Antioxidants of natural plant origins: from sources to food industry applications

ReviewIn recent years, great interest has been focused on using natural antioxidants in food products, due to studies indicating possible adverse effects that may be related to the consumption of synthetic antioxidants. A variety of plant materials are known to be natural sources of antioxidants, such as herbs, spices, seeds, fruits and vegetables. The interest in these natural components is not only due to their biological value, but also to their economic impact, as most of them may be extracted from food by-products and under-exploited plant species. This article provides an overview of current knowledge on natural antioxidants: their sources, extraction methods and stabilization processes. In addition, recent studies on their applications in the food industry are also addressed; namely, as preservatives in different food products and in active films for packaging purposes and edible coatingsinfo:eu-repo/semantics/publishedVersio

Identification of regulatory polymorphisms associated with breast cancer risk

Dissertação de Mestrado, Ciências Biomédicas, Departamento de Ciências Biomédicas e Medicina, Universidade do Algarve, 2014O cancro da mama é uma das patologias oncológicas mais comuns, e causa de morte mais frequente entre as mulheres. Trata-se de uma doença complexa com fatores genéticos e não genéticos envolvidos na sua etiologia. Até ao momento, o conhecimento adquirido acerca do risco genético não explica mais do que dois terços dos casos de cancro familiares permanecendo ainda por explicar cerca de 65% a 70%. Com os recentes avanços na tecnologia de microarrays e nos estudos de associação realizados a nível de genoma inteiro (genome-wide association studies, GWAS), têm surgido evidências que sugerem que as variantes cis-reguladoras podem ser importantes para o risco de cancro da mama. Variantes cis-reguladoras são polimorfismos que regulam a expressão de genes. Podem-no fazer através da modificação de elementos reguladores como, por exemplo: afetando a ligação de fatores de transcrição em promotores e elementos intensificadores Essas variantes são frequentes na população e contribuem para a variabilidade intra e inter -espécies. Com base nestas evidências, a nossa hipótese consiste em que a maioria dos polimorfismos comuns e associados a risco ainda por identificar podem ser também cis-reguladores. Deste modo, a procura para a restante suscetibilidade genética do cancro da mama deve centrar-se nas variantes com maior potencial cis-regulador. As variantes cis-reguladoras podem ser identificadas de diferentes formas, como por exemplo através de loci de características quantitativas de expressão (expression quantitative trait loci, eQTL) e análises de expressão diferencial alélica (differential allelic expression, DAE) em indivíduos heterozigóticos. DAE é uma abordagem que compara os níveis relativos de expressão dos dois alelos do mesmo gene em indivíduos heterozigóticos, utilizando um SNP transcrito (tSNP). Esta técnica tem revelado ser bastante eficaz, uma vez que compara os níveis de transcritos dos alelos dentro do mesmo contexto celular e de haplótipos, pelo que a influência de efeitos trans é eliminada (por exemplo concentração de fatores de transcrição no núcleo). Este trabalho teve dois grandes objetivos: o primeiro, a validação da dos resultados de DAE nos polimorfismos cis-reguladores identificados num estudo anteriormente realizado pela Prof. Ana Teresa Maia; o segundo, a identificação de novos loci envolvidos no risco para o cancro da mama. No estudo para validação da DAE, foi medida a quantidade relativa da expressão dos dois alelos de 10 SNPs, previamente identificados como apresentando DAE (rs2526935; rs10503416; rs10513376; rs7600326; rs6494466; rs10016; rs13265801; rs9250; rs8097892; rs1384) e de 4 SNPs sem DAE (rs2834653; rs710945; rs1477017 e rs10521). Foram utilizadas 18 amostras de tecido mamário de indivíduos saudáveis e os níveis da DAE foram determinados utilizando a técnica de PCR em tempo real específica alélica. As distribuições de DAE foram comparadas aplicando um Teste t de Student (t-test), o qual compara as médias da distribuição de