Quaternary palynomorph fromthe valley of the river San Eugenio (Risaralda, Colombia)

ABSTRACT: Quantitative analysis of the palynological observations in an archaeological settlement between Late Pleistocene to Early Holocene in Santa Rosa de Cabal, Risaralda Colombia. A total of 71 samples were analysed over volcanic soils La pochola01 (47 samples) and La pochola02 (25 samples). The radiocarbon result dated the oldest simple which is 13.540±60 years B.P in the 105 cm (Late Pleistocene) and the earliest simple which was 6743±45 years B.P in the 57 cm, (Early Holocene). Diversified, well preserved palynofloras were recognized. A total of 61 species were described, including species of the, Pteridophytos (11 species), Pinopsida (1species) and Angiosperm (50species). This paper aims to contribute an increase to the knowledge of the Quaternary palynoflora in the middle Cauca.RESUMEN: Un análisis cualitativo de las observaciones palinológicas realizadas sobre un yacimiento arqueológico entre el Pleistoceno tardío hasta el Holoceno temprano sobre Santa rosa de Cabal, Risaralda Colombia fue llevado a cabo como parte de una reconstrucción paleoecológica, dentro de la cual se analizaron un total de 71 muestras a partir de dos núcleos suelos volcánicos, La pochola 01 (47 muestras) y la pochola 02 (25 muestras).Con base en los datos de 14C obtenidos de la Pochola 01 se pudo establecer que la edad más antigua es de 13.540±60 años A.P, en los 105 cm (Pleistoceno tardío) y la edad más reciente 6743±45 años a.P en los 57 cm, (Holoceno medio). Los resultados muestran que la preservación de los granos de polen en suelos volcánicos es alta,la diversidad y buena preservación. Un total de 67 especies fueron descritas dentro de las cuales se encuentran representantes de clases, Pteridophytos (11 especies), Pinopsida (1especies) y Angiospermas (50 especies).Mediante este documento se pretende incrementar y contribu

Diversidad de bacterias endófitas asociadas a raíces del pasto colosuana (bothriochloa pertusa) en tres localidades del departamento de sucre, colombia

El objetivo del presente trabajo fue aislar diversidad de bacterias endófitas cultivables asociadas a raíces del pasto colosuana Bothriochloa pertusa (L) A. Camus en tres localidades del departamento de Sucre, Colombia. La diversidad de bacterias endófitas fue realizada mediante el aislamiento de colonias en medios de cultivos. La densidad poblacional fue estimada por conteo directo de colonias en placa y las características culturales de cada morfotipo fueron obtenidas mediante observación de cada colonia formada. Se determinó la correlación diversidad, densidad poblacional y localidades, utilizando ANOVA y análisis de componentes principales o de correspondencia simple, mediante el programa estadístico R, 2009 (4,5). Fueron muestreadas 20 fincas por localidad; se observó presencia de diversos morfotipos de bacterias endófitas. Se encontró diferencias significativas entre diversidad (morfotipos), densidad poblacional (UFC.raíz-1) y localidades. La diversidad de bacterias endófitas representa apenas una pequeña fracción de la diversidad total existente en la naturaleza, siendo escasas las informaciones que se tienen de la presencia de estos microorganismos en agroecosistemas específicos, razón por lo cual este trabajo se convierte en la primera evidencia de asociación entre bacterias endófitas y raíces del pasto colosuana en Colombia. Palabras claves: Bacteria, endófitas, raíz, past

SARS-CoV-2 RNAemia is associated with severe chronic underlying diseases but not with nasopharyngeal viral load

Supported by Plan Nacional de I + D + i 2013–2016 and Instituto de Salud Carlos III, Subdirección General de Redes y Centros de Investigación Cooperativa, Ministerio de Economía, Industria y Competitividad, Spanish Network for Research in Infectious Diseases (REIPI, RD16/0016/0001, RD16/0016/0005, RD16/0016/0007, RD16/0016/0009, RD16/0016/0010, R D16/0016/0013) cofinanced by European Development Regional Fund “A way to achieve Europe”, Operative program Intelligent Growth 2014–2020. JSC and EC received grants from the Instituto de Salud Carlos III, Ministerio de Ciencia e Innovación, Proyectos de Investigación sobre el SARSCoV-2 y la enfermedad COVID-19 ( COV20/00580 ; COV20/00370 ). J.S.C. is a researcher belonging to the program “Nicolás Monardes” (C-0059–2018), Servicio Andaluz de Salud, Junta de Andalucía, Spain

