Plant regeneration of tea (Camellia sinensis) by in vitro culture of meristems, axillary buds and uninodal segments

Tres tipos de explantes de dos clones ( C H 1 4 I N TA y C H 3 1 8 I N TA ) d e t é (Camellia sinensis (L.) O. Kuntze) fueron evaluados para su regeneración in vitro, bajo la influencia de dos citocininas (BAP y CIN) y una giberelina (AG3). Previa desinfección, con etanol 70% (1 minuto) e hipoclorito de sodio 1,5% (20 minutos) y tres enjuagues con agua destilada estéril, los explantes fueron aislados y cultivados en los distintos medios de cultivo. Las mejores respuestas en formación de vástagos se registraron con los segmentos uninodales de ambos clones cultivados en el medio ½ MS + 1 mg/L de BAP o con el cultivo de yemas axilares del clon CH 14 INTA en el medio ½ MS + 1 mg/L de BAP o del clon CH 318 INTA en el medio ½ MS + 1 mg/L BAP + 1 mg/L AG3. Los mejores resultados con el empleo de meristemas caulinares se obtuvieron en el medio ½ MS + 1 mg/L de CIN y 1 mg/L de AG3. Los vástagos obtenidos fueron enraizados mediante su cultivo en ¼ MS + 6 mg/L de IBA.Plants of two clones (CH 14 INTA and CH 318 INTA) of tea (Camellia sinensis (L.) O. Kuntze) were regenerated by in vitro culture of three types of explants disinfected by immersion in 70% ethanol (1 min) and 1.5% sodium hypochlorite (20 min). The best medium for shoot regeneration from uninodal segments, for both clones, as well as for axillary buds of CH 14 INTA clone was ½ MS + 1 mg/L BAP. While the best medium for axillary buds of CH 318 clone was ½ MS + 1 mg/L BAP + 1 mg/L AG3. For meristems culture, the best medium, for both clones was ½ MS + 1 mg/L KIN + 1 mg/L AG3. Rooting of regenerated shoots were achieved by culture them on ¼ MS + 6 mg/L IBA.Fil: Molina, Sandra P.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (Argentina). Estación Experimental Agropecuaria Cerro AzulFil: Pérez, María Laura. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias AgrariasFil: Rey, Hebe Y.. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias AgrariasFil: Mroginski, Luis A.. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Ciencias Agraria

Novel aromatic ring-hydroxylating dioxygenase genes from coastal marine sediments of Patagonia

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), widespread pollutants in the marine environment, can produce adverse effects in marine organisms and can be transferred to humans through seafood. Our knowledge of PAH-degrading bacterial populations in the marine environment is still very limited, and mainly originates from studies of cultured bacteria. In this work, genes coding catabolic enzymes from PAH-biodegradation pathways were characterized in coastal sediments of Patagonia with different levels of PAH contamination.</p> <p>Results</p> <p>Genes encoding for the catalytic alpha subunit of aromatic ring-hydroxylating dioxygenases (ARHDs) were amplified from intertidal sediment samples using two different primer sets. Products were cloned and screened by restriction fragment length polymorphism analysis. Clones representing each restriction pattern were selected in each library for sequencing. A total of 500 clones were screened in 9 gene libraries, and 193 clones were sequenced. Libraries contained one to five different ARHD gene types, and this number was correlated with the number of PAHs found in the samples above the quantification limit (<it>r </it>= 0.834, <it>p </it>< 0.05). Overall, eight different ARHD gene types were detected in the sediments. In five of them, their deduced amino acid sequences formed deeply rooted branches with previously described ARHD peptide sequences, exhibiting less than 70% identity to them. They contain consensus sequences of the Rieske type [2Fe-2S] cluster binding site, suggesting that these gene fragments encode for ARHDs. On the other hand, three gene types were closely related to previously described ARHDs: archetypical <it>nahAc</it>-like genes, <it>phnAc</it>-like genes as identified in <it>Alcaligenes faecalis </it>AFK2, and <it>phnA1</it>-like genes from marine PAH-degraders from the genus <it>Cycloclasticus</it>.</p> <p>Conclusion</p> <p>These results show the presence of hitherto unidentified ARHD genes in this sub-Antarctic marine environment exposed to anthropogenic contamination. This information can be used to study the geographical distribution and ecological significance of bacterial populations carrying these genes, and to design molecular assays to monitor the progress and effectiveness of remediation technologies.</p

