Les multiples réseaux formels et informels d’un apothicaire parisien : l’échevin Matthieu-François Geoffroy

Matthieu-François Geoffroy (1644-1708), appartenait à un réseau formel, celui des apothicaires parisiens réunis au sein d’une communauté régie par des statuts, dont il fut garde en 1684, mais il appartenait également à de nombreux réseaux informels très influents. L’étude de son journal ainsi que de nombreux autres documents (éloge de son fils Étienne-François, article du Journal des Savants, archives de la ville, etc.) permet de constater leur multiplicité et leur importance dans le déroulement de sa carrière aux confins de l’administration et de la marchandise. Le réseau informel des anciens élèves des Jésuites du Collège de Clermont, où il fut le condisciple de Louvois, lui ouvrit les portes du réseau politico-administratif constitué autour de la famille Le Tellier. Les conférences scientifiques qu’il organisait dans son officine pour l’éducation de ses enfants montrent qu’il se trouvait au cœur d’un réseau scientifique comportant de nombreux membres (Cassini, Joblot, du Vernay, Homberg) de l’Académie des sciences, compagnie dont deux de ses fils firent ultérieurement partie. Il convient de ne pas négliger le réseau d’artistes (Sébastien Le Clerc, Nicolas de Plate-Montagne, Nicolas de Largillière) avec lequel ses fonctions lui permirent des contacts fructueux. Un réseau influent était constitué par les membres de sa clientèle aristocratique avec qui il entretenait une relation privilégiée.Matthieu-François était en relation avec le réseau des échevins de Paris avant même son élection à ce poste prestigieux (1685), grâce à son grand-père Étienne Ier (1586-1673) qui l’avait précédé, en 1636, dans ces fonctions. Son fils Claude-Joseph occupa, lui aussi, cette position enviée. Il fit ensuite partie de la juridiction consulaire (1694), autre réseau institutionnel, dont son grand-père lui avait ouvert la voie. L’appartenance de Geoffroy à un aussi grand nombre de réseaux était exceptionnelle, même à l’époque, et explique en partie sa réussite sociale

La zone hyporhéique, une composante à ne pas négliger dans l'état des lieux et la restauration des cours d'eau

Les projets de restauration des cours d'eau sont maintenant de plus en plus fréquents et ambitieux. Intégrant un grand nombre de composantes de l'hydrosystème, ils ne prennent néanmoins pas pleinement en compte sa dimension verticale et oublient souvent un compartiment fondamental, représenté par la zone hyporhéique. Cette zone constitue une seconde rivière dont l'écoulement souterrain est invisible, et dont l'existence et la fonction sont largement méconnues. Pourtant elle joue un rôle fondamental dans le maintien des processus écologiques et dans la préservation de la biodiversité du cours d'eau. Après avoir précisé les rôles du milieu hyporhéique et souligné l'effet des activités humaines qui altèrent souvent sa structure et ses fonctions, on montrera de quelle manière les projets actuels de réhabilitation pourraient être complétés grâce à l'intégration systématique de la zone hyporhéique dans leurs plans et leurs suivis de restauration. / Stream restoration projects are nowadays more and more numerous and ambitious. While they now integrate many components of hydrosystems, they are still ignoring a fundamental one, the hyporheic zone. This zone can be considered as a second river whose subsurface flow is invisible and whose functions are still poorly known. Nevertheless, the hyporheic zone plays a major role in sustaining stream ecological processes and preserving stream biodiversity. After pointing out how human activities can impair the hyporheic zone structure and function, we will show how restoration projects could be much improved by considering the hyporheic zone

Graph Creation, Visualisation and Transformation

We describe a tool to create, edit, visualise and compute with interaction nets - a form of graph rewriting systems. The editor, called GraphPaper, allows users to create and edit graphs and their transformation rules using an intuitive user interface. The editor uses the functionalities of the TULIP system, which gives us access to a wealth of visualisation algorithms. Interaction nets are not only a formalism for the specification of graphs, but also a rewrite-based computation model. We discuss graph rewriting strategies and a language to express them in order to perform strategic interaction net rewriting

Strategic programming on graph rewriting systems

We describe a strategy language to control the application of graph rewriting rules, and show how this language can be used to write high-level declarative programs in several application areas. This language is part of a graph-based programming tool built within the port-graph transformation and visualisation environment PORGY.Comment: In Proceedings IWS 2010, arXiv:1012.533

Ezrin enhances line tension along transcellular tunnel edges via NMIIa driven actomyosin cable formation

Transendothelial cell macroaperture (TEM) tunnels control endothelium barrier function and are triggered by several toxins from pathogenic bacteria that provoke vascular leakage. Cellular dewetting theory predicted that a line tension of uncharacterized origin works at TEM boundaries to limit their widening. Here, by conducting high-resolution microscopy approaches we unveil the presence of an actomyosin cable encircling TEMs. We develop a theoretical cellular dewetting framework to interpret TEM physical parameters that are quantitatively determined by laser ablation experiments. This establishes the critical role of ezrin and non-muscle myosin II (NMII) in the progressive implementation of line tension. Mechanistically, fluorescence-recovery-after-photobleaching experiments point for the upstream role of ezrin in stabilizing actin filaments at the edges of TEMs, thereby favouring their crosslinking by NMIIa. Collectively, our findings ascribe to ezrin and NMIIa a critical function of enhancing line tension at the cell boundary surrounding the TEMs by promoting the formation of an actomyosin ring.Peer reviewe

PORGY: Strategy-Driven Interactive Transformation of Graphs

This paper investigates the use of graph rewriting systems as a modelling tool, and advocates the embedding of such systems in an interactive environment. One important application domain is the modelling of biochemical systems, where states are represented by port graphs and the dynamics is driven by rules and strategies. A graph rewriting tool's capability to interactively explore the features of the rewriting system provides useful insights into possible behaviours of the model and its properties. We describe PORGY, a visual and interactive tool we have developed to model complex systems using port graphs and port graph rewrite rules guided by strategies, and to navigate in the derivation history. We demonstrate via examples some functionalities provided by PORGY.Comment: In Proceedings TERMGRAPH 2011, arXiv:1102.226

The role of organisms in hyporheic processes : gaps in current knowledge, needs for future research and applications

Fifty years after the hyporheic zone was first defined (Orghidan, 1959), there are still gaps in the knowledge regarding the role of biodiversity in hyporheic processes. First, some methodological questions remained unanswered regarding the interactions between biodiversity and physical processes, both for the study of habitat characteristics and interactions at different scales. Furthermore, many questions remain to be addressed to help inform our understanding of invertebrate community dynamics, especially regarding the trophic niches of organisms, the functional groups present within sediment, and their temporal changes. Understanding microbial community dynamics would require investigations about their relationship with the physical characteristics of the sediment, their diversity, their relationship with metabolic pathways, their inter- actions with invertebrates, and their response to environmental stress. Another fundamental research question is that of the importance of the hyporheic zone in the global metabolism of the river, which must be explored in relation to organic matter recycling, the effects of disturbances, and the degradation of contaminants. Finally, the application of this knowledge requires the development of methods for the estimation of hydro- logical exchanges, especially for the management of sediment clogging, the optimization of self-purification, and the integration of climate change in environmental policies. The development of descriptors of hyporheic zone health and of new metrology is also crucial to include specific targets in water policies for the long-term management of the system and a clear evaluation of restoration strategies