Positive Interactions Drive Bat Distribution in a Remote Oceanic Archipelago (Azores, Portugal)

One of the fundamental interests in ecology is understanding which factors drive species’ distribution. We aimed to understand the drivers of bat distribution and co-occurrence patterns in a remote, insular system. The two bat species known to occur in the Azores archipelago were used as a model. Echolocation calls were recorded at 414 point-locations haphazardly distributed across the archipelago. Calls were analysed and assigned to each species. Binominal generalised linear models were adjusted using different descriptors at two scales: archipelago and island. The presence of the co-occurring species was included at both scales. The results show that island isolation, habitat and climate play an essential role on the archipelago and island scales, respectively. However, the positive interaction between bat species was the most critical driver of species’ distribution at the island scale. This high co-occurrence pattern at the island scale may result from both species’ maximising foraging profit in a region where prey abundance may be highly variable. However, further research is necessary to clarify the mechanisms behind this positive interaction. Both species are threatened and lack specific management and protection measures. Maintaining this positive interaction between the two species may prove to be fundamental for their conservationinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio

Spatially explicit models for planning bat foraging habitat conservation in agricultural landscapes

Tese de doutoramento, Biologia (Ecologia), Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2013Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT, SFRH/BD/23800/2005

Laboratorio de museología en una escuela de arte en Cabo Verde. Pescar en mar abierto

Resumen: Este artículo surge a partir del contexto pedagógico en torno a la conceptualización y primera fase de implementación del Museo de la Pesca en Cabo Verde, archipiélago en el Océano Atlántico. Este contexto está promovido por el M_EIA, Instituto Universitario de Arte, Tecnología y Cultura. El M_EIA abrazó el proyecto del Museo en 2012 con equipos de estudiantes, profesores y profesionales de diversas áreas, cuestionando sus papeles, relaciones y la contribución del diseño en la expresión de las memorias del archipiélago. La herencia museológica en Cabo Verde, así como de la educación y del diseño, está marcada de forma general por tendencias occidentales normativizadas. Por ello, es preciso trabajar para provocar, a partir de cambios en la educación, mayor implicación en los discursos y prácticas en la museología. El artículo se centra en la confrontación de los conceptoshistoria-memoria, así como en la problemática de las relaciones entre las narrativas oficiales y la representación de las voces de las comunidades locales en el museo. Se presenta una lectura de los desafíos experimentados en el proceso de conceptualización y diseño del Museo de la Pesca, a través de la lente de la Nueva Museología/Museología Crítica y Pedagogía Crítica. Palabras clave: Nueva Museología,  Museología Crítica, Cabo Verde, Diseño, Pedagogía Crítica, Educación Artística, Memoria colectiva, Comunidades.Abstract: This article emerges from the pedagogical context around the conceptualisation and first stage of implementation of the Museu da Pesca (Fishing Museum) in Cape Verde, an archipelago in the Atlantic Ocean. M_EIA, University Institute of Art, Technology and Culture, started the project for the Museum in 2012, bringing together teams of students, teachers, and several professionals, questioning their roles, relations and the contribution of design/drawing in the expression of the archipelago's memories. The history of museology in Cape Verde, as well as the history of education and design/drawing, is generally marked by western normative trends. For that reason, it is necessary to work in order to provoke, through changes in education, a greater implication in the discourses and practices of museology. The article is centred in the confrontation of the concepts of history and memory, and in the relations between official narratives and the representation of the voices of local communities in the museum. We present a reading of the challenges experienced in the process of conceptualising and designing the Fishing Museum, through the lens of New Museology, Critical Museology and Critical Pedagogy. Keywords: New Museology, Critical Museology, Cape Verde, Design, Critical Pedagogy, Art Education, Collective Memory, Communitieshttp://dx.doi.org/10.7203/eari.7.8050

