Apports des méthodes statistiques et hydrochimiques à la caractérisation des eaux des aquifères fissurés de la région du N’zi-Comoé (Centre-Est de la Côte d’Ivoire)

La région du N’zi-Comoé est située au Centre-Est de la Côte d’Ivoire et appartient du point de vue géologique au socle cristallin. La végétation est constituée de lambeaux de forêt mésophile, de savanesséparées par des forêts-galeries et de jachères, résultat de la déforestation. L’appauvrissement des sols, issu de cette déforestation a eu pour conséquence l’utilisation d’engrais. La déforestation et l’usage des engrais suscitent des interrogations sur la qualité des eaux souterraines du N’zi-Comoé et leur aptitude à la consommation humaine. C’est pour répondre à cette problématique que ce présent travail a été initié. Ainsi,l’objectif de cette étude est la caractérisation hydrogéochimique des eaux et l’analyse de leur aptitude à la consommation humaine. Ce travail a été mené à partir des résultats d’analyses de paramètres physicochimiquesdes eaux et s’est appuyé sur un échantillon de 193 forages. La méthodologie appliquée est basée sur une approche pluridisciplinaire intégrant l’hydrochimie (diagramme triangulaire de piper, indicateur de temps de séjour) et des analyses statistiques univariées, bivariées et multivariées (ACPN). Du point de vue hydrofaciès, la majorité des eaux des aquifères fissurés du N’zi-Comoé est du faciès bicarbonaté calcique etmagnésien. La région du N’zi-Comoé est dominée par deux phénomènes hydrochimiques majeurs : la minéralisation couplée au temps de séjour et l’oxydo-réduction qui sont à l’origine de l’acquisition de la minéralisation des eaux souterraines du N’zi-Comoé. L’étude de la potabilité révèle que les eaux souterraines sont physico-chimiquement conformes dans l’ensemble aux normes recommandées par l’OMS et ne présententpas de danger majeur pour la consommation humaine

Application des méthodes d’analyses statistiques multivariées à l’étude de la minéralisation des eaux des aquifères fissurés de la zone Guiglo-Duekoué (Ouest de la Côte d’Ivoire)

Plusieurs études hydrogéologiques ont été réalisées à travers la Côte d’Ivoire pour une meilleure évaluation (quantitative et qualitative) des ressources en eaux souterraines. Les résultats obtenus au cours de ces travaux sont fort encourageants et ont contribué en particulier à une meilleure connaissance de l’hydrogéochimie des eaux souterraines. En dépit de ces résultats considérables, des efforts restent encore à faire. Dans la région Ouest, qui est aujourd’hui la nouvelle boucle du cacao, de telles études sont quasiinexistantes. C’est donc dans le souci d’apporter une contribution à la connaissance de l’hydrogéochimie des aquifères de l’Ouest de la Côte d’Ivoire que la présente étude a été entreprise. Cette étude a été particulièrement menée dans la zone Guiglo-Duekoué qui est située entre les latitudes 7°00 et 7°42 Nord et les longitudes 6°28 et 6°50 Ouest. L’objectif de cette étude est la caractérisation hydrogéochimique des eaux souterraines pour la compréhension de la minéralisation de celles-ci. Ce travail a été mené à partir des résultats d’analyses de paramètres physico-chimiques des eaux et s’est appuyé sur un échantillon de 48 forages. La méthodologie appliquée est basée une approche statistique multivariée (Analyse en Composantes Principales Normées (ACPN) et Classification Hiérarchique Ascendante (CHA)). La combinaison de ces différentes méthodes a permis d’apporter des réponses à notre problématique. Cette étude a permis d’identifier deux principaux mécanismes qui sont responsables de l’évolution de la minéralisation des eaux de la région. Le premier mécanisme est le phénomène de minéralisation couplé au temps de séjour qui met en évidence l’hydrolyse des silicates après l'infiltration des eaux enrichies en CO2 du sol. Le deuxième mécanisme est le phénomène d’oxydo-réduction, lié à la turbidité, aux teneurs en fer et en manganèse. Ces résultats contribuent à une meilleure connaissance des propriétés hydrogéochimiques des ressources en eaux souterraines du socle cristallin de Côte d’Ivoire.Mots clés: Analyse en Composantes Principales Normées, Classification Hiérarchique Ascendante, minéralisation, eaux souterraine

Caractérisation hydrogéochimique des eaux des aquifères fissurés de la zone Guiglo-Duekoué (Ouest de la Côte d’Ivoire)