Treatment with tocilizumab or corticosteroids for COVID-19 patients with hyperinflammatory state: a multicentre cohort study (SAM-COVID-19)

Objectives: The objective of this study was to estimate the association between tocilizumab or corticosteroids and the risk of intubation or death in patients with coronavirus disease 19 (COVID-19) with a hyperinflammatory state according to clinical and laboratory parameters. Methods: A cohort study was performed in 60 Spanish hospitals including 778 patients with COVID-19 and clinical and laboratory data indicative of a hyperinflammatory state. Treatment was mainly with tocilizumab, an intermediate-high dose of corticosteroids (IHDC), a pulse dose of corticosteroids (PDC), combination therapy, or no treatment. Primary outcome was intubation or death; follow-up was 21 days. Propensity score-adjusted estimations using Cox regression (logistic regression if needed) were calculated. Propensity scores were used as confounders, matching variables and for the inverse probability of treatment weights (IPTWs). Results: In all, 88, 117, 78 and 151 patients treated with tocilizumab, IHDC, PDC, and combination therapy, respectively, were compared with 344 untreated patients. The primary endpoint occurred in 10 (11.4%), 27 (23.1%), 12 (15.4%), 40 (25.6%) and 69 (21.1%), respectively. The IPTW-based hazard ratios (odds ratio for combination therapy) for the primary endpoint were 0.32 (95%CI 0.22-0.47; p < 0.001) for tocilizumab, 0.82 (0.71-1.30; p 0.82) for IHDC, 0.61 (0.43-0.86; p 0.006) for PDC, and 1.17 (0.86-1.58; p 0.30) for combination therapy. Other applications of the propensity score provided similar results, but were not significant for PDC. Tocilizumab was also associated with lower hazard of death alone in IPTW analysis (0.07; 0.02-0.17; p < 0.001). Conclusions: Tocilizumab might be useful in COVID-19 patients with a hyperinflammatory state and should be prioritized for randomized trials in this situatio

Eficiencia de hongos formadores de micorrizas arbusculares (H.M.A.) nativos, asociados a la producción de forraje en la especie de pasto colosuana (Bothriochloa Pertusa (L.) A. Camus) en el municipio de Corozal, departamento de Sucre, Colombia

Magíster en BiologíaMaestrí

Bacillus cereus bacteria endófita promotora de crecimiento vegetal

Lippia origanoides plants have been widely studied for their antimicrobial and antifungal effects of various extracts and essential oils against a large number of pathogenic microorganisms. However, to date there is little record of the diversity of endophytic bacteria associated with this plant species. The objective of the work was to evaluate in vitro the capacity to promote plant growth of endophytic bacteria of Lippia origanoides in the municipality of Sincelejo-Sucre, Colombia. In this study morphotypes were isolated and population density (CFU/ g of tissue) was determined; Qualitative plant growth tests were performed and molecularly identified. The results show that there were significant differences for population density of endophytic bacteria with respect to the type of tissue, with higher values at the root (2.0 x 1010 / g root), followed by the stem (1.3 x 1010 / g stem) and on the sheets (9.2 x 109 / g sheet). A total of 20 endophytic bacteria were isolated, showed phosphate solubilizing capacity, fixing nitrogen, siderophores production and ACC deaminase, corresponding to the TLO5 and RLO4 morphotypes such as Bacillus cereus endophytic bacteria associated with Lippia origanoides plants, which could become a possible resource biological to be used in the promotion of plant growth in these plants producing essential oils.ippia origanoides plantas têm sido amplamente estudadas por seus efeitos antimicrobianos e antifúngicos de vários extratos e óleos essenciais contra um grande número de microorganismos patogênicos. No entanto, até o momento, há pouco registro da diversidade de bactérias endofíticas associadas a esta espécie vegetal. O objetivo do trabalho foi avaliar in vitro a capacidade de promover o crescimento de bactérias endofíticas de Lippia origanoides no município de Sincelejo-Sucre, Colômbia. Neste estudo, os morfotipos foram isolados e a densidade populacional (UFC / g de tecido) foi determinada; Testes qualitativos de crescimento de plantas foram realizados e identificados molecularmente. Os resultados mostram que houve diferenças significativas para a densidade populacional de bactérias endofíticas em relação ao tipo de tecido, com maiores valores na raiz (2,0 x 1010 / g raiz), seguido do caule (1,3 x 1010 / g caule) e nas folhas (9,2 x 109 / g folha). Um total de 20 bactérias endofíticas foram isoladas, apresentaram capacidade de solubilização de fosfato, fixação de nitrogênio, produção de sideróforos e ACC deaminase, correspondendo aos morfotipos TLO5 e RLO4, como bactérias endofíticas de Bacillus cereus associadas a plantas de Lippia origanoides, o que poderia se tornar um possível recurso biológico para ser usado na promoção do crescimento de plantas nestas plantas que produzem óleos essenciais.La planta Lippia origanoides ha sido ampliamente estudiada debido al efecto antimicrobiano y antifúngico que poseen sus extractos y aceites esenciales, los cuales han sido probados contra un gran número de microorganismos patógenos. Sin embargo, es escasa la literatura que registra la diversidad de bacterias endófitas asociadas a esta especie de plantas. El objetivo del trabajo fue evaluar in vitro la capacidad de promoción de crecimiento vegetal de bacterias endófitas de Lippia origanoides en el municipio de Sincelejo-Sucre, Colombia. En este estudio se aislaron bacterias endófitas en medio de cultivo agar R2A a partir de diferentes tejidos, se evaluó la densidad poblacional (UFC/g de tejido) por conteo en superficie y la promoción de crecimiento vegetal de forma cualitativa en medios selectivos específicos. Se observaron diferencias significativas para la densidad poblacional de bacterias endófitas respecto al tipo de tejido, con mayores valores en la raíz (2,0 x 1010/g raíz), seguido del tallo (1,3 x 1010/g tallo) y hojas (9,2 x 109/g hoja). Se obtuvieron un total de 20 bacterias endófitas, los cuales dos mostraron capacidad solubilizadora de fosfato, fijación biológica de nitrógeno, producción de sideróforos y ACC desaminasa. Los morfotipos TLO5 y RLO4 fueron identificados molecularmente como Bacillus cereus, mostrando buenos resultados de promoción de crecimiento vegetal