Political work in health: tuberculosis in Rio de Janeiro

A intervenção sobre a tuberculose no Rio de Janeiro, Brasil, revela atualmente uma intensificação e alargamento das articulações de pessoas, organizações e instituições envolvidas. Para compreender este processo, recorri ao mapeamento de arenas e mundos sociais. Os mundos sociais definem-se pela partilha de objetivos e de ações, constituindo unidades de ação coletiva. Para atingir os seus objetivos precisam de interagir com outros mundos sociais. Os espaços onde interagem sobre temas de comum interesse, mas sobre os quais têm perspetivas e até objetivos diferentes, denominam-se arenas. O estudo revelou que a arena da tuberculose no Rio de Janeiro se ampliou na última década, aumentando e diversificando os mundos sociais envolvidos, através do “trabalho político” de pessoas e organizações locais, nacionais e internacionais, isto é, através da atribuição de poder a determinadas instâncias com base na valorização ética de objetivos comuns. Este trabalho político tem vindo a implicar a interseção com as arenas do Sistema Único de Saúde e do VIH-Sida. A ampliação da arena da tuberculose redefine a própria doença e as formas de intervir sobre ela. Os apoios socioeconómicos para as/os pacientes, o tratamento de comorbidades, os direitos humanos, bem como outras questões que extravasam a perspetiva biomédica, integram agora as agendas da tuberculose. Neste processo, os intervenientes alargam também as fronteiras da ação na saúde.Intervention on tuberculosis in Rio de Janeiro, Brazil, reveals an intensification and extension of the articulations between people, organizations and institutions involved. To understand this process I mapped the arenas and social worlds present. Social worlds are unities of collective action, defined by the sharing of goals and actions. To achieve those goals they need to interact with other social worlds. The spaces where they interact on themes of their common interest, but on which they hold different perspectives and even different goals, are called arenas. The study revealed that the arena of tuberculosis in Rio de Janeiro has extended in the last decade, with more, and more diverse, social worlds involved, through the “political work” of persons and organizations, at the local, national and international levels, that is, through the attribution of power to certain entities, based on the ethical valuation of common goals. This political work is implying the intersection with the arenas of HIV-Aids and the National Health System. The extension of the tuberculosis arena redefines the disease and the ways people act on it. Social and economic support to patients, the treatment of co-morbidities, human rights, and other issues that go beyond the biomedical perspective, now integrate the agendas of tuberculosis. In this process, people also redefine the boundaries of action on health

SpaceSheep: comunicações de satélite para cenários de agricultura inteligente

The need to increase productivity in daily activities has been contributing to the development of new systems that can optimize those tasks. Within the agricultural sector, IoT solutions are allowing the autonomous monitoring of crops and animals, reducing human effort and, consequently, the cost of the final product. One of those solutions was developed under the scope of the SheepIT project, which is an animal monitoring system developed to remove weeds in vineyards by controlling the behaviour of herds. To do so, each animal is equiped with a sensorand actuator-based device (collar), which monitors and conditions its actions. The information these devices collect is periodically forwarded to an aggregator node (gateway) through fixed nodes spread around the pasture area (beacon), where is then processed and uploaded to a remote computational platform via the Internet. However, these animals typically move around extensive areas with poor or non-existent ground network coverage, which inhibits the proper communications operation of such system. This work aimed to mitigate the common lack of coverage in rural areas. To do so, a satellite communications interface was integrated into the SheepIT project and, consequently, the messages exchanged by the system were adapted and optimized to meet the constraints of this new technology. These modifications extend the SheepIT project to be able to operate in scenarios where ground network coverage is not available.A necessidade do aumento de produtividade de atividades diárias tem vindo a contribuir para o desenvolvimento de novos sistemas que consigam otimizar essas tarefas. Dentro do sector agrícola, soluções de IoT têm permitido a monitorização autónoma de plantações e animais, reduzindo o esforço humano e, consequentemente, o custo do produto final. Uma dessas soluções foi desenvolvida no âmbito do projeto SheepIT, um sistema de monitorização animal desenvolvido de forma a remover espécies infestantes em vinhas atráves do controlo do comportamento de rebanhos. Para isso, cada animal está equipado com um dispositivo com sensores e atuadores (collar), que monitoriza e condiciona as suas ações. A informação recolhida por estes dispositivos é enviada periodicamente para um nó agregador (gateway) através de nós fixos espalhados pela área de pasto (beacon), onde é então processada e transferida para uma plataforma computacional remota atráves da Internet. Todavia, estes animais deslocam-se tipicamente por extensas áreas com cobertura de rede terrestre fraca ou inexistente, inibindo o correto funcionamento de tal sistema. Este trabalho visou mitigar a ausência de cobertura comum em áreas rurais. Para tal, uma interface de comunicações satélite foi integrada no projeto SheepIT e, consequentemente, as mensagens trocadas pelo sistema foram adaptadas e otimizadas de forma a responder às limitações desta nova tecnologia. Estas modificações extendem o projeto SheepIT para operar em cenários em que a cobertura de rede terrestre não está disponível.Mestrado em Engenharia de Computadores e Telemátic