La zone d’étude, Guiglo-Duekoué, est située à l’Ouest de la Côte d’Ivoire, entre les latitudes 7°00’ et 7°42’ Nord et les longitudes 6°28’ et 6°50’ Ouest. Cette étude vise à faire une analyse hydrogéochimique les eaux souterraines de la région de Guiglo-Duekoué. L’approche méthodologique est basée sur la détermination des hydrofaciès à partir des diagrammes de Piper et de Schoeller-Berkaloff et l’étude de la qualité des eaux qui s’est appuyée sur une analyse comparative des teneurs des paramètres physico-chimiques aux normes OMS. Les résultats de l’étude ont montré que les eaux sont bicarbonatées calciques et magnésiennes (95,83%) et bicarbonatées sodi-potassiques (4,17%). Ces eaux ont des températures qui varient entre 25,7 °C et 28,9 °C, avec une moyenne de 26,7 °C. Leurs pH oscillent entre 6,51 et 7,13, avec une moyenne de 6,67. La turbidité des eaux souterraines reste très faible avec des valeurs qui varient entre 0,20 NTU et 1,01 NTU, pour une moyenne de 0,49 NTU. La conductivité électrique des eaux varie entre 106 μS/cm et 349 μS/cm, avec une moyenne de 208,437 μS/cm. La majorité des échantillons d’eau a une conductivité électrique comprise entre 100 μs/cm et 250 μs/cm (68,75%). La dureté des eaux est comprise entre 2,8 °F et 15,40 °F, avec une moyenne de 6,41 °F. La qualité physico-chimique des eaux souterraines étudiées est conforme dans l’ensemble aux normes recommandées par l’OMS et ne présentent pas de danger majeur pour la consommation humaine. Cependant, il existe de fortes teneurs en fer (0,66 mg/L) et en manganèse (0,16 mg/L), ce qui explique l’apparence rougeâtre et le goût désagréable de ces eaux.Mots clés: Eaux souterraines; Diagrammes d’analyses hydrochimiques; Normes de l’OMS; faciès hydrochimiques; Potabilité; Région ouest semi-montagneus

Application des méthodes statistiques et géostatistiques à l’étude de la conductivité électrique des eaux souterraines de la région du N’zi-Comoé (Centre-Est de la Côte d’Ivoire)

La région du N’zi-Comoé est située au Centre-Est de la Côte d’Ivoire. L’approvisionnement en eau potable des populations rurales est assuré majoritairement par les forages d’hydraulique villageoise. Ces eaux appartiennent à un environnement géologique de socle cristallin et cristallophyllien. Les formations géologiques sont constituées de roches magmatiques (granites, migmatites, gneiss) et métamorphiques (schistes, grès, roches vertes). La détermination de la qualité des eaux souterraines peut être appréciée par la conductivité électrique (CE). Elle représente un paramètre physique de l’eau qui fournit des informations sur sa minéralisation. Le but de cette étude est de comprendre l’environnement physico-chimique et l’évolution spatiale de la minéralisation des eaux souterraines des aquifères fissurés de la région du N’zi-Comoé à partir d’un descripteur performant qui est la conductivité électrique (CE). La méthodologie appliquée est fondée sur une approche pluridisciplinaire intégrant les analyses statistiques et géostatistiques, avec un échantillon de 193 forages. L’analyse en composantes principales normées (ACPN) a confirmé que la conductivité électrique des eaux souterraines est influencée par les paramètres physico-chimiques de l’eau. Cependant, elle n’est pas influencée par l’épaisseur d’altération et l’épaisseur forée dans le niveau fissuré. L’analyse géostatistique a montré que le modèle exponentiel modélise au mieux la conductivité électrique, variable régionalisée et structurée. La cartographie de la conductivité électrique, en tenant compte de sa structure spatiale, a permis de mettre en évidence une répartition hétérogène dans l’espace de la minéralisation avec les plus fortes valeurs dans le Sud-Ouest et le Nord-Est.Mots clés: Minéralisation; ACPN; Analyse variographique; Cartographie; Aquifères fissurés; Côte d’Ivoir

Phenolics content, fruit flesh colour and browning in cultivated eggplant, wild relatives and interspecific hybrids and implications for fruit quality breeding

