D-Bees: A Novel Method Inspired by Bee Colony Optimization for Solving Word Sense Disambiguation

Word sense disambiguation (WSD) is a problem in the field of computational linguistics given as finding the intended sense of a word (or a set of words) when it is activated within a certain context. WSD was recently addressed as a combinatorial optimization problem in which the goal is to find a sequence of senses that maximize the semantic relatedness among the target words. In this article, a novel algorithm for solving the WSD problem called D-Bees is proposed which is inspired by bee colony optimization (BCO)where artificial bee agents collaborate to solve the problem. The D-Bees algorithm is evaluated on a standard dataset (SemEval 2007 coarse-grained English all-words task corpus)and is compared to simulated annealing, genetic algorithms, and two ant colony optimization techniques (ACO). It will be observed that the BCO and ACO approaches are on par

Topical prostaglandin analogues and conjunctival inflammation in uveitic glaucoma.

A pilot study to determine whether topical prostaglandin analogues alter the expression of conjunctival inflammatory markers in patients with uveitic glaucoma.Prospective, single-masked case series of 20 patients with uveitis and secondary raised intraocular pressure. Participants were divided into four groups of five patients dependent on their use of topical medication: (1) prostaglandin analogues only, (2) corticosteroids only, (3) both prostaglandin analogues and corticosteroids, (4) no topical medication. Conjunctival cells were harvested by impression cytology and were examined for inflammatory markers (CD3, CD54, HLA-DR, CCR4, CCR5) by flow cytometry. A tear fluid sample was also examined for inflammatory cytokines (IL-12p70, IL-2, IL-10, IL-8, IL-6, IL-4, IL-5, IFN-gamma, IL-1beta, IFN-alpha, IFN-beta) by multiplex bead arrays.All groups demonstrated increased markers of conjunctival inflammation. There was no significant difference in levels of any inflammatory markers between the four groups, suggesting that the use of topical prostaglandin analogues does not increase conjunctival levels of inflammation beyond those already seen in uveitis.The use of topical prostaglandins does not appear to induce conjunctival inflammation over that which is already present in patients with uveitic glaucoma. This supports the use of topical prostaglandin analogues in patients with uveitic glaucoma, indicating that their use is unlikely to adversely affect subsequent glaucoma filtration surgery through the induction of chronic conjunctival inflammation

Cyber Warfare: International Security Intelligence

This essay will investigate the cyber threats presented on UAVs, which are now the backbone of the US arsenal on the war on terror. In addition, it will assess whether the US government are taking serious measures to counter the threat that cyber warfare could implicate on their drone fleets. Finally, the paper suggests some policy recommendations to combat that threat

Biotransformation of Oxo-Bile Acids Derivatives by Human Gut Bacteria

Bile acids are one group of steroids that can be metabolically transformed by human gut anaerobes. One of these transformations is the conversion of primary bile acids to secondary bile acids by 7α-dehydroxylating gut bacteria such as Clostridium scindens, Clostridium hylemonae, and Clostridium hiranonis. These anaerobes metabolize bile acid derivatives via 3α- and 7α-hydroxysteroid dehydrogenases (HSDH). Studies to date have not reported if these organisms are capable of converting 12-oxolithocholic acid (12-oxoLCA) to deoxycholic acid (DCA). The emphasis of this study was to determine the ability of C. scindens ATCC 35704, C. hiranonis DSM 13275, and C. hylemonae DSM 15053 to reduce 12-oxoLCA to DCA during growth, to identify 12α-HSDH genes in, C. scindens and C. hiranonis, to express, purify, and characterize the 12α-HSDH gene product (protein) of C. scindens. These organisms were grown anaerobically at 37°C in brain heart infusion (BHI) broth. Bile acids, prepared in methanol, were added to BHI broth to a final concentration of 0.1 mM. Following growth, cultures were extracted with ethyl acetate; extracts were dried, re-suspended in methanol, and subjected to thin-layer chromatography (TLC) for the detection of bile acids. In addition, 12α-HSDH recombinant enzymes were characterized and purified by affinity chromatography using Strep-Tactin® resin. Kinetic constants (Km, Kcat, Vmax, and Kcat/Km) were determined for the purified recombinant proteins for the forward and reverse directions. Catalytic efficiencies Kcat/Km toward the reductive direction were between 2.8-3.5-fold greater than oxidative direction. However, Vmax and Kcat in the oxidative direction were between 1.6-2.9-fold higher than the reductive direction. The 12α-HSDH recombinant enzyme from each strain was shown to reduce 12-oxoLCA to DCA. Moreover, these organisms were able to transform other oxo-bile acids during growth