Biorremediación de mercurio y níquel por bacterias endófitas de macrófitas acuáticas

Environmental pollution has been categorized as one of the main problems that affects the health of different life forms. Endophytic bacteria (BE) are able to improve the nutritional status of plants and remove soil contaminants. The Mojana subregion works as a river depreciation zone. In this study, samples of aquatic macrophytes were collected from the marshes of Ayapel, San Marcos and San Benito Abad, from which endophytic bacteria were isolated. The population densities of these bacteria and their respective tolerance to nickel and mercury heavy metals were quantified. Subsequently, the tolerant strains were molecularly identified and their ability to promote plant growth was evaluated, from which the population densities of endophytic bacteria and tolerance to heavy metals were isolated and determined. , to the tolerant isolates and capable of growing in nickel and mercury, plant growth promotion was evaluated, finally they were identified at the molecular level. A total of 182 morphotypes of endophytic bacteria were isolated, the highest population density averages were obtained in the macrophytes of the swamp of San Benito Abad located at the coordinates coordinates 8 ° 55'32.81'' N and 75 ° 1 '13.72 "W , lo. The highest averages of mercury and nickel tolerant morphotypes were found in the Ayapel swamp at coordinates 8 ° 18'51.10'' N and 75 ° 8'8.26 "O. L The results show that the isolates with the greatest biotechnological potential are BAT6, BAR2 and PAT2, where the first two have a 100% homology with the species Lysinibacillus fusifomis and the genus Enterobacter, respectively, while the third isolation had a homology of 96% with the species Burkholderia cepacia show that the isolated BAT6, presented 100% homology with the species of bacteria Lysinibacillus fusifomis; BAR2 100% homology with the bacterial species belonging to the genus Enterobacter and PAT2 96% homology with the species Burkholderia cepacia. The present study reports for the first time the presence of Lysinibacillus fusifomis and Burkholderia cepacia associated with macrophytes in swampy bodies of Sucre and Córdoba.La contaminación ambiental se ha categorizado como uno de los principales problemas que afecta la salud de las diferentes formas de vida. Las bacterias endófitas (BE), son capaces de mejorar el estado nutricional de las plantas y remover contaminantes del suelo. La subregión la Mojana funciona como zona de amortización de ríos. En este estudio, se colectaron muestras de macrófitas acuáticas de las ciénagas de Ayapel, San Marcos y San Benito Abad, de los cuales se aislaron bacterias endófitas. Se cuantificó las densidades poblacional de estas bacterias y su respectiva tolerancia a los metales pesados níquel y mercurio. Posteriormente, las cepas tolerantes fueron identificadas molecularmente y se les evaluó su capacidad de promover el crecimiento vegetal. Un total de 182 morfotipos de bacterias endófitas fueron aislados, los mayores promedios de densidad poblacional se obtuvieron en las macrófitas de la ciénaga de San Benito Abad ubicada en las coordenadas coordenadas 8°55'32.81" N y 75°1'13.72" O. Los mayores promedios de morfotipos tolerantes a mercurio y níquel se encontraron en la ciénaga de Ayapel en las coordenadas 8°18'51.10" N y 75°8'8.26" O. Los resultados muestran que los aislados con mayor potencial biotecnológico son BAT6, BAR2 y PAT2, donde los dos primeros tienen una homología del 100% con la especie Lysinibacillus fusifomis y el género Enterobacter, respectivamente, mientras que el tercer aislamiento tuvo una homología del 96% con la especie Burkholderia cepacia. El presente estudio reporta por primera vez la presencia de Lysinibacillus fusifomis y Burkholderia cepacia asociadas a macrófitas en cuerpos cenagosos de Sucre y Córdoba