rácios de DAE. No total dos 10 SNPs com DAE validámos 6 SNPs que eram consistentes com os resultados observados anteriormente. Apenas um de quatro SNPs sem evidências da DAE mostrou consistência com os resultados anteriores. Para o estudo de identificação de novos loci foi aplicada uma abordagem inovadora, a qual consiste no cruzamento de dados para cancro da mama publicados nos GWAS com os nossos dados de DAE. Esse cruzamento de dados é feito de acordo com a localização cromossómica, distância física (janelas de ±250kb a partir da variante com DAE) e padrões de desequilíbrio de ligação (linkage disequilibrium, LD). Com este exercício pretendemos testar se esta abordagem pode ajuda a priorizar os loci candidatos de GWAS para validação e posteriores análises funcionais. Este cruzamento de dados permitiu identificar vários loci que contêm SNPs associados com risco para cancro da mama e SNPs com DAE. Para uma análise inicial selecionaram-se dois loci: 17q22 (TOM1L1/COX11/STXBP4) e 12q24 (AACS), com base nos cenários de DAE, LD entre o tSNP de DAE e o SNP do GWAS. Esses dois loci foram inicialmente analisados para potenciais elementos reguladores e evidência funcional (promotores, intensificadores e ligação de fatores de transcrição) nos locais onde se encontram os candidatos a variantes cis-reguladoras. Para essa análise foram utilizadas uma base de dados, RegulomeDB, e um navegador de informação genómica, Genome Browser, que contêm informações sobre hipersensibilidade à desoxirribonuclease (DNAse), TFBS, e regiões promotoras, evidências obtidas em estudos in silico e/ou in vitro para variantes codificadoras e não codificadoras. No locus 17q22, foram encontrados 12 SNPs em sobreposição com regiões que contêm marcadores para elementos funcionais, tais como promotores e intensificadores. Sugerindo que esses podem possivelmente ter um efeito funcional através da regulação da expressão do gene. Posteriormente, analisaram-se os SNPs para a estrutura de LD nessa região e para identificação dos haplótipos na população os quais podem ser responsáveis pelo aumento ou diminuição na expressão dos genes. Foram identificados quatro haplótipos comuns associados com diferenças nos níveis de expressão. No locus 12q24, o tipo de análises realizadas foram as mesmas descritas para o outro locus. Para o locus 12q24 foram encontrados 13 SNPs em sobreposição com regiões contendo elementos reguladores o que sugere um possível efeito funcional na regulação da expressão dos genes. Todos SNPs foram também analisados para a estrutura de LD e identificação de haplótipos. Com base nessa análise, foram identificados quatro haplótipos comuns associados com as diferenças nos níveis de expressão. Essas variantes candidatas a serem cis-reguladoras foram selecionadas com base em análises in silico, utilizando ferramentas para a previsão de potenciais locais de ligação de fatores de transcrição. Posteriormente, 3 SNPs foram analisadas funcionalmente in vitro, numa linha celular de cancro da mama (HCC1954). Como os genes presentes em cada um dos loci mostraram evidências para a presença de variantes cis-reguladoras, decidiu-se validar os níveis de DAE em tecido de mama normal e compará-las com os níveis de DAE no sangue. Para essa análise usou-se um tSNP para cada gene (rs17817901 no COX11 e rs7138557 no AACS). Validaram-se os resultados da DAE, no tecido da mama, e para o AACS e observou-se que esses não são comparáveis com os níveis da DAE no sangue. Os nossos resultados não suportam, portanto, o uso de sangue em estudos de DAE em substituição para o tecido da mama, na aplicação futura em estudos de predisposição ao cancro da mama. Para averiguar se a DAE em ambos os loci está realmente associada com o risco de cancro de mama, foi realizado um estudo de caso-controlo. Foi encontrada uma associação significativa neste estudo, o que sugere que DAE em ambos os loci deve ser futuramente explorado como instrumento de previsão de risco para cancro da mama. Futuramente, uma análise mais aprofundada da regulação destes genes poderá levar também à compreensão da biologia de predisposição ao tumor e contribuir para o desenvolvimento de terapias futuras, especialmente na área da medicina personalizada