Detailed genetic approach to improve frost tolerance of German winter faba beans

Es wurden mehrere Experimente durchgeführt, um - basierend auf 208 hochgradig homozygoten Inzuchtlinien - genetisch die Frosttoleranz von Ackerbohnen (Vicia faba L.) zu analysieren. Die Inzuchtlinien sind in drei Sätzen organisiert: Original-Satz (N=208, O-Satz), Winterbohnen-Satz (N=196, WB-Satz; eine Untermenge des O-Satzes), und Assoziations-Satz (N=186, A-Satz; eine Untermenge des WB-Satzes). Alle Experimente fanden statt: in der sog. Frost-Kammer (Pflanzenwuchskammer), im Gewächshaus, im Molekulargenetischen Laboratorium, oder im Zuchtgarten (Versuchsstation Reinshof der Georg-August-Universität Göttingen). Insgesamt wurden 65 morphologische Merkmale (Saison 2011/2012 und 2012/2013), physiologische Merkmale (Saison 2011/2012), und Feld-Merkmale (Saison 2012/2013) erfasst. Daraus werden 25 Merkmale für diese Studie hier verwendet. Mittels des A-Satzes und mit 156 polymorphen SNP-Markern wurde eine Assoziationsanalyse durchgeführt. Das Ziel dieser Untersuchung war, eine markergestützte Züchtung auf Frosttoleranz bei der Ackerbohne vorzubereiten, und also QTLs für Frosttoleranz für zukünftige Zuchtprogramme zu detektieren. Die Ergebnisse können wie folgt zusammengefasst werden. 1- Es wurde eine hohe genetische Variation zwischen allen Linien (Original-Satz) beobachtet, für alle acht morphologische Merkmale, die an Spross und Wurzel von Ackerbohnen-Jungpflanzen erfasst wurden. Die Pflanzen wurden über 10 Tage (5°C) gehärtet und dann während dreier Nächte einem Frost ausgesetzt (-16°C, -18°C, -19°C). Alle Merkmale zeigten eine hohe Wiederholbarkeit (h²), die Schätzwerte reichten von h2=59,45 für Wurzel-Frostempfindlichkeit bis zu h2=94,71 für den Blattturgor- und Blattfarbverlust. Darüber hinaus wurden hochsignifikante phänotypische und genotypische Korrelationen zwischen den morphologischen Merkmalen unter Froststress entdeckt. Die genotypischen Korrelationen zwischen den Merkmalen waren höher als die phänotypischen Korrelationen. Die höchste genetische (rg=-0,96) und phänotypische (rp= -0,83**) Korrelation wurde zwischen dem Wiederaufwuchs und der Wurzel-Frostempfindlichkeit gefunden. Zur Charakterisierung der Frosttoleranz von Ackerbohnen wurden drei Selektionsindices berechnet. Der wichtigste war der Frosttoleranz-Index, weil er zwei Schlüsselaspekte kombiniert: die Überlebensneigung und den Wiederaufwuchs. Diese hohe genetische Variation, phänotypische Korrelation, genotypische Korrelation, und hohe Wiederholbarkeit versprechen, dass ein Ausleseprozess zur erblichen Verbesserung der Frosttoleranz fruchtbar und effektiv wäre. 2- Als physiologische Parameter mit Beziehung zur Frosttoleranz der Ackerbohne wurde die Fettsäurezusammensetzung nach Härtung (5°C) und der relative Sproßwassergehalt (vor und nach Frost) studiert. Für diese physiologischen Parameter wurde der WB-Satz benutzt. Die genetische Variation in den aufgefundenen Fettsäure-Gehalten und im relativen Sproßwassergehalt wurde festgehalten. Alle physiologischen Kennwerte zeigten sehr hohe Wiederholbarkeitsschätzwerte (62,78 < h2 < 89,04). Wir erwartet war die Korrelation zwischen den ungesättigten Fettsäuren und den gesättigten Fettsäuren negativ (rp = -0,62, rg = -0,84**). Eine Erhöhung der ungesättigten Fettsäuren geht in Ackerbohnen bekanntermaßen mit einer Verringerung der gesättigten Fettsäuren einher. Eine ähnlich negative und signifikante Korrelationen (r = -0,20**) wurde zwischen dem Wassergehalt nach Frost und dem Wassergehalt vor Frost (nach Härtung) gefunden. Es ist gängiges Wissen, dass die Frosttoleranz von Pflanzen mit der Fähigkeit der Pflanzen assoziiert ist, die Eiskristallbildung während des Frosts im Spross- und Wurzelgewebe zu modulieren. Es wurden signifikante Korrelationen zwischen morphologischen und physiologischen Merkmalen gefunden. Der Gehalt an ungesättigten Fettsäuren war mit dem Frosttoleranz-Index positiv korreliert (r = 0,22**). Darüber hinaus war die Verringerung des Wassergehaltes durch Froststress hochsignifikant korreliert mit allen morphologischen Merkmalen. Solche Korrelationen bieten eine verbesserte Beschreibung des physiologischen Verhaltens, welches die Pflanzen dem Frost gegenüber zeigen. 3- Der WB-Satz wurde auch benutzt, um die genetische Variation der Winterhärte der Genotypen in einem einjährigen Feldversuch zu überprüfen. Eine hohe, signifikante Variation wurde für alle Feldmerkmale gefunden. Die Wiederholbarkeitsschätzwerte reichten von 61,98 für Kornertrag (g/2m2) bis zu 92,03 für Blühbeginn. Die Linien S_299 und S_271 kombinierten hohe Winter-Überlebensraten mit niedriger Frostanfälligkeit des Blattes und mit hohem Kornertrag unter Feldbedingungen. Dieselben Genotypen rangierten bei den Besten für Frosttoleranz in den Frostkammer-Experimenten. Interessanterweise zeigten mehrere Feldmerkmale signifikante Korrelationen mit Merkmale aus der Frostkammer. Die höchste Korrelation (r=0,39**) war die zwischen Wiederaufwuchs (Frostkammer) und Winter-Überlebensrate (Feld). 4- Um die Verbesserung der Frosttoleranz der Ackerbohne weiter nach vorne zu bringen, wurde ein Assoziationsanalyse-Ansatz mit dem A-Satz gefahren. Als Ergebnis liegen nun 70 mutmaßliche QLTs vor, die sieben morphologische Merkmale (Überlebensneigung, Blattturgor- und Blattfarbverlust, Frosttoleranz-Index, Wuchshöhe, Index1, Index2, und Sproß-Frischmasse nach Frost) und sechs physiologische Merkmale (Gehalt an gesättigten Fettsäuren, Gehalt an ungesättigten Fettsäuren, relativer Wassergehalt vor Frost, relativer Wassergehalt nach Frost, Verringerung des Wassergehaltes durch Froststress, und C16:0-Gehalt, also Palmitinsäuregehalt) betreffen. Das Gametenphasenungleichgewicht zwischen Marker-Loci zeigte ein sehr niedriges Niveau (r2=0,00075). Darüber hinaus zeigt die Hauptkoordinatenanalyse für genetische Distanzen zwischen den A-Satz-Linien keine offensichtliche Struktur in dieser Linienpopulation. Mehrere Marker zeigten eine signifikante Assoziation mit mehr als einem Merkmal, was ernstlich die Hoffnung erhöht, dass der markergestützte Ausleseansatz für die Verbesserung der Frosttoleranz bei der Ackerbohne genutzt werden kann