Prospecting biotechnologically-relevant monooxygenases from cold sediment metagenomes: An in silico approach

Source at https://doi.org/10.3390/md15040114.The goal of this work was to identify sequences encoding monooxygenase biocatalysts with novel features by in silico mining an assembled metagenomic dataset of polar and subpolar marine sediments. The targeted enzyme sequences were Baeyer–Villiger and bacterial cytochrome P450 monooxygenases (CYP153). These enzymes have wide-ranging applications, from the synthesis of steroids, antibiotics, mycotoxins and pheromones to the synthesis of monomers for polymerization and anticancer precursors, due to their extraordinary enantio-, regio-, and chemo- selectivity that are valuable features for organic synthesis. Phylogenetic analyses were used to select the most divergent sequences affiliated to these enzyme families among the 264 putative monooxygenases recovered from the ~14 million protein-coding sequences in the assembled metagenome dataset. Three-dimensional structure modeling and docking analysis suggested features useful in biotechnological applications in five metagenomic sequences, such as wide substrate range, novel substrate specificity or regioselectivity. Further analysis revealed structural features associated with psychrophilic enzymes, such as broader substrate accessibility, larger catalytic pockets or low domain interactions, suggesting that they could be applied in biooxidations at room or low temperatures, saving costs inherent to energy consumption. This work allowed the identification of putative enzyme candidates with promising features from metagenomes, providing a suitable starting point for further developments

Neoplasms of minor salivary gland - Retrospective study

Objectivos: Análise descritiva dos casos de neoplasias das glândulas salivares minor tratados no serviço de Otorrinolaringologia do IPO de Lisboa, e comparação dos resultados com o que está descrito na literatura. Metodologia: Análise retrospectiva de todos os casos com diagnóstico histológico de neoplasia das glândulas salivares minor das cavidade nasal, cavidade oral, laringe e faringe, que ocorreram durante o período entre Outubro de 1992 a Novembro de 2015, tratados no serviço de Otorrinolaringologia do Instituto Português de Oncologia de Lisboa, Francisco Gentil. Resultados : Foram documentados 58 casos de neoplasia das glândulas salivares minor, 60% ocorreram em indivíduos do sexo feminino e 40% ocorreram no sexo masculino, com um média de idades de 57 anos. O sintoma mais frequente na cavidade nasal foi a obstrução nasal, na cavidade oral a presença de úlcera ou tumefacção, e na orofaringe a dor. Os tipos histológicos mais comuns foram o carcinoma adenoide quístico (33%), o adenocarcinoma polimórfico (24%) e o carcinoma mucoepidermóide (22%). A orofaringe foi o local mais comum destas neoplasias. A cirurgia foi o tratamento de 1ª linha em 93% dos casos e 52% realizaram radioterapia adjuvante. A recidiva ocorreu em 20% dos casos. A mortalidade relacionada com o tumor foi de 7%. Conclusões: As neoplasias das glândulas salivares minor são pouco frequentes, sendo as mais comuns o carcinoma adenoide quístico, o adenocarcinoma pleomórfico e o carcinoma mucoepidermóide. O tratamento cirúrgico é efetivo isoladamente em muitos casos. A mortalidade está relacionada com o estadio e com o tipo histológico do tumor.info:eu-repo/semantics/acceptedVersio

Regeneración de plantas de té (Camellia sinensis) por cultivo invitro de meristemas, yemas axilares y segmentos uninodales *