Exploring the role of proteolysis in Extracellular Matrix remodeling: Links to Chronic Obstructive Pulmonary Disease and Lung Cancer

Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) and lung cancer (LC) are two complex disorders, currently representing the 4th cause of death and the most lethal cancer in Western countries, respectively. A mechanistic link between COPD and LC has been proposed due to an overlap of risk factors of both diseases, where uncontrolled proteolysis may be a critical event in their progress and outcomes. The activity of proteases, their substrates and inhibitors have a significant impact in the extracellular matrix (ECM) remodeling, which may ultimately lead to the development of COPD and LC. Despite the identification of several susceptibility factors in both diseases, there is still many aspects of their pathogenesis that require further elucidation. To address this issue, for our study, we selected 73 proteolysis genes, based on their roles in ECM remodeling, lung expression and/or presence in lung samples and former reports by Genome Wide Association Studies. In a first analysis, we took benefit of The Cancer Genome Atlas on-line database regarding clinical, epidemiological and mutational (somatic and germline) information for two common LC subtypes (adenocarcinoma and squamous cell carcinoma). We found that somatic mutability differs from germline trends and between the two LC subtypes, possibly affecting ECM in distinct ways. Then, we screened by means of PCR-based and Sanger sequencing techniques SERPINB3/B4 and CTSG genes, in a small cohort of COPD and LC patients from which blood and bronchoalveolar lavage fluid samples were collected. Even though, we could not detect any somatic mutation in our sample, for SERPINB3 we detect a considerable number of low-frequency variants in COPD cases in particular, suggesting a misfunction of this gene as a possible genetic risk factor for lung disease. Additional studies in larger cohorts of patients and controls are necessary to confirm this hypothesis