[EN] Increasing the content in bioactive phenolics in the eggplant (Satanum melongena) fruit is of interest, but may result in enhanced browning. We evaluated six varieties of S. melongena, 22 accessions of wild related species and 42 interspecific hybrids between cultivated eggplant and wild relatives for phenolics content, fruit flesh colour, polyphenol oxidase (PPO) activity, and fruit flesh browning. Wild relatives generally had a higher content in phenolics and a broader range of variation than cultivated eggplant. Chlorogenic acid was the predominant ( > 65.0%) phenolic acid in cultivated eggplant and its primary genepool wild ancestor S. insanum, while for the other wild species on average represented < 50% of the chromatogram peak area. Fruit flesh colour was lighter in S. melongena than in the wild species, while PPO activity and browning was much higher in wild species of the secondary and tertiary genepools. Interspecific hybrids between S. melongena and S. insanum were intermediate in their characteristics, while those with secondary and tertiary genepool species were more similar to the wild species. No significant correlations were found between total phenolics or chlorogenic acid contents and fruit flesh browning, but PPO activity was correlated to both the degree of browning (r = 0.404) and colour difference (r = 0.458). The results indicate that wild species can contribute to improving the bioactive properties of eggplant without affecting negatively fruit flesh colour and browning.This work has been funded in part by the initiative "Adapting Agriculture to Climate Change: Collecting, Protecting and Preparing Crop Wild Relatives", which is supported by the Government of Norway (GS13044 and GS17011). This project is managed by the Global Crop Diversity Trust with the Millennium Seed Bank of the Royal Botanic Gardens, Kew and implemented in partnership with national and international gene banks and plant breeding institutes around the world. For further information see the project website: http://www.cwrdiversity.org/. Funding has also been received from the European Union's Horizon 2020 - Research and Innovation Framework Programme under grant agreement No 677379 (G2P-SOL project: Linking genetic resources, genomes and phenotypes of Solanaceous crops) and from Spanish Ministerio de Economia y Competitividad and Fondo Europeo de Desarrollo Regional (grant AGL2015-64755-R from MINECO/FEDER). Prashant Kaushik is grateful to ICAR for a pre-doctoral grant. Pietro Gramazio is grateful to Universitat Politecnica de Valencia for a pre-doctoral (Programa FPI de la UPV-Subprograma 1/2013 call) contract.Kaushik, P.; Gramazio, P.; Vilanova Navarro, S.; Raigón Jiménez, MD.; Prohens Tomás, J.; Plazas Ávila, MDLO. (2017). Phenolics content, fruit flesh colour and browning in cultivated eggplant, wild relatives and interspecific hybrids and implications for fruit quality breeding. Food Research International. 102:392-401. https://doi.org/10.1016/j.foodres.2017.09.028S39240110

RNA Aptamers Generated against Oligomeric Aβ40 Recognize Common Amyloid Aptatopes with Low Specificity but High Sensitivity

Aptamers are useful molecular recognition tools in research, diagnostics, and therapy. Despite promising results in other fields, aptamer use has remained scarce in amyloid research, including Alzheimer's disease (AD). AD is a progressive neurodegenerative disease believed to be caused by neurotoxic amyloid β-protein (Aβ) oligomers. Aβ oligomers therefore are an attractive target for development of diagnostic and therapeutic reagents. We used covalently-stabilized oligomers of the 40-residue form of Aβ (Aβ40) for aptamer selection. Despite gradually increasing the stringency of selection conditions, the selected aptamers did not recognize Aβ40 oligomers but reacted with fibrils of Aβ40, Aβ42, and several other amyloidogenic proteins. Aptamer reactivity with amyloid fibrils showed some degree of protein-sequence dependency. Significant fibril binding also was found for the naïve library and could not be eliminated by counter-selection using Aβ40 fibrils, suggesting that aptamer binding to amyloid fibrils was RNA-sequence-independent. Aptamer binding depended on fibrillogenesis and showed a lag phase. Interestingly, aptamers detected fibril formation with ≥15-fold higher sensitivity than thioflavin T (ThT), revealing substantial β-sheet and fibril formation undetected by ThT. The data suggest that under physiologic conditions, aptamers for oligomeric forms of amyloidogenic proteins cannot be selected due to high, non-specific affinity of oligonucleotides for amyloid fibrils. Nevertheless, the high sensitivity, whereby aptamers detect β-sheet formation, suggests that they can serve as superior amyloid recognition tools

Sucrose in the concentrated solution or the supercooled “state” : a review of caramelisation reactions and physical behaviour

Sucrose is probably one of the most studied molecules by food scientists, since it plays an important role as an ingredient or preserving agent in many formulations and technological processes. When sucrose is present in a product with a concentration near or greater than the saturation point—i.e. in the supercooled state—it possesses high potentialities for the food industry in areas as different as pastry industry, dairy and frozen desserts or films and coatings production. This paper presents a review on critical issues and research on highly concentrated sucrose solutions—mainly, on sucrose thermal degradation and relaxation behaviour in such solutions. The reviewed works allow identifying several issues with great potential for contributing to significant advances in Food Science and Technology.Authors are grateful for the valuable discussions with Teresa S. Brandao and Rosiane Lopes da Cunha during this research. Author M. A. C. Quintas acknowledges the financial support of her research by FCT grant SFRH/BPD/41715/2007

Development and Genetic Characterization of Advanced Backcross Materials and An Introgression Line Population of Solanum incanum in a S. melongena Background

