC50 was obtained (1.49μL L-1). This concentration was used for all the other assays treated with EOM, except the instantaneous rate of population growth, which hand no EOM treatment. The Paracatu population showed the highest LC50 (2.97 μL L-1) and LC95 (6.82 μL L-1) while Machado showed the lowest LC95 (2.16 μL L-1). The toxicity ratio based on the LC50 ranged from 1.08 to 1.99 times, and from 0.76 and 2.42 times based on the LC95. The slopes of the concentration mortality curves varied among the populations from 4.56 ± 0.72 (Paracatu) to 13.14 ± 0.75 (Tunápolis). The distance walked did not significantly differ between insects treatead with EOM and control or among populations. However, regarless of the population, the resting time of the insects was reduced by treatment with EOM. The other walking parameters (walking velocity and number of stops), flight parameters (flying height and number of takeoffs), respiratory rate, and body mass, the only varied among the populations, but no difference existed for insects exposed or not exposed to EOM. In conclusion, the EOM was toxic to the five populations of S. zeamais and did not promote major changes in the locomotory behavior of the insects. Different locomotory behavioral patterns, respiratory rate, and body mass were observed in the S. zeamais populations, but with uniform response to mustard oil; these differences should be inherent to the genetic make up of the populations.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superio

Characterization of fom-mat drying process to obtain powder of Ubá mango

A manga possui relevante importância econômica, principalmente nos países tropicais. Isso se deve ao seu excelente sabor e aroma. Os frutos dessa espécie são altamente perecíveis após a colheita. Assim, a desidratação dos frutos, que diminui sua perecibilidade, torna-se de grande importância para aumentar seu período de disponibilidade ao consumidor. Objetivou-se neste trabalho caracterizar o processo de produção da manga Ubá em pó por meio da secagem em leito de espuma, determinando-se o melhor emulsificante e concentração. E ainda, caracterizar as propriedades físico-químicas da polpa in natura, da espuma e do pó obtido, ajustar diferentes modelos matemáticos aos valores experimentais da secagem da polpa da manga e determinar as isotermas de sorção. Utilizou-se frutos de manga Ubá, que foram despolpados em uma centrífuga. Adicionou-se à polpa os emulsificantes albumina, Emustab ® , maltodextrina e Superliga neutra ® nas proporções de 0,5; 1,0; 1,5; 2,0 e 2,5% em massa. Para obter a espuma, a mistura da polpa com cada emulsificante foi submetida à agitação durante 15 min em batedeira. As análises de caracterização da polpa, da espuma e do pó da manga Ubá foram: teor de água, atividade de água, pH, acidez total titulável, sólidos solúveis totais, açúcares solúveis totais e redutores e cor. A escolha do melhor emulsificante e sua concentração foi determinada baseada nos indicadores massa específica, expansão e estabilidade. Para a secagem em leito de espuma da manga Ubá utilizou-se o aditivo Emustab ® na concentração de 2,35% estabelecido como melhor emulsificante e melhor concentração. A secagem da espuma foi realizada em secador, nas temperaturas de 50, 60, 70 e 80 °C. Foram propostos e ajustados modelos matemáticos utilizando os dados coletados da perda de água durante a secagem. As isotermas de sorção foram realizadas utilizando dessecadores com solução saturada nas temperaturas de 10, 20, 30 e 40 °C. As propriedades físico-químicas das espumas não indicaram características que impedissem a secagem em leito de espuma. O melhor emulsificante para a produção da espuma da manga Ubá foi o Emustab ® na concentração de 2,35%. O modelo matemático que melhor se ajustou aos dados da vsecagem da espuma da manga Ubá foi o Polinomial de terceiro grau, sendo este selecionado para representar a cinética de secagem. O modelo que melhor descreve as isotermas de adsorção do pó da manga Ubá foi o Sigma Copace, formando curvas características do tipo III. As propriedades físico-químicas do pó da manga Ubá indicaram boa conservação e estabilidade do pó obtido por meio da secagem em leito de espuma.The mango has significant economic importance, especially in tropical countries. This is due to its excellent flavor and aroma. The fruits of this species are highly perishable after harvesting. Thus, fruit dehydration, which decreases its perishability, becomes of great importance to increase its period of availability to the consumer. The objective of this work was to characterize the production process of Ubá powder by in foam-mat drying, determining the best emulsifier and concentration. Also, characterize the physicochemical properties of the in natura pulp, the foam and the obtained powder, to adjust different mathematical models to the experimental values of the pulp drying of the sleeve and to determine the sorption isotherms for diverse conditions of temperatures and relative humidities of the air. Ubá mango fruits were used, which were pulped in a centrifuge. Emulsifiers albumin, Emustab ® , maltodextrin and Superliga neutra ® were added to the pulp in the proportions of 0.5; 1.0; 1.5; 2.0 and 2.5% mass. To obtain the foam, the blending of the pulp with each emulsifier was subjected to stirring for 15 min in an electric mixer. The analyzes of pulp, foam and powder characterization of the Ubá mango were: water content, water activity, pH, titratable total acidity, total soluble solids, total soluble sugars and reducing and color. The choice of the best emulsifier and its concentration was determined based on the specific mass, expansion and stability indicators. For the foam-mat drying of the Ubá sleeve, the Emustab ® additive was used in the 2.35% concentration established as the best emulsifier and the best concentration. The foam was dried in a dryer at temperatures of 50, 60, 70 and 80 °C. Mathematical models were proposed and adjusted using data collected from water loss during drying. The sorption isotherms were performed using desiccators with saturated solution at temperatures of 10, 20, 30 and 40 °C. The physical-chemical properties of the foams did not indicate characteristics that would prevent foam-mat drying. The best emulsifier for the production of Ubá mango foam was Emustab ® at a concentration of 2.35%. The mathematical model that best fit the drying data of Ubá mango foam was the Third degree polynomial, which was selected to represent drying kinetics. The model that best describes the adsorption isotherms of the Ubá mango was Sigma viiCopace, forming type III characteristic curves. The physical-chemical properties of Ubá mango powder indicated good conservation and stability of the powder obtained by foam-mat drying