Plants of two clones (CH 14 INTA and CH 318 INTA) of tea (Camellia sinensis (L.) O. Kuntze) were regenerated by in vitro culture of three types of explants disinfected by immersion in 70% ethanol (1 min) and 1.5% sodium hypochlorite (20 min). The best medium for shoot regeneration from uninodal segments, for both clones, as well as for axillary buds of CH 14 INTA clone was ½ MS + 1 mg/L BAP. While the best medium for axillary buds of CH 318 clone was ½ MS + 1 mg/L BAP + 1 mg/L AG3. For meristems culture, the best medium, for both clones was ½ MS + 1 mg/L KIN + 1 mg/L AG3. Rooting of regenerated shoots were achieved by culture them on ¼ MS + 6 mg/L IBA. &nbsp;Tres tipos de explantes de dos clones ( C H 1 4 I N TA y C H 3 1 8 I N TA ) d e t é (Camellia sinensis (L.) O. Kuntze) fueron evaluados para su regeneración in vitro, bajo la influencia de dos citocininas (BAP y CIN) y una giberelina (AG3). Previa desinfección, con etanol 70% (1 minuto) e hipoclorito de sodio 1,5% (20 minutos) y tres enjuagues con agua destilada estéril, los explantes fueron aislados y cultivados en los distintos medios de cultivo. Las mejores respuestas en formación de vástagos se registraron con los segmentos uninodales de ambos clones cultivados en el medio ½ MS + 1 mg/L de BAP o con el cultivo de yemas axilares del clon CH 14 INTA en el medio ½ MS + 1 mg/L de BAP o del clon CH 318 INTA en el medio ½ MS + 1 mg/L BAP + 1 mg/L AG3. Los mejores resultados con el empleo de meristemas caulinares se obtuvieron en el medio ½ MS + 1 mg/L de CIN y 1 mg/L de AG3. Los vástagos obtenidos fueron enraizados mediante su cultivo en ¼ MS + 6 mg/L de IBA

Neoplasms of minor salivary gland - Retrospective study

Objectivos: Análise descritiva dos casos de neoplasias das glândulas salivares minor tratados no serviço de Otorrinolaringologia do IPO de Lisboa, e comparação dos resultados com o que está descrito na literatura. Metodologia: Análise retrospectiva de todos os casos com diagnóstico histológico de neoplasia das glândulas salivares minor das cavidade nasal, cavidade oral, laringe e faringe, que ocorreram durante o período entre Outubro de 1992 a Novembro de 2015, tratados no serviço de Otorrinolaringologia do Instituto Português de Oncologia de Lisboa, Francisco Gentil. Resultados : Foram documentados 58 casos de neoplasia das glândulas salivares minor, 60% ocorreram em indivíduos do sexo feminino e 40% ocorreram no sexo masculino, com um média de idades de 57 anos. O sintoma mais frequente na cavidade nasal foi a obstrução nasal, na cavidade oral a presença de úlcera ou tumefacção, e na orofaringe a dor. Os tipos histológicos mais comuns foram o carcinoma adenoide quístico (33%), o adenocarcinoma polimórfico (24%) e o carcinoma mucoepidermóide (22%). A orofaringe foi o local mais comum destas neoplasias. A cirurgia foi o tratamento de 1ª linha em 93% dos casos e 52% realizaram radioterapia adjuvante. A recidiva ocorreu em 20% dos casos. A mortalidade relacionada com o tumor foi de 7%. Conclusões: As neoplasias das glândulas salivares minor são pouco frequentes, sendo as mais comuns o carcinoma adenoide quístico, o adenocarcinoma pleomórfico e o carcinoma mucoepidermóide. O tratamento cirúrgico é efetivo isoladamente em muitos casos. A mortalidade está relacionada com o estadio e com o tipo histológico do tumor.info:eu-repo/semantics/acceptedVersio

Primary mucosal malignant melanoma of the head and neck: experience from the Portuguese Institute of Oncology in Lisbon

Introdução: O melanoma maligno da mucosa (MMM) é uma doença rara com mau prognóstico. Material e Métodos: Estudo retrospetivo de 32 doentes do Instituto Português de Oncologia Francisco Gentil de Lisboa com MMM da cabeça e pescoço, no período de 1998 a 2012. Resultados: Dos 32 casos analisados a idade média foi de 70 anos. O tumor primário localizou-se na cavidade nasal e seios peri-nasais em 24 doentes e na cavidade oral em 8 casos. A maioria dos doentes (23) foi submetida a tratamento cirúrgico. Destes, 16 foram propostos para terapêutica complementar com Radioterapia. O tempo de seguimento variou de 26 dias a 10 anos. A sobrevida aos 5 anos foi de 18%. Conclusões: A maioria dos doentes apresentou um estadio avançado na altura do diagnóstico e, apesar dos tratamentos instituídos, verificou-se uma elevada mortalidade. O tratamento de escolha é a cirurgia. O papel da radioterapia continua a ser controverso.Introduction: Mucosal melanoma of the head and neck is an uncommon disease with poor prognosis. Material and Methods: Retrospective chart review of 32 patients treated for head and neck mucosal melanoma in a cancer center from 1998 to 2012. Results: There were 32 cases with an average age of 70. The primary tumor was located in the nasal cavity in 24 patients and in the oral cavity in 8 patients. The majority of patients (23) underwent surgical treatment. Of these, 16 were proposed for adjunctive therapy with radiotherapy. Follow-up time ranged between 26 days to 10 years. The five year survival rate was 18%. Conclusions: The majority of patients had an advanced stage at diagnosis and despite the treatments here was a high rate of mortality. The treatment of choice is surgery. The role of radiation therapy remains controversial