Analogues of the antimicrobial peptide BP214

Trabalho Final de Mestrado Integrado, Ciências Farmacêuticas, Universidade de Lisboa, Faculdade de Farmácia, 2017The excessive and uncontrolled use of antibiotics over the last decades has contributed strongly to the increase in the number of resistant microorganisms and with this, the increase in the number of deaths due to intractable infections and an increase of the Healthcare expenditure. For economic and regulatory reasons, the development of new antibiotics has also decreased significantly. Thus, the search for new therapeutic alternatives to conventional antibiotics led researchers to focus on the study of antimicrobial peptides. In addition to antimicrobial activity, these peptides have the ability to exhibit antibiofilm, immunomodulatory and anticancer activities. Recently a previous study reported BP214 peptide, an analogue of the cecropin-α-melittin hybrid BP100, which showed a high antimicrobial potential against colistin-resistant Acinetobacter baumannii strains and other relevant bacterial agents and a relatively low hemolytic activity. In order to identify the most important amino acids for BP214 activity, a D-Alanine scan was performed. Thus, eleven new analogues of the BP214 peptide were synthesized through the solid-phase peptide synthesis. Subsequently, the synthesized peptides were analysed and purified using MALDI-TOF mass spectrometry and reversed-phase HPLC. Finally, its antimicrobial and hemolytic activities were determined. In the analogues where a single lysine or arginine was replaced by alanine, an improvement in antimicrobial activity against most bacterial strains was verified. On the other hand, with the substitution of a single leucine, isoleucine, phenylalanine or tyrosine, the analogues showed a reduced antimicrobial potential compared to BP214. In addition, all analogues which showed antimicrobial activities as good or better than the BP214 peptide also showed higher hemolytic toxicities. From the information obtained with reversed-phase HPLC, it was still possible to relate the retention time of each peptide to its hydrophobic character. Thus, the influence of the hydrophobicity on antimicrobial and hemolytic activities and consequently on cell selectivity was ascertained. All analogues that showed a superior hydrophobic character to BP214 were also those that showed superior antimicrobial and hemolytic activities. Before presenting the results, a detailed procedure of all the methods performed was also included in this dissertation.O uso excessivo e descontrolado de antibióticos nas últimas décadas tem contribuído fortemente para o aumento do número de microrganismos resistentes e com isto, o aumento do número de mortes por infeções intratáveis e um aumento nas despesas para a saúde. Por questões económicas e regulamentares, o desenvolvimento de novos antibióticos tem também diminuído significativamente. Assim, a procura de novas alternativas terapêuticas aos antibióticos convencionais levou investigadores a focarem-se no estudo dos péptidos antimicrobianos. Os péptidos antimicrobianos são pequenas moléculas anfipáticas e catiónicas com elevada seletividade e especificidade, que existem naturalmente nos seres vivos e que contribuem para a defesa imunitária dos mesmos. Como a superfície das células bacterianas é carregada negativamente, os péptidos antimicrobianos, com carga positiva, são atraídos electrostaticamente, provocando a disrupção da membrana bacteriana e, assim, a morte celular. Atualmente, inúmeros péptidos antimicrobianos já foram identificados e alguns mesmo já se encontram aprovados como fármacos. Para além da atividade antimicrobiana, estes péptidos têm a capacidade de exibir atividades antibiofilme, imunomodulatória e anticancerígena. Contudo, a baixa biodisponibilidade, o curto tempo de semivida, a dificuldade na purificação e a toxicidade hemolítica que apresentam tornam essencial a síntese para a otimização destas estruturas. Recentemente foi reportado o péptido BP214 (kklfkkilryl-NH2), um análogo do híbrido cecropina-α-melitina BP100 (KKLFKKILKYL-NH2), que mostrou um elevado potencial antimicrobiano contra estirpes de Acinetobacter baumannii resistentes à colistina e outros agentes bacterianos relevantes, para além de uma atividade hemolítica relativamente reduzida na presença de altas concentrações de péptido. Com o objetivo de identificar quais os aminoácidos mais importantes para a atividade do BP214, procedeu-se à realização de um scan de D-Alanina, ou seja, à substituição de cada um dos aminoácidos da sequência peptídica do BP214 pelo aminoácido D-Alanina. Assim, através da síntese de péptidos em fase sólida, foi então possível sintetizar onze novos análogos do péptido BP214. A síntese em fase sólida é o método de escolha na síntese de péptidos, em particular a estratégia Fmoc/tBu, a mesma estratégia utilizada no presente estudo. Nesta síntese em fase sólida, um primeiro aminoácido, protegido pelo grupo Fmoc no grupo α-amina, é acoplado através do resíduo C-terminal a um suporte sólido polimérico, a resina. De seguida, a desproteção da amina permite o ataque nucleofílico deste grupo ao ácido carboxílico do segundo aminoácido, com a formação de uma ligação amida. O