Jean Claude Risset’s Duet for One Pianist: Challenges of a Real-Time Performance Interaction with a Computer-Controlled Acoustic Piano 16 Years Later

This study aims to discuss the work Duet for one Pianist (1989) by the French composer Jean-Claude Risset (b. 13 March 1938) by analyzing the challenges of the music performance of this Computer-Aided Composition work Disklavier and implies HumanComputer Interaction performance. Extremely honored to perform the revised version of the 8 Sketches for One Pianist and Disklavier within a research project of CITAR and a new Sketch Reflections (2012) by Jean-Claude Risset dedicated to me in a World premiere in the closing ceremony of Black&White 2012 Film Festival promoted by the Catholic University of Portugal. Several issues on the performance of this work are analysed as a casestudy, from the point of view of the performer, particularly the components of expressive performance in a real-time interaction between performer and computer. These components can work as analysis criteria of a piano interpretation, in here, of a pianist and Disklavier interpretation.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Promover o questionamento durante as visitas de estudo a centros interativos de ciência [o que dizem os monitores experientes]

Este estudo com oito monitores experientes de dois centros interativos de ciência Portugueses foca-se nas representações dos monitores sobre o questionamento dos alunos (13-14 anos) no âmbito de visitas de estudo a secções de ótica. Os dados recolhidos, através de entrevistas semiestruturadas aos monitores, revelam que na maioria das visitas de estudo a interação dos alunos com os módulos resulta num questionamento de nível cognitivo baixo e que são vários os fatores que condicionam o questionamento (a maioria dos quais relatados na literatura). Várias estratégias implementadas a nível institucional têm promovido o questionamento dos alunos, por exemplo, criação de fichas semiestruturadas ou de “questões de abertura” junto aos módulos. Para além disso, os monitores consideram que podem facilitar a aprendizagem dos alunos assumindo um papel de questionadores ao invés de transmissores de conhecimentos. Alguns exemplos de estratégias de questionamento que os monitores dizem implementar refletem criatividadeThis study with eight science museums educators from two interactive science centres in Portugal focuses on their representation on students’ questioning during school visits to a thematic exhibition about optics. Data collected through semi-structured interviews show that for monitors most of the students’ questioning is low cognitively. It also shoes that several factors affect the type of questioning that occurs during students’ interactions (most of them already identified in the literature), and several institutional interventions have contributed to increase students’ questioning, such as semi-structured worksheets or adjacent questions to the exhibitions. In addition, museum educators believe they can promote learning through questioning and some of the strategies that are being implemented with this aim show creativity.Fundação para a Ciência e a Tecnologia (FCT

Car accidents: How much is due to external factors and conditions? A data science approach for the Portuguese road network