Outcomes for patients referred to a head and neck cancer center

Os tumores da cabeça e pescoço (TCP) associam-se a elevada morbilidade e mortalidade. A referenciação atempada assume particular importância na evolução clínica. No intuito de avaliar a evolução dos doentes observados em consulta de Otorrinolaringologia “Oncológica”, procedeu-se a um estudo dos doentes com TCP referenciados ao Instituto Português de Oncologia (IPO) de Lisboa no ano 2008. Dos 454 doentes observados, a maioria era do sexo masculino (86%) com idade média 60 anos. Os tumores mais comuns foram laríngeos (36%), a maioria (69%) em estadio avançado. A cirurgia foi o tratamento primário em 60%. O intervalo médio de tempo entre primeira consulta e tratamento foi 75 dias, e a sobrevida global aos 2 anos 66%. A maioria dos doentes apresentava tumores avançados aquando da referenciação, o que comprometeu a sobrevida e o controlo locorregional, apesar do início rápido dos tratamentos. Políticas de saúde pública deveriam ser implementadas para melhoria da educação para a saúde, prevenção e referenciação destes doentes.Head and neck cancer is related to high morbidity and mortality. Early referral is particularly important. We performed a retrospective study concerning all patients referred to the head and neck consultation of Lisbon’s Instituto Português Oncologia over the year of 2008. Most of the 454 patients observed were male (86%), with a mean age of 60 years. The most common cancer was laryngeal (36%), and most of the tumors (69%) were advanced. Surgery and adjuvant radiotherapy were used in 60% of patients. The average time elapsed between first appointment and treatment was 75 days. The overall 2-year survival rate was 66%. Most of our patients had advanced tumors at the time of referral. Despite the early beginning of treatment at our center, survival, loco-regional control and treatment options are compromised. Public health policies should be developed to improve public health education regarding head and neck cancer prevention and early referral

Endoscopic approach to nasal tumors: our experience in IPOLFG

Introdução: Os tumores nasais são, classicamente, abordados pela via externa mas recentemente tem-se optado, também, pela via endoscópica. No entanto, em tumores localmente avançados, poderá não ser possível a remoção completa. Material e métodos: Foram analisados os processos clínicos dos 14 doentes com tumor das fossas nasais removido por via endoscópica no IPOLFG entre 2005 e 2012. Resultados: Dos 14 doentes, 8 apresentavam tumor maligno e 5 tumor benigno. Não houve preponderância de nenhum tipo histológico. 7 doentes realizaram RT adjuvante e 1 foi submetido a esvaziamento ganglionar cervical ipsilateral. Foram registadas 2 complicações cirúrgicas: 1 fístula de LCR e 1 complicação minor. Apenas 2 doentes recidivaram, recorrendo-se à via externa em 1. Conclusões: A abordagem de tumores nasais por via endoscópica é uma opção eficaz mas é necessária uma correta avaliação da extensão tumoral para decisão da via cirúrgica a utilizar, para remoção completa e obtenção de margens livres.Introduction:The nasal tumors are classically addressed by external but, recently, also endoscopically. However, in locally advanced tumors, it may not be possible to achieve complete removal. Material and methods: We analyzed the medical records of 14 patients with nasal fossa tumor removed endoscopically in IPOLFG between 2005 and 2012. Results: Of the 14 patients, 8 had malignant tumor and 5 benign. There was no preponderance of any histological type. 7 patients underwent adjuvant RT and 1 underwent ipsilateral cervical lymph node dissection. 3 surgical complications were recorded: 1 CSF fistula and 1 minor complication. Only 2 patients relapsed, with the need to use the external approach in 1. Conclusions: The endoscopic approach to nasal tumors is an effective option but it requires an accurate assessment of tumor extension to decide the approach for complete removal and clear margins