[EN] Advanced backcrosses (ABs) and introgression lines (ILs) of eggplant (Solanum melongena) can speed up genetics and genomics studies and breeding in this crop. We have developed the first full set of ABs and ILs in eggplant using Solanum incanum, a wild eggplant that has a relatively high tolerance to drought, as a donor parent. The development of these ABs and IL eggplant populations had a low efficiency in the early stages, because of the lack of molecular markers and genomic tools. However, this dramatically improved after performing genotyping-by-sequencing in the first round of selfing, followed by high-resolution-melting single nucleotide polymorphism genotyping in subsequent selection steps. A set of 73 selected ABs covered 99% of the S. incanum genome, while 25 fixed immortal ILs, each carrying a single introgressed fragment in homozygosis, altogether spanned 61.7% of the S. incanum genome. The introgressed size fragment in the ILs contained between 0.1 and 10.9% of the S. incanum genome, with a mean value of 4.3%. Sixty-eight candidate genes involved in drought tolerance were identified in the set of ILs. This first set of ABs and ILs of eggplant will be extremely useful for the genetic dissection of traits of interest for eggplant, and represents an elite material for introduction into the breeding pipelines for developing new eggplant cultivars adapted to the challenges posed by the climate-change scenario.This work has been funded in part by the initiative "Adapting Agriculture to Climate Change: Collecting, Protecting and Preparing Crop Wild Relatives," which is supported by the Government of Norway. This project is managed by the Global Crop Diversity Trust with the Millennium Seed Bank of the Royal Botanic Gardens, Kew and implemented in partnership with national and international gene banks and plant breeding institutes around the world. For further information see the project website: http://www.cwrdiversity.org/. Funding has also been received from the European Union's Horizon 2020 Research and Innovation Programme under grant agreement No 677379 (G2P-SOL project: Linking genetic resources, genomes and phenotypes of Solanaceous crops) and from Spanish Ministerio de Economia, Industria y Competitividad and Fondo Europeo de Desarrollo Regional (grant AGL201564755-R from MINECO/ FEDER). PG is grateful to Universitat Politecnica de Valencia for a pre-doctoral (Programa FPI de la UPV-Subprograma 1/2013 call) contract. MP is grateful to Ministerio de Economia, Industria y Competitividad for a post-doctoral grant within the Juan de la Cierva programme (FCJI-2015-24835). GM is grateful to Conselleria d'Educacio, Investigacio, Cultura i Esport de la Generalitat Valenciana for a pre-doctoral grant within the Santiago Grisolia programme (GRISOLIAP/2016/012). Authors also thank the Italian Eggplant Genome Sequencing Consortium for providing access to an improved version of the eggplant genome.Gramazio, P.; Prohens Tomás, J.; Plazas Ávila, MDLO.; Mangino, G.; Herraiz García, FJ.; Vilanova Navarro, S. (2017). Development and Genetic Characterization of Advanced Backcross Materials and An Introgression Line Population of Solanum incanum in a S. melongena Background. Frontiers in Plant Science. 8. https://doi.org/10.3389/fpls.2017.01477S1477

Socializing One Health: an innovative strategy to investigate social and behavioral risks of emerging viral threats

In an effort to strengthen global capacity to prevent, detect, and control infectious diseases in animals and people, the United States Agency for International Development’s (USAID) Emerging Pandemic Threats (EPT) PREDICT project funded development of regional, national, and local One Health capacities for early disease detection, rapid response, disease control, and risk reduction. From the outset, the EPT approach was inclusive of social science research methods designed to understand the contexts and behaviors of communities living and working at human-animal-environment interfaces considered high-risk for virus emergence. Using qualitative and quantitative approaches, PREDICT behavioral research aimed to identify and assess a range of socio-cultural behaviors that could be influential in zoonotic disease emergence, amplification, and transmission. This broad approach to behavioral risk characterization enabled us to identify and characterize human activities that could be linked to the transmission dynamics of new and emerging viruses. This paper provides a discussion of implementation of a social science approach within a zoonotic surveillance framework. We conducted in-depth ethnographic interviews and focus groups to better understand the individual- and community-level knowledge, attitudes, and practices that potentially put participants at risk for zoonotic disease transmission from the animals they live and work with, across 6 interface domains. When we asked highly-exposed individuals (ie. bushmeat hunters, wildlife or guano farmers) about the risk they perceived in their occupational activities, most did not perceive it to be risky, whether because it was normalized by years (or generations) of doing such an activity, or due to lack of information about potential risks. Integrating the social sciences allows investigations of the specific human activities that are hypothesized to drive disease emergence, amplification, and transmission, in order to better substantiate behavioral disease drivers, along with the social dimensions of infection and transmission dynamics. Understanding these dynamics is critical to achieving health security--the protection from threats to health-- which requires investments in both collective and individual health security. Involving behavioral sciences into zoonotic disease surveillance allowed us to push toward fuller community integration and engagement and toward dialogue and implementation of recommendations for disease prevention and improved health security