The main objective of this research is to find out which and what weight external factors have in accidents and victims resulting from them. Within the variable accidents, all accidents that happened in Mainland Portugal in 2018 are counted, according to INE, as the victims include all victims, in Mainland Portugal in 2018 resulting from an accident. The data used was taken from several sources, namely, PORDATA, IPMA, INE, DGTerritório and Here. After collecting the data, the data was thoroughly analyzed and new variables were created with the help of QGIS and SPSS Statistics software, all of them organized by municipalities belonging to the country under study. After all the analysis and selection of variables with the Geoda software and the literature, different models were performed in order to draw conclusions about the selected variables. For this study, two different models were made, for accidents and victims (per 1000 meters and per 1000 inhabitants respectively), because these two variables (targets) didn’t have a strong linear correlation, presenting a value of 0.036 (Pearson correlation) since there was no relationship between the variables. In order to generalize to Portuguese road structures and to other countries with similar characteristics to Portugal, the bootstrap method was used as a simulation strategy, thus generating 300,000 new data. After evaluation the data, it was found that the external factors used in these models have an explanatory capacity of less than 50%, but spatial dependence is a key and very important factor in geospatial problems.O principal objetivo desta pesquisa é encontrar quais e qual o peso dos fatores externos nos acidentes e das vítimas que resultam do mesmo. A variável dos acidentes contém todos os acidentes que aconteceram em Portugal Continental em 2018, de acordo com o INE e a variável das vítimas contém todas as vítimas desde ligeiras, graves e mortais em Portugal Continental em 2018 resultantes de acidentes. Os dados foram retirados de fontes como a IPMA, PORDATA, INE e Here (rede viária de Portugal). Após a recolha dos dados, a análise dos mesmos e a criação de novas variáveis, com a ajuda dos softwares QGIS e SPSS Statistics, foram todas organizas por município pertencentes ao país em estudo. Após toda a seleção das variáveis, de acordo com a literatura, foram criados diferentes modelos de forma a retirar conclusões sobre as varáveis (fatores externos). Para este estudo foram criados dois modelos diferentes, para acidentes e vítimas pois estas duas variáveis (targets) não tinham uma forte correlação linear apresentando um valor de Sig de 0,554. De modo a generalizar para as estruturas rodoviárias portuguesas e para outros países com características semelhantes a Portugal, foi utilizado o método de bootstrap como uma estratégia de simulação, deste modo gerou-se 300000 novos dados. Após a avaliação dos dados verificou-se que os fatores externos, utilizados nestes modelos têm uma capacidade explicativa inferior a 50%, mas a dependência espacial é um fator chave e muito importante em problemas geo-espaciais

Lemon Jelly : spreading lemon through the internet

Lemon Jelly is a fashion brand that produces and sells plastic footwear. The brand belongs to the company Procalçado, a family-owned Portuguese company that already had an experience of 40 years as a soles and footwear components producer before creating Lemon Jelly. The company is characterized by innovative production processes that allow them to produce plastic injected shoes. Lemon Jelly is mostly being sold through distributors, however it also has an online presence. The brand’s official website represents from 5 to 10% of the brand’s sales, which were up to 3 million euros in 2015. The motivation for this dissertation was to write a case study about the e-commerce strategy of Lemon Jelly. The main challenge of the brand is to understand how it can increase its online sales, being this analyzed in the Teaching Note chapter that explores some issues relevant to the main problem of the case and proposes recommendations for the future. The previous chapter, Literature Review, was designed to support the Teaching Note through theoretical concepts. It is concluded that there are several factors that can influence a brand’s online sales, therefore Lemon Jelly should select some of them according to its needs, while monitoring the results at the same time. It is also important to benchmark competitors and other players in the industry in order to keep updated through the digital evolution.A Lemon Jelly é uma marca de moda que produz e vende sapatos de plástico. A marca pertence à Procalçado, uma empresa familiar Portuguesa que já contava com 40 anos de experiência enquanto produtora de solas e componentes de sapatos antes de criar a Lemon Jelly. A empresa é caraterizada por produzir através de processos inovadores, o que lhe permite criar calçado de plástico injetado. A Lemon Jelly é vendida principalmente através de distribuidores, no entanto também está presente online. O website oficial da marca representa entre 5 a 10% das suas vendas totais, que atingiram 3 milhões de euros em 2015. A motivação para esta dissertação passou por escrever um caso de estudo sobre a estratégia de comércio eletrónico da Lemon Jelly. O principal desafio da marca é perceber como pode aumentar as suas vendas online, e para isto é feita uma análise no capítulo da nota de ensino, que explora algumas questões relevantes para o principal problema do caso e onde são propostas recomendações para o futuro. O capítulo anterior, de revisão de literatura, destina-se a apoiar a nota de ensino através de conceitos teóricos. Conclui-se que há vários fatores que podem influenciar as vendas online de uma marca, pelo que a Lemon Jelly deve selecioná-los consoante as suas necessidades, controlando ao mesmo tempo os resultados obtidos. É também importante efetuar comparações com concorrentes e outras empresas da indústria para a marca se manter atualizada perante a evolução digital