Parapharyngeal space tumors: a 10 year experience of IPO-LFG

Introdução: As neoplasias do espaço parafaríngeo são raras, representando apenas 0,5% dos tumores da cabeça e pescoço. A maioria são benignas, mas uma ampla variedade de patologias benignas e malignas podem ser encontradas neste espaço, o que cria desafios complexos de diagnóstico e tratamento. Objetivo: Descrever e analisar uma série de casos de neoplasias primárias do espaço parafaríngeo tratadas no Instituto Português de Oncologia de Lisboa Francisco Gentil (IPOLFG). Material e métodos: Estudo retrospetivo, com recolha e análise dos dados dos processos clínicos de tumores primários do espaço parafaríngeo, que foram diagnosticados ou referenciados ao IPOLFG entre 1 de Janeiro de 2003 e 31 de Dezembro de 2013. Resultados: Foram incluídos 38 doentes. A idade mediana foi de 52 anos (Âmbito Interquartil: 40-63 anos). Dez (26,3%) doentes eram assintomáticos. O sintoma mais comum à apresentação foi a sensação de corpo estranho orofaríngeo (23,7%) e o achado mais frequente foi um abaulamento orofaríngeo (78,4%). Todos os doentes fizeram exames de imagem pré-operatórios: 94,7% tomografia computorizada e 68,4% ressonância magnética. A citologia aspirativa foi realizada em 39,5%. 31 tumores eram benignos (81,6%), sendo os mais frequentes os adenomas pleomórficos (58,1%). 7 eram malignos (18,4%), com os carcinomas exadenomas pleomórficos (28,6%) e os linfomas (28,6%) sendo os mais comuns. 36 doentes (94,7%) foram submetidos a tratamento cirúrgico primário; os outros 2 doentes (5,3%) receberam tratamento não cirúrgico, com quimioterapia e quimioradioterapia, respectivamente. A abordagem cervical foi a mais utilizada (80%). A mandibulotomia foi necessária em apenas 5,7%. A complicação mais frequente foi a neuropatia de pares cranianos de novo, identificada em 22,2%. Destes, 75% foram sequela da resseção de tumores neurogénicos. Todas as neuropatias que resultaram da resseção de tumores não neurogénicos foram transitórias. O follow-up mediano foi de 6,5 anos. A taxa de recorrência foi de 13,5%. Conclusões: Os tumores do espaço parafaríngeo requerem um elevado índice de suspeição para serem diagnosticados num estadio precoce. A resseção cirúrgica completa é o principal tratamento. A abordagem cirúrgica deve ser selecionada caso a caso, mas a cervical fornece um excelente acesso à maioria dos tumores deste espaçoIntroduction: Parapharyngeal space neoplasms are rare, accounting for only 0.5% of head and neck tumors. The majority of PPS tumors are benign, but a wide spectrum of pathologies, both benign and malignant, has been encountered in this region. This range of histopathologies in combination with the complex anatomy of the parapharyngeal space creates complex diagnostic and management challenges. Objective: To describe and analyze a case series of primary parapharyngeal space neoplasms at Instituto Português de Oncologia de Lisboa Francisco Gentil (IPOLFG). Methods: Retrospective review of medical records of patients with parapharyngeal space neoplasms, diagnosed or referred to IPOLFG between 1st of January of 2003 and 31st of December of 2013. Results: 38 patients were included. The median age was 52 years (Interquartile range 40-63). 10 patients (26.3%) were asymptomatic. The most common symptom was an oropharyngeal lump sensation (23.7%). All patients had preoperative imaging: 94.7% computed tomography and 68.4% magnetic resonance image. 39.5% underwent fineneedle aspiration biopsy. 31 tumors were benign (81.6%), with pleomorphic adenomas comprising the majority (58.1%). 7 were malignant (18.4%), with carcinoma ex pleomorphic adenoma (28.6%) and lymphoma (28.6%) being the most common. 36 patients (94.7%) underwent primary surgical management; the other 2 patients (5,3%) were treated with chemotherapy and chemoradiotherapy, respectively. The cervical approach was the most common (80%). A mandibulotomy was required in just 5.7% of primary cases. The most frequent complication was cranial neuropathy, identified in 22,2%. Of these, 75% were sequelae from resection of neurogenic tumors. Median follow-up was 6.5 years. Conclusion: PPS tumors require a high index of suspicion to diagnose them at an early stage. Complete surgical resection is the mainstay of treatment. The optimum surgical approach needs to be selected on an individual basis, but the cervical approach is safe and effective for most PPS neoplasms