Comet assay to determine genetic damage by the use of ivermectin in zebu cows ( Bos taurus indicus )

ABSTRACT Objective. The objective of the work was evaluate the damage genetic caused by the use of ivermectin (IVM) in cows zebu to concentrations of 1% and 3.15% through the test comet. Material and methods. 15 cows, were taken with age between 3 and 4 years old, average weight of 350 kg, body condition between 3 and 3.5. Three experimental groups with five animals per group, which were exposed to the concentration of IVM to 1% to 3.15% more group control (without application of IVM) were used. Animal blood sample was performed by venipuncture jugular or medial flow with vacutainer® needle, extracting 8 ml of blood. The blood samples it was collected at 9, 18 and 27 days post-treatment. Results. The display of the comets is made by using fluorescence microscope, the cells were evaluated by means of visual log and the Comet image software. Evidenced the presence of nuclei with DNA migration in all analyzed plates. The values of classification of comets indicate cells with high levels of damage (grade 3: cells with high damage). The rate of DNA damage of the treatment to 1% to 3.15% was significant, to relate to the control group. Conclusions. The results obtained in this study demonstrate the likely genotoxic potential of the use of IVM in cattle.RESUMEN Objetivo. El objetivo del trabajo fue evaluar el daño genético causado por el uso de Ivermectina (IVM) en vacas cebú (Bos taurus indicus). Materiales y Métodos. Se tomaron quince vacas, con edad entre tres y cuatro años, peso promedio de 350 kilogramos, condición corporal entre 3 y 3,5. Se utilizaron tres grupos experimentales con cinco animales por grupo, los cuales se expusieron a la concentración de IVM al 1% y 3,15% más un grupo control (sin aplicación de IVM). La muestra sanguínea por animal fue realizada mediante punción venosa yugular o caudal medial con aguja para vacutainer ®, extrayéndose 8 ml de sangre. Las muestras sanguíneas fueron recolectadas a los 9, 18 y 27 días postratamiento. Resultados. La visualización de los cometas se realizaron con microscopio de fluorescencia, las células fueron evaluadas por medio de registro visual y por el software Comet Imagen. Se evidenció la presencia de núcleos con migración de ADN en todas las placas analizadas. Los valores de clasificación de los cometas, denotaron células con altos niveles de daño alto (grado 3). El índice de daño del ADN de los tratamientos al 1% y 3,15% fue significativo, al relacionarlo con el grupo control. Conclusión. Los resultados de este estudio evidenciaron el probable potencial genotóxico del uso de la IVM en ganado vacuno