Effects of sleep deprivation on postural control

Sleep is an essential biological requirement for the human organism to regulate its physiological, physical, cognitive, psychological and emotional resources, according to its necessities, allowing the functionality to carry out daily activities successfully. Evidence claims that sleep deprivation has a negative impact on physical performance, motor development and quality of life. One of the components that reflects motor performance is postural control. Sleep deprivation decreases considerably the capacity of stabilizing the neuromuscular system and adapting to environmental constraints, leading to a greater propensity to injuries and falls. This study aims to investigate the effects of a 24-hour sleep deprivation on postural control. Seventeen healthy participants (age 23.88±2.42 years, height 1.75±0.06 m, weight 71.80±7.97 kg, body mass index 23.30±1.80 kg/m2) visited the laboratory on two occasions: pre and post 24 hours of sleep deprivation. In both sessions, participants performed the postural control assessment, using the posturography technique. The protocol consisted on stabilizing the body, standing on both legs over a platform, for two minutes, while remaining quiet. The evaluation was performed twice, under two conditions: with eyes opened, and with eyes closed. Linear parameters of the center of pressure data were analyzed. Non-linear parameters of variability in the regularity of postural control were also determined through the sample entropy metric. Paired samples t-tests or a Wilcoxon Signed-rank tests were performed to test the effect of sleep deprivation on all dependent variables. Nearly all linear parameters showed an increase after sleep deprivation (excluding range in the anterior-posterior direction in eyes opened condition, which was maintained), while sample entropy decreased. Our findings show that 24 hours of sleep deprivation negatively affects postural control. This study confirmed the observations of previous studies using linear variables and provided a new contribution regarding the effects of a 24-hour sleep deprivation on the complexity of postural control and motor performance. The measure of entropy reflects the adaptability of motor control and acts as an indirect index of the functional capacity of the human neuromuscular system. Accordingly, in a state of sleep deprivation, psychomotor, cognitive and adaptability capacities are reduced, suggesting that there is a greater probability of compromising the neuromuscular system and, consequently, a greater exposure to injuries and falls.O sono é um requisito biológico essencial para manter o organismo humano a regular o equilíbrio a nível fisiológico, físico, cognitivo, psicológico e emocional, de forma adequada e de acordo com as suas necessidades, permitindo restabelecer a sua funcionalidade para realizar as atividades diárias e garantir o seu bem-estar. Existe evidência de que a privação do sono tem um impacto negativo no desenvolvimento motor e na qualidade de vida. Uma das componentes que reflete o desempenho motor é o controlo postural. As situações de privação de sono aumentam consideravelmente as dificuldades na capacidade de estabilização do sistema neuromuscular e em adaptá-lo a constrangimentos do ambiente, tendendo a aumentar o risco de lesões e quedas. Desta forma, este estudo tem como objetivo investigar o efeito de 24 horas de privação do sono no controlo postural. Dezassete sujeitos saudáveis (idade 23.88±2.42 anos, altura 1.75±0.06 m, massa corporal 71.80±7.97 kg, índice de massa corporal 23.30±1.80 kg/m2) visitaram o laboratório em duas ocasiões; pré e pós 24 horas de privação do sono. Nas duas sessões, os participantes realizaram a avaliação do controlo postural a partir da técnica de posturografia. O protocolo consistiu na estabilização da postura em pé e bipedal, durante dois minutos. A avaliação realizou-se duas vezes, sob duas condições: olhos abertos e olhos fechados. Foram analisados os parâmetros lineares que caracterizam o equilíbrio postural, a partir dos dados do centro de pressão. Foram também determinados parâmetros não lineares de variação da regularidade do controlo postural, através da métrica da entropia amostral, na direção ântero-posterior (SampEn AP) e médio-lateral (SampEn ML). Foram efetuados testes t para amostras emparelhadas e os testes de Wilcoxon para testar o efeito da privação do sono de todas as variáveis dependentes. Em quase todos os parâmetros lineares foi observado um aumento depois da privação de sono (com exceção da amplitude na direção ântero-posterior na condição de olhos abertos, que se manteve), enquanto a entropia amostral diminuiu. Os resultados indicam que a privação de 24 horas de sono afeta negativamente o controlo postural. Este estudo confirmou as observações de estudos anteriores a partir de variáveis lineares e ainda forneceu um novo contributo em relação aos efeitos da privação do sono na complexidade do controlo postural e do controlo motor. A medida reflete a adaptabilidade do controlo motor e atua como uma medida indireta da capacidade funcional do sistema neuromuscular humano. Um estado de 24 horas de privação de sono contribuiu para a redução das capacidades psicomotoras, cognitivas e a adaptabilidade aos constrangimentos, sugerindo-se que existe maior probabilidade em comprometer o sistema neuromuscular e, consequente, maior exposição para ocorrência de lesões e quedas