A Qualitative Approach To Understanding The Attitudes Of Maternal Fetal Medicine Specialists Regarding Prenatal Diagnosis, Disability And Termination

Background: Prenatal detection of congenital anomalies has forced Maternal Fetal Medicine specialists (MFMs) to navigate many new ethical and legal issues when counseling expecting parents. And yet, little is known about the attitudes, beliefs and perceptions of MFMs regarding the intersection of prenatal diagnosis, disability and termination. Thus, we aimed to identify the key attitudes and opinions surrounding prenatal genetic testing, disability and termination of MFM specialists who counsel expectant mothers with a prenatal diagnosis of fetal anomaly. Methods: This was a prospective, qualitative study using semi-structured interviews with MFMs across the nation, recruited through the snow-ball method. Interviews were audio- recorded, transcribed, and qualitatively analyzed using modified grounded theory by three reviewers. Results: 2,227 codes from 17 interviews were grouped into six clusters. Codes were then characterized to triangulate MFM perspectives into 18 themes and 39 sub-themes. Difficulties with patient misunderstanding of prenatal genetic screening, diagnostic technology, the implications of certain genetic anomalies, and limited time to explain thesefactors were identified as major barriers to effective counseling. All physicians reported viewing themselves primarily as informants in the prenatal diagnostic process, and all offered their patients the option of termination in the case of the diagnosis of a severe or lethal congenital anomaly; however, physician definitions of severe or lethal congenital anomaly differed. Moreover, physicians reported fears of being perceived as coercive by patients, and a high degree of moral and emotional distress during these consultations. Finally, physicians identified legal, financial and structural barriers that prevented patients from accessing prenatal genetic diagnostic services and termination services. It was felt that these limitations ultimately inhibited autonomous decision making by patients. Conclusions: These findings highlight important barriers, perspectives, and conflicts that occur for MFM providers during prenatal consults with pregnant women following prenatal discovery of congenital anomalies. Further exploration of the identified themes in this study would benefit MFM providers in identifying strategies to improve prenatal counseling