Percepción de citricultores ante el efecto del cambio climáticoen Campeche

In Mexico, citrus cultivation has a food, social and cultural importance that comes to govern family life and community dynamics in the regions where it occurs and that are being affected by climate change. The objective of this research was to measure theperception of citrus growers, faced with the effect of climate change. A participatory survey was applied to 65 citrus producers in Campeche. Variables on the occurrence of events associated with climate change, direct damage to plants, perception of the increase in meteorological phenomena, technological and socioeconomic change were measured. The surveyedare men (86.3%), of older age and basic education. 55% of the participants own commonland and 44% have private property. The average yield of citrus fruits is low due to the lack of technical irrigation systems and the effects of climate change, particularly the increase in temperature and the decrease in precipitation. Producers have a total of seven types of crops on their plots, without correlation with the size of the property (r=0.032), nor with the area destined for cultivation (r= 0.33). The 66.6% of the participants have heard about climate change being the source of information television. The 69.6% have perceived greater changes in the climate, which has motivated them to make changes in the type of tillage (McNemar.test χ2= 10.56, p< 0.01**). Thus, the effects of climate change are influencing the citrus management practices of the producers of Campeche;however, they are reactive actions, so research is required to quantify and assess the damages caused by this phenomenon and strategies are designed to counteract its effects in the medium and long termEn México, el cultivo de cítricos tiene una importancia alimentaria, social y cultural que llega a regir la vida familiar y la dinámica comunitaria en las regionesy están siendo afectadas por el cambio climático. El objetivo de esta investigaciónfue medir la percepción de los citricultores, ante el efecto del cambio climático. Se aplicó una encuesta participativa a 65 productores de cítricos de Campeche, México. Se midieron variables sobre ocurrencia de eventos asociados al cambio climático, daño directo a las plantas, percepción del aumento de fenómenos meteorológicos, cambio tecnológico y socioeconómico. Los encuestados son hombres (86.3%), de edad mayor y escolaridad básica. El 55% de los participantes posee tierra ejidal y 44% propiedad privada. El rendimiento promedio de los cítricos es bajo debido a la falta de sistemas de riego tecnificado y a los efectos del cambio climático, particularmente el aumento de la temperatura y el descenso de la precipitación. Los productores poseen un total de siete tipos de cultivos en sus parcelas, sin correlación con el tamaño de propiedad (r=0.032), ni con el área destinada al cultivo (r=0.33). El 66.6% de los participantes ha escuchado sobre el cambio climático siendo la fuente deinformación latelevisión. El 69.6% ha percibido cambios mayores en el clima, lo que ha motivado a realizar cambios en el tipo de labranza (McNemar.test χ2= 10.56, p< 0.01**). Así, los efectos del cambio climático estánincidiendo en las prácticas de manejo de los cítricosenCampeche;sin embargo,son acciones reactivas yse requieren de investigaciones que cuantifiquen y valoren los daños por este fenómeno y se diseñen estrategias para contrarrestar sus efectos en el mediano y largo plazo

Actividad antibacteriana de extracto de hojas de Melia azedarach L

Título en ingles: Antibacterial activity of leaf extract Melia azedarach L. Resumen: El trabajo tuvo como objetivo evaluar la actividad antibacteriana de extractos de hojas de Melia azedarach L. sobre seis bacterias patógenas. Inicialmente mediante extracción por el método Soxhlet se obtuvo extracto total en etanol y a partir de éste se prepararon fracciones líquido-líquido con éter de petróleo y acetato de etilo. El extracto total y las dos fracciones fueron diluidos a diferentes concentraciones (ppm) para evaluar in vitro su actividad antibacteriana.  Las bacterias de mayor susceptibilidad fueron las patógenas de humanos Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa y Klebsiella oxytoca, en relación a la fitopatógena Burkholderia glumae quien mostró resistencia a todos los tratamientos. Las bacterias patógenas fueron más susceptibles a la fracción éter de petróleo a concentración mínima de 25 ppm. El screen fitoquímico de la planta indicó presencia de metabolitos secundarios tipo alcaloides, terpenos/esteroles, saponinas, taninos y antocianinas. Estos resultados evidencian el posible uso de M. azederach como alternativa de control biológico sobre las bacterias analizadas. Palabras clave: bacterias; patógenas; inhibición; extractos. Abstract: The work was objective to evaluate the antibacterial activity of extracts from leaves of Melia azedarach (L) on six pathogenic bacteria. Total ethanol extract was obtained initially by extraction with method Soxhlet and from this prepared liquid-liquid fractions with petroleum ether and ethyl acetate. The total extract and the two fractions were diluted at different concentrations (ppm) to evaluate its antibacterial activity in vitro.  More susceptible bacteria were the pathogenic human Enterococcus faecalis, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella oxytoca, in relation to the plant pathogen Burkholderia glumae who showed resistance to all treatments. Pathogenic bacteria were more susceptible to the fraction of petroleum ether to the minimum concentration of 25 ppm. Screen plant phytochemical indicated presence of secondary metabolites type alkaloids, terpenes/sterols, saponins, tannins and anthocyanins. These results demonstrate the potential use of M. azederach as biological control alternatively on analysed bacterial. Key words: bacteria; pathogenic; inhibition; extract