grupo Fmoc é lábil a bases, por isso é removido através do tratamento com piperidina, uma base forte. Este ciclo repete-se até que todo o péptido desejado seja obtido. Os péptidos sintetizados neste trabalho foram posteriormente analisados e purificados usando o HPLC em fase-reversa, de modo a obter uma purificação de pelo menos 95%. E, de forma a identificar e determinar a massa molecular dos mesmos, foi utilizada a espectrometria de massa MALDI-TOF. Em anexo, são apresentados os respetivos cromatogramas e espectros. Por fim, as suas atividades antimicrobiana e hemolítica foram determinadas. A resistência antimicrobiana está sobretudo associada a bactérias Gram-negativas, por essa razão, a atividade antimicrobiana dos análogos do péptido BP214 foi testada contra estirpes de Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae e Acinetobacter baumannii, todas bactérias Gram-negativas clinicamente revelantes. Utilizando a microdiluição em caldo, um dos métodos mais usados para avaliar o potencial antimicrobiano de fármacos, cada uma das bactérias selecionadas foi inoculada com diferentes concentrações dos péptidos em estudo e as suas concentrações mínimas inibitórias foram determinadas. Contudo, não basta apenas que os péptidos antimicrobianos apresentem elevada atividade bactericida para que possam ser aplicados na prática clínica. É também essencial que demonstrem baixa toxicidade contra as células hospedeiras, em particular, os eritrócitos. Para a determinação da atividade hemolítica, diferentes concentrações de péptido foram também incubadas com uma suspensão de glóbulos vermelhos e, a partir da hemoglobina libertada, a percentagem de hemólise foi calculada. Nos análogos em que se procedeu à substituição de uma única lisina ou arginina pelo aminoácido alanina, verificou-se uma melhoria na atividade antimicrobiana contra a maioria das estirpes bacterianas, com concentrações mínimas inibitórias inferiores a 8 µg/mL. Por outro lado, com a substituição de uma única leucina, isoleucina, fenilalanina ou tirosina, os análogos demonstraram uma diminuição no potencial antimicrobiano em relação ao péptido BP214, em particular a substituição da leucina na posição 11, que revelou concentrações mínimas inibitórias superiores a 128 µg/mL na generalidade dos casos. Estes resultados sugerem que os aminoácidos lisina e arginina não são cruciais para a atividade do BP214 e que os aminoácidos leucina, isoleucina, fenilalanina e tirosina são importantes para a atividade deste mesmo péptido. Para além disso, todos os análogos que revelaram concentrações mínimas inibitórias tão boas ou melhores que o péptido BP214, apresentaram também uma toxicidade hemolítica superior. Também se observou que, de todas as estirpes bacterianas selecionadas, as piores concentrações mínimas inibitórias (≥ 34 µg/mL) dos análogos do péptido BP214 foram obtidas para a Pseudomonas aeruginosa. Este resultado já era de esperar, uma vez que a Pseudomonas aeruginosa é um microrganismo que adquire facilmente resistências. A partir da informação obtida no HPLC de fase reversa, foi ainda possível relacionar o tempo de retenção de cada péptido sintetizado com o seu caráter hidrofóbico. Deste modo, averiguou-se a influência da hidrofobicidade nas atividades antimicrobiana e hemolítica e consequentemente, na seletividade celular. Todos os análogos que mostraram um caráter hidrofóbico superior ao péptido BP214, foram também os que revelaram atividades antimicrobianas e hemolíticas superiores. Com isto concluiu-se que a hidrofobicidade contribui para o aumento da atividade antimicrobiana e da toxicidade hemolítica e assim, para a redução da seletividade celular. Assim, apesar de alguns dos análogos do péptido BP214 terem-se revelado bastante promissores quanto ao seu potencial antimicrobiano, também mostraram uma toxicidade significativa que torna pouco provável a continuação dos seus estudos e a sua aplicação futura no tratamento de doenças infeciosas. Antes da apresentação dos resultados foi também incluído, nesta dissertação, um procedimento detalhado de todos os métodos realizados para atingir os objetivos deste trabalho, com base nos protocolos fornecidos e utilizados pelo laboratório

Brazil: fisherwomen, a backbreaking struggle

The abject working conditions of the shellfish fisherwomen on the Paraná coast of Brazil call for a revaluation of their work to guarantee them rights and benefits

Unstable rights

People with multidrug-resistant tuberculosis in Rio de Janeiro accessed basic rights of citizenship, including socioeconomic rights and even formal citizenship, through their use of the public health care system. Access to those rights, however, was unstable and this had life-and-death implications. I argue that patients could only fulfil their right to live after it had been jeopardised by the absence of basic socioeconomic rights that rendered life precarious. Thus, the right to live is not a prerequisite of other rights, but rather cannot be fulfilled without them. I discuss the politics of life in this context based on ethnographic fieldwork in an outpatient clinic for multidrug-resistant tuberculosis and interviews with patients, health professionals, and activists, all conducted in 2009 and 2010 in Rio de Janeiro