Le Forum, Vol. 45 #4

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Viral to metazoan marine plankton nucleotide sequences from the Tara Oceans expedition

A unique collection of oceanic samples was gathered by the Tara Oceans expeditions (2009-2013), targeting plankton organisms ranging from viruses to metazoans, and providing rich environmental context measurements. Thanks to recent advances in the field of genomics, extensive sequencing has been performed for a deep genomic analysis of this huge collection of samples. A strategy based on different approaches, such as metabarcoding, metagenomics, single-cell genomics and metatranscriptomics, has been chosen for analysis of size-fractionated plankton communities. Here, we provide detailed procedures applied for genomic data generation, from nucleic acids extraction to sequence production, and we describe registries of genomics datasets available at the European Nucleotide Archive (ENA, www.ebi.ac.uk/ena). The association of these metadata to the experimental procedures applied for their generation will help the scientific community to access these data and facilitate their analysis. This paper complements other efforts to provide a full description of experiments and open science resources generated from the Tara Oceans project, further extending their value for the study of the world's planktonic ecosystems

L’enseignement et l’apprentissage de la lecture aux différents niveaux de la scolarité

S'inscrivant dans la continuité de publications précédentes, cet ouvrage réunit onze articles qui interrogent la progression de l'enseignement de la lecture au long de la scolarité obligatoire dans les quatre pays francophones (Belgique, France, Québec, Suisse). Plusieurs de ces articles portent sur différents cycles d'enseignement, dont ils soulignent les spécificités et les continuités. D'autres abordent la question de la progression en confrontant textes institutionnels et pratiques effectives, ou encore en comparant différents programmes nationaux. Une partie importante des articles, enfin, traite de situations d’apprentissage effectives ou de performances d’élèves, fournissant ainsi des savoirs empiriques nouveaux. L’ouvrage rassemble des contributions d’équipes de recherche confirmées ou qui travaillent depuis plusieurs années sur le sujet. Plusieurs de ces études constituent dès lors des recherches d’envergure, qui, à bien des égards, entrent en dialogue et se complètent mutuellement. Témoin d’un courant important de la recherche actuelle en didactique du français, ce livre n’esquive aucune des problématiques soulevées par le sujet, qu’il s’agisse de l’apprentissage continué de la lecture entre les différents cycles, de la progression curriculaire du lecteur, des comparaisons internationales de pratiques d’enseignement et d’apprentissage, ou encore des différents types de compétences mobilisées en lecture. Il constitue à ce titre un ouvrage de référence pour tout chercheur qui s’intéresse à la progression en lecture et désire s’appuyer sur les travaux les plus récents en la matière

Niche-expressed Galectin-1 is involved in pre-B acute lymphoblastic leukemia relapse through pre-B cell receptor activation

B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL) reflects the malignant counterpart of developing B cells in the bone marrow (BM). Despite tremendous progress in B-ALL treatment, the overall survival of adults at diagnosis and patients at all ages after relapse remains poor. Galectin-1 (GAL1) expressed by BM supportive niches delivers proliferation signals to normal pre-B cells through interaction with the pre-B cell receptor (pre-BCR). Here, we asked whether GAL1 gives non-cell autonomous signals to pre-BCR+ pre-B ALL, in addition to cell-autonomous signals linked to genetic alterations. In syngeneic and patient-derived xenograft (PDX) murine models, murine and human pre-B ALL development is influenced by GAL1 produced by BM niches through pre-BCR-dependent signals, similarly to normal pre-B cells. Furthermore, targeting pre-BCR signaling together with cell-autonomous oncogenic pathways in pre-B ALL PDX improved treatment response. Our results show that non-cell autonomous signals transmitted by BM niches represent promising targets to improve B-ALL patient survival