An exploratory analysis of incentive packages and managerial performance

Artigo publicado em revista científica internacionalThis study explores the interplay among different types of incentives (monetary incentives, non-monetary incentives, and benefits) and managerial performance. We collect data via a questionnaire and use qualitative comparative analysis (QCA) to analyze them. Using data from 614 managers, we identify multiple incentive packages that are consistently related to high managerial performance. Specifically, our analyses reveal that non-monetary incentives in the form of autonomy and development opportunities are as related to high performance in isolation as their combination with recognition. High performance can also be achieved with the combination of traditional tangible benefits with (1) social support benefits and recognition or with (2) monetary incentives. Finally, our findings suggest that monetary incentives, social benefits, and autonomy and development opportunities are more important for the success of CFOs than to non-CFOs. Conversely, tangible benefits are particularly relevant for the high performance of non-CFOs but not for CFOs. Our findings contribute to the incentives literature by showing successful incentive packages that companies are using in practice and how they relate to different theories such as agency theory, self-determination theory, and human capital theory.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

The use of non-financial performance measures for managerial compensation: evidence from SMEs

Artigo publicado em revista científica internacional.This study explores the relationship between contextual variables—strategy, per ceived environmental uncertainty (PEU), and decentralization—and the use of non fnancial performance measures (NFPM) for managerial compensation in small and medium enterprises (SMEs). Using questionnaire data from SMEs’ managers, we fnd that the use of NFPM is positively associated with PEU hostility and decentrali zation. Furthermore, our study shows that these results are mostly driven by CEO’s compensation (in comparison to non-CEOs compensation) and family frms (in comparison to non-family frms). Finally, our analyses reveal that the use of diferent types of NFPM (customer-oriented, employee-oriented and operations-oriented) is associated with distinct contextual variables. Particularly, customer-oriented NFPM are negatively related to PEU dynamism and positively related to decentralization, while operations-oriented NFPM are positively related to PEU hostility.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Subjective performance evaluation and managerial work outcomes

Artigo publicado em revista científica internacionalOrganisations design performance evaluation systems to obtain desired work outcomes. Thisstudy analyses how subjective performance evaluation (SPE), a specific type of performanceevaluation, is related to managerial work outcomes—turnover intention, organisationalidentification, and performance. To this end, we consider two possible mechanisms:feedback quality and trust in the supervisor. Moreover, we also consider whether addingobjective performance measures to SPE alters these relationships. Based on questionnaire responses from 751 top executives and middle managers in small and medium enterprises,wefind that SPE is negatively related to feedback quality, but this effect is mitigated whenSPE is used jointly with objective performance measures. SPE is not directly related totrust in the supervisor when feedback quality is also considered in the analysis because thetwo mechanisms are inter-related—wefind a positive relationship between feedback qualityand trust in the supervisor. Both mechanisms are negatively related to turnover intention,but only trust in the supervisor is positively related to organisational identification. Finally,both turnover intention and organisational identification are positively related toperformance. Ourfindings suggest that companies using SPE can improve work outcomesby adding objective performance measures to their performance evaluation system.info:eu-repo/semantics/publishedVersio